p****p
发帖数: 3360 | 1 我不是这个领域的人。不太了解。不过这个领域的组都很大－－太烧钱了。
但是知道一个group，Guy Montelione在新泽西州立大学Rutgers。
Good luck. |
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m***o
发帖数: 272 | 2 我是不是还没有讲明白，急死了。转录和翻译的起始点我都困惑。
这个5UTR是在原来gene的intron里面。
关于翻译的起始点，是不是原则No1是第一个ATG一般就是起始的，No2 才是考虑Kozak
序列。虽然后面的两个有Kozak序列，但因为第一个ATG挡在那里，所以翻译还是从第一
个开始。
关于转录的起始点，我测了20多个序列了。如果第一个ATG的A为0，那么我只有一个在
大概-70（这是最远的），有2个在-4，其余的大概好几个就在+4+5+6位置，还有好多在
+15to+18之间（这个就是3个ATG的下游了）。（原来说的60个bp的差别该改成88个）。
如果在3个ATG的下游，那岂不就没法翻译了吗。不过PCR倾向于拷短的条带，所以有可
能放大了短的片段。
然后我用RT-PCR把5‘引物放在+24，可以看到很强的条带，放到-20条带就弱了很多，
放到-70位置，就更弱了。但是都能看到条带，而且对照很干净，所以就是说这些不同
长度的RNA都存在。而且还有可能-90的位置可能也转录了，但是我没有得到克隆测序。
所以我现在就很想知道转录到底哪是起始点。
另外做5-RACE，大家可以得到... 阅读全帖 |
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Z******5
发帖数: 435 | 3 实验室有个PI是做幽门螺杆菌蛋白组的，经常要培养幽门螺杆菌。
问题是，我们实验室空间比较小，实验室的超净台不是外循环那种，上面一个进风机，
风从操作台下面的小孔（直径一厘米左右）直接吹到超净台外，没有任何过滤装置。
想知道在这样的实验室呆久了（两年以上），会不会比较危险？ |
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z*t
发帖数: 863 | 4 说说我了解的老板吧
goodell比较低调，而且paper没有huda那么炫。。。她对stem cell的分离方法和
weissman的方法有很大不同，而且她并不focus on cancer stem cell这点决定她在地
位和一些title上不能和weissman几个弟子相比。但她的方法目前有独到的地方，对
stem cell内亚群有很好的分离。实事求是讲，她的眼界及idea不在weissman弟子之下。
Huda更偏向于human genetics,侧重neurology这一块，对小鼠之类基本以构建人类疾病
的model为主。她本人的思路相当清晰，talk给的非常漂亮。影响也很大，她实验室
postdoc的行情基本是1-2 CNS。
OMarlley大叔接触不多，只知道考试喜欢出怪题，他实验室很大，手下几个小老板在管
实验室，而且和BCM这边很多人一起都在做激素受体这些东西，蛋白组实验做得多一点 |
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h***0
发帖数: 248 | 5 基于NGS的cancer ~omics研究
或者是基于MS,对肝病，糖尿病等蛋白组学研究
哪个可能在未来有更大的突破
比如说会得到更多的经费，会使更多的病人受益等 |
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w******n
发帖数: 371 | 6 什么会是下一个生命科学的炒作主题？【转】
来源： 肖瑶的日志
过去30年，美国的生命科学高速发展，现在除了药物研发上与欧洲平分秋色外，在基础
研究，生物科技上成了世界的龙头老大，成果累累但是采取的竟争手段也不是很温柔。
成果累累：
1. 美国主挑完成了人类基因测序（Venter Institute/Whiteheand Institute为主挑)；
2. 建立强大完整的生命科学数据库（Pubmed,MGD,UCSC genome etc）;
3. 建立了系统完整的生命医学文献资料文库（cell系列， Science, Nature分枝系列
，PNAS, Plos系列 America J.of ×××）等等。
4. 掌握了绝大部分生物核心技术（Con-focal Microscope, FACS, PCR, qRT-PCR，
第一代，第二代DNA sequencing技术，莹光标记技术，莹光成像技术，人源化的单抗制
备技术，基因芯片， ChIP技术，和欧洲，日韩同步的干细胞技术。)
5. 拥有500-1000家成型的生物公司，有强大的应用开发实力和团队,拥有当今世界绝大
多数的生物高科... 阅读全帖 |
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e****o
发帖数: 268 | 7 天津医科大学基础医学院诚聘英才
天津医科大学创建于1951年，是新中国成立后国家政务院批准新建的第一所高等医学院
校，为天津市属唯一一所西医学校和国家"211工程" 重点建设院校。新任校长为著名生
物化学与分子生物学家、中国科学院院士尚永丰教授。学校拥有一批包括1名中国科学
院院士、2名中国工程院院士、2名973首席专家及多名获得“长江学者”、“千人计划
”、“杰出青年基金获得者”、“重大科学研究计划项目首席科学家”等称号奖励的国
内外知名的教授、学者。学校现有肿瘤学等国家级重点学科5个，医学表观遗传学（正
在筹建国家重点实验室）等省部级重点实验室11个及天津总医院、天津肿瘤医院等7所
附属教学医院。现根据大学“完善学科结构，健全以学系为主的科研体系”的新科研布
局和发展思路和需要，天津医科大学基础医学院面向海内外公开招聘研究组长（PI）。
招聘学科方向和招聘岗位：
1. 病理学；教授，具体研究方向不限，1-2位PI（含可能系主任候选人）。
2. 微生物/病原生物学：教授，具体研究方向不限，1-2位PI（含可能系主任候选人）。
3. 生理学：教授，具体研究方向不限，1-2位PI。
4.... 阅读全帖 |
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b****r
发帖数: 17995 | 8 RNA seq，蛋白组学，microarray，在我看来，都不是将来寻找机制的金钥匙。这些都
是现象，DNA才是本质，等技术成熟到可以直接研究本质，恐怕大家一般不会绕个弯子
透过现象研究本质
seq |
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g*********5
发帖数: 2533 | 9 抗体wb就一条带吗？
一直有个疑问，如果抗体多条带的话，免疫荧光和免疫组化总能得到一些信号的...
我实验室一个人，做病理的，像我说santa cruz的抗体质量好。
可能每次片子都能得到信号吧。 |
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l*******i
发帖数: 153 | 10 iPS本身最大的创新可能是1）技术的简易化，使得其迅速普及；2）其本身机制的研究
促进了epigenetics等领域的发展。
reprogramming这个概念早就存在。就体细胞向ESC逆编程而言，SCNT应该比iPS更好，
可惜的是，到目前为止还无法在人的细胞上完全实现。
iPS细胞刚出来时，几乎所有人都对其临床应用充满了期待，随着研究的深入，该领域
内怀疑其clinical therapy价值的人渐渐增多，其主要弱点有：
1）iPS与ESC的identity：Yamanaka现在似乎仍然坚持iPS与ESC是非常相似的，但是他
本人也承认现在iPS还根本无法取代ESC;相反的一派认为iPS与ESC根本就是两种不同的
细胞，无论是在transcriptome水平，还是epigenetic水平——蛋白组水平的研究，我
只看到两篇文章，不知为啥这方面的研究到目前还少之又少。当然，就目前已有的ESC
株，不同实验室分离的，不同人种来源的，相互之间也有比较大的差别，甚至这种差别
影响到了其pluripotency/分化能力。我个人的看法是，ESC是一个动态变化的cell
population（... 阅读全帖 |
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u**********d
发帖数: 573 | 11 要看其它的修饰是不是要对MS的结果进行一次专门的search？比如根据特定氨基酸残基
的理论分子量的变化。
好多糖基化的情况是多糖，可能还带分支，MS来分析的话，样品是不是要经过特殊的处
理，数据分析是不是有不同？去年来看到好几次糖蛋白组的文章在MCP上面，你有兴趣
可以去参考一下。
不同体腔的氧化程度差异这个问题挺有意思，不过M的氧化是不是最好的检测方式呢？
氧化差异如果单指用氧分子来氧化的情况的话，就可能受氧含量的影响，也可能受氧化
酶的含量以及活性的影响。 |
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b******n
发帖数: 4225 | 12 你突变体纯合子能被抗体检测，是western还是免疫组化？
突变体纯合子的mRNA可以做primer extension，看看是不是有alternative start
codon
想降低qPCR本底水平，引物可以设计一端priming在exon1，另外一端在别的exon或者5'
-UTR |
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l*******e
发帖数: 170 | 13 是啊，抗体特异性差就必须得跑胶转膜，很难自动化。
全蛋白组自动化扫描做出来赚大钱了。 |
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p****3
发帖数: 17 | 14 我记得he fuchu还是谁说
中国是肝炎和肝癌高发国家，做比较蛋白组学去找什么东西
这个跟现在很多美国大实验室，去用病人sample 去deepseq找varient
感觉是差不多的思路
也算是有科学问题了吧
不过不知道后面有没有发什么好文章或者其他成果，毕竟投入那么多钱
人家做deep seq可是好多CNS |
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b****e
发帖数: 52 | 15 age是match的,因为是TKO,用DKO mate的,而且P0就死了,所以只好用P0的B6 pups做对照
. KO应该不是纯的B6,棕色的毛.Variation大的话只能多做几组吗? |
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l******o
发帖数: 62 | 17 生化，蛋白组，分子，细胞生物学方面都行。 多谢！！！ |
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b*******0
发帖数: 48 | 18 最近在做小鼠大脑切片的immunohistochemistry, 大脑是先心脏灌注PFA, 1:1 PFA :
sucrose 过夜，30% sucrose 3h.
OCT embedding. 然后cryostat 切片10um. 想染的蛋白主要是在cytoplasm。 先室温干
燥，然后extraction buffer 10 min, block 30min, Primary Ab 4oC ON. wash.
Secondary Ab . 试过Cy5 anti-rabbit, Alexa fluor 350 anti-rabbit. 好像都没有
荧光。
请问是Primary ab 浓度太低了，还是extraction buffer 不够啊。
谢谢。 |
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B******s
发帖数: 52 | 19 不懂你的问题，不过你可以参考一下protein chip 和 蛋白组相关的技术 但是我估计
数据太粗糙 |
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x*******n
发帖数: 34 | 20 目前在做identification and quantification of proteome, phosphorpteome,
ubiquitome of cancer cell方面的工作。想攒点审稿经历以便将来申请绿卡。
哪位好心人可以帮忙推荐一些相关的审稿机会？
万分感谢！！！
email:y**********[email protected]
另， 我以前做生物物理方面的工作（interactions of protein and DNA), 这方面的
审稿机会也可。 |
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n****m
发帖数: 25 | 21 I'm interested to invite you as referee.
Please send name and position to me via message within this website. thanks! |
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x*******n
发帖数: 34 | 22 非常感谢您愿意帮忙。已经回您站内信箱了，请查看.
谢谢
thanks! |
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M*******T
发帖数: 66 | 23 据说有清华的参与。
我不是做蛋白的，什么都不懂。不过如果能建中心做那么多数据出来，至少不是坏事。
生物数据本身也是资源吧。
详细说说，怎么个平庸法？ |
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w****6
发帖数: 169 | 24 顶这个帖子，说得很好。
我博士也做过结构，呵呵，也解了一个好些组一直在做，但很多年来都没解出来的结构
。现在做薄厚就转方向了，在细胞水平筛药。理由和你的帖子说的很类似。
rate |
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x****6
发帖数: 4339 | 25 难道现在不是已经这样了么？
美国有人类基因组，encode,蛋白组计划，向公众宣传所谓破解了人类的秘密；
国内游一公、饶毅，把生物领域/产业描述得如此美妙，引无数年轻学子往坑里跳。就
算廉价测出这些个玩意儿，解决不了实际问题，大众也不是傻子。
按照这个思路，我倒是还更看好民营资本发起的太空旅游项目spaceX,还不算纯粹忽悠
，至少那么个体验。
Pattern |
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e****s
发帖数: 1125 | 26 晕。我现在还在拼命往质谱上靠。不过蛋白组是不做的。 |
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a***y
发帖数: 19743 | 27 如果从0.5ml的blood sample里提buffy
然后做quantitative proteomics
也许做label free的counting方法
大约每个sample需要多少钱？
谢谢！ |
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s*****5
发帖数: 52 | 29 大家好，我博士四年级。做的方向主要是基于LC-MS的proteomics分析，主要负责整个
课题设计，样品处理，数据分析以及给出一些biological story等等。仪器分析这块是
高度固定化的方法，所以这块背景并不是很强。 不想之后再做学术了，想去industry
找工作，但是因为不清楚proteomics这个方向的就业形势到底是怎么样的，job market
是扩大还是缩小。所以发帖来问问，希望有相关领域的前辈能多多指教，万分感谢。
实验室还有一个方向是mAb定量，以及一些蛋白的定向的绝对定量，似乎在工业界更好
找到工作，不知道是不是这样。如果是的话，也在考虑是不是做这个方向。 |
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s*****5
发帖数: 52 | 30 大家好，我博士四年级。做的方向主要是基于LC-MS的proteomics分析，主要负责整个
课题设计，样品处理，数据分析以及给出一些biological story等等。仪器分析这块是
高度固定化的方法，所以这块背景并不是很强。 不想之后再做学术了，想去industry
找工作，但是因为不清楚proteomics这个方向的就业形势到底是怎么样的，job market
是扩大还是缩小。所以发帖来问问，希望有相关领域的前辈能多多指教，万分感谢。
实验室还有一个方向是mAb定量，以及一些蛋白的定向的绝对定量，似乎在工业界更好
找到工作，不知道是不是这样。如果是的话，也在考虑是不是做这个方向。 |
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E*********4
发帖数: 16 | 31 想要做成stable cell line，用病毒的话效率会很高。如果直接转染，也可以整合到基
因组，就是效率太低。 |
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p*******q
发帖数: 472 | 32 上周组会的点评：1.我很佩服颜老师，在支持这么好的情况下坚持科研，真心佩服；2.
希望借此能够关注对于本土培养的青年科学家的支持问题；3.这个研究如果所有数据
solid，前景巨大，好极了；4.这项研究不属于创新型研究，是跟风型的，没必要神话
，原创在2013年。 |
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p******b
发帖数: 379 | 33 我们组会没有点评这个文章，个人感觉如下：
1.这个研究如果所有数据都硬，前景巨大，好极了；
2.这项研究不属于创新型研究，是跟风型的，没必要神话，原创在上个世纪，在颜教授
之前至少有几百篇相关的文章。
不知道我这个感觉对不对。。。
2. |
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f*******K
发帖数: 34 | 34 Phosphopeptides是亲水性的，tag标记后的Cys peptides是相对疏水性的，可以通过
HILIC相对区分开，降低他们的相互影响。和以前的方法相比，鉴定数目明显胜出。
To dahuzi,我不知道你这个蛋白的相对丰度，不好给具体建议。不过如果你的蛋白质
里面那些包含你感兴趣的PTMs sites的peptides能够通过常规LCMSMS鉴定到,那么我的
方法应该也能。不过对单个蛋白质，你可以考虑做topdown,应该更直接。 |
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l*****7
发帖数: 8463 | 35 你的技术主要用于研究细胞内代谢和信息传导中蛋白的功能状态【磷酸化或去磷酸化
（激活或失活）和酶】
如果效率高，特异性强，应该很实用。 |
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r*****m
发帖数: 3619 | 36 和我大舅吃饭听到差不多可以公布了。
1，结构生物学
2，生物信息学
3，与疾病无关的信号转导学
4，与疾病无关的基因组蛋白组学
5，meta analysis
6，主要工作在国外完成的
全国医学院，医院，中科院药物所，药科大学，不得开办生命学院，已经开办的撤销，
兼并为生物系。耗竭基金委医学部，医学院和医院财务的上述6类闲杂人员，逐步清退
，仅保留部分为医学服务的PhD医学科技人员。严重老化的病理，病原，药学，严重缺
乏的药物制剂，临床研究基地，作为医学院，药学院和医院的重点发展方向。 |
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G*****h
发帖数: 320 | 37 希望在这里找一两个审稿的。要用 proteomics 经验，以及微生物背景（熟悉些寄生原
虫的更好）。
有意者请发邮件给我，简单介绍一下学历、工作、文章（或简历）。
如果被邀请，请一定认真完成 review。能够及时最好，但晚几天问题不大。之前碰见
过得了邀请函，但没有递交评审意见的，导致我有一段时间不愿意来这里征 reviewers
。 |
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T****i
发帖数: 15191 | 38 其实如果屁爱着地的时候能好好学些生物信息或者蛋白组学的技术，毕业找个学校的技
术支持类职位还是没问题的，没绿卡也行。比做千老强。 |
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发帖数: 1 | 40 统计和生物 双博士 （还有个CS master)，有一篇一作 Nature Methods 关于 NGS
data 分析 （目前 citation ～500）， 一篇一作 PNAS， 两篇 一作 使用
nature language progressing (and deep learning) 分析 electronic medical
records (medical informatics top journals), 一篇 一作 JBC (signal
transduction analysis, wet lab). 还有一篇一作 反应器设计的工程文章。 其他还
有共同一作 Bioinformatics 的蛋白组学文章一篇，N作文章几篇。 熟练 Pyathon,
Perl and R. C 也能写点， 但不擅长。 请问背景match 您的工作吗？ 谢谢 ! 忘了
， 给本科生上过一年 Machine learning and Python 课. |
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m******2
发帖数: 1056 | 41 同求啊。本人做糖的，任何糖类相关的文章都可以，当然分析类的最对口。
然后普通的蛋白组和化学生物学也应该问题不大。
拜托拜托啊各位！ |
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w********h
发帖数: 12367 | 42 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: lingzhuzi (), 信区: Biology
标 题: Re: 2012年诺贝尔生物医学奖
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Oct 8 15:55:54 2012, 美东)
iPS本身最大的创新可能是1）技术的简易化，使得其迅速普及；2）其本身机制的研究
促进了epigenetics等领域的发展。
reprogramming这个概念早就存在。就体细胞向ESC逆编程而言，SCNT应该比iPS更好，
可惜的是，到目前为止还无法在人的细胞上完全实现。
iPS细胞刚出来时，几乎所有人都对其临床应用充满了期待，随着研究的深入，该领域
内怀疑其clinical therapy价值的人渐渐增多，其主要弱点有：
1）iPS与ESC的identity：Yamanaka现在似乎仍然坚持iPS与ESC是非常相似的，但是他
本人也承认现在iPS还根本无法取代ESC;相反的一派认为iPS与ESC根本就是两种不同的
细胞，无论是在transcriptome水平，还是epigenetic水平——蛋白组水平的研究，我
只看到两篇文章，不知为啥... 阅读全帖 |
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b*******r
发帖数: 1073 | 43 你们有人在用代谢组学去发现biomaker么？thanks， |
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f******s
发帖数: 288 | 44 发现楼上mm回的是楼主一年前的帖子。。。想起自己那时候还在找工作，呵呵，感慨一
下物是人非。
恩，我觉得做酶的其实还是有前景的吧，（如果你的方向不仅仅局限于筛inhibitor之
类的话。。） 大分子是趋势，且很多蛋白制剂／抗体之类的都要做好的
characterization，尤其是到了development 阶段。
不过，只是感觉，我也想听楼主透露一下。＝）
deadend, |
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z**********2
发帖数: 8 | 45 下周就是最后一门考试了：）然后是两个月的实验，八月初毕业。
最近一个在buffalo的朋友帮我联系了一位老师，做LCMS以及蛋白组学，同意我去他实
验室volunteer。不知有没有前辈对这个方向有所了解？前几个月我曾向本校一位有PK
core的老师申请实习，那位老师说他主要做LCMS，而我之前都是做分子水平实验，就以
实验室人太多婉拒了。。所以想问下大家去buffalo实习，学习LCMS对于我向PK
modeling方向发展有帮助吗？
再次谢谢大家：）祝大家工作学习一切顺利 |
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l*******k
发帖数: 63 | 46 现在大分子质谱也这么难吗？我是fresh phd做质谱蛋白组的，当初选这个phd就是觉得
还相对好找工作，难道我也要面临毕业即失业吗？天啊！！！ |
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c***s
发帖数: 70028 | 47 日前，方舟子在其博客发文直指林志颖旗下爱碧丽生物科技有限公司(下称“爱碧丽”)推销假保健品。消息一出，引起哗然。随后，爱碧丽发布声明试图澄清相关问题，不过市场质疑的声音却不断增强。时代周报记者多方调查发现，爱碧丽实际上并没有自己的产品生产加工工厂。
林志颖现身回应方舟子质疑
继《爸爸去哪儿》之后，星爸林志颖的“逆生长”秘密再度成为大众关注的焦点。
日前，方舟子在其博客发文直指林志颖旗下爱碧丽生物科技有限公司(下称“爱碧丽”)推销假保健品。消息一出，引起哗然。随后，爱碧丽发布声明试图澄清相关问题，不过市场质疑的声音却不断增强。
时代周报记者多方调查发现，爱碧丽实际上并没有自己的产品生产加工工厂。其胶原蛋白饮品无核心研发，全部都是委托上海葡萄王企业有限公司(下称“上海葡萄王”)代工生产。号称拥有“逆生长”功效的爱碧丽“梦幻奇迹限量组”售价高达1080元，而其实际成本仅为每瓶4元。
事实上，爱碧丽早在2013年2月就注册了相关商标。借着《爸爸去哪儿》的热播，林志颖不失时宜地推出了爱碧丽胶原蛋白饮品。
然而，官方网站显示所在地在上海的爱碧丽实际上却并未在中国大陆注册。其在未取得食品流通许可证、... 阅读全帖 |
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c*********d
发帖数: 9770 | 48 荒猫牛不耕微信号laoniu003005
功能介绍
好文分享
来源：荒猫之舞
作者：荒猫
中美贸易战告一段落，毫不意外地，咱们又赢了。不过与以往不同的是，这次美国也赢
了，是双赢。据报道，咱们答应了美国减少贸易逆差的要求，所以美国赢了；而因为要
减少贸易逆差，中方将大量增加自美购买商品和服务，这样可以满足咱们不断增长的消
费需求和促进高质量经济发展，所以咱们也赢了。
但让我感觉不可思议的是，这么好的事情，为什么一直不做呢？为什么要在美国政府的
逼迫下去做呢？是因为没有想到？那岂不是说那些人能力低下？是因为想到了而不做，
那岂不是证明了那些人很坏？
而且在美国高调启动贸易战之初，咱们是抱着多大的决心，宁为玉碎不为瓦全，一定要
打赢的，一定要粉碎美国人阻挡咱们大国崛起的阴谋的。当美国提出500亿的清单时，
咱们针锋相对；当美国提出1000亿的清单时，咱们继续应战；而当美国把清单的总价提
高到2000亿的时候，一夜之间，美国就不是阻挡咱们大国崛起，而是有利于咱们大国崛
起了。美国的要求原来是有利于咱们的发展，而不是遏制咱们的发展了。我恍然大悟：
原来以前的针锋相对，是用的激将法，是为了刺激美... 阅读全帖 |
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z**n
发帖数: 22303 | 49 美国可以信誓旦旦的编造理由攻打他国，一个让孟山都高管做头头的FDA还真信不过。
转基因食品存在健康影响吗?
生物技术公司宣称,基因工程并不比传统的杂交更不可预测或是更危险,因此不应该对
转基因作物进行特殊或者系统的安全评价。事实上,基因修饰从根本上与传统杂交有所
区别, 已经有强有力的证据证明转基因作物的安全性。
基因工程通常将一些来自一种(或者多种)生物的遗传材料引入到另一种生物的 DNA 中,
通常是完全不同的另一个种。这一过程从不基于植物的正常繁殖过程。相反,外来的
DNA 或者通过感染疾病细菌或者采用包裹着外来 DNA 的精细金属粒子撞击细胞。这一
人 工 DNA 插入过程破坏了通常意义上维持物种遗传完整性的自然生物机制。在这一过
程的不 同阶段,实验室使细胞数量增长的方法称之为“组织培养”。
这一技术存在着诸多缺陷。这个方法使得转基因作物隐含了大量的风险,而传统的杂交
生产的植物不存在这些问题:
由于插入的基因通常来自其他的生物,比如细菌或者是人工合成的,产生的蛋白通常对
于动物或者人类的饮食而言比较新。蛋白的产生可能也需要在植物体内形成新的生物化
学过程或者是影响一个已经存... 阅读全帖 |
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o*****y
发帖数: 699 | 50 11101433 彭君 中南大学 “补丁”马氏过程
及其相关问题的研究 A0110 青年科学基金项目 22
2012-1-1 2014-12-31
2 11101434 徐勇 中南大学 无限时滞随机泛
函微分方程及其在种群动力系统中的应用 A011003 青年科学基金项目
22 2012-1-1 2014-12-31
3 11101435 周岳 中南大学 三类常数项恒等
式的数学机械化研究 A0116 青年科学基金项目 22
2012-1-1 2014-12-31
4 11102239 李地元 中南大学 ... 阅读全帖 |
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