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Biology版 - 分子小白请教fusion protein
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s*********r
发帖数: 13
1
第一次设计fusion protein,想给自己的蛋白加个mcherry tag,没有现成的载体,不知
道中间需要加个linker呢,还是直接按ORF接上就好呢?pcDNA3.1的vector。没有现成
的linker给我用,如果要加的话,是不是得设计到primer上去,那这primer也太长了吧
,能P出来吗。。。。
谢谢指导^^
C*******e
发帖数: 4348
2
光说引物
引物长没问题哈
做过很多七十几到八十左右的引物,其中跟模板配对的部分是18左右,P起来完全没问题

【在 s*********r 的大作中提到】
: 第一次设计fusion protein,想给自己的蛋白加个mcherry tag,没有现成的载体,不知
: 道中间需要加个linker呢,还是直接按ORF接上就好呢?pcDNA3.1的vector。没有现成
: 的linker给我用,如果要加的话,是不是得设计到primer上去,那这primer也太长了吧
: ,能P出来吗。。。。
: 谢谢指导^^

p******i
发帖数: 1092
3
中间加linker有时候是为了防止后加上的TAG影响原来蛋白的功能
可以参考pcDNA6.2 fusion GFP系列的linker
不过以前貌似很多人都是直接加个GFP……

【在 s*********r 的大作中提到】
: 第一次设计fusion protein,想给自己的蛋白加个mcherry tag,没有现成的载体,不知
: 道中间需要加个linker呢,还是直接按ORF接上就好呢?pcDNA3.1的vector。没有现成
: 的linker给我用,如果要加的话,是不是得设计到primer上去,那这primer也太长了吧
: ,能P出来吗。。。。
: 谢谢指导^^

n***w
发帖数: 2405
4
我正在做一个fusion protein,我就是设计引物,然后p。。。引物大概35个碱基吧。
。。overlap。。。还是比较好p的。。。
s*********r
发帖数: 13
5
谢谢^^
w**********s
发帖数: 72
6
像GFP这么大的蛋白很可能会影响定位.一般我还是会加一个Linker。 比如GGSG。
K*C
发帖数: 2825
7
我最近做了一些fusion proteins.我的建议是你不要在引物里面加linker。
最好先做出一个Target protein-non coding region-Fluorescent protein(FP)的
prototype来,然后用Site-directed mutagenesis往里加linker。 FP加在N端还是C端
,是要试的。linker用多长的,什么样的,也是要选的。否则会对蛋白折叠有影响。

【在 s*********r 的大作中提到】
: 第一次设计fusion protein,想给自己的蛋白加个mcherry tag,没有现成的载体,不知
: 道中间需要加个linker呢,还是直接按ORF接上就好呢?pcDNA3.1的vector。没有现成
: 的linker给我用,如果要加的话,是不是得设计到primer上去,那这primer也太长了吧
: ,能P出来吗。。。。
: 谢谢指导^^

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