d********m
发帖数: 3662 | 1 小弟不才，薄厚两年半，心气有点泄了，不太想继续了。国内一个大医院在筹建数据中
心，有一个机会，工作岗位不明。
我读博的时候，顺手捞了一个统计硕士，统计建模之类的相当扎实，工作中也经常用到
。但编程技能相当弱。想请教一下，如果想去医学院附属的数据中心发展（比如芝大那
个translational data center)，有什么技能（软件？算法？）是几个月之内能强化到
去了之后就能即插即用的。
谢谢各位专家点拨 |
s******s
发帖数: 13035 | 2 点名问的哈，
这种医学院附属的数据中心，大概有三种吧。
第一种是给医院服务的，帮助build各种系统什么的，和你没啥关系
第二种是负责给校内科研提供支持的，包括知识上的或者pipeline/cluster方面的。
既然是搞科研的，那要求肯定五花八门，但是基本编程，linux，科研能力这些一
般是要的
第三种是像我们芝大转化科学中心的，自己是一个独立的实体，和校内科研合作
不是必须，主要做大数据项目的。我们要求其实和第二类差不多，当然独立科研
的能力要求没那么高，但是反过来，编程，pipeline，云计算这些希望经验再丰富
一点。
【在 d********m 的大作中提到】
: 小弟不才，薄厚两年半，心气有点泄了，不太想继续了。国内一个大医院在筹建数据中
: 心，有一个机会，工作岗位不明。
: 我读博的时候，顺手捞了一个统计硕士，统计建模之类的相当扎实，工作中也经常用到
: 。但编程技能相当弱。想请教一下，如果想去医学院附属的数据中心发展（比如芝大那
: 个translational data center)，有什么技能（软件？算法？）是几个月之内能强化到
: 去了之后就能即插即用的。
: 谢谢各位专家点拨
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s******s
发帖数: 13035 | 3 芝加哥大学转化数据科学中心（原名大数据科学中心）https://ctds.uchicago.edu
继续招收bioinformatician/ computational biologist/ scientific programer.
这个职位是主要是为Genomics Data Commons设置的，要求熟悉二代测序pipeline开发。
https://uchicago.wd5.myworkdayjobs.com/External/job/Shoreland/Senior-
Bioinformatician_JR06313
https://uchicago.wd5.myworkdayjobs.com/External/job/Shoreland/Senior-
Bioinformatician_JR05236
【在 d********m 的大作中提到】
: 小弟不才，薄厚两年半，心气有点泄了，不太想继续了。国内一个大医院在筹建数据中
: 心，有一个机会，工作岗位不明。
: 我读博的时候，顺手捞了一个统计硕士，统计建模之类的相当扎实，工作中也经常用到
: 。但编程技能相当弱。想请教一下，如果想去医学院附属的数据中心发展（比如芝大那
: 个translational data center)，有什么技能（软件？算法？）是几个月之内能强化到
: 去了之后就能即插即用的。
: 谢谢各位专家点拨
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d********m
发帖数: 3662 | 4 thanks very much
【在 s******s 的大作中提到】
: 点名问的哈，
: 这种医学院附属的数据中心，大概有三种吧。
: 第一种是给医院服务的，帮助build各种系统什么的，和你没啥关系
: 第二种是负责给校内科研提供支持的，包括知识上的或者pipeline/cluster方面的。
: 既然是搞科研的，那要求肯定五花八门，但是基本编程，linux，科研能力这些一
: 般是要的
: 第三种是像我们芝大转化科学中心的，自己是一个独立的实体，和校内科研合作
: 不是必须，主要做大数据项目的。我们要求其实和第二类差不多，当然独立科研
: 的能力要求没那么高，但是反过来，编程，pipeline，云计算这些希望经验再丰富
: 一点。
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d********m
发帖数: 3662 | 5 very helpful, thanks a gain
发。
【在 s******s 的大作中提到】
: 芝加哥大学转化数据科学中心（原名大数据科学中心）https://ctds.uchicago.edu
: 继续招收bioinformatician/ computational biologist/ scientific programer.
: 这个职位是主要是为Genomics Data Commons设置的，要求熟悉二代测序pipeline开发。
: https://uchicago.wd5.myworkdayjobs.com/External/job/Shoreland/Senior-
: Bioinformatician_JR06313
: https://uchicago.wd5.myworkdayjobs.com/External/job/Shoreland/Senior-
: Bioinformatician_JR05236
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h*****s
发帖数: 153 | 6
为什么不继续呢，感觉你这个方向有个一作Nature Biotechnology/methods/genetics
就能找到教职了。。。换个实验室拼一把？
【在 d********m 的大作中提到】
: 小弟不才，薄厚两年半，心气有点泄了，不太想继续了。国内一个大医院在筹建数据中
: 心，有一个机会，工作岗位不明。
: 我读博的时候，顺手捞了一个统计硕士，统计建模之类的相当扎实，工作中也经常用到
: 。但编程技能相当弱。想请教一下，如果想去医学院附属的数据中心发展（比如芝大那
: 个translational data center)，有什么技能（软件？算法？）是几个月之内能强化到
: 去了之后就能即插即用的。
: 谢谢各位专家点拨
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d********m
发帖数: 3662 | 7 换实验室没有必要。目前project还是很好的，老板也很支持。但是属于high risk,
high reward的那种，心里打鼓的厉害。刚好心里也想回国了。所以到版上问问
genetics
【在 h*****s 的大作中提到】
:
: 为什么不继续呢，感觉你这个方向有个一作Nature Biotechnology/methods/genetics
: 就能找到教职了。。。换个实验室拼一把？
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d********m
发帖数: 3662 | 8 目前想拼下nature neuroscience，拼到了，也准备回国发展了
genetics
【在 h*****s 的大作中提到】
:
: 为什么不继续呢，感觉你这个方向有个一作Nature Biotechnology/methods/genetics
: 就能找到教职了。。。换个实验室拼一把？
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h*****s
发帖数: 153 | 9
你博士阶段有这些Nature或者Cell大子刊的话，感觉发一两片Genome biology/
research 估计就够了。
加油。
【在 d********m 的大作中提到】
: 目前想拼下nature neuroscience，拼到了，也准备回国发展了
:
: genetics
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d********m
发帖数: 3662 | 10 thanks
【在 h*****s 的大作中提到】
:
: 你博士阶段有这些Nature或者Cell大子刊的话，感觉发一两片Genome biology/
: research 估计就够了。
: 加油。
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n******7
发帖数: 12463 | 11 如果是偏科研的，用好python/R的各种包就好了
如果是偏工程的，会java就好了，不过这个不跟着做项目不好练级 |
c********e
发帖数: 598 | 12
You can apply industry job. R or python. You can learn GUI Software in a
few hours.
【在 d********m 的大作中提到】
: 小弟不才，薄厚两年半，心气有点泄了，不太想继续了。国内一个大医院在筹建数据中
: 心，有一个机会，工作岗位不明。
: 我读博的时候，顺手捞了一个统计硕士，统计建模之类的相当扎实，工作中也经常用到
: 。但编程技能相当弱。想请教一下，如果想去医学院附属的数据中心发展（比如芝大那
: 个translational data center)，有什么技能（软件？算法？）是几个月之内能强化到
: 去了之后就能即插即用的。
: 谢谢各位专家点拨
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s******s
发帖数: 13035 | 13 学python
学python
学python
重要的事情说三遍
不是说好不好用，而是好不好找工作。我估计找工作的方便程度python = 5 java = 50
R
【在 n******7 的大作中提到】
: 如果是偏科研的，用好python/R的各种包就好了
: 如果是偏工程的，会java就好了，不过这个不跟着做项目不好练级
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n******7
发帖数: 12463 | 14 你说找啥工作？
找bioinfo，可能是python好使
找data scientist，也可能是
找software develop engineer，就肯定不是了
而工作数量比较 bioinfo : ds : sde 大致是 1:10:100
收入水平 bioinfo < ds < sde
需要学习的知识 bioinfo > ds > sde
而且学python是个伪命题，两点：
1. python的卖点就是易学，中位数水平的java写手摸几个小时就能达到python写手的
中位数水平。反过来就不行了。很多python写手，特别是bioinfo的python写手只会写
脚本，对OOP根本没入门
2. 用python不是用python本身，而是各种层出不穷的包，每个包都类似个DSL，都是要
学。不难但是很繁，把各种主流包用好下的功夫不必学java啥的少。
java/c#也很多包，但是由于强力的IDE支持，上手不要太快，连蒙带试代码就出来了。
大部分包也是java/c#写的，想深入了解看看源代码就清楚怎么实现的了
python嘛，有性能需求的地方得上c/c++,你得再学这些才能改源码修bug。之前一个课
题需要，我改过SK-learn的一些源码，只是python部分，因为我的c/c++经验很有限。
至于开发体验，用java/c#这样的静态OOP语言不要太爽，电脑可以帮你考虑很多细节，
比python无脑多了。写点小脚本还是python操快猛。
python最大的卖点是data science， ML/DL之类，这得感谢numpy
就编程工作机会和职业发展，还是java/c#价值高
我的两分钱
50
【在 s******s 的大作中提到】
: 学python
: 学python
: 学python
: 重要的事情说三遍
: 不是说好不好用，而是好不好找工作。我估计找工作的方便程度python = 5 java = 50
: R
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s******s
发帖数: 13035 | 15 那确实是。我说的是本版的，也就是bioinfo，ML, data science这方面。
另外，就算码工java还是老大，但是python很猛 啊 https://www.codeplatoon.org/wp
-content/uploads/2019/04/Screen-Shot-2019-04-23-at-1.22.10-PM-1020x1030.png
【在 n******7 的大作中提到】
: 你说找啥工作？
: 找bioinfo，可能是python好使
: 找data scientist，也可能是
: 找software develop engineer，就肯定不是了
: 而工作数量比较 bioinfo : ds : sde 大致是 1:10:100
: 收入水平 bioinfo < ds < sde
: 需要学习的知识 bioinfo > ds > sde
: 而且学python是个伪命题，两点：
: 1. python的卖点就是易学，中位数水平的java写手摸几个小时就能达到python写手的
: 中位数水平。反过来就不行了。很多python写手，特别是bioinfo的python写手只会写
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n******7
发帖数: 12463 | 16 这个图坐标不明确，不好参考
感觉是对数scale的相对变化，这个还是没有绝对值有说服力
有的语言可能一夜之间流行度增加十倍，从0.001% 到 0.01% :)
还有数据收集的bias
比如java的position,可能JD里面顺便写个python
而只要python的position，写个java的可能性就不大了
你是做数据的，你明白的
我个人不喜欢python就两个原因
1. 得懂c/c++, 不然纯python实现有些东西太慢了
2. 写复杂点的东西比用C#累,包括IDE提示，debug，deploy等等
几十行的脚本写写还是不错的。另外做数据相关的也只能用python才能快猛了
wp
png
【在 s******s 的大作中提到】
: 那确实是。我说的是本版的，也就是bioinfo，ML, data science这方面。
: 另外，就算码工java还是老大，但是python很猛 啊 https://www.codeplatoon.org/wp
: -content/uploads/2019/04/Screen-Shot-2019-04-23-at-1.22.10-PM-1020x1030.png
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w****p
发帖数: 6 | 17 被北京某医院耍过的人现身说法。我建议别去，工资不高，待遇不好。人家医生在医院
美滋滋，你一个后台辅助部门没钱没人脉，不如去高校。医院管理很混乱，给你说好的
待遇也不知道能兑现多少。你要是真想做生物统计，去个实验室专门做生统，找个相关
的教职算了。
【在 d********m 的大作中提到】
: 小弟不才，薄厚两年半，心气有点泄了，不太想继续了。国内一个大医院在筹建数据中
: 心，有一个机会，工作岗位不明。
: 我读博的时候，顺手捞了一个统计硕士，统计建模之类的相当扎实，工作中也经常用到
: 。但编程技能相当弱。想请教一下，如果想去医学院附属的数据中心发展（比如芝大那
: 个translational data center)，有什么技能（软件？算法？）是几个月之内能强化到
: 去了之后就能即插即用的。
: 谢谢各位专家点拨
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w****p
发帖数: 6 | 18 你做数据方向的，在医院搞不好还没那些做生物实验的研究员吃香呢，人家发文章影响
因子高，科室主任喜欢，去了以后人家觉得你是个修电脑的。。。 |
d********m
发帖数: 3662 | 19 re
i began to learn python early this year. haven't made much progress though
50
【在 s******s 的大作中提到】
: 学python
: 学python
: 学python
: 重要的事情说三遍
: 不是说好不好用，而是好不好找工作。我估计找工作的方便程度python = 5 java = 50
: R
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d********m
发帖数: 3662 | 20 wow
learned so much from this reply. thanks
【在 n******7 的大作中提到】
: 你说找啥工作？
: 找bioinfo，可能是python好使
: 找data scientist，也可能是
: 找software develop engineer，就肯定不是了
: 而工作数量比较 bioinfo : ds : sde 大致是 1:10:100
: 收入水平 bioinfo < ds < sde
: 需要学习的知识 bioinfo > ds > sde
: 而且学python是个伪命题，两点：
: 1. python的卖点就是易学，中位数水平的java写手摸几个小时就能达到python写手的
: 中位数水平。反过来就不行了。很多python写手，特别是bioinfo的python写手只会写
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d********m
发帖数: 3662 | 21 人家医生在医院美滋滋，你一个后台辅助部门没钱没人脉
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true, thanks for the tips |
h*****s
发帖数: 153 | 22
你之前不会python？那ML DL 那些你都用什么搞的？R？
【在 d********m 的大作中提到】
: re
: i began to learn python early this year. haven't made much progress though
:
: 50
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s*********n
发帖数: 34 | 23 如果有选择，就不要做bioinfo的工作。
bioinfo的工作机会少，工资低，但是要求还很高。
做DS和SDE都行。
【在 n******7 的大作中提到】
: 你说找啥工作？
: 找bioinfo，可能是python好使
: 找data scientist，也可能是
: 找software develop engineer，就肯定不是了
: 而工作数量比较 bioinfo : ds : sde 大致是 1:10:100
: 收入水平 bioinfo < ds < sde
: 需要学习的知识 bioinfo > ds > sde
: 而且学python是个伪命题，两点：
: 1. python的卖点就是易学，中位数水平的java写手摸几个小时就能达到python写手的
: 中位数水平。反过来就不行了。很多python写手，特别是bioinfo的python写手只会写
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n******7
发帖数: 12463 | 24 我本来也这么想，不过我们这里的pharmaceutical公司很多，好像待遇还不错
也不用准备。所以先试试，能拿个offer也就能看看他们给多少了
DS我得刷下profile，最近几年天天写C#，DS很多技能闲置了
SDE我得刷题，等这波bioinfo的工作申差不多了我就开始。我们这里没啥IT大公司，就
怕还不如大厂做bioinfo的待遇。之前看个IT公司的广告，indeed上面只看到了说自己
待遇好，点到公司页面，发现写着 xxx-yyy k，还没我现在拿的多。。
【在 s*********n 的大作中提到】
: 如果有选择，就不要做bioinfo的工作。
: bioinfo的工作机会少，工资低，但是要求还很高。
: 做DS和SDE都行。
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s*********n
发帖数: 34 | 25 C#玩得溜，可以考虑以C#为中心，拓展技能。
C#虽说没有Java流行，但是总体的工作机会还是比bioinfo多多了。
微软有自己的全套技术：云计算、数据库、桌面开发、网络开发...
有了Unity3D锐器，C#在游戏开发、虚拟现实方面也蛮好玩。
当然，如果大药厂职位稳定，给的待遇好，继续呆着也行。实在无聊了，就做点好玩的
业余项目，修炼技能。
【在 n******7 的大作中提到】
: 我本来也这么想，不过我们这里的pharmaceutical公司很多，好像待遇还不错
: 也不用准备。所以先试试，能拿个offer也就能看看他们给多少了
: DS我得刷下profile，最近几年天天写C#，DS很多技能闲置了
: SDE我得刷题，等这波bioinfo的工作申差不多了我就开始。我们这里没啥IT大公司，就
: 怕还不如大厂做bioinfo的待遇。之前看个IT公司的广告，indeed上面只看到了说自己
: 待遇好，点到公司页面，发现写着 xxx-yyy k，还没我现在拿的多。。
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n******7
发帖数: 12463 | 26 你说的很在理
我现在主要想努力那个药厂的offer，看看他们给多少钱，了解下市场
我现在的位置其实待遇还不错，每天实际写码时间不多，很多时候在各个组直接扯谈。
每年可以休25天。
C#语言上甩java 10条街，就是dotnet core出的太晚了
要是没拿到比现在好的offer我就刷题找C#工作了
【在 s*********n 的大作中提到】
: C#玩得溜，可以考虑以C#为中心，拓展技能。
: C#虽说没有Java流行，但是总体的工作机会还是比bioinfo多多了。
: 微软有自己的全套技术：云计算、数据库、桌面开发、网络开发...
: 有了Unity3D锐器，C#在游戏开发、虚拟现实方面也蛮好玩。
: 当然，如果大药厂职位稳定，给的待遇好，继续呆着也行。实在无聊了，就做点好玩的
: 业余项目，修炼技能。
|
d********m
发帖数: 3662 | 27 不搞ml dl之类的
建模做的基本就是传统统计，比如linear mixed effect model什么的。用的比较多的
是R里的nlme之类的。python是从来没用过。所以很焦躁
【在 h*****s 的大作中提到】
:
: 你之前不会python？那ML DL 那些你都用什么搞的？R？
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h*****s
发帖数: 153 | 28
啊，那还是得学点编程。我上完了我们大学除了两门测度论以外的所有stats phd
comprehensive exam的课后感受是，感觉统计的编程和cs比太毛毛雨了。
【在 d********m 的大作中提到】
: 不搞ml dl之类的
: 建模做的基本就是传统统计，比如linear mixed effect model什么的。用的比较多的
: 是R里的nlme之类的。python是从来没用过。所以很焦躁
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h*****s
发帖数: 153 | 29
C太不适合新手了，语法复杂，包也少。但是没学过C不能说懂programming，学完了C，
你基本上对语言如何跟硬件打交道就有一定的了解了。
【在 s*********n 的大作中提到】
: C#玩得溜，可以考虑以C#为中心，拓展技能。
: C#虽说没有Java流行，但是总体的工作机会还是比bioinfo多多了。
: 微软有自己的全套技术：云计算、数据库、桌面开发、网络开发...
: 有了Unity3D锐器，C#在游戏开发、虚拟现实方面也蛮好玩。
: 当然，如果大药厂职位稳定，给的待遇好，继续呆着也行。实在无聊了，就做点好玩的
: 业余项目，修炼技能。
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s*********n
发帖数: 34 | 30 不用焦躁，努力干起来。
要学ML，可以从Coursera上 Andrew Ng的课程开始学，用Python把作业完成一遍。然后
完成几个项目，比如Kaggle上的项目。同时刷刷SQL和Python题目。
高强度搞两个月，然后就开始投简历试水。
【在 d********m 的大作中提到】
: 不搞ml dl之类的
: 建模做的基本就是传统统计，比如linear mixed effect model什么的。用的比较多的
: 是R里的nlme之类的。python是从来没用过。所以很焦躁
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s*********n
发帖数: 34 | 31 如果等米下锅，不要从C开始学习。
学JavaScript（前端、全栈）、Python（数据科学、DL、后端）、Java都行。
C# 跟Java类似。由于鲍尔默的傻逼，耽误了大好的发展机会，不过还是很有潜力发展
起来。
【在 h*****s 的大作中提到】
:
: C太不适合新手了，语法复杂，包也少。但是没学过C不能说懂programming，学完了C，
: 你基本上对语言如何跟硬件打交道就有一定的了解了。
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h*****s
发帖数: 153 | 32
C和Java都学过，Java写过android app，C写过操作系统。不过现在在啥也记不得了。
ML，DL用python，写脚本用python，自然语言用python。现在全部都用python。连画图
除非万不得已，都直接matplot搞定。
C在图像处理领域貌似还很有用，处理那种bitmap文件之类的好像很有优势。我外行，
瞎说的。
【在 s*********n 的大作中提到】
: 如果等米下锅，不要从C开始学习。
: 学JavaScript（前端、全栈）、Python（数据科学、DL、后端）、Java都行。
: C# 跟Java类似。由于鲍尔默的傻逼，耽误了大好的发展机会，不过还是很有潜力发展
: 起来。
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s******s
发帖数: 13035 | 33 bioinfo现在分两类
NGS和非NGS
做NGS pipeline的，工作机会还是非常多的，招人是很难的，工资还是不错的
非NGS，尤其是广大postdoc边wet边dry自我训练出来的一手好R，这样的
candidate实在是太多太多了，就不要指望太多了。
【在 s*********n 的大作中提到】
: 如果有选择，就不要做bioinfo的工作。
: bioinfo的工作机会少，工资低，但是要求还很高。
: 做DS和SDE都行。
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d********m
发帖数: 3662 | 34 那个ml没啥好学的，比研究生学的优化和贝叶斯差的远了
关键是找不到什么peoject做
【在 s*********n 的大作中提到】
: 不用焦躁，努力干起来。
: 要学ML，可以从Coursera上 Andrew Ng的课程开始学，用Python把作业完成一遍。然后
: 完成几个项目，比如Kaggle上的项目。同时刷刷SQL和Python题目。
: 高强度搞两个月，然后就开始投简历试水。
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d********m
发帖数: 3662 | 35 属实
感觉很多r packages里的代码，就是能算就行。哈哈
【在 h*****s 的大作中提到】
:
: C和Java都学过，Java写过android app，C写过操作系统。不过现在在啥也记不得了。
: ML，DL用python，写脚本用python，自然语言用python。现在全部都用python。连画图
: 除非万不得已，都直接matplot搞定。
: C在图像处理领域貌似还很有用，处理那种bitmap文件之类的好像很有优势。我外行，
: 瞎说的。
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d********m
发帖数: 3662 | 36 赞一手好R，哈哈
【在 s******s 的大作中提到】
: bioinfo现在分两类
: NGS和非NGS
: 做NGS pipeline的，工作机会还是非常多的，招人是很难的，工资还是不错的
: 非NGS，尤其是广大postdoc边wet边dry自我训练出来的一手好R，这样的
: candidate实在是太多太多了，就不要指望太多了。
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n******7
发帖数: 12463 | 37 做NGS pipeline data processing的位置是很多
大概能有bioinfo位置的一半
但是恕我直言，工资很一般，实在没啥技术含量
我身边做生物的朋友很多都会python和NGS data processing
然并卵
【在 s******s 的大作中提到】
: bioinfo现在分两类
: NGS和非NGS
: 做NGS pipeline的，工作机会还是非常多的，招人是很难的，工资还是不错的
: 非NGS，尤其是广大postdoc边wet边dry自我训练出来的一手好R，这样的
: candidate实在是太多太多了，就不要指望太多了。
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h*****s
发帖数: 153 | 38
还得会数学建模，统计算法
整点Metropolis-Hastings，Jacobi，Gauss-Seidal 之类的就可以忽悠人了。
【在 n******7 的大作中提到】
: 做NGS pipeline data processing的位置是很多
: 大概能有bioinfo位置的一半
: 但是恕我直言，工资很一般，实在没啥技术含量
: 我身边做生物的朋友很多都会python和NGS data processing
: 然并卵
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