l*****t
发帖数: 2019 | 1 做bioinformatics如果不是Python，R双修的话，就过时了。 |
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m******l
发帖数: 1 | 3 早在两年前的时候 nature biotechnology 就发出过对这个领域的前景报导的一
篇文章, 当时也是一个小的bioinformatics公司关门了. 记得还是个女abc当老板什么
的. Anyway, 撇开别的不说, 关键在于business model的问题, 很多公司想用给
licence的方法来拉住大 至药厂客户, 但业内人士对于在internet上传送公司机密
sequence的idea 一向不屑一故. 放开security不说, 这种只对big pharm的市场实在
是太小了. 有点类似 Oracle的 方式, 但oracle的用户市场开阔的多, 但是就licence
的model 来说, Oracle的日子也不是很好过.
Anyway, 从整个pharm的角度来讲, 其实它的市场也只是病人, focus在保健, 和疾病
上, 比起广泛的computer 的市场来说, 本身就小了一些. 要成功, 一定要看好有大的市
场
另外一定要领先对手, 积极创新. viagra其实只针对男人, 本身市场就砍掉一半, 女人
不适用, 它的成功在于它是首例, 领先了对 |
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g***l
发帖数: 4 | 4 an example;
US-CA, Programmer Analyst with A Masters in Computer Science and a PhD in a
scientific field, such as biology, chemistry, or bioinformatics. Job# F1550
Job Number: F1550Job Title: Programmer Analyst with A Masters in Computer
Science and a PhD in a scientific field, such as biology, chemistry, or
bioinformaticsLocation: South San Francisco Job Type: FulltimeSalary:
DOEEligibility Requirements:?In order to conduct face-to-face interviews, we
are able to work with local candidates only |
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B*******e
发帖数: 3882 | 5 有bioinformatics program 的也就那么不多的学校吧。 估计相对质量跟学校的相对总
体水平差不多。
UCLA,U Michigan, Boston Univ(这个的program 比较老， 好像还不错）， NCSU， Ga
Tech（新开的PhD program）。 Rice 的好像是一个professional 的MS program。
University of California, Santa Cruz (new program ?), upenn(好像也是老资格了） |
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w******y
发帖数: 8040 | 6 r u serious?
quite a few systems biology faculty openings out there
but for structural bioinformatics, there are very few openings |
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s*******r
发帖数: 181 | 7 CS is much better than bioinformatics. |
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s*******p
发帖数: 41 | 8 Postdoctoral Fellow (Bioinformatics-focused)
This position is open immediately in the Lo Laboratory, which is focused on
melanoma research in three thematic areas:
Discovering somatically mutated genes in melanoma using exon capture and
next-generation sequencing and studying these genes in the pathogenesis of
melanoma.
Dissecting oncogene co-dependent survival networks in melanoma using V600EB-
RAF as a prototypic melanoma oncogene and siRNA library as a discovery tool.
Understand the mechanism |
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b****r
发帖数: 17995 | 9 我觉得microfluid很难说，工程的东西技术上的难关有时候几十年都攻克不了也不是不
可能。而且将来我觉得医学检验的方向是高通量的core lab，而不是到处分散的小作坊
。bioinformatics应该更有戏，摩尔定律在生物方面也不会失效的，起码目前没有。当
然要有计算机天赋，生物也不能丢 |
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b*****l
发帖数: 9499 | 10 当然是后者了。
想起个毛笑话：小女孩看小男孩洗澡，回家哭，说，为啥自己没有。小女孩的妈安慰说
：那东西，还不是以后想要多少就有多少。
先做好 microfluidics，以后想找人做 bioinformatics，只要你有数据有实验室，
biostatisticians 那还不是想找多少就有多少，想找谁就是谁。 |
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b*****l
发帖数: 9499 | 11 in general，bioinformatics 更忽悠啊。 |
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l****y
发帖数: 398 | 13 bioinformatics.
Everyone needs good programmer, try to be one of them.
our beloved "computer guy" got a tenure track job in a top school without
even giving a job talk.
Academia is desperate to compete with the money loaded industry for such
persons. |
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b******l
发帖数: 1632 | 15 唉，现在满大街都是 bioinformatics 的 job opening 啊，同学们，在这么艰难的就
业环境下。。。 |
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c****b
发帖数: 127 | 16 请问下 bioinformatics 好找工作么, 本人今年fall入学, 学校三流吧, 专业排名60左
右. 本人没有生物背景, EE master 毕业.
谢谢 |
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y***i
发帖数: 11639 | 17 是。现在大部分工作机会需要计算机背景（编程，数据库建立，网站），而不需要生
物背景。
就是这样，做bioinformatics的工作机会也不如老老实实做编程。 |
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v**t
发帖数: 74 | 18 诚心请教：
生物（PhD）背景，没有计算机背景，若转到bioinformatics，能最快上手的编程入门
课程是什莫？Perl, Java,or C/C++? 或者其它？
先谢了！ |
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C*****s
发帖数: 292 | 19 建议用python。Perl不是不好（Perl可能有最多的bioinformatics 包），但是不适合
写大型或很复杂的程序。 |
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v******s
发帖数: 51 | 20 说真的，除非你做实验混不下去了，否则别跳bioinformatics。
干这行就是靠傍着做benchwork的lab吃饭，整天低头哈腰求人要数据
或者做个follow up实验，工作发了CNS也轮不到你当第一作者。
另外放弃自己的专长，跑去和搞统计和计算机的人比modelling和编程，
你也没有任何优势啊。
如果你真是铁了心的要搞bioinfo，最好去个实验和计算都做的lab，
这样也许你能找到适合自己的方向。 |
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l******o
发帖数: 2649 | 21 但是感觉bioinformatics还是最终会成为commodity |
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e*****t
发帖数: 642 | 22 做bioinfo的好处就是可以有借口多上cs和统计的课，将来就是bioinformatics不好找
工作，编程好，统计行，还能勉强糊口，比千老强一点。 |
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d*****u
发帖数: 17243 | 23 有些CS系就是在做bioinformatics啊 |
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b****r
发帖数: 17995 | 24 bioinformatic 我觉得将来市场一定很好的，我们系里最近就一直要招人，但是就是招
不到合适的。几年之内很多分子生物学的东西都将会是海量的data，特别是RNA seq
DNAseq，而做分子生物的没有几个懂这个
我也是做实验的，不过我觉得这种东西是不是将来适合国际合作，在中国招一群计算机
本科生来现学现做这个应该成本低多了。纯粹瞎想，各位砖家拍砖吧。 |
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v******s
发帖数: 51 | 25 嗯，biostat方面最近几年也有越来越多的人做比如small n large p的问题，
但是现在紧跟生物技术发展潮流的是bioinformatics。
原因一方面我觉得是你说的，stat的经典理论不适用于现在的high
dimensional data；另外一个方面是stat的研究偏重理论上的研究，
而bioinfo偏重应用。比如搞bioinfo的人写个算法就可以拿来用
然后发文章，只要它好使；但是搞stat的人不经过证明肯定不敢
这么做，呵呵。 |
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v******s
发帖数: 51 | 26 个人观点是从生物学发展的现状来看，还不能够支撑从系统角度对
生命现象的研究。当然这个是从发展普遍性的方法和技术角度来讲，
打个比方来说，现在的工业科技水平能够支撑载人航天的发展，但是
在中国古代就不可能，虽然那个时候就有人用炮竹和板凳上了天。
现在systems biology在国内外都非常热，国内有的学校已经开设了
系统生物学系，所以这个说法肯定有人不同意，呵呵。从上个世纪末期
开始的bioinformatics到现在的systems biology，对当代生物学的真正
贡献只能靠后人去评价了。 |
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v***n
发帖数: 123 | 27 Bioinformatics deals with the analysis of genetic data, mostly in research
domain. If you study Medicalinformatics,you can look for job in hospitals. |
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T**********t
发帖数: 1604 | 28 前阵子发的一个视频不就是讲的Larry Shapiro实验室的么，他实验室好挤啊。
可惜我不是做bioinformatics的。 |
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e*****t
发帖数: 642 | 29 bioinformatics does not care how much space they have.
a computer is enough. hehe |
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X***n
发帖数: 366 | 30 经典的biochemistry基本处在没落阶段。
你要是统计、数学和生物学基础比较好，做computational biology不错。传统的
bioinformatics没啥。我这些是从科研角度说。
欢迎砖头。 |
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g*********d
发帖数: 233 | 31 Bioinformatics jobs decreased 15% !
anywhere |
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b*******1
发帖数: 127 | 32 Data, samples, platforms, and even experiments are becoming commodity. You
can easily buy all these online. A lot of them are even free. As long as you
can propose important biological/clinical questions, you can get all
process done without any single experiment by yourself. For example, with
several gene/markers in hand and offer money and co-authorship for
validation, any famous specialized lab would happily take the offer. These
commodities freed us bioinformatics scientists from doing tedio... 阅读全帖 |
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d*****r
发帖数: 2583 | 33 the problem is, the current dataset is still too small, covering only
very very small portion of the disease or protein signaling dimension.
Most of the data are 2D, or much less 3D, very very little 4D...
e.g., we don't have any real-time molecular interaction data of hundreds
protein or thousands of proteins in subcellular resolution in vitro, not
even say in vivo...
Without all these technic available, bioinfo can't go far.
platform,
bioinformatics
data, you
validation
we
high-
biological/c... 阅读全帖 |
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M****e
发帖数: 178 | 34 如果是bioinformatics 和 biostatistics 相比呢， 哪份工作更好些？ |
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v*******g
发帖数: 334 | 35 看了以上所有帖子，小结一下：
Bioinformatics 这行离快速增长还是比较远，可能是在平均增长速度吧。
这一行还未看到工业化的迹象，所以增长不可能快。
从讨论的参与者来来看，多是在academic,也证实了公司职位还不多 |
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h******3
发帖数: 190 | 36 一直分不清bioinformatics和biostat的一些分支，例如statistical genetics的区别
。 主要差别是什么? |
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P******n
发帖数: 78 | 37 看到某些人攻击bioinformatics是辅助啊无用啥的，真是怀疑是做生物的么？搞生物的
谁敢站出来说自己做的实验手段是是主导。计算模型只是众多模型中的一种，只是手段
而已。你说计算模型不准确，那你跟我举个aniaml或者cell line 的模型可以无误的模
拟疾病机制。那些可都是发展了多少年的了？你喜欢实验手段无可厚非，不要就说其他
手段是垃圾，太井底之蛙了。那些说系统生物学是个笑话的人，大概不是不懂生物系统
就是不懂计算模型。我不太建议学计算机的数学的人搞生物信息，除非真的很热爱生物
，很想解决生物难题，不然还是去模拟其他系统。搞生物出生而且逻辑思维远远强于动
手能力的，生物信息是个很好的选择，可以提出自己的假设，选择模型数据，在很短时
间内验证自己的想法，还可以找实验室帮助验证(注意，我没有说去雇几个国内廉价生
物博士，上面有些人好像说要雇佣国内廉价搞计算的，好像国内计算机工资不低吧) 。
至于生物信息前景，呵呵，这个目前比纯生物还是强很多，至于以后，还是那话，任何
专业都是发展的，跟不上节奏还是白搭。科学是建在技术发展的基础上，生物信息之所
以火在于与之相关的技术在飞速发展... 阅读全帖 |
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P******n
发帖数: 78 | 38 bioinformatics 可以作为工具，但绝对不仅仅是工具，比如data mining这一方向，就
可以对生物系统进化，调控机制提出很多假设。这些假设不是做一两个小试验就可以发
现和论证的。你说的TFbinding的预测，的确准确率不高，很多计算模型的准确率都让
生物学家不满意，但是瓶颈往往在于现在的试验数据太片面，不准确，或者量太少，但
根据数据建立模型本身没有错误，如果认为这都不算科学，那就没有真正的科学了。如
何证明？预测结果有多准确就是对模型本身最好的验证，即使准确率现在还不高，但也
比抓阄或者一个一个的试强，这就是贡献，能够进一步缩短目标就是贡献。bioinf有没
有原创性？数据摆在那里，不同人能挖出不同东西，这就是水平和原创。
bioinfo |
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l*********s
发帖数: 5409 | 39 In some sense bioinformatics is kind of quantitative finance. It is just
natural for ppl to doubt its usefulness.
了。 |
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c*******e
发帖数: 3 | 40 现在在一个西部的biotech公司，在drug development的informatics部门
我们组需要招一个2011 summer intern来做bioinformatics的几个projects
Requirement:
experience in microarray processing and expression analysis; next generation
sequencing analysis is a plus but is not required;
knowledge of statistical testing and pathway analysis;
having certain knowledge of genetic diseases and cancer development;
如果有兴趣的话，可以发简历到 cortolife AT gmail DOT com
Thanks. |
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t******s
发帖数: 27 | 41 I think bioinformatics is a tool for biomedical research. We do need those,
although this field may be too crowded now. |
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d*******o
发帖数: 493 | 42 In short, bioinformatics needs PCR skills:
P: Perl or Python to manipulate and integrate data;
C: SQL to store and query data;
R: R to model and visualize data. |
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C***k
发帖数: 1570 | 43 “
比较喜欢统计，想换到bioinformatics 或是genetics的实验室。一个实验室是
proteome informatics，老板是AP，人很NICE。文章也不错。另一个老板是ASSOCIATE
PROFESSOR，人也很好。研究 GWAS和其平台的构建。手下带出很多的PI，但是因为研究
方法，发的文章IF不是很高。想问一下大家该如何选择？
1。 对将来还没有特定的想法，公司或是学校都可以，但是不想当很久的博后。不知道
哪个方向发展的潜力更大一些。
2。 另外如果将来想回国发展的话，应该怎么样选择。
3。 不知道随着NEXT GENERATION SEQUENCING 的发展，GWAS 的发展会不会受到限制。
4。也有其他别的MEDICAL INFORMATICS 的选择（做NLP， MACHINE LEARNING），但是
怕计算机方向的知识不够，学习太难。
先谢过大家啦！” |
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p*u
发帖数: 2978 | 44 'understanding bioinformatics' is the best i have ever read. |
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T*****t
发帖数: 6 | 46 入门的还是进阶的？
傻瓜丛书有一本bioinformatics好像，我们老师推荐过 |
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e****l
发帖数: 318 | 47 不好意思又来麻烦大家了！这次国内那小孩又拿到了uic的bioinformatics offer,
这次他有点迟疑，这专业有点偏CS。
另一个offer是CS@Old Dominion University，但是还是做生物相关的研究
他很犹豫，好歹uic的ranking不错，Old Dominion University的综排比较靠后，但是
CS的专业排名在NRC上查是排40。而且很多人说CS毕业了更好找工作。
本科物理，研究生阶段读的生物
谢谢大家了！ |
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s*********x
发帖数: 1923 | 48 这倒是真的，还不如看introductary perl for bioinformatics 来的实在。s. eddy的
书很多计算机系的人读起来都有困难。 |
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a****m
发帖数: 693 | 49 Variable selection for discriminant analysis with Markov random field
priors for the analysis of microarray data
Bioinformatics (2011) 27(4): 495-501 first published online December 14,
2010
i*********[email protected] |
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f********n
发帖数: 6465 | 50 computational biology/bioinformatics硕士毕业好找工作吗？
如果有好前途，可以考虑博士毕业后再自费读个硕士。也不知道好不好读。
谢谢指教。 |
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