m****n
发帖数: 1066 | 1 正在设计siRNA, 理论上应该尽量避免off-target cleavage.
用blast search一下可以吗？ 用mRNA database. |
b****n
发帖数: 311 | 2 没用的。siRNA不用完全匹配就能抑制mRNA.跟miRNA类似。off-target effect是不能完
全排除
的。保险的方法是做RNAi之后的rescue。
【在 m****n 的大作中提到】
: 正在设计siRNA, 理论上应该尽量避免off-target cleavage.
: 用blast search一下可以吗？ 用mRNA database.
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w***a
发帖数: 4361 | 3 或者同时设计多个siRNA target同一基因，然后看你感兴趣的phenotype是否sequence
specific。
对于siRNA off target effect，大部分打酱油的paper都直接无视。俺建议你也别费事
算鸟。
【在 b****n 的大作中提到】
: 没用的。siRNA不用完全匹配就能抑制mRNA.跟miRNA类似。off-target effect是不能完
: 全排除
: 的。保险的方法是做RNAi之后的rescue。
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m****n
发帖数: 1066 | |
f*****n
发帖数: 12752 | 5 做个单核苷酸差异的对照ｓｉＲＮＡ就够意思了吧。。。
要证明对其他所有ｍＲＮＡ都没有影响似乎不太可能？一般ａｃｔｉｎ ｏｒ ｔｕｂｕｌｉｎ对照也是默认ａｃｔｉｎ ｏｒ ｔｕｂｕｌｉｎ不受影响的。。。 |
m****n
发帖数: 1066 | 6 Very informative.
Any good online tools to design efficient siRNAs?
Thanks. |
m*********7
发帖数: 5207 | 7 Try Invitrogen or Dharmacon.
【在 m****n 的大作中提到】
: Very informative.
: Any good online tools to design efficient siRNAs?
: Thanks.
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h********n
发帖数: 4079 | 8 1.公司设计好的.
2. rescue exp 是王道.siRNA以后再表达那个基因 |
