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全部话题 - 话题: mirnas
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s******n
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1
【 以下文字转载自 History 讨论区 】
发信人: shaodian (有熊), 信区: History
标 题: 余云辉: 中美贸易协议后果严重
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Mar 2 00:09:36 2020, 美东)
中美贸易协议后果严重
2020-2-29
摘要: 中美贸易协议不仅颠覆了前三十年“依托国内市场、发展自主技术”的增长模式
,而且颠覆了后三十年“依托国际市场、以市场换技术”的增长模式,从而使得中国高
科技产业的发展将面临既缺乏国内市场保护,又缺乏国际技术来源的困境。这一颠覆性
的严重后果将在不远的将来逐步显现出来。
中美贸易协议后果严重
余云辉
根据传统流年算法,己亥年立冬(2019年11月8日)之后就开始步入庚子年的运势。
庚子年历来是中国多灾多难之年。近代史上无论第一次鸦片战争还是八国联军攻入北京
,总是伴随着割地赔款、签订卖国条约等。同样,中国历史也将记住中美贸易协定的签
订、武汉肺炎疫情的流行。相比而言,武汉肺炎疫情的不利影响是短暂的,而中美贸易
协定的不利影响则是长远的。
中美贸易协定主要涉及三大领域:知识产权保护、转基因产品进口、... 阅读全帖
z**n
发帖数: 22303
2
美国《大西洋月刊》:“转基因食品有非常真实的危险”
大西洋月刊 2012-1-12
最新研究表明:我们在食用食物的时候不仅仅是吸收了维他命和蛋白质,而且还摄取了
生命信息和微核糖核酸。
Update 1/12: 2012-1-12
感谢Christie Wilcox和Emily Willingham分别在“科学美国人”博客网和《生物档案
》上发表的科学和生物学博文,介绍阿里·勒沃( Ari LeVaux')在最近的《昙花一现
》专栏中指出的“科学中的非自洽”,所幸的是这篇文章为多家报社和杂志网站所转载。
这个专栏是为Alternet做的扩展和更新,勒沃在评论栏中做了进一步润色。
中国的研究人员已经在食用大米的人的血液和器官中发现了大米核糖核酸片段。这个以
南京大学为基础的研究队称这种遗传物质会粘附在受体的肝脏细胞上,并且左右人体从
血液中清除胆固醇。
此种核糖核酸因其本身很小,被称作微小核糖核酸(缩写为miRNA)。十年前miRNA被发
现,之后被广泛地研究,并且被认为是癌症、老年痴呆症和糖尿病等多种人类疾病的诱
因。这些miRNA会通过压制或关闭特定基因来发挥作用。
中国的研究首次展... 阅读全帖
m**d
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3
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发信人: wayofflying (小破熊), 信区: Military
标 题: 南京大学重大发现 揭露了转基因惊人秘密
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 2 23:46:36 2011, 美东)
南京大学张辰宇教授重大发现 “剑指”转基因食物安全(图)
在九月出版的《细胞研究》(Cell research)的一篇研究中,南京大学张辰宇教授课题
组展示了一项非常令人惊奇的发现——植物的微小核糖核酸(microRNA)可以通过日常
食物摄 取的方式进入人体血液和组织器官。并且,一旦进入体内,它们将通过调控人
体内靶基因表达的方式影响人体的生理功能,进而发挥生物学作用。该研究证明植物微
小核糖核酸可能是食物中的“第七种营养成分”(其他六种分别是水、蛋白质、脂肪
酸、碳水化合物、维他命和稀有元素)。
南大教授张辰宇作《21世纪生物科学与生物经济》讲座
原文地址
Exogenous plant MIR168a specifically targets mammalian LDLRAP1: evidence of
cross-... 阅读全帖
f********t
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4
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标 题: 南京大学重大发现 揭露了转基因惊人秘密
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 2 23:46:36 2011, 美东)
南京大学张辰宇教授重大发现 “剑指”转基因食物安全(图)
在九月出版的《细胞研究》(Cell research)的一篇研究中,南京大学张辰宇教授课题
组展示了一项非常令人惊奇的发现——植物的微小核糖核酸(microRNA)可以通过日常
食物摄 取的方式进入人体血液和组织器官。并且,一旦进入体内,它们将通过调控人
体内靶基因表达的方式影响人体的生理功能,进而发挥生物学作用。该研究证明植物微
小核糖核酸可能是食物中的“第七种营养成分”(其他六种分别是水、蛋白质、脂肪
酸、碳水化合物、维他命和稀有元素)。
南大教授张辰宇作《21世纪生物科学与生物经济》讲座
原文地址
Exogenous plant MIR168a specifically targets mammalian LDLRAP1: evidence of
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f********t
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5
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发信人: wayofflying (小破熊), 信区: Military
标 题: 南京大学重大发现 揭露了转基因惊人秘密
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 2 23:46:36 2011, 美东)
南京大学张辰宇教授重大发现 “剑指”转基因食物安全(图)
在九月出版的《细胞研究》(Cell research)的一篇研究中,南京大学张辰宇教授课题
组展示了一项非常令人惊奇的发现——植物的微小核糖核酸(microRNA)可以通过日常
食物摄 取的方式进入人体血液和组织器官。并且,一旦进入体内,它们将通过调控人
体内靶基因表达的方式影响人体的生理功能,进而发挥生物学作用。该研究证明植物微
小核糖核酸可能是食物中的“第七种营养成分”(其他六种分别是水、蛋白质、脂肪
酸、碳水化合物、维他命和稀有元素)。
南大教授张辰宇作《21世纪生物科学与生物经济》讲座
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d*******r
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6
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发信人: wayofflying (小破熊), 信区: Military
标 题: 南京大学重大发现 揭露了转基因惊人秘密
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 2 23:46:36 2011, 美东)
南京大学张辰宇教授重大发现 “剑指”转基因食物安全(图)
在九月出版的《细胞研究》(Cell research)的一篇研究中,南京大学张辰宇教授课题
组展示了一项非常令人惊奇的发现——植物的微小核糖核酸(microRNA)可以通过日常
食物摄 取的方式进入人体血液和组织器官。并且,一旦进入体内,它们将通过调控人
体内靶基因表达的方式影响人体的生理功能,进而发挥生物学作用。该研究证明植物微
小核糖核酸可能是食物中的“第七种营养成分”(其他六种分别是水、蛋白质、脂肪
酸、碳水化合物、维他命和稀有元素)。
南大教授张辰宇作《21世纪生物科学与生物经济》讲座
原文地址
Exogenous plant MIR168a specifically targets mammalian LDLRAP1: evidence of
cross-... 阅读全帖
f***y
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7
http://news.nju.edu.cn/show_article_2_37651
一个偶然的机会,张辰宇将目光瞄准了当时刚刚引起学术界关注的一种小分子核酸物质
——微小核糖核酸(MicroRNA)。并在南京大学生命科学院组建了一支被称作M3的研究
团队,该团队由生命科学、分子生物学、植物生物学、生物信息学、医学、化学等多学
科研究者组成。
在“泡了”三天三夜实验室后,陈熹和导师张辰宇的研究团队,得出了一个突破传统生
物学常识、震惊学术界、国际首发的实验结论,即MicroRNA在人和动物的血清/血浆中
可长期稳定存在。
本报记者王世玲南京报道
未拆包的搬家行李、满屋书籍、屋中间放置着一个脚踏健身器……2014年年底冬日的一
个周日下午,32岁的陈熹正在刚搬入的新办公室里用电脑敲打着最新的科研论文。即便
是周末,跟陈熹办公室同楼层的南京大学仙林校区的生命科学学院实验室内,一群国内
外研究生们仍在紧张地做着实验。
作为南京大学生命科学院最年轻的博士生导师,7年前,当陈熹还是南大博士时,他被
导师张辰宇“逼着”去做一个略显疯狂的生物学想法的实验:去检测人的血清中是否含
有微小核糖核酸(m... 阅读全帖
l*****1
发帖数: 8
8
来自主题: Biology版 - Need a paper. Happy new year!
Happy new year! I need a paper.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=21919692
Future Oncol. 2011 Sep;7(9):1045-55.
miRNAs in lung cancer: large roles for small players.
Cherni I, Weiss GJ.
SourceThe Translational Genomics Research Institute, Phoenix, AZ, USA.
Abstract
miRNAs play an important role in the regulation of a wide assortment of
cellular processes by sequestering target mRNAs and inhibiting translation
of the proteins that they encode. Multiple miRNAs can regulate single mRNA
molecu... 阅读全帖
U**8
发帖数: 1921
9
懂植物的来说说,如果下边这段是真的,Monsanto水平是不咋地。
第一,这篇文章的测
序方法是有问题的。植物的miRNA跟动物不大一样,一般3‘端有2′-O-methyl的修饰,
会降低连接的效率,所以做植物miRNA测序,一般要先氧化一下,不然测出来的序不靠
谱。你看,这篇文章即使直接测大米,也就测出1000多个读段,这怎么可能哩?搞植物
的请站出来说句话,您测个水稻的miRNA组就只能测出个1000个读段?最起码也是百万
以上啊。另外,搞植物的人有结果的,测大米的miR156和miR168怎么测都在10000RPM以
上,你总共测出1000个读段,估计是不知道植物的miRNA跟动物的不一样,这个可以理
解,做学问嘛,你不懂我可以教你。OK,这部分的意思就是,孟山都的方法不靠谱;第
二,你说你RT-PCR验证不出来血清里存在植物的miRNA,这是因为你选的内参不合适,
你弄一个表达超高的线虫miRNA做内参,这啥看不见啊。内参要选合适的。得,RT-PCR
技术不过关啊(很纳闷哦,RT-PCR有这么难吗?);第三,你都说LDL水平会下降了,你
恐怕得做更多的实验,来表明LDL水平的下... 阅读全帖
c*****t
发帖数: 1084
10
来自主题: Biology版 - Re: 问题?3'UTR
since i'm in this field i think sth should be clarified. so far
the only functional miRNAs has been found in worms and plant
but not in mammlian cells although miRNAs are detected in mammalian
cells. no targets have been found yet. also in worms miRNA (actually
let-7 and lin-4) is not perfectly complenentary to its target
seq at 3'UTR. some bulges exist withink base paring region. this
posts most difficult part to identify potential miRNA target
seq since it's not perfectly match. also miRNA is
s******s
发帖数: 13035
11
没做过miRNA,瞎说两句。
感觉其实这玩意儿就是一大堆mRNA和一大堆miRNA混在一起,除了少部分(也许我错了)
mRNA被target去某些特别的地方,其他的就是random混杂。考虑到miRNA允许错配,这种
调节过程其实是一个基因被N个miRNA调控,N个基因被同一miRNA调控的复杂网络,很多
调控并不一定有生物学的意义,只是off target, 再说还有epigenetics的effect

关.
candidate
x*******e
发帖数: 111
12
Exogenous plant MIR168a specifically targets mammalian LDLRAP1: evidence of
cross-kingdom regulation by microRNA
Lin Zhang1,*, Dongxia Hou1,*, Xi Chen1,*, Donghai Li1,*, Lingyun Zhu1,2,
Yujing Zhang1, Jing Li1, Zhen Bian1, Xiangying Liang1, Xing Cai1, Yuan Yin1,
Cheng Wang1, Tianfu Zhang1, Dihan Zhu1, Dianmu Zhang1, Jie Xu1, Qun Chen1,
Yi Ba3, Jing Liu1, Qiang Wang1, Jianqun Chen1, Jin Wang1, Meng Wang1, Qipeng
Zhang1, Junfeng Zhang1, Ke Zen1 and Chen-Yu Zhang1
1Jiangsu Engineering Research Cent... 阅读全帖
x*******e
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13
Exogenous plant MIR168a specifically targets mammalian LDLRAP1: evidence of
cross-kingdom regulation by microRNA
Lin Zhang1,*, Dongxia Hou1,*, Xi Chen1,*, Donghai Li1,*, Lingyun Zhu1,2,
Yujing Zhang1, Jing Li1, Zhen Bian1, Xiangying Liang1, Xing Cai1, Yuan Yin1,
Cheng Wang1, Tianfu Zhang1, Dihan Zhu1, Dianmu Zhang1, Jie Xu1, Qun Chen1,
Yi Ba3, Jing Liu1, Qiang Wang1, Jianqun Chen1, Jin Wang1, Meng Wang1, Qipeng
Zhang1, Junfeng Zhang1, Ke Zen1 and Chen-Yu Zhang1
1Jiangsu Engineering Research Cent... 阅读全帖
j*****d
发帖数: 787
14
http://www.nature.com/cr/journal/vaop/ncurrent/full/cr2011158a.
anybody has full access? thanks.
However, they did not provide evidence that miRNA168a directly
travels from rice grains to human/animal stomac to serum (whose serum????)
and, timely, survive to what extent. Their functional study (miRNA168a
targets LDRAP1) acctually is an in vitro manipulation.
Exogenous plant MIR168a specifically targets mammalian LDLRAP1: evidence of
cross-kingdom regulation by microRNA
Lin Zhang, Dongxia Hou, Xi... 阅读全帖
n**8
发帖数: 221
15
这是CR的原文摘要
Our previous studies have demonstrated that stable microRNAs (miRNAs) in
mammalian serum and plasma are actively secreted from tissues and cells and
can serve as a novel class of biomarkers for diseases, and act as signaling
molecules in intercellular communication. Here, we report the surprising
finding that exogenous plant miRNAs are present in the sera and tissues of
various animals and that these exogenous plant miRNAs are primarily acquired
orally, through food intake. MIR168a is ... 阅读全帖
v*******n
发帖数: 8995
16
希望大家知道一点大米mirna事件的背景,小弟开喷了:
NBT你可以证伪,装b,做出再世基督,生物救世的样子。
可是你的反驳雄文就只有一个正文就一个figure,一个表格。supplemental figure 就
3-4张图。基本上是一个个耗子吃药,然后测序,blood work的流水线的实验。估计只
要一个人总共一周工时。(1)
nbt知道这种文章没有一点novelty,所以自己心虚的去发文解释越描越黑问道‘Do
replication studies belong in top-tier journals?’ 这种典型的假装可观洗脑方
式,和cnn是不是一个妈教的 该不该发?你不也已经发了吗,有什么好多问的? 如果
重复实验不配发nbt, 你还发了,你要自宫给大家看吗?(2)
果然nbt最后花了2/3的篇幅来装逼,说这个结果多么重要, 可是你们编辑部怎么不发
老张的文章哪(2)?说重复多么重要,你有空怎么不把那你自己还有你老母nature上
重复不了的列个表格。自己就是这个sb科研体系的受益者,始作俑者,有摆出一福众人
皆醉,我独醒的样子。其心可诛。我说要解决生物实验重复性差的问... 阅读全帖
S**********e
发帖数: 1789
17
来自主题: Biology版 - 请教个microRNA的问题
转染效率的确是个问题。这个细胞对质粒转染效率是没问题的,但miRNA的确不知道。
看样子要搞一个对照看看了。
载体表达miRNA没问题,这个我知道,我也买了一个表达miRNA的质粒,但pcDNA表达
miRNA不知道是否正确。 表达蛋白的载体也可以表达miRNA?

tricky
j****x
发帖数: 1704
18
多数时候,还是需要bioinformatics给一些提示或方向,或者划定一个范围,才有实验
验证的可能,否则只能是大海捞针,如果对bioinformatics的预测不抱任何希望的话,
很多miRNA的研究就根本没有希望。
和Broad Institute的相关人士交流过,事实上单纯的supervised miRNA target
prediction,他们可以做到准确率50%左右,简单说就是,给出一个miRNA,预测出2个
target candidate,至少有一个可以被实验验证。如果是给出一个miRNA和一个mRNA,
预测是否有targeting及其interaction site,那么准确性应该更高。
这其实和我个人的经验比较吻合。做过两次new miRNA target prediction,一次给了2
个candidate一次给了3个,最终都有一个能被验证为真靶点。当然,实际投入的精力也
比较多,远不是跑个TargetScan或者什么其他的软件选个top3 hits那么简单。不过也
可能是我运气比较好,呵呵。

发帖数: 1
19
来自主题: Biology版 - 求文献,谢谢
Methods Mol Biol. 2014;1119:239-65. doi: 10.1007/978-1-62703-788-4_14.
Techniques for characterizing cytomegalovirus-encoded miRNAs.
Hook LM1, Landais I, Hancock MH, Nelson JA.
Author information
Abstract
microRNAs (miRNAs) are small noncoding RNAs that regulate gene expression at
the posttranscriptional level, by binding to sites within the 3'
untranslated regions of messenger RNA (mRNA) transcripts. The discovery of
this completely new mechanism of gene regulation necessitated the
development ... 阅读全帖

发帖数: 1
20
来自主题: Biology版 - paper thanks
Methods Mol Biol. 2012;822:33-52. doi: 10.1007/978-1-61779-427-8_3.
Stem-loop RT-qPCR for microRNA expression profiling.
Hurley J1, Roberts D, Bond A, Keys D, Chen C.
Author information
Abstract
Quantification of the microRNAs (miRNAs) in cells or tissues is a crucial
step in understanding their biological functions. Development of the stem-
loop reverse transcription procedure and TaqMan(®) miRNA assays enables
accurate detection of miRNA expression levels by quantitative PCR.
Increased ex... 阅读全帖
c******r
发帖数: 3778
21
来自主题: Military版 - 转基因作物到底有害在何处?
要是miRNA这么容易就进入人体,那可以直接吃转miRNA大米治肿瘤了。
miRNA即使进入人体也无法进入细胞。人类想象直接注射,脂粒包裹,基因枪。。。办
法很多,目前还没法把miRNA有效转进体内细胞里面。原来吃大米就可以了。。。

30%
a****k
发帖数: 1130
22
来自主题: Biology版 - microRNA 能做tissue specific KO吗?
刚刚有空再仔细读了遍帖子,发现我是不是也理解错了lz的意思,其实是想ko miRNA啊
。。如果是这个意思的话也还是可以的,loxp site放在pre-miRNA的两边,这类型的实
验都是从pre-miRNA开始的,不用担心miRNA太短了。也给个例子吧,还是最近的paper
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20679397
h********n
发帖数: 4079
23
做个几年miRNA的工作, 现在不做, 说说我的看法吧.
你的第一个问题,"是否可以从biology的角度去推测一个基因的表达是否受microRNA调
控", 我觉得这个问题一一不大. 多数基因都会或多或少的受到miRNA的调控, 但是这
一个调控不是universal的, 而是tissue specific, 或者说跟某个生理/病理过程相关.
比如某个基因在肺上皮细胞受miR-X调节, 而在大肠上皮里主要受miR-Y调节.
另一个问题是尺度的问题. 对某个基因来说, 如果确定在某种细胞里受miR-X调节, 这
个量有多大, 是微调还是大尺度调节. 这个问题可能是现在miRNA领域很多人都认识到
却不愿意面对的.
你的第二个问题, 用那些网上软件去预测, 比如TargetScan, 可以得到一大堆
candidate. 同时再看看这些miRNA在这个组织或者疾病的profile, 挑出一些candidate
做functional assay. 不要被别人的发现所限制.
比如当时我们投文章(miR-xxx is an oncomiR in lung cancer)的时候发现一... 阅读全帖
a******p
发帖数: 414
24
肿瘤组织和受损失的liver都会分泌microRNA到血液中,这已经有报道了, 其他组织摄
取miRNA的报道我没有看到,一个重要的问题是,这种miRNA是单链还是双链,ambion的
technian说单链的miRNA很难整合到RISC上,还有miRNA的浓度有多高, 能不能高到一
个能够抑制其他细胞的target gene, 个人觉得这个一个新发现,但是没有多少的临床
的意义,因为注射的方式oligo应该比口服更见有效
a******p
发帖数: 414
25
肿瘤组织和受损失的liver都会分泌microRNA到血液中,这已经有报道了, 其他组织摄
取miRNA的报道我没有看到,一个重要的问题是,这种miRNA是单链还是双链,ambion的
technian说单链的miRNA很难整合到RISC上,还有miRNA的浓度有多高, 能不能高到一
个能够抑制其他细胞的target gene, 个人觉得这个一个新发现,但是没有多少的临床
的意义,因为注射的方式oligo应该比口服更见有效
p******b
发帖数: 379
26
来自主题: Biology版 - 请问双荧光reporter老鼠的问题
大家好, 我想做一个双荧光reporter老鼠, 打算构建一个全身表达EGFP和mCherry的
reporter老鼠, 其中mCherry受某个miRNA调控, EGFP不受miRNA调控(作为control)
,因为miRNA结合可能导致mRNA降解, 所以我想把EGFP和mCherry分别表达在不同的
mRNA上面, 请问这样设计可行吗? pUBC-EGFP-PolyA-pCAG-mCherry-miRNA binding
site-PolyA
谢谢了,请多指教
i***l
发帖数: 1656
27
来自主题: Biology版 - 求助一道题目的思路
i am not in this field, just for fun.
o. dry lab: data search and find miRNA paralog/homolog in B's relatives---
pathway may be conserved
0.5 wet lab in vitro: miRNA target to a certain sequence which exists in B
/ B relative
1. wet lab semi in vivo: check miRNA's function in a cell line from B or B
relative
2. wet in vivo: miRNA function in B relative animal if possilbe

B
M********r
发帖数: 142
28
ELISA肯定比WB精确啊,不懂lz怎么会这样辩解。
会不会血清中的miRNA是循环的,从肠吸收,经过血运输到target 组织,然后target组
织通过某种机制(受体?)富集。
所以再测测target组织的植物miRNA
lz解释说孟山都NBT文章测序之前没有氧化miRNA去掉修饰,植物miRNA都得这么测。有
没有做植物的,说说是这样吗?
S**********e
发帖数: 1789
29
来自主题: Biology版 - 请教个microRNA的问题
最近用了400多个乳腺癌病人组织,根据他们复发的时间(跟踪8年左右)筛到几个
miRNA, 已经在其它肿瘤里有报道了,跟proliferation, migration等等有关。这几天
用MDA-MB-231细胞做验证,miRNA买自Ambion, 用lipofectamin RNAiMAX转的,结果什
么表型也没看到。很是奇怪,别人的表型这么强,为什么我在乳腺癌里什么也没看到呢
? 难道有什么细节漏掉了? 请有经验的同学指导一下。
有篇文章用pcDNA3.1转miRNA,这个对吗?这不是表达蛋白的载体吗? 也能表达miRNA?
j****x
发帖数: 1704
30
来自主题: Biology版 - 请教个microRNA的问题
有转染效率的control吗?效率不够的话看不到表型很正常,miRNA转染虽说并不tricky
,但有时候也会不稳定。
用质粒表达miRNA不稀奇。你直接转染的其实是miRNA mimics,拿载体表达的是miRNA
precursor.
H*****e
发帖数: 120
31
来自主题: Biology版 - 请教个microRNA的问题
I also use viral vector too. But you need to use the pre-miRNA sequence not
miRNA. Pre-miRNA will be processed to produce miRNA. But not a lot.
Sometime it is good enough. Some time, it is not.
S**********e
发帖数: 1789
32
来自主题: Biology版 - 请教个microRNA的问题
我有400多病人组织,然后做了Nanostring miRNA array (800个miRNA)。然后根据8年
follow up的数据(复发和死亡),用统计学方法cox regression, 找到一些跟复发相
关的miRNA.现在要在细胞系验证了。我没有用周边正常组织,只看肿瘤组织中哪些
miRNA跟复发时间有关。所以这个方法跟肿瘤比较正常组织不太一样。
因为我用triple negative, TCGA数据太少了,power不够。
j******i
发帖数: 21
33
来自主题: Biology版 - microRNA deep sequencing 分析求助
新人求助,第一次做miRNA deep sequencing 分析,想请问版上各位有没有比较实用的
分析protocol或者 pipeline。 还有一个问题就是, sequence read 是直接 map到
mature miRNA的 sequence上比较好,还是map 到genome上然后用 gff file locate
mature miRNA的位置。 如果是map到mature miRNA上,下一步的fold changes 的和 t
test 的分析用什么program做比较好。 菜鸟一枚,感谢赐教!!!
y********1
发帖数: 22
34
来自主题: MedicalCareer版 - The Bridge Medical Summit 2011
The following are the highlights of the conference:
CME Credits: 6.5 AMA PRA Category 1 CreditsTM *
Hematology & Oncology
Cancer is the leading cause of mortality for people younger than 85 years
old. After decades of vigorous study, new modalities of cancer treatment
are emerging. Advance in research has brought new hope in fundamental
changes in cancer treatment. To share these exciting progresses in cancer
biology, physicians and scientists from the BMS Hematology and Oncology
Session wi... 阅读全帖
h*****n
发帖数: 2023
35
来自主题: Military版 - 转基因作物到底有害在何处?
你能举个例子什么东西(可以食用的)的副作用会在10代以后出现?
从实际观察上,没有发现转基因表达的蛋白有副作用。
从生物学理论上,没有任何分析软件预测出转基因在DNA,RNA还是蛋白水平比其他的食
物蛋白会更有毒性。大米基因组有394Mb, 玉米是2500MB, 转基因DNA最多10kb,算上多
拷贝,转基因只占万分之一或者十万分之一。从推算看,即使转基因序列表达miRNA,也
只占万分之一到十万分之一,没有理由表明这(十)万分之一比其他绝大多数更特别。
而且目前还没发现转基因序列表达miRNA. 生物体内的RNA在生物死亡也会很快降解。
在蛋白水平也一样,转基因表达的蛋白也只占总蛋白的万分之一或者更少(已经考虑多
拷贝因素)。如果人体内存在受体,即使万分之一也不能吃,就像毒蘑菇,河豚之类。
这种情况反应会很快。
所有反对转基因的证据全是“或许有”。甚至或许有的理论也不是很成熟的。
那篇植物miRNA进入人体并且作用于人体功能的论文,中国人做的实验,发在中国人办
的杂志(CNS都拒了),我仔细看了,漏洞很多。引用该文的也是一些不入流杂志。目
前还有其他组发表类似的结果。需要指出的是,该... 阅读全帖
f***y
发帖数: 4447
36
这里的生物学家怎么看?
http://www.ebiotrade.com/newsf/read.asp?page=2014108134301819
南京大学张辰宇团队最新研究发现,一种植物微小核糖核酸 (microRNA), MIR2911直
接靶向甲型流感病毒 (IAV),包括H1N1, H5N1和H7N9。而在金银花中富含这种微小核糖
核酸。给小鼠饮用金银花汤剂,可预防其感染IAV,并降低H5N1导致的小鼠死亡率。
MicroRNAs (miRNAs) 是一类长约19-24个核苷酸的非编码RNA,并不编码蛋白。它们与
靶点信使RNA结合,从而抑制蛋白翻译。在以往研究中,该团队已证实稳定存在于哺乳
动物血清和血浆中的microRNAs由组织和细胞主动分泌出来,可作为疾病的新型生物标
记物,并起着细胞内分子信号传递的作用。该团队还报道过植物miRNAs可通过摄食进入
摄食者血液和组织。更重要地,一旦进入摄食者体内,源自食物的外源性miRNAs就可以
通过调控宿主“靶”基因,影响动物的生理状态。
此次,他们公布一项出人意料的发现,一种中药材——即金银花中的MIR2911能抑制甲
型流感病... 阅读全帖
w********2
发帖数: 632
37
来自主题: Military版 - gmo食品最大的问题
Chinese researchers have found small pieces of rice ribonucleic acid (RNA)
in the blood and organs of humans who eat rice. The Nanjing University-based
team showed that this genetic material will bind to receptors in human
liver cells and influence the uptake of cholesterol from the blood.
The type of RNA in question is called microRNA (abbreviated to miRNA) due to
its small size. MiRNAs have been studied extensively since their discovery
ten years ago, and have been implicated as players in sev... 阅读全帖
l********i
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来自主题: Stock版 - 心情复杂 (转载)
这是我在俱乐部说的,算是马后炮一下
发信人: longlaoshi (最近喜欢钓鱼), 信区: Pharmstocks
标 题: RGLS搞个毛啊
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jun 26 14:03:28 2015, 美东)
MiRNA治疗丙肝,治疗个毛啊,等药搞出来,都被GILD给治完了
MiRNA治病,忽悠人还差不多,发发文章还可以,治病还是免了吧。做MiRNA的那帮人都
快没饭吃了,都去高LnRNA去了
我看小药股一帮人搞这个,天天喊,真心觉得累。有点象以前这里搞CPRX,自己玩死自己
药王也喊了不少好股,比如前几天提到的DXCM,走得那么牛,根本没人买
他们这个丙肝药根本不行,有效率只有60%多,人家的药有90%多。联合用药也没
意义,谁愿意吃药再打针,光吃药就行了。他们其他合作的药还有点意思,但都还早。
他们做的东西有点象ISIS的,只是目标不太一样,潜力还是有的,目前还不行。
l********i
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39
在药王离开前的那段时间,我在俱乐部和他讨论过,我说我不看好RGLS,还和他打过赌
,说RGLS迟早跌破9的平台,破8。看得出他是看好RGLS的,不然不会和我打这个赌,
而且在RGLS上破11的时候出来向我BSO过,至少当时他是看多的。RGLS突破失败后,
他应该是在小药股提醒过要跑路的,至于他做空没有我不知道
发信人: longlaoshi (最近喜欢钓鱼), 信区: Pharmstocks
标 题: RGLS搞个毛啊
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jun 26 14:03:28 2015, 美东)
MiRNA治疗丙肝,治疗个毛啊,等药搞出来,都被GILD给治完了
MiRNA治病,忽悠人还差不多,发发文章还可以,治病还是免了吧。做MiRNA的那帮人都
快没饭吃了,都去高LnRNA去了
发信人: PatientGuy (灵活,不可固执), 信区: Pharmstocks
标 题: Re: RGLS搞个毛啊
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jun 26 14:12:27 2015, 美东)
这么说,小药股要横尸荒野了。。。。我要去救人。。。。哈哈
发信人: Patie... 阅读全帖
T**7
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来自主题: Immigration版 - 审稿机会 PLoS ONE
"Integrative analysis of berberine-mediated differential miRNA profile and
functional study on miR-21 by anti-miRNA oligonucleotide (AMO) in multiple
myeloma"
希望你:
有miRNA或者myeloma的知识或工作经历
请发给我
你的名字
你的email
你的精短简历(2-3行即可)
你最近的3篇文章
h********n
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来自主题: Biology版 - 感慨一下
周五跟老板聊天的时候我说, 我觉得Weinberg有些文章的有些实验我不太相信(我指的
是有些metastasis exp data), 结果老板说, 你说的是2007年那篇miR-10b的文章吗?
我说不是, 我说的不是miRNA的文章.
那篇miRNA的文章我看过, 因为我以前一直做miRNA, 但我们老板也看, 不太合理; 也可
能他听到什么流言.
感慨一下.
s******r
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42
来自主题: Biology版 - 感慨一下
那篇不是直接被人在nature上质疑了,
而且Weinberg的回答也不是很有力。

周五跟老板聊天的时候我说, 我觉得Weinberg有些文章的有些实验我不太相信(我指的
是有些metastasis exp data), 结果老板说, 你说的是2007年那篇miR-10b的文章吗?
我说不是, 我说的不是miRNA的文章.
那篇miRNA的文章我看过, 因为我以前一直做miRNA, 但我们老板也看, 不太合理; 也可
能他听到什么流言.
感慨一下.
h****r
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我觉得最有意思的是,吃谷物就可以吸收里面的miRNA。是不是直接吃miRNA的效率就非
常低。如果是这样的话,我们做植物研究的人就有用武之地啦。
例如,把针对某个癌症的基因的miRNA转化水稻,然后患者天天吃这种水稻就行啦。
j****x
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其实应该说这个并不奇怪,之前有计算表明,每一个human miRNA都可能参与调控多个
靶点,而且数目还不小(有人认为可能平均下来可能会有上百个,不过争议比较大),
原因可能在于miRNA/mRNA interaction对序列匹配度的要求至少目前看来不是特别的高
,考虑到transcriptome这么大,那么无论内源外源的miRNA能蒙上几个target应该说并
不意外,碰巧又有相关的生物/生理学功能,那自然就会吸引眼球了。
h****r
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我觉得最有意思的是,吃谷物就可以吸收里面的miRNA。是不是直接吃miRNA的效率就非
常低。如果是这样的话,我们做植物研究的人就有用武之地啦。
例如,把针对某个癌症的基因的miRNA转化水稻,然后患者天天吃这种水稻就行啦。
j****x
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其实应该说这个并不奇怪,之前有计算表明,每一个human miRNA都可能参与调控多个
靶点,而且数目还不小(有人认为可能平均下来可能会有上百个,不过争议比较大),
原因可能在于miRNA/mRNA interaction对序列匹配度的要求至少目前看来不是特别的高
,考虑到transcriptome这么大,那么无论内源外源的miRNA能蒙上几个target应该说并
不意外,碰巧又有相关的生物/生理学功能,那自然就会吸引眼球了。
a******p
发帖数: 414
47
来自主题: Biology版 - 咨询下microRNA profiling的收费
1. abi miRNA profile based on Taqman PCR, 一个sample 大约 5000,dollar, 你
有<10个samples的话,10K肯定够了,好处是 它measure mature form of miRNA
2.microarray, available in affymetryix , exiqon ect, it should be 1K/
samples, 有很多假阳性,但总能找到一些
3.exiqon SYBR based miRNA RT PCR, ask the company directly,
4.a lab in our university developed a microarray chip and it is very cheap
but the quality is just so so
r*****t
发帖数: 4793
48
来自主题: Biology版 - paper help!
and this one
Wiley Interdiscip Rev RNA. 2011 Nov 15. doi: 10.1002/wrna.113. [Epub ahead
of print]
Diversity of animal small RNA pathways and their biological utility.
Okamura K.
Source
Department of Developmental Biology, Sloan-Kettering Institute, New York, NY
, USA. o******[email protected].
Abstract
Higher eukaryotes employ extensive post-transcriptional gene regulation to
accomplish fine control of gene expression. The microRNA (miRNA) family
plays important roles in the post-transcriptional gene ... 阅读全帖
a*****x
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来自主题: Biology版 - 外行问一个问题
是比较SLN treated versus untreated miRNA的稳定性. Free miR-34a是没有SLN
treat过的。做了target的qPCR,看miRNA的作用。至于能不能直接对应miRNA的
degradation,需要其他数据支持。
l*******i
发帖数: 153
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circulating miRNA这个基本没争议,张的文章引用率高的文章也主要是一块。
现在有争议的是“在动物体内测到有功能的植物miRNA”,注意,是有“功能”的。这
个发现是最具颠覆性的,到目前为止,也只有张辰宇实验室报道的是positive结果,而
其他几个实验室(包括孟山都)则全是negative。MITBBS上的争议也在这一方面。
就上面当事人的回应,并没有讲清楚为什么别人重复不出来,而他们则可以做出来。因
此,我建议他们可以把实验技术细节发表出来,写成像nature protocols的那样,或者
在某个合适的媒介完全公开,让反对者去重复。
另外,就作者指出的“没有qPCR raw CT values”的问题,在他们的Cell Res文章中,
他们同样也仅是show的“relative level”,没有raw CT values(除了内参U6)。核心
问题扔没有理清:动物体内的植物miRNA测不到的原因,到底是不存在,还是测序方法
有问题?如果是后者,关键问题是什么,能否详细说明一下?
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