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Biology版 - 震惊世界:海归院士施一公首揭老年痴呆症致病蛋白结构(图)
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跟风请帮忙解读11公γ-分泌酶复合物的意义不捧不撕不喷,请内行来评施一公的工作
施一公:这是我科学生涯里最耀眼的成果对话施一公及其团队
颜宁和庄晓薇应该是目前华人里最有希望得炸药奖的吧李克强与施一公有关“大脑”的深入对话
腰斩王晓东施一公晶体信号学科是必然的关于NgAGO, 这样的讨论才是理性和有意思的
Nature上刚online的一个牛逼的结构一公时代的到来zz
竟然到现在还没有人讨论syg的一周三灌施一公到底做出过什么贡献呀?
MacKinnon 也开始用冰冻电镜了2012 nobel chemistry prize-Koblika &lefkowitz
如何在没有抗体的情况下快速CONFIRM CRISPR KO可笑就是比什么impact factor
相关话题的讨论汇总
话题: 结构话题: dna话题: 蛋白话题: 阿尔茨海默话题: 双螺旋
1 (共1页)
s****n
发帖数: 8912
1
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: sautin (老将萨乌丁), 信区: Military
标 题: 震惊世界:海归院士施一公首揭老年痴呆症致病蛋白结构(图)
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 4 12:33:21 2014, 美东)
施一公在发布会现场
今天上午,记者从清华大学获悉,著名结构生物学家、中科院院士、清华大学教授施一
公研究组在世界上首次揭示了阿尔茨海默症(俗称老年痴呆症)发病直接相关的人源γ
分泌酶复合物的精细三维结构,为理解γ分泌酶复合物的工作机制及阿尔茨海默症的发
病机理提供了重要线索。该成果于6月29日在英国《自然》杂志在线发表。
成果发布
"这是我职业生涯上,最重要的突破"
今天上午,在清华大学召开的发布会上,施一公教授展示了阿尔茨海默症发病直接相关
的人源γ分泌酶复合物的精细三维结构。
他在介绍他的研究组成果时表示,此前的研究表明,阿尔茨海默症的发生和大脑中淀粉
样斑块的形成密切相关。淀粉样斑块是由膜整合蛋白酶复合物γ分泌复合酶异常切割"
淀粉样前体蛋白"APP而产生过量易聚集的Aβ42肽所致。
γ分泌酶复合物可以理解成细胞膜上的一个蛋白酶体,或者更通俗地形容为垃圾粉碎机
。它的主要作用是降解细胞膜上的一些废物蛋白,把它降解成小的片段,让人体再吸收
、再利用。
获得γ分泌酶复合物的三维结构是目前世界生命科学领域最热门的研究课题之一,世界
上几十个实验室都在进行科研攻关,但几十年都未有收获。
此前,外国科学家只能将蛋白酶解析到12埃的分辨率,而此次施一公教授对获得的复合
物样品进行了冷冻镜分析和数据收集,最终获得了分辨率达4.5埃的γ复合物三维结构
,更进一步地分析出了其三维结构。
施一公表示,此前世界上已经在阿尔茨海默症的功能性方面获得了突破,但此次空间结
构上的解析还为首次,"这是我职业生涯上,最重要的突破。"
"好比国外科学家在100米外看一个馒头,而我们在5米外看一个馒头,我们的目标是做
更精细的解析,希望未来能在10厘米外看一个馒头。"施一公笑着说。
目前,该成果于6月29日在英国《自然》杂志上在线发表,《自然》杂志于1869年在英
国创立,在学术界享有盛誉,常与美国《科学》杂志并称为世界两大顶级学术刊物。
研究进展
应用到临床仍有距离
" 阿尔茨海默症最主要的特征就是失忆。"施一公教授表示,阿尔茨海默症是一种致死
性神经退行性疾病。该病多发于65岁以上的老人,然而也有少见的早发性病患会提早发
病。随着现代人寿命的增长,罹患阿尔茨海默症的人越来越多。美国前总统里根和英国
前首相撒切尔夫人都罹患该病。据不完全统计,我国目前大约有 500万阿尔茨海默症患
者,占世界发病总数的四分之一。
据相关资料显示,早在2006年,全世界约有2600万人患有阿尔茨海默症,到2050年时估
计全球每85人就有1人罹患该病。
阿尔茨海默症患者临床表现为逐渐严重的认知障碍,对患者及家庭都会造成严重的影响
。在发达国家中,阿尔茨海默症是社会中花费最高的疾病之一,而对于该病,现在仍没
有较好的治疗方法。
施一公教授表示,所研究的人源γ分泌酶复合物的精细三维结构,是阿尔茨海默症的基
础研究,但应用到临床还有很大一段距离。
马上就访
一线医生说治疗药物"空白"
作为一线接触该病的医生,上午,宣武医院神经内科闵宝权医生告诉记者,目前国内乃
至世界上对治疗阿尔茨海默症都没有特别好的办法,只能够对病人采取针对性治疗。
闵宝权表示,目前能够做的就是提高病人的记忆力、减少部分有害物质以及治疗失眠等
减缓性治疗,"病人记忆力不好,就给病人吃提高记忆力的药;睡眠不好,就给病人吃
治疗失眠的药,都是对症下药。"闵宝权表示,治疗阿尔茨海默症并没有直接有效的药
,目前只能间接治疗,缓解其症状,几乎不可能根治。目前虽然已经了解了阿尔茨海默
症的发病原理,但治疗其的药物并未研发出来,在临床方面并没有太大的突破。 文并
摄/记者马晓晴
施一公简介
河南郑州人,世界著名的结构生物学家,美国双院外籍院士,中国科学院院士。曾是美
国普林斯顿大学分子生物学系建系以来最年轻的终身教授和讲席教授。
2008 年2月至今,受聘清华大学教授;2009年9月28日起,任清华大学生命科学学院院
长。获2010年赛克勒国际生物物理学奖。2013年4月当选美国艺术与科学院外籍院士、
美国科学院外籍院士。2013年12月19日,施一公当选中国科学院院士。2014年4月2日,
施一公获爱明诺夫奖,成为获此奖项的第一位中国人。该奖为国际知名奖项,由瑞典国
王亲自颁发。
p*****u
发帖数: 191
2
wo ding
D*a
发帖数: 6830
3
这篇写的倒挺实在的,没有“攻克阿尔兹海默氏症”。
w********h
发帖数: 12367
4
呵呵,人也得有点羞耻之心不是?

【在 D*a 的大作中提到】
: 这篇写的倒挺实在的,没有“攻克阿尔兹海默氏症”。
j******i
发帖数: 939
5
施一公的套路就是测完这个蛋白,接着换另一个蛋白测。所以,几乎可以肯定,他不会
继续深
究什么阿尔兹海默氏症,而是会换另外一个蛋白测,继续发NS, 然后开新闻发布会,‘
我的工作为理解/治疗xxxxx症提供了重要的线索'。
L********d
发帖数: 3820
6
摊子不能铺得太大吗,做结构就好好做结构

【在 j******i 的大作中提到】
: 施一公的套路就是测完这个蛋白,接着换另一个蛋白测。所以,几乎可以肯定,他不会
: 继续深
: 究什么阿尔兹海默氏症,而是会换另外一个蛋白测,继续发NS, 然后开新闻发布会,‘
: 我的工作为理解/治疗xxxxx症提供了重要的线索'。

g*****a
发帖数: 1112
7
老年痴呆症真的确定这个蛋白是病因了?我怎么印象中有争议
f******r
发帖数: 96
8
A-beta和Tau之争还在继续,不管怎么说,的确是重要的蛋白。
y***i
发帖数: 11639
9
家族病的不是这个complex有b变异就是app 也就是它的底物有变异。重要性是毋庸置
疑的。其实这个脢更重要的功能是Notch的剪切脢。

【在 g*****a 的大作中提到】
: 老年痴呆症真的确定这个蛋白是病因了?我怎么印象中有争议
y***i
发帖数: 11639
10
我觉得这个工作灭有他的细胞凋亡更重要啊。尤其是分辨率太低了,只有4.5A。大家怎
么看?

【在 s****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
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: 标 题: 震惊世界:海归院士施一公首揭老年痴呆症致病蛋白结构(图)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 4 12:33:21 2014, 美东)
: 施一公在发布会现场
: 今天上午,记者从清华大学获悉,著名结构生物学家、中科院院士、清华大学教授施一
: 公研究组在世界上首次揭示了阿尔茨海默症(俗称老年痴呆症)发病直接相关的人源γ
: 分泌酶复合物的精细三维结构,为理解γ分泌酶复合物的工作机制及阿尔茨海默症的发
: 病机理提供了重要线索。该成果于6月29日在英国《自然》杂志在线发表。
: 成果发布

相关主题
竟然到现在还没有人讨论syg的一周三灌不捧不撕不喷,请内行来评施一公的工作
MacKinnon 也开始用冰冻电镜了对话施一公及其团队
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f******r
发帖数: 96
11
冷冻电镜目前解析度不高,但是大势所趋。

怎么看?
v*******e
发帖数: 11604
12

你这是废话嘛。他当然专攻自己拿手的东西,难道叫他去做药、搞clinical trial?

【在 j******i 的大作中提到】
: 施一公的套路就是测完这个蛋白,接着换另一个蛋白测。所以,几乎可以肯定,他不会
: 继续深
: 究什么阿尔兹海默氏症,而是会换另外一个蛋白测,继续发NS, 然后开新闻发布会,‘
: 我的工作为理解/治疗xxxxx症提供了重要的线索'。

j******i
发帖数: 939
13
你以为他没在做药物,做临床啊(都临床二期了,效果未知)?他这么人精的人,哪里
会不知道做出一个药物来比解100结构,发100片CNS更有影响力,更能造福人类,更能
挣钱,有更好的仕途,也更能让所有质疑他的人服气。我个人对他没意见,科学家开个
发布会处处风头也是应该的。他现在能这么风光,更多不是因为他有科学做得多出色,
而是在中国鹤立鸡群,试想中国有十几个诺贝尔奖得主,他还能吸引这
么多的关注吗?他烧了那么多钱,发几个cns是最基本的吧。要不,他自己都不好意思
了。

【在 v*******e 的大作中提到】
:
: 你这是废话嘛。他当然专攻自己拿手的东西,难道叫他去做药、搞clinical trial?

a*********n
发帖数: 2526
14
这个发现把治愈老年痴呆的时间提前了100多年.

【在 s****n 的大作中提到】
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: 标 题: 震惊世界:海归院士施一公首揭老年痴呆症致病蛋白结构(图)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 4 12:33:21 2014, 美东)
: 施一公在发布会现场
: 今天上午,记者从清华大学获悉,著名结构生物学家、中科院院士、清华大学教授施一
: 公研究组在世界上首次揭示了阿尔茨海默症(俗称老年痴呆症)发病直接相关的人源γ
: 分泌酶复合物的精细三维结构,为理解γ分泌酶复合物的工作机制及阿尔茨海默症的发
: 病机理提供了重要线索。该成果于6月29日在英国《自然》杂志在线发表。
: 成果发布

f*******g
发帖数: 245
15
开玩笑吗?
现在这些已经背离科学原则的,有些近乎无耻的吹嘘风,到底是从哪里出来的?

【在 a*********n 的大作中提到】
: 这个发现把治愈老年痴呆的时间提前了100多年.
j******i
发帖数: 939
16
国内目前的科研氛围很浮躁,谈的都是钱,然后画画大饼,不奇怪。

【在 f*******g 的大作中提到】
: 开玩笑吗?
: 现在这些已经背离科学原则的,有些近乎无耻的吹嘘风,到底是从哪里出来的?

v*******e
发帖数: 11604
17

如果他没做,别人也会做出来。如果还没有人在做,也就提前一两年吧。如果正在有人
在做他们抢先做出来发表,那么也就提前几个月吧。

【在 a*********n 的大作中提到】
: 这个发现把治愈老年痴呆的时间提前了100多年.
w***u
发帖数: 17713
18
我有个很土的问题请教大家。一个蛋白,是其in vivo的三级结构四级结构有用,还是
结晶状态结构有用?怎么现在搞个结晶电镜图像就像中了大奖一样?
w******l
发帖数: 67
19
你的问题一点都不土!
有疑问么?当然是in vivo的结构最有用。
就像新合成一种药,虽然不能根治某病,但是可以延长病人的寿命/生活质量,这个药
就是在当前有效的。
晶体/电镜结构也一样,这个也需要问?

【在 w***u 的大作中提到】
: 我有个很土的问题请教大家。一个蛋白,是其in vivo的三级结构四级结构有用,还是
: 结晶状态结构有用?怎么现在搞个结晶电镜图像就像中了大奖一样?

j*******1
发帖数: 266
20
晶体/电镜结构与in vivo的结构一样吗?
让不一样,晶体/电镜结构有什么实际意义?
相关主题
关于NgAGO, 这样的讨论才是理性和有意思的2012 nobel chemistry prize-Koblika &lefkowitz
一公时代的到来zz可笑就是比什么impact factor
施一公到底做出过什么贡献呀?Watson 和 Crick 算得上生物学中的牛顿吗
w********h
发帖数: 12367
21
呵呵,不结晶怎么解结构?
DNA的结构不也是结晶状态下解的,没有意义么?

【在 j*******1 的大作中提到】
: 晶体/电镜结构与in vivo的结构一样吗?
: 让不一样,晶体/电镜结构有什么实际意义?

w******l
发帖数: 67
22
你的这个问题实在是太高深了,无法回答。。。

【在 j*******1 的大作中提到】
: 晶体/电镜结构与in vivo的结构一样吗?
: 让不一样,晶体/电镜结构有什么实际意义?

j*******1
发帖数: 266
23

了解DNA的结构的意义是要发现自然界的秘密,至此而已。而发现蛋白质的意义是有根
据活性集团发展新药物,如结晶状态状态下与IN VIVO 不同,那么只会使发展新药物走
弯路。

【在 w********h 的大作中提到】
: 呵呵,不结晶怎么解结构?
: DNA的结构不也是结晶状态下解的,没有意义么?

x********e
发帖数: 35261
24
DNA结构只揭示了基因的初级结构,核小体,染色体等高级结构是用其他方式了解的。双
螺旋对于基因转录调控等方面没任何指导。
蛋白质in vivo folding是一个dynamic的过程。解结晶结构只揭示folding的一个state
,对于蛋白在体内的结构和功能,指示性也很有限。
话说protein做NMR的多么

【在 w********h 的大作中提到】
: 呵呵,不结晶怎么解结构?
: DNA的结构不也是结晶状态下解的,没有意义么?

w******l
发帖数: 67
25
都说了,这就是当前能得到的最接近in vivo结构的方法。
真无法理解你们都是在纠结什么。。。

。双
state

【在 x********e 的大作中提到】
: DNA结构只揭示了基因的初级结构,核小体,染色体等高级结构是用其他方式了解的。双
: 螺旋对于基因转录调控等方面没任何指导。
: 蛋白质in vivo folding是一个dynamic的过程。解结晶结构只揭示folding的一个state
: ,对于蛋白在体内的结构和功能,指示性也很有限。
: 话说protein做NMR的多么

e****y
发帖数: 129
26
简单说吧,结构对做新药,尤其是discovery阶段的candidate非常有用,做药的都希望
有尽量多的结构信息。但结构即不是必要条件也不是充分条件。至于离最后做出新药还
有十万八千里。说什么解出结构就看到新药的曙光,征服什么什么疾病,那是纯粹胡扯。
就结构本身,当然in vivo的结构是最有用,但是目前没有有效的手段得到对做新药有
用的结构。那么解晶体还是目前最有效的也是最成功的手段。所以一说到解结构,那么
大家首先默认的就是X光衍射解晶体。至于晶体状态和in vivo状态下结构的差异,确实
是个conern,但是在很多晶体结构还渴望不可及的情况下,基本上还不需要太concern
这个问题。其他手段也有NMR,包括这个电镜,有不错的例子,也有他们的优势,但总
体上和晶体结构提供的information差远了。至于这个4.5A的电镜结构,对做药基本上
没用。

【在 j*******1 的大作中提到】
:
: 了解DNA的结构的意义是要发现自然界的秘密,至此而已。而发现蛋白质的意义是有根
: 据活性集团发展新药物,如结晶状态状态下与IN VIVO 不同,那么只会使发展新药物走
: 弯路。

f*******g
发帖数: 245
27
下弦月说的太好了,我挺你。

。双
state

【在 x********e 的大作中提到】
: DNA结构只揭示了基因的初级结构,核小体,染色体等高级结构是用其他方式了解的。双
: 螺旋对于基因转录调控等方面没任何指导。
: 蛋白质in vivo folding是一个dynamic的过程。解结晶结构只揭示folding的一个state
: ,对于蛋白在体内的结构和功能,指示性也很有限。
: 话说protein做NMR的多么

w******l
发帖数: 67
28
他说的再好能改变晶体/电镜结构是目前能达到最接近in vivo结构的事实么?
还你挺他。。。

【在 f*******g 的大作中提到】
: 下弦月说的太好了,我挺你。
:
: 。双
: state

f*******g
发帖数: 245
29
俺看她(?)说的很高深,先挺一挺。

【在 w******l 的大作中提到】
: 他说的再好能改变晶体/电镜结构是目前能达到最接近in vivo结构的事实么?
: 还你挺他。。。

x********e
发帖数: 35261
30
现在有做optical tweezer研究dynamic folding的
觉得RNA结构做得比蛋白结构好。不过蛋白稳定性差,是不好做

【在 w******l 的大作中提到】
: 都说了,这就是当前能得到的最接近in vivo结构的方法。
: 真无法理解你们都是在纠结什么。。。
:
: 。双
: state

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拍卖Crick诺贝尔奖牌施一公:这是我科学生涯里最耀眼的成果
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跟风请帮忙解读11公γ-分泌酶复合物的意义腰斩王晓东施一公晶体信号学科是必然的
x********e
发帖数: 35261
31
现在蛋白结构研究的问题主要是静态。研究静态结构用处不大。不管是RNA还是protein
,没有kinetics都是扯淡。
特别是像阿兹海默这种研究misfolding和peptide aggregation的,解个晶体结构能说明
什么呢?蛋白酶晶体结构倒是用处很大。

【在 w******l 的大作中提到】
: 他说的再好能改变晶体/电镜结构是目前能达到最接近in vivo结构的事实么?
: 还你挺他。。。

w******l
发帖数: 67
32
那好吧,既然mm(?)你都说用处不大了,那就是用处不大了。
我也挺你!

protein
说明

【在 x********e 的大作中提到】
: 现在蛋白结构研究的问题主要是静态。研究静态结构用处不大。不管是RNA还是protein
: ,没有kinetics都是扯淡。
: 特别是像阿兹海默这种研究misfolding和peptide aggregation的,解个晶体结构能说明
: 什么呢?蛋白酶晶体结构倒是用处很大。

b******k
发帖数: 2321
33
你这是典型的回帖不看帖 11g解的难道不是蛋白酶?

protein
说明

【在 x********e 的大作中提到】
: 现在蛋白结构研究的问题主要是静态。研究静态结构用处不大。不管是RNA还是protein
: ,没有kinetics都是扯淡。
: 特别是像阿兹海默这种研究misfolding和peptide aggregation的,解个晶体结构能说明
: 什么呢?蛋白酶晶体结构倒是用处很大。

y***i
发帖数: 11639
34
太扯了。你这好比说发动机的结构图用处不大,因为还没有发动机动起来的图。
事实上发动机的结构图已经有了它在动态情况下的绝大部分 ---99%以上的信息。

protein
说明

【在 x********e 的大作中提到】
: 现在蛋白结构研究的问题主要是静态。研究静态结构用处不大。不管是RNA还是protein
: ,没有kinetics都是扯淡。
: 特别是像阿兹海默这种研究misfolding和peptide aggregation的,解个晶体结构能说明
: 什么呢?蛋白酶晶体结构倒是用处很大。

x********e
发帖数: 35261
35
我回帖没说是11g的工作啊
就是感觉整体蛋白结构这块缺少folding kinetics的研究

【在 b******k 的大作中提到】
: 你这是典型的回帖不看帖 11g解的难道不是蛋白酶?
:
: protein
: 说明

x********e
发帖数: 35261
36
我不觉得蛋白和RNA结构可以类比成发动机
发动机造好了就不会散架,可生物大分子是处于一种非常不稳定的动态平衡。温度,盐
浓度,chaperones,crowding factors,都会影响kinetics

【在 y***i 的大作中提到】
: 太扯了。你这好比说发动机的结构图用处不大,因为还没有发动机动起来的图。
: 事实上发动机的结构图已经有了它在动态情况下的绝大部分 ---99%以上的信息。
:
: protein
: 说明

y***i
发帖数: 11639
37
一个蛋白结构就那么几个大domain,动态情况下,只会有少量变化,而不会整个
domain折叠变化,更不可能这个蛋白质有大的折叠变化,所以拿一个静态结构就能猜想
出很多动态信息了。无数结构都是这么做的:得到一个结构,根据这个结构去猜想那些
是重要的氨基酸,动态情况下结构可能做什么变化,然后做几个mutation验证猜想。
我觉得你是没看过什么结构文章,在瞎猜,而且猜错了。

【在 x********e 的大作中提到】
: 我回帖没说是11g的工作啊
: 就是感觉整体蛋白结构这块缺少folding kinetics的研究

x********e
发帖数: 35261
38
有专家大牛出来说说protein NMR吗?
有没有可能在溶液中解蛋白结构?

扯。
concern

【在 e****y 的大作中提到】
: 简单说吧,结构对做新药,尤其是discovery阶段的candidate非常有用,做药的都希望
: 有尽量多的结构信息。但结构即不是必要条件也不是充分条件。至于离最后做出新药还
: 有十万八千里。说什么解出结构就看到新药的曙光,征服什么什么疾病,那是纯粹胡扯。
: 就结构本身,当然in vivo的结构是最有用,但是目前没有有效的手段得到对做新药有
: 用的结构。那么解晶体还是目前最有效的也是最成功的手段。所以一说到解结构,那么
: 大家首先默认的就是X光衍射解晶体。至于晶体状态和in vivo状态下结构的差异,确实
: 是个conern,但是在很多晶体结构还渴望不可及的情况下,基本上还不需要太concern
: 这个问题。其他手段也有NMR,包括这个电镜,有不错的例子,也有他们的优势,但总
: 体上和晶体结构提供的information差远了。至于这个4.5A的电镜结构,对做药基本上
: 没用。

x********e
发帖数: 35261
39
我对晶体结构没什么了解。知道点用optical tweezer做动态peptide folding的,觉得
protein folding并不是之前想象的那么简单。

【在 y***i 的大作中提到】
: 一个蛋白结构就那么几个大domain,动态情况下,只会有少量变化,而不会整个
: domain折叠变化,更不可能这个蛋白质有大的折叠变化,所以拿一个静态结构就能猜想
: 出很多动态信息了。无数结构都是这么做的:得到一个结构,根据这个结构去猜想那些
: 是重要的氨基酸,动态情况下结构可能做什么变化,然后做几个mutation验证猜想。
: 我觉得你是没看过什么结构文章,在瞎猜,而且猜错了。

s******s
发帖数: 13035
40
你这是何不食肉糜。有静态结构比没有强100倍

protein
说明

【在 x********e 的大作中提到】
: 现在蛋白结构研究的问题主要是静态。研究静态结构用处不大。不管是RNA还是protein
: ,没有kinetics都是扯淡。
: 特别是像阿兹海默这种研究misfolding和peptide aggregation的,解个晶体结构能说明
: 什么呢?蛋白酶晶体结构倒是用处很大。

相关主题
腰斩王晓东施一公晶体信号学科是必然的MacKinnon 也开始用冰冻电镜了
Nature上刚online的一个牛逼的结构如何在没有抗体的情况下快速CONFIRM CRISPR KO
竟然到现在还没有人讨论syg的一周三灌不捧不撕不喷,请内行来评施一公的工作
y***i
发帖数: 11639
41
你这是本科生化实验的结论。真正有价值的酶的动态,几乎必然是静态下的微小变
化。本科实验那种煮一煮加高盐,和生理状态的动态变化一点关系都没有。

【在 x********e 的大作中提到】
: 我不觉得蛋白和RNA结构可以类比成发动机
: 发动机造好了就不会散架,可生物大分子是处于一种非常不稳定的动态平衡。温度,盐
: 浓度,chaperones,crowding factors,都会影响kinetics

f*******g
发帖数: 245
42
俺还是挺下玄月同学的观点。 动态结构才是真的结构,静态结构可能与功能相差十万
八千里。
比如DNA的双螺旋,这个狗屁结构除了画在图书上好看点,真是一点功能没涉及。
x********e
发帖数: 35261
43
我没说解晶体结构不好啊,我只是提出我觉得未来应该突破的方向

【在 s******s 的大作中提到】
: 你这是何不食肉糜。有静态结构比没有强100倍
:
: protein
: 说明

y***i
发帖数: 11639
44
我猜想你说的是整个蛋白怎么折叠成functional结构。但这个问题其实价值不大。有
价值的动态结构是:比如酶结合底物和不结合底物的对比,马达蛋白不同步骤时候的对
比。。。这些变化,就我所知,基本都是domain之间的相对位置变化,不会有一个大
domain整个辩了。就象汽车装客人的时候,是车门开关的变化,不会整个车架子卸开再
装人。

猜想
那些

【在 x********e 的大作中提到】
: 我对晶体结构没什么了解。知道点用optical tweezer做动态peptide folding的,觉得
: protein folding并不是之前想象的那么简单。

x********e
发帖数: 35261
45
很多蛋白不光是水解个ATP就完了的事
比如说V-SNARE和t-SNARE怎么互相识别dimerize的,motor protein怎么就在水解ATP后
发生构象改变了,光解个kinase domain解决不了问题。还有些intrinsic disordered
protein或者protein domain,根本无法用静态结构去理解。比如核孔蛋白含的FG doma
in。

【在 y***i 的大作中提到】
: 我猜想你说的是整个蛋白怎么折叠成functional结构。但这个问题其实价值不大。有
: 价值的动态结构是:比如酶结合底物和不结合底物的对比,马达蛋白不同步骤时候的对
: 比。。。这些变化,就我所知,基本都是domain之间的相对位置变化,不会有一个大
: domain整个辩了。就象汽车装客人的时候,是车门开关的变化,不会整个车架子卸开再
: 装人。
:
: 猜想
: 那些

x********e
发帖数: 35261
46
说得那么轻松,就说马达蛋白吧
dynein/dynactin的部分结构很早就用电镜看到了,到现在50年肯定有了,还是那个样子

【在 y***i 的大作中提到】
: 我猜想你说的是整个蛋白怎么折叠成functional结构。但这个问题其实价值不大。有
: 价值的动态结构是:比如酶结合底物和不结合底物的对比,马达蛋白不同步骤时候的对
: 比。。。这些变化,就我所知,基本都是domain之间的相对位置变化,不会有一个大
: domain整个辩了。就象汽车装客人的时候,是车门开关的变化,不会整个车架子卸开再
: 装人。
:
: 猜想
: 那些

t******n
发帖数: 138
47
DNA的双螺旋结构是它的功能的最好注释吧?

【在 f*******g 的大作中提到】
: 俺还是挺下玄月同学的观点。 动态结构才是真的结构,静态结构可能与功能相差十万
: 八千里。
: 比如DNA的双螺旋,这个狗屁结构除了画在图书上好看点,真是一点功能没涉及。

b******k
发帖数: 2321
48
motor protein从我一个外行看来已经了解的够清楚了 剩下的问题是细枝末节而已 当然
也许你是内行 可以谈谈motor protein的机理还有啥特别核心的部分不知道

样子

【在 x********e 的大作中提到】
: 说得那么轻松,就说马达蛋白吧
: dynein/dynactin的部分结构很早就用电镜看到了,到现在50年肯定有了,还是那个样子

x********e
发帖数: 35261
49
kinesin和myosin好像挺轻松的,dynein的貌似特别难。我就半罐子水,算不上内行,不
过某个当年解了dynein结构的教授在系里,每次听他讲都觉得痛苦

当然

【在 b******k 的大作中提到】
: motor protein从我一个外行看来已经了解的够清楚了 剩下的问题是细枝末节而已 当然
: 也许你是内行 可以谈谈motor protein的机理还有啥特别核心的部分不知道
:
: 样子

y***i
发帖数: 11639
50
是啊,解释了 1.碱基配对 2. DNA的半保留复制是怎么回事 3. 细胞分裂时怎么保证
DNA信息精确复制。
把DNA所有最基本的最重要的功能都解释了。历史上最震撼人心的精致,简洁又完美
的结果。什么叫一点功能没涉及。生化没学好啊。

十万

【在 t******n 的大作中提到】
: DNA的双螺旋结构是它的功能的最好注释吧?
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对话施一公及其团队一公时代的到来zz
李克强与施一公有关“大脑”的深入对话施一公到底做出过什么贡献呀?
关于NgAGO, 这样的讨论才是理性和有意思的2012 nobel chemistry prize-Koblika &lefkowitz
w******l
发帖数: 67
51
所以,mm,我必须得挺你!
都没什么了解也能下结论!
挺你一万年!

【在 x********e 的大作中提到】
: 我对晶体结构没什么了解。知道点用optical tweezer做动态peptide folding的,觉得
: protein folding并不是之前想象的那么简单。

t******n
发帖数: 138
52
那模拟对peptide folding的解释可信吗?

【在 x********e 的大作中提到】
: 我对晶体结构没什么了解。知道点用optical tweezer做动态peptide folding的,觉得
: protein folding并不是之前想象的那么简单。

x********e
发帖数: 35261
53
我没说DNA双链没涉及一点功能啊
我说的是没有揭示染色体高级结构,对基因转录调控方面没什么暗示

【在 y***i 的大作中提到】
: 是啊,解释了 1.碱基配对 2. DNA的半保留复制是怎么回事 3. 细胞分裂时怎么保证
: DNA信息精确复制。
: 把DNA所有最基本的最重要的功能都解释了。历史上最震撼人心的精致,简洁又完美
: 的结果。什么叫一点功能没涉及。生化没学好啊。
:
: 十万

x********e
发帖数: 35261
54
optical tweezer不是模拟

【在 t******n 的大作中提到】
: 那模拟对peptide folding的解释可信吗?
t******n
发帖数: 138
55
哈哈,这个我知道,就是想问问做实验的对模拟结果有什么看法。

【在 x********e 的大作中提到】
: optical tweezer不是模拟
f*******g
发帖数: 245
56
你该好好看看那半篇paper,涉及个屁。
玩结构就玩结构,结构和生化还离得远。
你说的这几个,都不是那个双螺旋结构解决的。

【在 y***i 的大作中提到】
: 是啊,解释了 1.碱基配对 2. DNA的半保留复制是怎么回事 3. 细胞分裂时怎么保证
: DNA信息精确复制。
: 把DNA所有最基本的最重要的功能都解释了。历史上最震撼人心的精致,简洁又完美
: 的结果。什么叫一点功能没涉及。生化没学好啊。
:
: 十万

a********k
发帖数: 2273
57
谨慎同意,我当年看那小文章的时候也这么想。不晓得现在有闲工夫看一遍的话是不是
有不同的感受

【在 f*******g 的大作中提到】
: 你该好好看看那半篇paper,涉及个屁。
: 玩结构就玩结构,结构和生化还离得远。
: 你说的这几个,都不是那个双螺旋结构解决的。

x********e
发帖数: 35261
58
我自己不做结构,只是经常去听听生物物理系的讲座,了解一下不同的领域
专业问题回答不上来

【在 t******n 的大作中提到】
: 哈哈,这个我知道,就是想问问做实验的对模拟结果有什么看法。
t******n
发帖数: 138
59
不好意思,我不是学生物出身,麻烦你解释一下没有双螺旋结构为基础,这些问题是怎
么解决的?

保证
完美

【在 f*******g 的大作中提到】
: 你该好好看看那半篇paper,涉及个屁。
: 玩结构就玩结构,结构和生化还离得远。
: 你说的这几个,都不是那个双螺旋结构解决的。

x********e
发帖数: 35261
60
1.碱基配对:DNA中(A+T):(C+G)永远是1:1
2.噬菌体碱基同位素标记

【在 t******n 的大作中提到】
: 不好意思,我不是学生物出身,麻烦你解释一下没有双螺旋结构为基础,这些问题是怎
: 么解决的?
:
: 保证
: 完美

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s**a
发帖数: 2138
61
2 是什么意思?

【在 x********e 的大作中提到】
: 1.碱基配对:DNA中(A+T):(C+G)永远是1:1
: 2.噬菌体碱基同位素标记

y***i
发帖数: 11639
62
你说的是两个现象,这个两个现象的机理被双螺旋解释。
DNA中(A+T):(C+G)永远是1:1 的现象在这以前就被发现了,但为什么?没人知道。直
到双螺旋告诉你 A和T配对,C和G配对。
同样,在双螺旋被发现之前,人们不能理解为什么有半保留现象。双螺旋完美解释。
然后双螺旋加碱基配对,自然解释基因精密复制遗传的机理。

是怎

【在 x********e 的大作中提到】
: 1.碱基配对:DNA中(A+T):(C+G)永远是1:1
: 2.噬菌体碱基同位素标记

f*******g
发帖数: 245
63
Chargaff law, in any species, A=T, C=G, the complimentary law.

【在 x********e 的大作中提到】
: 1.碱基配对:DNA中(A+T):(C+G)永远是1:1
: 2.噬菌体碱基同位素标记

w**********k
发帖数: 386
64
90年代的时候,由于软盘容量小,放不了avi, 拿到一些QPEG 就可以撸好几天。

【在 j*******1 的大作中提到】
: 晶体/电镜结构与in vivo的结构一样吗?
: 让不一样,晶体/电镜结构有什么实际意义?

x********e
发帖数: 35261
65
双螺旋结构哪里揭示了半保留复制?在不知道分子机制前孟德尔等人早就用其他方式总
结出了遗传的基本原理。原理一直在那里,只能说双螺旋解释了为什么是这样的原理。

【在 y***i 的大作中提到】
: 你说的是两个现象,这个两个现象的机理被双螺旋解释。
: DNA中(A+T):(C+G)永远是1:1 的现象在这以前就被发现了,但为什么?没人知道。直
: 到双螺旋告诉你 A和T配对,C和G配对。
: 同样,在双螺旋被发现之前,人们不能理解为什么有半保留现象。双螺旋完美解释。
: 然后双螺旋加碱基配对,自然解释基因精密复制遗传的机理。
:
: 是怎

y***i
发帖数: 11639
66
这就是我说的。双螺旋--解--释--了这3个现象的机理。

。直
释。

【在 x********e 的大作中提到】
: 双螺旋结构哪里揭示了半保留复制?在不知道分子机制前孟德尔等人早就用其他方式总
: 结出了遗传的基本原理。原理一直在那里,只能说双螺旋解释了为什么是这样的原理。

D*******D
发帖数: 100
67
问个土问题,我在一直不了解,解结构这个越来越接近工业化生产的工作,为什么不像
有些lab 一样去成立一个公司专门做产品卖给别人(如做转基因老鼠的),利人利己,
而不是在这里抢占研究资源?为什么还十年如一日的发NS?
a*********n
发帖数: 2526
68
麦当劳快餐模式 对 中餐馆老师傅模式 呵呵

【在 D*******D 的大作中提到】
: 问个土问题,我在一直不了解,解结构这个越来越接近工业化生产的工作,为什么不像
: 有些lab 一样去成立一个公司专门做产品卖给别人(如做转基因老鼠的),利人利己,
: 而不是在这里抢占研究资源?为什么还十年如一日的发NS?

b****s
发帖数: 872
69
要能产业化,肯定早做了。这种结构,估计卖不出去。
产业化最起码得有需求,离应用近,人家肯出钱买。

【在 D*******D 的大作中提到】
: 问个土问题,我在一直不了解,解结构这个越来越接近工业化生产的工作,为什么不像
: 有些lab 一样去成立一个公司专门做产品卖给别人(如做转基因老鼠的),利人利己,
: 而不是在这里抢占研究资源?为什么还十年如一日的发NS?

s******y
发帖数: 17729
70
双螺旋这个还算好的了
有一小错人在研究的东西更扯犊子,好像是用啥nono技术,基于原子里的显微结构观察
DNA结构,观测这些结构真的是让人无语

【在 f*******g 的大作中提到】
: 俺还是挺下玄月同学的观点。 动态结构才是真的结构,静态结构可能与功能相差十万
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: 比如DNA的双螺旋,这个狗屁结构除了画在图书上好看点,真是一点功能没涉及。

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x********e
发帖数: 35261
71
另外,我觉得晶体结构有时候是有误导,或者说片面的。就说双螺旋吧,只有在原核生
物里是线性的。在真核生物in vivo的情况下,大部分时候DNA都是有histone
chaperone包裹着。双螺旋反应不了高级结构

【在 y***i 的大作中提到】
: 这就是我说的。双螺旋--解--释--了这3个现象的机理。
:
: 。直
: 释。

x********e
发帖数: 35261
72
那个拉曼什么?

【在 s******y 的大作中提到】
: 双螺旋这个还算好的了
: 有一小错人在研究的东西更扯犊子,好像是用啥nono技术,基于原子里的显微结构观察
: DNA结构,观测这些结构真的是让人无语

s******y
发帖数: 17729
73
AFM观测DNA单分子结构
不懂结构,偶尔听听报告而已,感觉他们蛋扯的没边的感觉

【在 x********e 的大作中提到】
: 那个拉曼什么?
b****s
发帖数: 872
74
盲人摸象的不同摸法。有人喜欢摸象的汗毛,你说这不叫摸,他们会不高兴的

【在 x********e 的大作中提到】
: 另外,我觉得晶体结构有时候是有误导,或者说片面的。就说双螺旋吧,只有在原核生
: 物里是线性的。在真核生物in vivo的情况下,大部分时候DNA都是有histone
: chaperone包裹着。双螺旋反应不了高级结构

y***i
发帖数: 11639
75
。。。。。我说了这么半天,你还没明白?双螺旋结构对DNA的机制的揭示,绝对震古
烁今,说是生物学历史上最伟大的工作都不为过。在那之前,人们只是知道生物有遗传
信息的现象,而双螺旋让人们真正明白机理是什么。其机制的简洁,优美,让人震惊。
而你说的东西,比双螺旋结构揭示的知识,鸡毛蒜皮而已。
这些话根本不该在这里说,因为是学生物的都该知道,怎么还有好几个人能顶着生物
的tittle在这里自作聪明。。。。。

【在 x********e 的大作中提到】
: 另外,我觉得晶体结构有时候是有误导,或者说片面的。就说双螺旋吧,只有在原核生
: 物里是线性的。在真核生物in vivo的情况下,大部分时候DNA都是有histone
: chaperone包裹着。双螺旋反应不了高级结构

x********e
发帖数: 35261
76
AFM还可以这样用?我只知道从细胞层面上用AFM看表面结构

【在 s******y 的大作中提到】
: AFM观测DNA单分子结构
: 不懂结构,偶尔听听报告而已,感觉他们蛋扯的没边的感觉

x********e
发帖数: 35261
77
我都说是片面了。说不叫摸的是你吧。
你作为搞结构的,能不能简单介绍一下结构生物学研究技术方面的进展呢?我感觉从富
兰克林时代就开始用X光衍射到现在还是用同样的技术。还有结晶技术方面,有什么突
破性进展吗?

【在 b****s 的大作中提到】
: 盲人摸象的不同摸法。有人喜欢摸象的汗毛,你说这不叫摸,他们会不高兴的
b**z
发帖数: 1351
78
施一公在NATURE发表的科研故事作为一个系列,精彩度和价值已经超越莫言的小说
希望施一公早日获得诺贝尔奖
照这样的速度下去,感觉他已经很近很近
我不熟悉、也不清楚蛋白结构领域,究竟啥样的成果是诺贝尔奖级别
但就最近2年的生理学奖的几个获奖人,感觉也就是搞出了些RNA啥的结构啊

【在 s****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: sautin (老将萨乌丁), 信区: Military
: 标 题: 震惊世界:海归院士施一公首揭老年痴呆症致病蛋白结构(图)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 4 12:33:21 2014, 美东)
: 施一公在发布会现场
: 今天上午,记者从清华大学获悉,著名结构生物学家、中科院院士、清华大学教授施一
: 公研究组在世界上首次揭示了阿尔茨海默症(俗称老年痴呆症)发病直接相关的人源γ
: 分泌酶复合物的精细三维结构,为理解γ分泌酶复合物的工作机制及阿尔茨海默症的发
: 病机理提供了重要线索。该成果于6月29日在英国《自然》杂志在线发表。
: 成果发布

D*******D
发帖数: 100
79

我的想法比如: 像有的公司需要做莫些药,那么相联系的靶点,蛋白的结构的case发
给yg他们,然后他们定向去解,从中盈利。

【在 b****s 的大作中提到】
: 要能产业化,肯定早做了。这种结构,估计卖不出去。
: 产业化最起码得有需求,离应用近,人家肯出钱买。

D*******D
发帖数: 100
80

其实现在都有川菜学校的了,真真有什么是像千年传承的技艺不外传的?很少了吧?

【在 a*********n 的大作中提到】
: 麦当劳快餐模式 对 中餐馆老师傅模式 呵呵
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如何在没有抗体的情况下快速CONFIRM CRISPR KO李克强与施一公有关“大脑”的深入对话
不捧不撕不喷,请内行来评施一公的工作关于NgAGO, 这样的讨论才是理性和有意思的
对话施一公及其团队一公时代的到来zz
b****s
发帖数: 872
81
有没有靶点,大概不需要非常细致的蛋白结构。

【在 D*******D 的大作中提到】
:
: 其实现在都有川菜学校的了,真真有什么是像千年传承的技艺不外传的?很少了吧?

h*****4
发帖数: 1158
82
看馒头有意思么?
w******l
发帖数: 67
83
你还说干啥呀,顶她就好了。。。

【在 y***i 的大作中提到】
: 。。。。。我说了这么半天,你还没明白?双螺旋结构对DNA的机制的揭示,绝对震古
: 烁今,说是生物学历史上最伟大的工作都不为过。在那之前,人们只是知道生物有遗传
: 信息的现象,而双螺旋让人们真正明白机理是什么。其机制的简洁,优美,让人震惊。
: 而你说的东西,比双螺旋结构揭示的知识,鸡毛蒜皮而已。
: 这些话根本不该在这里说,因为是学生物的都该知道,怎么还有好几个人能顶着生物
: 的tittle在这里自作聪明。。。。。

x********e
发帖数: 35261
84
哈哈 我也想吐槽这个来着

【在 h*****4 的大作中提到】
: 看馒头有意思么?
I*M
发帖数: 937
85
nmr也没法看kinetics吧,最多是dynamics。小蛋白没有问题。
optical tweezer怎么看结构?没有结构怎么解释optical tweezer的结果?
afm倒是能又看结构又做kinetics,可惜两个方向的精度都太差。

protein
说明

【在 x********e 的大作中提到】
: 现在蛋白结构研究的问题主要是静态。研究静态结构用处不大。不管是RNA还是protein
: ,没有kinetics都是扯淡。
: 特别是像阿兹海默这种研究misfolding和peptide aggregation的,解个晶体结构能说明
: 什么呢?蛋白酶晶体结构倒是用处很大。

x********e
发帖数: 35261
86
看folding的kinetics,可以分清有多少个intermediate states, 跟做RNA结构有点类似

【在 I*M 的大作中提到】
: nmr也没法看kinetics吧,最多是dynamics。小蛋白没有问题。
: optical tweezer怎么看结构?没有结构怎么解释optical tweezer的结果?
: afm倒是能又看结构又做kinetics,可惜两个方向的精度都太差。
:
: protein
: 说明

f*******g
发帖数: 245
87
解释个屁。就那模模湖糊的一团,连碱基对都不知道谁是谁,没有前面的功能性研究,
这结构屁都不是。

【在 y***i 的大作中提到】
: 。。。。。我说了这么半天,你还没明白?双螺旋结构对DNA的机制的揭示,绝对震古
: 烁今,说是生物学历史上最伟大的工作都不为过。在那之前,人们只是知道生物有遗传
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: 这些话根本不该在这里说,因为是学生物的都该知道,怎么还有好几个人能顶着生物
: 的tittle在这里自作聪明。。。。。

x********e
发帖数: 35261
88
话说那个时候没有计算机,怎么从衍射图谱反推出晶体结构啊?

【在 f*******g 的大作中提到】
: 解释个屁。就那模模湖糊的一团,连碱基对都不知道谁是谁,没有前面的功能性研究,
: 这结构屁都不是。

f*******g
发帖数: 245
89
不知道呢,那(咱们大家)猜猜看?

【在 x********e 的大作中提到】
: 话说那个时候没有计算机,怎么从衍射图谱反推出晶体结构啊?
X****7
发帖数: 27
90
好吧,我来给大家科普一下。gamma secreatase的抑制剂早就有了。各大制药公司都有
,以Eli Lilly, Merck, BMS 为主,都有上二期到三期临床。这个药的问题在于付作用
,正如前面有人提到,gamma secreatase 也是notch 的剪切酶。notch 对身体里正常
干细胞的更新至关重要。要避开notch 的抑制只影响APP的剪切还做不到。所以发现
gamma secreatase 的结构当然会有些帮助,但决不能说明Alzheimer's 就可以有办法
治疗了。如果下一步能发现剪切APP 和剪切notch 的不同之处,倒会是一个了不起的发
现。
这个结构的困难在于是个多分子的大型膜蛋白。能解到这程度算不错的。这是主要成就。

【在 s****n 的大作中提到】
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X****7
发帖数: 27
91
好吧,我来给大家科普一下。gamma secreatase的抑制剂早就有了。各大制药公司都有
,以Eli Lilly, Merck, BMS 为主,都有上二期到三期临床。这个药的问题在于付作用
,正如前面有人提到,gamma secreatase 也是notch 的剪切酶。notch 对身体里正常
干细胞的更新至关重要。要避开notch 的抑制只影响APP的剪切还做不到。所以发现
gamma secreatase 的结构当然会有些帮助,但决不能说明Alzheimer's 就可以有办法
治疗了。如果下一步能发现剪切APP 和剪切notch 的不同之处,倒会是一个了不起的发
现。
这个结构的困难在于是个多分子的大型膜蛋白。能解到这程度算不错的。这是主要成就。

【在 s****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
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s******3
发帖数: 28
92
我觉得楼里有些人根本没做过结构哪怕相关的工作,纯粹看看百科全书或者全凭臆测。
。。就我一个做过浅显的相关工作的来看,11公的工作毫无道理,膜蛋白牵涉到的物化
因素太过复杂。不过这个意义尚待验证,毕竟大家都没有好办法,兴趣这是一个可行的
方法
w******l
发帖数: 67
93
深有同感啊,所以只能顶她们了。。

【在 s******3 的大作中提到】
: 我觉得楼里有些人根本没做过结构哪怕相关的工作,纯粹看看百科全书或者全凭臆测。
: 。。就我一个做过浅显的相关工作的来看,11公的工作毫无道理,膜蛋白牵涉到的物化
: 因素太过复杂。不过这个意义尚待验证,毕竟大家都没有好办法,兴趣这是一个可行的
: 方法

x********e
发帖数: 35261
94
你们专家也不科普一下

【在 w******l 的大作中提到】
: 深有同感啊,所以只能顶她们了。。
s******3
发帖数: 28
95

感觉你藏了个大雕在怀里
有什么说出来又不会死

【在 w******l 的大作中提到】
: 深有同感啊,所以只能顶她们了。。
x********e
发帖数: 35261
96
我觉得手算还是可行的
nb的突破性成就都诞生在手算阶段啊,人原子弹都是靠手算出来的

【在 f*******g 的大作中提到】
: 不知道呢,那(咱们大家)猜猜看?
E******g
发帖数: 170
97
没做过结构都敢在楼里瞎评论~可见在自己得领域里更加不可一世。没有肚量,只剩下
点痞子气。

【在 x********e 的大作中提到】
: 我觉得手算还是可行的
: nb的突破性成就都诞生在手算阶段啊,人原子弹都是靠手算出来的

w****6
发帖数: 169
98
汗。做过了相关工作的还说一公的工作毫无道理?虽然有局限,但也不能说毫无道理吧。

【在 s******3 的大作中提到】
: 我觉得楼里有些人根本没做过结构哪怕相关的工作,纯粹看看百科全书或者全凭臆测。
: 。。就我一个做过浅显的相关工作的来看,11公的工作毫无道理,膜蛋白牵涉到的物化
: 因素太过复杂。不过这个意义尚待验证,毕竟大家都没有好办法,兴趣这是一个可行的
: 方法

x********e
发帖数: 35261
99
就事论事,不要在这里瞎扯。我都是举例用事实证明我的观点的。你觉得我哪点说的不
对就直接指出来,顺带帮大家科普一下。我早就说了,请各位做结构的大牛聊聊晶体结
构近几十年有什么技术上的突破,是不是已经确定结晶和in vivo坏境下结构都一样,
如果不是,将来会从哪个方向上去解决这个问题。你既然是领域内的,能不能回答一下?

【在 E******g 的大作中提到】
: 没做过结构都敢在楼里瞎评论~可见在自己得领域里更加不可一世。没有肚量,只剩下
: 点痞子气。

x********e
发帖数: 35261
100
才发现我说错了。。。应该是A=T C =G

【在 f*******g 的大作中提到】
: Chargaff law, in any species, A=T, C=G, the complimentary law.
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跟风请帮忙解读11公γ-分泌酶复合物的意义腰斩王晓东施一公晶体信号学科是必然的
施一公:这是我科学生涯里最耀眼的成果Nature上刚online的一个牛逼的结构
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P*A
发帖数: 7996
101
这两个现象也可以被平面梯子的DNA结构完美解释
就算人类到现在也没法证实DNA到底是平面的还是双螺旋结构,生化遗传免疫哪一方面
会因为没有这个晶体结构的发现而无法进步?
结构就是个屁

【在 y***i 的大作中提到】
: 。。。。。我说了这么半天,你还没明白?双螺旋结构对DNA的机制的揭示,绝对震古
: 烁今,说是生物学历史上最伟大的工作都不为过。在那之前,人们只是知道生物有遗传
: 信息的现象,而双螺旋让人们真正明白机理是什么。其机制的简洁,优美,让人震惊。
: 而你说的东西,比双螺旋结构揭示的知识,鸡毛蒜皮而已。
: 这些话根本不该在这里说,因为是学生物的都该知道,怎么还有好几个人能顶着生物
: 的tittle在这里自作聪明。。。。。

y***i
发帖数: 11639
102


。直
释。

【在 P*A 的大作中提到】
: 这两个现象也可以被平面梯子的DNA结构完美解释
: 就算人类到现在也没法证实DNA到底是平面的还是双螺旋结构,生化遗传免疫哪一方面
: 会因为没有这个晶体结构的发现而无法进步?
: 结构就是个屁

O******e
发帖数: 4845
103
对于连DNA双螺旋的重要性都认识不到的人,你就别浪费精神去招呼了。不值得。

【在 y***i 的大作中提到】
: 靠
:
: 。直
: 释。

w********h
发帖数: 12367
104
hehe...前面看了这么多作生物的人否定dna结构的重要性,
我还以为风向变了呢。。。。

【在 O******e 的大作中提到】
: 对于连DNA双螺旋的重要性都认识不到的人,你就别浪费精神去招呼了。不值得。
x********e
发帖数: 35261
105
我觉得否定的不是DNA结构的重要性,而是DNA晶体X光衍射对于揭示DNA结构的重要性。
你可以说是last piece of puzzle, 但是没有之前那些重要贡献,我很怀疑花生和克里
克能推出双螺旋的结构。

【在 w********h 的大作中提到】
: hehe...前面看了这么多作生物的人否定dna结构的重要性,
: 我还以为风向变了呢。。。。

f*******g
发帖数: 245
106
嘿嘿,哪里能变?在中国,结构=生化=生物=生命科学。不做结构就等于不懂生物

【在 w********h 的大作中提到】
: hehe...前面看了这么多作生物的人否定dna结构的重要性,
: 我还以为风向变了呢。。。。

f*******g
发帖数: 245
107
话说,计算机就是为了算才在mit诞生的,是为了算云子蛋?

【在 x********e 的大作中提到】
: 我觉得手算还是可行的
: nb的突破性成就都诞生在手算阶段啊,人原子弹都是靠手算出来的

x********e
发帖数: 35261
108
我就读过费曼的自传。原子弹的理论计算时还处于手算阶段,费曼他们发明了一种用卡
片记忆的方式,连计算器都说不上,更不要说计算器机了。
真是崇敬那个时代的科学家啊。条件如此简陋,却是个群星云集的时代。

【在 f*******g 的大作中提到】
: 话说,计算机就是为了算才在mit诞生的,是为了算云子蛋?
M*P
发帖数: 6456
109
据说碱基在major groove的更容易被转录因子结合。

【在 P*A 的大作中提到】
: 这两个现象也可以被平面梯子的DNA结构完美解释
: 就算人类到现在也没法证实DNA到底是平面的还是双螺旋结构,生化遗传免疫哪一方面
: 会因为没有这个晶体结构的发现而无法进步?
: 结构就是个屁

n********k
发帖数: 2818
110
很不professional的说,哪有那么多震惊世界,如果STAP是真的,那可能真算的上是震
惊世界,今年还有其他能称得上震惊世界的吗?CRISPR都不敢说是震惊世界吧。科学还
是有科学的本分的好,秀场是政客和明星的事情吧。

【在 s****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: sautin (老将萨乌丁), 信区: Military
: 标 题: 震惊世界:海归院士施一公首揭老年痴呆症致病蛋白结构(图)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 4 12:33:21 2014, 美东)
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竟然到现在还没有人讨论syg的一周三灌不捧不撕不喷,请内行来评施一公的工作
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b******k
发帖数: 2321
111
太认真了 你又不是不知道记者什么水平

【在 n********k 的大作中提到】
: 很不professional的说,哪有那么多震惊世界,如果STAP是真的,那可能真算的上是震
: 惊世界,今年还有其他能称得上震惊世界的吗?CRISPR都不敢说是震惊世界吧。科学还
: 是有科学的本分的好,秀场是政客和明星的事情吧。

n********k
发帖数: 2818
112
关键是是院士用不着每次都出来记者一会吧,年轻PI也就罢了,到这种地步了,整天这
样很有趣么,即便要从政也用不着这样造势吧,感觉很多真的科学家总是躲着鸡者吧,
Andy Fire是很典型的,拿来诺将都不好意思说的那种。程和平有几个工作还有圈点吧
,感觉很少出头的样子。

【在 b******k 的大作中提到】
: 太认真了 你又不是不知道记者什么水平
M*P
发帖数: 6456
113
这就是人和人的不同。你喜欢低调的不等于他就应该低调。
另外国内这种发布会未必是他自己想不去就能不去的。

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

【在 n********k 的大作中提到】
: 关键是是院士用不着每次都出来记者一会吧,年轻PI也就罢了,到这种地步了,整天这
: 样很有趣么,即便要从政也用不着这样造势吧,感觉很多真的科学家总是躲着鸡者吧,
: Andy Fire是很典型的,拿来诺将都不好意思说的那种。程和平有几个工作还有圈点吧
: ,感觉很少出头的样子。

x********e
发帖数: 35261
114
记者水平太差
应该输送点生物前线的人才去新闻界
或者大力支持果壳网科学松鼠会之类的

【在 M*P 的大作中提到】
: 这就是人和人的不同。你喜欢低调的不等于他就应该低调。
: 另外国内这种发布会未必是他自己想不去就能不去的。
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

M*P
发帖数: 6456
115
这都是什么网站,从来没听过

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

【在 x********e 的大作中提到】
: 记者水平太差
: 应该输送点生物前线的人才去新闻界
: 或者大力支持果壳网科学松鼠会之类的

s*****g
发帖数: 7857
116
真能黑啊!

【在 a*********n 的大作中提到】
: 这个发现把治愈老年痴呆的时间提前了100多年.
j*******1
发帖数: 266
117
有谁知道哪个药是靠结构分析为主制造出来的?
y***i
发帖数: 11639
118
用结晶研究药品和蛋白质结合的工作很多。结晶现在是任何一个大制药厂的重要研究
部分。
http://www.uahsj.ualberta.ca/files/Issues/1-1/pdf/7.pdf

【在 j*******1 的大作中提到】
: 有谁知道哪个药是靠结构分析为主制造出来的?
O******e
发帖数: 4845
119
如果STAP算震惊世界,那CRISPR的影响就是震惊太阳系了,^_^
STAP只是生成stem cells的一个新方法,但CRISPR是一套前途无量的新系统,重要性
差得挺大的。

【在 n********k 的大作中提到】
: 很不professional的说,哪有那么多震惊世界,如果STAP是真的,那可能真算的上是震
: 惊世界,今年还有其他能称得上震惊世界的吗?CRISPR都不敢说是震惊世界吧。科学还
: 是有科学的本分的好,秀场是政客和明星的事情吧。

y***i
发帖数: 11639
120
http://www.pharmabiz.com/NewsDetails.aspx?aid=74219&sid=2
Receptos determines new GPCR structure, achieves milestone from Ono Pharma
San Diego
Monday, March 11, 2013, 14:00 Hrs [IST]
Biopharmaceutical company Receptos has successfully determined a novel
protein crystal structure of an undisclosed proprietary GPCR drug discovery
target for Ono Pharmaceuticals.
In December 2011, Ono entered into a technology collaboration to access
Receptos' proprietary GPCR structure determination technology platform,
which enables rational drug design for the GPCR target class. The structure
determination milestone represents the third significant milestone met under
the terms of the collaboration, all of which have been achieved ahead of
originally anticipated timelines.
Financial terms were not disclosed.
"The timely delivery of a novel GPCR structure under the Ono-Receptos
collaboration supports structure-based drug design efforts at Ono for an
important therapeutic target," said Faheem Hasnain, president and chief
eExecutive officer of Receptos. "This rapid success represents further
endorsement of the robust nature of the Receptos GPCR structural biology
expertise that underpins our proprietary platform technology."

【在 y***i 的大作中提到】
: 用结晶研究药品和蛋白质结合的工作很多。结晶现在是任何一个大制药厂的重要研究
: 部分。
: http://www.uahsj.ualberta.ca/files/Issues/1-1/pdf/7.pdf

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关于NgAGO, 这样的讨论才是理性和有意思的2012 nobel chemistry prize-Koblika &lefkowitz
一公时代的到来zz可笑就是比什么impact factor
施一公到底做出过什么贡献呀?Watson 和 Crick 算得上生物学中的牛顿吗
j*******1
发帖数: 266
121
它可作为一个辅助手段,提供点线索,但生理,生化,药理是主角。

【在 y***i 的大作中提到】
: http://www.pharmabiz.com/NewsDetails.aspx?aid=74219&sid=2
: Receptos determines new GPCR structure, achieves milestone from Ono Pharma
: San Diego
: Monday, March 11, 2013, 14:00 Hrs [IST]
: Biopharmaceutical company Receptos has successfully determined a novel
: protein crystal structure of an undisclosed proprietary GPCR drug discovery
: target for Ono Pharmaceuticals.
: In December 2011, Ono entered into a technology collaboration to access
: Receptos' proprietary GPCR structure determination technology platform,
: which enables rational drug design for the GPCR target class. The structure

y***i
发帖数: 11639
122
互补,四条桌子腿你不能说哪条腿是辅助哪条腿是主力。
生理药理当然要做,但他们不告诉你这个药物的分子水平的机理。做了结构,你能看
见drug老老实实的待在靶蛋白的活性位点,对这个drug的功能就是致命一击,没有任何
疑问,其他手段很难做到。另外根据靶蛋白设计修正drug,也只有用结构才能做。设计
出来了还需要生化和生理实验验证。

研究

【在 j*******1 的大作中提到】
: 它可作为一个辅助手段,提供点线索,但生理,生化,药理是主角。
W***o
发帖数: 6519
123
这是 opportunist的典范啊

【在 j******i 的大作中提到】
: 施一公的套路就是测完这个蛋白,接着换另一个蛋白测。所以,几乎可以肯定,他不会
: 继续深
: 究什么阿尔兹海默氏症,而是会换另外一个蛋白测,继续发NS, 然后开新闻发布会,‘
: 我的工作为理解/治疗xxxxx症提供了重要的线索'。

j*******1
发帖数: 266
124

< 互补,四条桌子腿你不能说哪条腿是辅助哪条腿是主力。>
结构不是一条腿。药有很多,基本都没有靠结构,可见不是那么必须。
< 生理药理当然要做,但他们不告诉你这个药物的分子水平的机理。做了结构,你能看
作了做了结构,也看不见drug老老实实的待在靶蛋白的活性位点,drug进了体内,待没
待在靶蛋白的活性位点,谁也不知道。只能靠功能检测。
<另外根据靶蛋白设计修正drug,也只有用结构才能做。设计出来了还需要生化和生理
实验验证。>
对设计药可能有些帮助。

【在 y***i 的大作中提到】
: 互补,四条桌子腿你不能说哪条腿是辅助哪条腿是主力。
: 生理药理当然要做,但他们不告诉你这个药物的分子水平的机理。做了结构,你能看
: 见drug老老实实的待在靶蛋白的活性位点,对这个drug的功能就是致命一击,没有任何
: 疑问,其他手段很难做到。另外根据靶蛋白设计修正drug,也只有用结构才能做。设计
: 出来了还需要生化和生理实验验证。
:
: 研究

f**u
发帖数: 346
125
我个人觉得这个说的还真不对。
1953年的时候什么是遗传物质应该还是有争论的,有蛋白派跟核酸派。由于遗传物质必
须要能被精确复制,这个结构出来以后,提示了一个很简单的复制机理(那篇文章里提
到了),所以应该对于核酸派战胜蛋白派有很大的作用。在DNA结构之前,其实就有肺
炎链球菌转化试验很清楚的从功能上证明了DNA是遗传物质,但是大家还是觉得DNA化学
成分太简单,不可能是遗传物质。那个噬菌体同位素实验我记得应该是在DNA结构出来
之后。其实从实验角度来说,这个实验比细菌转化试验要脏不少,但有了DNA结构以后
,大家就都认了。
从这个角度,DNA结构是结构里的另类。现在大部分都是某个东西已经被证明很重要了
,再去解结构,把某些其他手段搞不定的机理搞一搞。DNA属于结构出来的时候这东西
有什么重要作用大家还有争论,结构出来以后争论就基本平了的。
DNA结构要说揭示了什么机理,那就一个,就是解释了查伽夫定律。但是这个东西如果
离开了DNA是遗传物质,其实就没什么意义了。所以DNA结构的意义我觉得还是在确立
DNA是遗传物质上。生物最重要的还是功能,是机理。关于DNA的很多功能实验是以后别
人做的,那些人会去做那些功能试验,是因为DNA是遗传物质,大家想了解遗传的机理
。很多功能试验未必需要DNA的结构信息。假如历史上用其他方法确定了DNA是遗传物质
,就算没有DNA结构,很多功能试验一样有人会去做。
DNA结构跟半保留复制没有任何关系。半保留复制的那个重同位素实验是很多年以后的
事了。那个实验是要区分DNA复制到底是半保留,是全保留,还是一段一段的不一样。

【在 y***i 的大作中提到】
: 互补,四条桌子腿你不能说哪条腿是辅助哪条腿是主力。
: 生理药理当然要做,但他们不告诉你这个药物的分子水平的机理。做了结构,你能看
: 见drug老老实实的待在靶蛋白的活性位点,对这个drug的功能就是致命一击,没有任何
: 疑问,其他手段很难做到。另外根据靶蛋白设计修正drug,也只有用结构才能做。设计
: 出来了还需要生化和生理实验验证。
:
: 研究

y***i
发帖数: 11639
126
大体同意。不能完全同意的是“生物最重要的还是功能,是机理。关于DNA的很多功
能实验是以后别人做的”。你说的这个功能/机理,都是以DNA双螺旋结构的结果为基石
(也就是双螺旋结构揭示的功能/机理,是其中最核心的部分)。
生物最神秘的特性就是极大量的的遗传信息怎么传递下去的问题。这个结构回答了这
个问题----这个传递的物质基础是什么(不光是DNA是遗传物质,而且包括这个信息该
怎么复制传递下去)。后面的结果都是添加细节。所以这两个哥们(再加上被坑的那个
富兰克林)名声比后来研究功能的那些人大无数倍。要真是其他人做的是“最重要
的”,呵呵呵。。。。显然是这些后来者的工作重要性小太多了----虽然对我们来说还
是无穷大。

。直
释。

【在 f**u 的大作中提到】
: 我个人觉得这个说的还真不对。
: 1953年的时候什么是遗传物质应该还是有争论的,有蛋白派跟核酸派。由于遗传物质必
: 须要能被精确复制,这个结构出来以后,提示了一个很简单的复制机理(那篇文章里提
: 到了),所以应该对于核酸派战胜蛋白派有很大的作用。在DNA结构之前,其实就有肺
: 炎链球菌转化试验很清楚的从功能上证明了DNA是遗传物质,但是大家还是觉得DNA化学
: 成分太简单,不可能是遗传物质。那个噬菌体同位素实验我记得应该是在DNA结构出来
: 之后。其实从实验角度来说,这个实验比细菌转化试验要脏不少,但有了DNA结构以后
: ,大家就都认了。
: 从这个角度,DNA结构是结构里的另类。现在大部分都是某个东西已经被证明很重要了
: ,再去解结构,把某些其他手段搞不定的机理搞一搞。DNA属于结构出来的时候这东西

x********e
发帖数: 35261
127
你能就着一个个实验结果下结论么?DNA双螺旋的确是分子生物学的基石。不过就一个
双螺旋能回答“遗传信息如何传递下去”这么深奥的问题?
确定核酸而非蛋白是遗传载体的实验是在双螺旋发现之前做的。发现双螺旋结构以后也
是研究DNA转录翻译密码子的人揭示的四碱基如何记载复杂的遗传信息。至于传递,那
是搞噬菌体同位素标记才知道的半保留复制。其他更细的我都不说了。
解一个遗传信息载体的结构就可以把其他人前后几百年苦心研究的credit都偷走了?

【在 y***i 的大作中提到】
: 大体同意。不能完全同意的是“生物最重要的还是功能,是机理。关于DNA的很多功
: 能实验是以后别人做的”。你说的这个功能/机理,都是以DNA双螺旋结构的结果为基石
: (也就是双螺旋结构揭示的功能/机理,是其中最核心的部分)。
: 生物最神秘的特性就是极大量的的遗传信息怎么传递下去的问题。这个结构回答了这
: 个问题----这个传递的物质基础是什么(不光是DNA是遗传物质,而且包括这个信息该
: 怎么复制传递下去)。后面的结果都是添加细节。所以这两个哥们(再加上被坑的那个
: 富兰克林)名声比后来研究功能的那些人大无数倍。要真是其他人做的是“最重要
: 的”,呵呵呵。。。。显然是这些后来者的工作重要性小太多了----虽然对我们来说还
: 是无穷大。
:

s******c
发帖数: 331
128
这个就是太乐观的看法,作为一个搞结构的,稍微跟pharmacology沾点边的半外行,说
一些粗浅的理解。
首先,药物分子水平的机理太复杂,结构能看的就是,药物小分子和一种蛋白在某个位
点上的相互作用有哪些。就这些信息,仍然受很多因素的影响,很多时候都不是致命一
击,比如小分子affinity低,占有率低,或结构分辨率低,就会有很多问题,如果小分
子太小,fit电子密度可能性有很多种,或小分子太大,不是所有的部分都有清晰的密
度,这个时候就很难讲,在这上面出错的结构有很多。结构不能揭示的药物分子机理就
太多了,药物怎么代谢的(往往很多药物代谢底物才是真正结合靶点的小分子),怎么
进细胞或怎么上膜,即便是跟靶蛋白,小分子进入和离开靶蛋白的kinetics,on rate
和off rate,进入binding site的整个process(first binding site,secondary
binding site etc)都是静态结构不能看到的,而这些信息很多时候才是重要的,比如
对于很多药物,其进入binding site的通道或过程往往决定其特异性,而不是结构看到
的binding site本身的环境,或者off rate是决定药效的关键等等。
还有,药物的side effects原因有非常多种,根据结构去改善,可以做的基本就两个方
面,在已知的chemical scaffold上提高affinity和specificity,但是这些很多时候
medicinal chemistry就可以做到,在大规模的screening到leading compounds之后,
medicinal chemists可以做非常多的修饰,然后high throughput去看不同地方的修饰
对affinity和efficacy有什么影响,然后再做下一步去develop更好的药物。当然根据
结构可以做一些有针对性的建议,但是很多时候也只是可能性提高一下,很难下很确定
的建议。对于其它方面的side effects,比如肝肾毒性,代谢慢,或太多的off
targets(总不能一个一个去解off targets和药物的结构),结构基本上无能为力。更
多的时候是一种或一类药物的effects太复杂,细胞水平上的机制都不是很全面的了解
,经典例子就是aspirin,大家知道其结合一个酶来抑制thromboxane分泌是药效机制之
一,但是这个只能解释其一小部分药效,其它方面的药效大家还是不清楚,这个时候结
构更是没任何用处。
其实对于制药行业,针对某类疾病最重要的是细胞水平的机制,能找到合适的target,
signaling pathway或某些蛋白,知道其抑制或激活的physiology和pathology,就几乎
成功了一小半,然后再high throughput screening去筛药,有leading compounds之后
再进一步改善药效,这些大多都是medicinal chemistry的活,成功率很高,你去看那
些重要的可能跟疾病有关的蛋白药物靶点,在结构出来之前或根本没有结构的,都已经
有一堆的小分子被develop出来,俺们做结构的很多时候就是放放马后炮,去做做这些
小分子和蛋白结合的结构,号称研究这些小分子作用的分子机制,其实就是申申经费有
用。在结构生物学迅速发展的这十几年,真没见过很多非结构不可甚至靠结构来改善的
药物,虽然也是有那么几个。
你所说的根据靶蛋白设计修正drug,我想应该是指docking,这个还是比较有用的,往
往可以发现一些新的chemical scaffolds或新的leading compounds,这个也是制药公
司跟结构有关用的最多的。但是,首先很多docking其实都可以用simulation model,
不一定要真正的结构,所以不是只有解出结构才能做,当然真正的结构成功率高,与此
同时对分辨率的要求也高,然后根据高分辨率的结构做docking的成功率普遍是很低的
,这跟targets有关系,一般来说potential binding sites比较limited的膜蛋白,比
如channels,transporters,尤其是GPCRs,都是成功率比较高的,而那些胞内的
proteases,enzymes之类,false positive太多,往往参考价值不大,远不如develop
更sensitive或更specific的screening methods去筛来的快来的好。
结构生物学个人觉得最大的贡献还是molecular mechanism,让大家对分子机制有非常
精细的了解,还是有就是提供了很好的3D model给做bioinformatics的人做计算。对药
物的发展虽然大家一直在嚷嚷,但是真心的贡献很有限。仅仅说对现有药物
development的实在的价值,清华的这几个还真不如上海做的那几个GPCR结构来的有用
(当然如果yigong的那个分辨率能大幅提高,还是很有价值的)。至于现在国内解个结
构就开始吹治xx病有望,我只能说,跟电线杆子上贴小广告的老中医没两样,可劲吹吧
骗骗外行人,等真的去根据结构搞点有用的小分子再来宣传,也来得及。

【在 y***i 的大作中提到】
: 大体同意。不能完全同意的是“生物最重要的还是功能,是机理。关于DNA的很多功
: 能实验是以后别人做的”。你说的这个功能/机理,都是以DNA双螺旋结构的结果为基石
: (也就是双螺旋结构揭示的功能/机理,是其中最核心的部分)。
: 生物最神秘的特性就是极大量的的遗传信息怎么传递下去的问题。这个结构回答了这
: 个问题----这个传递的物质基础是什么(不光是DNA是遗传物质,而且包括这个信息该
: 怎么复制传递下去)。后面的结果都是添加细节。所以这两个哥们(再加上被坑的那个
: 富兰克林)名声比后来研究功能的那些人大无数倍。要真是其他人做的是“最重要
: 的”,呵呵呵。。。。显然是这些后来者的工作重要性小太多了----虽然对我们来说还
: 是无穷大。
:

d*******g
发帖数: 8992
129
终于有个业内的人给他们科普一下吧。
结构学确实主要对于了解molecular mechanism.
说解一个晶体就了解了95%的动态信息,那是无知。
说晶体或结构一所是处,也是类似的。
结构学对于蛋白质的调节机制(小分子变大分子,开关状态,构型的变化)是很重要的
,还有就是加上点突变等等来测定重要的residues,看它们如果影响分子内或分子间的
相互作用。
真的要做到制药相关,差不多就是蛋白质的点突变结晶,加上小分子的突变,来获得合
适的酶与底物复合体。
模拟在现阶段,没有晶体、NMR和电镜的结构为基础,就是个屁。

rate

【在 s******c 的大作中提到】
: 这个就是太乐观的看法,作为一个搞结构的,稍微跟pharmacology沾点边的半外行,说
: 一些粗浅的理解。
: 首先,药物分子水平的机理太复杂,结构能看的就是,药物小分子和一种蛋白在某个位
: 点上的相互作用有哪些。就这些信息,仍然受很多因素的影响,很多时候都不是致命一
: 击,比如小分子affinity低,占有率低,或结构分辨率低,就会有很多问题,如果小分
: 子太小,fit电子密度可能性有很多种,或小分子太大,不是所有的部分都有清晰的密
: 度,这个时候就很难讲,在这上面出错的结构有很多。结构不能揭示的药物分子机理就
: 太多了,药物怎么代谢的(往往很多药物代谢底物才是真正结合靶点的小分子),怎么
: 进细胞或怎么上膜,即便是跟靶蛋白,小分子进入和离开靶蛋白的kinetics,on rate
: 和off rate,进入binding site的整个process(first binding site,secondary

r********e
发帖数: 84
130
CRISPR也不过是modify genome的一个新方法而已;毕竟没有它,人们还可以用zinc
finger nuclease或TALEN。

【在 O******e 的大作中提到】
: 如果STAP算震惊世界,那CRISPR的影响就是震惊太阳系了,^_^
: STAP只是生成stem cells的一个新方法,但CRISPR是一套前途无量的新系统,重要性
: 差得挺大的。

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拍卖Crick诺贝尔奖牌施一公:这是我科学生涯里最耀眼的成果
生物千老今天悲摧的始作俑者就是沃森,从他剽窃DNA双螺旋开始颜宁和庄晓薇应该是目前华人里最有希望得炸药奖的吧
跟风请帮忙解读11公γ-分泌酶复合物的意义腰斩王晓东施一公晶体信号学科是必然的
f*******g
发帖数: 245
131
江山代用豪杰出。物理学的牛粪时代以过。现在是医学时代,无穷无尽的生命之谜。人
类就是长生不老,所有的生命科学完全掌握,医学也不会消失。I remember the
prototype of computer was made at MIT in 1944.

【在 x********e 的大作中提到】
: 我就读过费曼的自传。原子弹的理论计算时还处于手算阶段,费曼他们发明了一种用卡
: 片记忆的方式,连计算器都说不上,更不要说计算器机了。
: 真是崇敬那个时代的科学家啊。条件如此简陋,却是个群星云集的时代。

m*****g
发帖数: 12
132
这个才是靠谱的大实话
其实yigong当然心里明白这些,只是坐在他那个位置上,很多话可能也只能那么说
况且他还是现在国内力捧的超级明星……我亲眼见过国内的一个本科生留言说:此生若
能成为施先生的学生,死而无憾……底下有人回:那你去考他的研究生啊,回答是:可
惜我已经转行不做生物了……
另外,说个跑题的话,很多PI写NIH grant的时候说the results from our proposed
experiments会把xx病干掉,心里多半是不相信的吧……

rate

【在 s******c 的大作中提到】
: 这个就是太乐观的看法,作为一个搞结构的,稍微跟pharmacology沾点边的半外行,说
: 一些粗浅的理解。
: 首先,药物分子水平的机理太复杂,结构能看的就是,药物小分子和一种蛋白在某个位
: 点上的相互作用有哪些。就这些信息,仍然受很多因素的影响,很多时候都不是致命一
: 击,比如小分子affinity低,占有率低,或结构分辨率低,就会有很多问题,如果小分
: 子太小,fit电子密度可能性有很多种,或小分子太大,不是所有的部分都有清晰的密
: 度,这个时候就很难讲,在这上面出错的结构有很多。结构不能揭示的药物分子机理就
: 太多了,药物怎么代谢的(往往很多药物代谢底物才是真正结合靶点的小分子),怎么
: 进细胞或怎么上膜,即便是跟靶蛋白,小分子进入和离开靶蛋白的kinetics,on rate
: 和off rate,进入binding site的整个process(first binding site,secondary

x********e
发帖数: 35261
133
万一人类发现精神或者灵魂可以脱离肉体呢?那就不需要医学了

【在 f*******g 的大作中提到】
: 江山代用豪杰出。物理学的牛粪时代以过。现在是医学时代,无穷无尽的生命之谜。人
: 类就是长生不老,所有的生命科学完全掌握,医学也不会消失。I remember the
: prototype of computer was made at MIT in 1944.

f*******g
发帖数: 245
134
那也需要精神病医生。

【在 x********e 的大作中提到】
: 万一人类发现精神或者灵魂可以脱离肉体呢?那就不需要医学了
x********e
发帖数: 35261
135
呵呵 这倒是

【在 f*******g 的大作中提到】
: 那也需要精神病医生。
j**h
发帖数: 126
136
震惊世界好像原文没有,转帖的人加的。

【在 n********k 的大作中提到】
: 很不professional的说,哪有那么多震惊世界,如果STAP是真的,那可能真算的上是震
: 惊世界,今年还有其他能称得上震惊世界的吗?CRISPR都不敢说是震惊世界吧。科学还
: 是有科学的本分的好,秀场是政客和明星的事情吧。

O******e
发帖数: 4845
137
随便拿本本科的生物学教材去看看吧,中英文均可。你就别在这里浪费时间了,好吧?

【在 x********e 的大作中提到】
: 你能就着一个个实验结果下结论么?DNA双螺旋的确是分子生物学的基石。不过就一个
: 双螺旋能回答“遗传信息如何传递下去”这么深奥的问题?
: 确定核酸而非蛋白是遗传载体的实验是在双螺旋发现之前做的。发现双螺旋结构以后也
: 是研究DNA转录翻译密码子的人揭示的四碱基如何记载复杂的遗传信息。至于传递,那
: 是搞噬菌体同位素标记才知道的半保留复制。其他更细的我都不说了。
: 解一个遗传信息载体的结构就可以把其他人前后几百年苦心研究的credit都偷走了?

x********e
发帖数: 35261
138
我说的这些实验是高中生物教材
说错的地方请指正一下?

【在 O******e 的大作中提到】
: 随便拿本本科的生物学教材去看看吧,中英文均可。你就别在这里浪费时间了,好吧?
O******e
发帖数: 4845
139
区别太大了,根本不是一个等级的。CRISPR的辉煌才刚刚开始,它不仅仅是研究工具,
还可能成为以后基因治疗的主力。这势头,跟iPS有的一比,太吓人了!

【在 r********e 的大作中提到】
: CRISPR也不过是modify genome的一个新方法而已;毕竟没有它,人们还可以用zinc
: finger nuclease或TALEN。

b******k
发帖数: 2321
140
是啊 能用上人那就完全不是一个概念的了 TFN和TALEN上人太繁琐了

【在 O******e 的大作中提到】
: 区别太大了,根本不是一个等级的。CRISPR的辉煌才刚刚开始,它不仅仅是研究工具,
: 还可能成为以后基因治疗的主力。这势头,跟iPS有的一比,太吓人了!

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w****6
发帖数: 169
141
顶这个帖子,说得很好。
我博士也做过结构,呵呵,也解了一个好些组一直在做,但很多年来都没解出来的结构
。现在做薄厚就转方向了,在细胞水平筛药。理由和你的帖子说的很类似。

rate

【在 s******c 的大作中提到】
: 这个就是太乐观的看法,作为一个搞结构的,稍微跟pharmacology沾点边的半外行,说
: 一些粗浅的理解。
: 首先,药物分子水平的机理太复杂,结构能看的就是,药物小分子和一种蛋白在某个位
: 点上的相互作用有哪些。就这些信息,仍然受很多因素的影响,很多时候都不是致命一
: 击,比如小分子affinity低,占有率低,或结构分辨率低,就会有很多问题,如果小分
: 子太小,fit电子密度可能性有很多种,或小分子太大,不是所有的部分都有清晰的密
: 度,这个时候就很难讲,在这上面出错的结构有很多。结构不能揭示的药物分子机理就
: 太多了,药物怎么代谢的(往往很多药物代谢底物才是真正结合靶点的小分子),怎么
: 进细胞或怎么上膜,即便是跟靶蛋白,小分子进入和离开靶蛋白的kinetics,on rate
: 和off rate,进入binding site的整个process(first binding site,secondary

y***i
发帖数: 11639
142
Nice。这个是行家出手。需要学习。

rate

【在 s******c 的大作中提到】
: 这个就是太乐观的看法,作为一个搞结构的,稍微跟pharmacology沾点边的半外行,说
: 一些粗浅的理解。
: 首先,药物分子水平的机理太复杂,结构能看的就是,药物小分子和一种蛋白在某个位
: 点上的相互作用有哪些。就这些信息,仍然受很多因素的影响,很多时候都不是致命一
: 击,比如小分子affinity低,占有率低,或结构分辨率低,就会有很多问题,如果小分
: 子太小,fit电子密度可能性有很多种,或小分子太大,不是所有的部分都有清晰的密
: 度,这个时候就很难讲,在这上面出错的结构有很多。结构不能揭示的药物分子机理就
: 太多了,药物怎么代谢的(往往很多药物代谢底物才是真正结合靶点的小分子),怎么
: 进细胞或怎么上膜,即便是跟靶蛋白,小分子进入和离开靶蛋白的kinetics,on rate
: 和off rate,进入binding site的整个process(first binding site,secondary

x********e
发帖数: 35261
143
这次怎么不反驳了?

【在 y***i 的大作中提到】
: Nice。这个是行家出手。需要学习。
:
: rate

c*****u
发帖数: 439
144
同意啊, 最近10年 除了ips ,我觉得就是CRISPR了。 不过,领域局限,也许别的领域
也有震惊世界的发现?

【在 O******e 的大作中提到】
: 区别太大了,根本不是一个等级的。CRISPR的辉煌才刚刚开始,它不仅仅是研究工具,
: 还可能成为以后基因治疗的主力。这势头,跟iPS有的一比,太吓人了!

c**********r
发帖数: 138
145
在理

这个就是太乐观的看法,作为一个搞结构的,稍微跟pharmacology沾点边的半外行,说
一些粗浅的理解。首先,药物分子水平的机理太复杂,结构能看的就是,药物小分子和
一种蛋白在某........

【在 s******c 的大作中提到】
: 这个就是太乐观的看法,作为一个搞结构的,稍微跟pharmacology沾点边的半外行,说
: 一些粗浅的理解。
: 首先,药物分子水平的机理太复杂,结构能看的就是,药物小分子和一种蛋白在某个位
: 点上的相互作用有哪些。就这些信息,仍然受很多因素的影响,很多时候都不是致命一
: 击,比如小分子affinity低,占有率低,或结构分辨率低,就会有很多问题,如果小分
: 子太小,fit电子密度可能性有很多种,或小分子太大,不是所有的部分都有清晰的密
: 度,这个时候就很难讲,在这上面出错的结构有很多。结构不能揭示的药物分子机理就
: 太多了,药物怎么代谢的(往往很多药物代谢底物才是真正结合靶点的小分子),怎么
: 进细胞或怎么上膜,即便是跟靶蛋白,小分子进入和离开靶蛋白的kinetics,on rate
: 和off rate,进入binding site的整个process(first binding site,secondary

w**********k
发帖数: 386
146
这么客观,怎么能忽悠到人

【在 w****6 的大作中提到】
: 顶这个帖子,说得很好。
: 我博士也做过结构,呵呵,也解了一个好些组一直在做,但很多年来都没解出来的结构
: 。现在做薄厚就转方向了,在细胞水平筛药。理由和你的帖子说的很类似。
:
: rate

f*******g
发帖数: 245
147
中国的生物/医学教材中的错误比比皆是。
比如:
1),中国世界上首次合成人工胰岛素。-----错
2),汤某某,第一个发现沙眼衣原体。-----错的离谱
3),陈某世界上第一个断肢再植-----错。
在 xiaxianyue (下弦月) 的大作中提到: 】
n********k
发帖数: 2818
148
CRISPR is very likely not gonna work for therapy, I think we would have to
wait for new tools or have to have some major improvement before I would be
convinced---despite the 6 studies which claims the low off target effects...
with that, I think CRISPR in today's fashion is gonna go down as another
great research tool! If it is true, STAP and its implication go way beyond
只是生成stem cells的一个新方法, in my mind, it would be far more reaching
than iPS.

【在 O******e 的大作中提到】
: 如果STAP算震惊世界,那CRISPR的影响就是震惊太阳系了,^_^
: STAP只是生成stem cells的一个新方法,但CRISPR是一套前途无量的新系统,重要性
: 差得挺大的。

b******y
发帖数: 627
149
别来无恙。
s******s
发帖数: 13035
150
crispr确实很牛,不过多伟大倒不一定。没了crispr也有zfn和talen,
以后也有drispr,这个和ips的原创性和亮瞎狗眼性完全不是一个档次的

【在 c*****u 的大作中提到】
: 同意啊, 最近10年 除了ips ,我觉得就是CRISPR了。 不过,领域局限,也许别的领域
: 也有震惊世界的发现?

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l********a
发帖数: 61
151
最近会有全长的cryo-EM结构出来(接近原子分辨率),这个领域确实很久没发展了

样子

【在 x********e 的大作中提到】
: 说得那么轻松,就说马达蛋白吧
: dynein/dynactin的部分结构很早就用电镜看到了,到现在50年肯定有了,还是那个样子

e********r
发帖数: 2352
152
你真的是作生物的?

【在 x********e 的大作中提到】
: 有专家大牛出来说说protein NMR吗?
: 有没有可能在溶液中解蛋白结构?
:
: 扯。
: concern

w****l
发帖数: 535
153
顶这个,还是靠screening
我们哪儿medicinal chemist根据lead compound搞出来一大堆compound,想看看
SAR (structure activity relation),筛完了后也没找到确定的SAR,太复杂了
用老邓的一句话,
不管黑structure,还是白structure, cell-based-assay里面筛完了能work的就是好
structure

rate

【在 s******c 的大作中提到】
: 这个就是太乐观的看法,作为一个搞结构的,稍微跟pharmacology沾点边的半外行,说
: 一些粗浅的理解。
: 首先,药物分子水平的机理太复杂,结构能看的就是,药物小分子和一种蛋白在某个位
: 点上的相互作用有哪些。就这些信息,仍然受很多因素的影响,很多时候都不是致命一
: 击,比如小分子affinity低,占有率低,或结构分辨率低,就会有很多问题,如果小分
: 子太小,fit电子密度可能性有很多种,或小分子太大,不是所有的部分都有清晰的密
: 度,这个时候就很难讲,在这上面出错的结构有很多。结构不能揭示的药物分子机理就
: 太多了,药物怎么代谢的(往往很多药物代谢底物才是真正结合靶点的小分子),怎么
: 进细胞或怎么上膜,即便是跟靶蛋白,小分子进入和离开靶蛋白的kinetics,on rate
: 和off rate,进入binding site的整个process(first binding site,secondary

j******i
发帖数: 939
154
对的。用来人体治疗的话,看zfn就行了。zfn发展也有十来年了吧,用到临床也有好几
年了。crispr还得追寻着zfn的足迹走,路远着呢。

be
..

【在 n********k 的大作中提到】
: CRISPR is very likely not gonna work for therapy, I think we would have to
: wait for new tools or have to have some major improvement before I would be
: convinced---despite the 6 studies which claims the low off target effects...
: with that, I think CRISPR in today's fashion is gonna go down as another
: great research tool! If it is true, STAP and its implication go way beyond
: 只是生成stem cells的一个新方法, in my mind, it would be far more reaching
: than iPS.

a********t
发帖数: 434
155
这个世界好小。 只有几千人。

【在 s****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: sautin (老将萨乌丁), 信区: Military
: 标 题: 震惊世界:海归院士施一公首揭老年痴呆症致病蛋白结构(图)
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 4 12:33:21 2014, 美东)
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: 成果发布

x********e
发帖数: 35261
156
我指的是我说的那几个实验,以及实验结论

【在 f*******g 的大作中提到】
: 中国的生物/医学教材中的错误比比皆是。
: 比如:
: 1),中国世界上首次合成人工胰岛素。-----错
: 2),汤某某,第一个发现沙眼衣原体。-----错的离谱
: 3),陈某世界上第一个断肢再植-----错。
: 在 xiaxianyue (下弦月) 的大作中提到: 】

x********e
发帖数: 35261
157
显然是你生物学太差了

【在 e********r 的大作中提到】
: 你真的是作生物的?
g*****p
发帖数: 451
158
仙乐mm你也太较真了
反正你也不是学生物的,在半罐子水的情况下随便含糊承认一个
既能遮羞又能逃跑,说不定还能激起其他生物wsn的同情帮你帮帮腔
你这么拿着鸡毛当令箭去找人家麻烦
又讨来一阵穷追猛打
不是自讨没趣么
国内的teenager发明了个新词,你这种情况叫“逗比”
才学会的,各位生物wsn/v也可以学习下

【在 x********e 的大作中提到】
: 显然是你生物学太差了
x********e
发帖数: 35261
159
一般都是半罐子水的逗比才上来二话不说往别人头上贴标签。我们就是论事。你要说我
外行请说明我哪点外行。

【在 g*****p 的大作中提到】
: 仙乐mm你也太较真了
: 反正你也不是学生物的,在半罐子水的情况下随便含糊承认一个
: 既能遮羞又能逃跑,说不定还能激起其他生物wsn的同情帮你帮帮腔
: 你这么拿着鸡毛当令箭去找人家麻烦
: 又讨来一阵穷追猛打
: 不是自讨没趣么
: 国内的teenager发明了个新词,你这种情况叫“逗比”
: 才学会的,各位生物wsn/v也可以学习下

u******u
发帖数: 595
160
说得太对了!
一般都是半罐子水的逗比才上来二话不说往别人头上贴标签。
尤其是在转行这件事上和对待一公老师这件事上。

我外行请说明我哪点外行。

【在 x********e 的大作中提到】
: 一般都是半罐子水的逗比才上来二话不说往别人头上贴标签。我们就是论事。你要说我
: 外行请说明我哪点外行。

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