q*****d
发帖数: 445 | 1 它是以ATG开始，并且以TAA结束，且序列长度是3的整数位，为什么不能翻译为一个蛋
白呢？
atgcagttacttcgctgtttttcaatattttctgttattgcttcagttttagcacaggaactgacaactatatgcg
agcaaatcccctcaccaactttagaatcgacgccgtactctttgtcaacgactactattttggccaacgggaaggc
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tccaggccagacggtcactatgcccgtagtagtcaagagttcaagtcttgcagttgctggtgcgcagtt |
P****d
发帖数: 564 | 2 Translation in what sense? in silico, in vivo, during cloing/expression?
NCBI blastx finds great hits. |
p****p
发帖数: 3360 | 3 1。上游有promoter吗？
2。ATG附近有Kozak序列吗？
3。这段序列中间有intron吗？
4。这段序列中间有转录终止信号吗？
5。这段序列中间有polyA剪接信号吗？
6。中间有in－frame的stop codon吗？
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agcaaatcccctcaccaactttagaatcgacgccgtactctttgtcaacgactactattttggccaacgggaaggc
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【在 q*****d 的大作中提到】
: 它是以ATG开始，并且以TAA结束，且序列长度是3的整数位，为什么不能翻译为一个蛋
: 白呢？
: atgcagttacttcgctgtttttcaatattttctgttattgcttcagttttagcacaggaactgacaactatatgcg
: agcaaatcccctcaccaactttagaatcgacgccgtactctttgtcaacgactactattttggccaacgggaaggc
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: aagtactggatgtttctgctaacagaaccgctgctgacggaacagttgaatggcttatcccaacagtaactgcagc
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q*****d
发帖数: 445 | 4 谢谢已经找到问题的所在，这段序列没有intron，就是一个CDS |
p****p
发帖数: 3360 | 5 中间有一个stop codon。或许是一个26kDa左右的蛋白如果表达。
【在 q*****d 的大作中提到】
: 谢谢已经找到问题的所在，这段序列没有intron，就是一个CDS
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s*r
发帖数: 2757 | 6 非要有intron吗
【在 q*****d 的大作中提到】
: 谢谢已经找到问题的所在，这段序列没有intron，就是一个CDS
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i********f
发帖数: 206 | 7 intron应该不是必须的吧,
又不少基因就是只有一个exon的,至少在RICE和ATH里面是这样
【在 s*r 的大作中提到】
: 非要有intron吗
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p****p
发帖数: 3360 | 8 误会了。
我是针对OP把那段序列当作一个ORF而提的问题。如果中间有intron，那么能够被3整除
一点意义都没有。
【在 s*r 的大作中提到】
: 非要有intron吗
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q*****d
发帖数: 445 | 9 没有intron啊，我要构建一个cellulosome的骨架，这上面有一个AGA2基因的信号肽，
三个cohesion分别来自三个微生物，第二和第三个cohesion之间有一个CBD(cellulose
binding domain)，现在问题出在第二个cohesion序列上，如果用这人序列就不能翻译
为一个蛋白，但是把第二个改变一下大小，就可以翻译成一个蛋白了。到底是什么原因
，我现在也没有搞清楚，我反正是把序列改动一下，就OK了！难道这个Vector NTI能够
自动识别intron吗？ 这是最新的序列，大家如果有空可以比对一下，只有几个碱基不
同而已，太令人匪夷所思了。
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aatgcaaggagtttttgaatattacaaatcagtaacgtttgtcagtaattgcgg |
i********f
发帖数: 206 | 10 会不会是因为在原核和真核里面, t-RNA三联体密码的偏好性不同
cellulose
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【在 q*****d 的大作中提到】
: 没有intron啊，我要构建一个cellulosome的骨架，这上面有一个AGA2基因的信号肽，
: 三个cohesion分别来自三个微生物，第二和第三个cohesion之间有一个CBD(cellulose
: binding domain)，现在问题出在第二个cohesion序列上，如果用这人序列就不能翻译
: 为一个蛋白，但是把第二个改变一下大小，就可以翻译成一个蛋白了。到底是什么原因
: ，我现在也没有搞清楚，我反正是把序列改动一下，就OK了！难道这个Vector NTI能够
: 自动识别intron吗？ 这是最新的序列，大家如果有空可以比对一下，只有几个碱基不
: 同而已，太令人匪夷所思了。
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p****p
发帖数: 3360 | 11 如果是微生物，可能发生的情况就复杂些了。比如，不同的promoter，ribosomal
entry site, readthough，frame shift等等。建议你看看转录翻译调控。
cellulose
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【在 q*****d 的大作中提到】
: 没有intron啊，我要构建一个cellulosome的骨架，这上面有一个AGA2基因的信号肽，
: 三个cohesion分别来自三个微生物，第二和第三个cohesion之间有一个CBD(cellulose
: binding domain)，现在问题出在第二个cohesion序列上，如果用这人序列就不能翻译
: 为一个蛋白，但是把第二个改变一下大小，就可以翻译成一个蛋白了。到底是什么原因
: ，我现在也没有搞清楚，我反正是把序列改动一下，就OK了！难道这个Vector NTI能够
: 自动识别intron吗？ 这是最新的序列，大家如果有空可以比对一下，只有几个碱基不
: 同而已，太令人匪夷所思了。
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q*****d
发帖数: 445 | 12 我这个还没有装promoter呢，应该跟promoter没有关系的吧，这个序列是人工合成的。
来源于4种微生物！ |
p****p
发帖数: 3360 | 13 你这玩笑开的。人工合成的序列应该找设计的人去问吧。几个ORF中间有可能放入IRES
等ribosomal entry sites。
【在 q*****d 的大作中提到】
: 我这个还没有装promoter呢，应该跟promoter没有关系的吧，这个序列是人工合成的。
: 来源于4种微生物！
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D****g
发帖数: 275 | 14 中间有Stop coden
cellulose
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【在 q*****d 的大作中提到】
: 没有intron啊，我要构建一个cellulosome的骨架，这上面有一个AGA2基因的信号肽，
: 三个cohesion分别来自三个微生物，第二和第三个cohesion之间有一个CBD(cellulose
: binding domain)，现在问题出在第二个cohesion序列上，如果用这人序列就不能翻译
: 为一个蛋白，但是把第二个改变一下大小，就可以翻译成一个蛋白了。到底是什么原因
: ，我现在也没有搞清楚，我反正是把序列改动一下，就OK了！难道这个Vector NTI能够
: 自动识别intron吗？ 这是最新的序列，大家如果有空可以比对一下，只有几个碱基不
: 同而已，太令人匪夷所思了。
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