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Biology版 - 总觉得“生物信息学”不大靠谱
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话题: 生物话题: 生信话题: 软件话题: 信息学话题: 信息
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1 (共1页)
B*******c
发帖数: 5056
1
我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
生物信息学”提供了空间。
以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
机的人并不会消失,只是行业萎缩。
ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?
m*b
发帖数: 1421
2
现在大规模测序的数据量太大
还是需要生物信息学分析的
a******k
发帖数: 1190
3
The last sentence disqualifies you from making such a statement

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

a********k
发帖数: 2273
4
想想十年前和现在的web就知道了

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

a***y
发帖数: 19743
5
lol

【在 a******k 的大作中提到】
: The last sentence disqualifies you from making such a statement
B*******c
发帖数: 5056
6
好吧您有随意评价我的权力。
字符界面转化成图形界面又不难,是那些开发软件的人不会吗?
生物信息学就应该为生物学者提供简单易用的工具。它们现在似乎忘记了自己的本分。

【在 a******k 的大作中提到】
: The last sentence disqualifies you from making such a statement
s******y
发帖数: 17729
7
只会做各种blot,ps图片的传统分子生物学,细胞生物学基本上就是不需要智商的活儿
,淘汰是早晚的事儿。在杂交炉旁边,倒倒buffer就行,或者对着显微镜里面咔嚓咔嚓
,放个猴子和放个人没有啥显著性差异

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

a******a
发帖数: 283
8
haha totally agree.
i think bioinformatics will be very important in the future for bioscience,
in fact, it will boost the growth of bioscience. as we develop more
experimental data, data mining with a solid and good structure in turn will
help the growth of basic science.

【在 a******k 的大作中提到】
: The last sentence disqualifies you from making such a statement
a******a
发帖数: 283
9
haha totally agree.
i think bioinformatics will be very important in the future for bioscience,
in fact, it will boost the growth of bioscience. as we develop more
experimental data, data mining with a solid and good structure in turn will
help the growth of basic science.

【在 a******k 的大作中提到】
: The last sentence disqualifies you from making such a statement
a******a
发帖数: 283
10
haha totally agree.
i think bioinformatics will be very important in the future for bioscience,
in fact, it will boost the growth of bioscience. as we develop more
experimental data, data mining with a solid and good structure in turn will
help the growth of basic science.

【在 a******k 的大作中提到】
: The last sentence disqualifies you from making such a statement
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D*a
发帖数: 6830
11
显著不显著你能肉眼看出来?
B*******c
发帖数: 5056
12
楼上这些反对我的,全都是人云己云,拾人牙慧,
没说出半点新鲜的东西。
m*********r
发帖数: 2456
13
生物学者你好!
你应该转个弯想想,为啥你不为生物信息学提供实验验证呢?这也是你的本分啊!

【在 B*******c 的大作中提到】
: 好吧您有随意评价我的权力。
: 字符界面转化成图形界面又不难,是那些开发软件的人不会吗?
: 生物信息学就应该为生物学者提供简单易用的工具。它们现在似乎忘记了自己的本分。

B*******c
发帖数: 5056
14
看不懂你在说什么

【在 m*********r 的大作中提到】
: 生物学者你好!
: 你应该转个弯想想,为啥你不为生物信息学提供实验验证呢?这也是你的本分啊!

m*********r
发帖数: 2456
15
这也就是你的硬伤。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 看不懂你在说什么
l********8
发帖数: 197
16
其实我同意楼主的观点,就是现在生物信息似乎有些太热了。而且很多从事生物信息的
人不是生物出生,更多的是从传统生物努力转到生物信息的,特别是近几年,生物信息
热的太不真实了。。。不过我想,如果看看计算机科学,我觉得也热得让我不敢相信了。
但是反过来想一想,其实,目前对于大量数据的分析确实是有很多位置的,很多人去从
事他们,不是说就一定要在科研界有多大的突破,而很大程度上是希望有个不错的工作
。目前来说,这个需求是大量存在的,但是以后,如果这种需求真的被满足了,或者有
了其他技术革新,那么确实会如楼主所说,会有缩水的风险。不过话说回来,那个专业
没有失业的风险呢?其实我觉得,到了那个时候,生物信息前沿的工作人员,如果想要
继续有工作,自然会找到其他相关的课题,会有相应的解决方法。就象现在,很多从事
传统生物研究的人,在面临职业瓶颈的时候会想到去多读一个生物信息的硕士,那样可
以帮助自己找到相关的工作。楼主不用去担忧自己没有能力改变的事情了~
B*******c
发帖数: 5056
17
嗯,故弄玄虚也是蒙人的一大法宝。

【在 m*********r 的大作中提到】
: 这也就是你的硬伤。
v*******e
发帖数: 11604
18
字符界面是必要的。现在流行"reproducible research",图形界面的软件解决不了这
个问题。
B*******c
发帖数: 5056
19
多谢您的留言,握爪
其实我在考察这个行业,有没有前途,该不该往里跳。

了。

【在 l********8 的大作中提到】
: 其实我同意楼主的观点,就是现在生物信息似乎有些太热了。而且很多从事生物信息的
: 人不是生物出生,更多的是从传统生物努力转到生物信息的,特别是近几年,生物信息
: 热的太不真实了。。。不过我想,如果看看计算机科学,我觉得也热得让我不敢相信了。
: 但是反过来想一想,其实,目前对于大量数据的分析确实是有很多位置的,很多人去从
: 事他们,不是说就一定要在科研界有多大的突破,而很大程度上是希望有个不错的工作
: 。目前来说,这个需求是大量存在的,但是以后,如果这种需求真的被满足了,或者有
: 了其他技术革新,那么确实会如楼主所说,会有缩水的风险。不过话说回来,那个专业
: 没有失业的风险呢?其实我觉得,到了那个时候,生物信息前沿的工作人员,如果想要
: 继续有工作,自然会找到其他相关的课题,会有相应的解决方法。就象现在,很多从事
: 传统生物研究的人,在面临职业瓶颈的时候会想到去多读一个生物信息的硕士,那样可

B*******c
发帖数: 5056
20
觉得这个解释挺牵强的。当然,软件能坚持字符界面,也反映出这个行业现在比较火,
还可以撒撒娇,装装逼,不必去讨好最终需求者。

【在 v*******e 的大作中提到】
: 字符界面是必要的。现在流行"reproducible research",图形界面的软件解决不了这
: 个问题。

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l********8
发帖数: 197
21
我觉得你能够去认真思考这个专业其实挺好的,因为很多人去做bioinf自己也没有搞清
楚自己喜不喜欢,适不适合,以及未来的发展如何。不过我觉得,相比于传统的生物,
生信的机会多了不是一点点,但是一个比较大的缺点是,如果要拿绿卡,生物信息发的
文章可能引用和影响因子都不是非常多,所以走EB1比较难,但是工作机会多很多,那
样的话,走EB2还是很有希望了。如果是未来怎么样,那我觉得谁也不敢打包票的~毕竟
生物经常就是热一阵,然后冷下来。。。不知道这一阵可以热多久。。可以安慰的是,
生物信息对于转行计算机还是相对容易些的。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 多谢您的留言,握爪
: 其实我在考察这个行业,有没有前途,该不该往里跳。
:
: 了。

B*******c
发帖数: 5056
22
多谢指导,
最怕的是“生物信息”的大潮过后,众喽啰们晒死在沙滩上……

【在 l********8 的大作中提到】
: 我觉得你能够去认真思考这个专业其实挺好的,因为很多人去做bioinf自己也没有搞清
: 楚自己喜不喜欢,适不适合,以及未来的发展如何。不过我觉得,相比于传统的生物,
: 生信的机会多了不是一点点,但是一个比较大的缺点是,如果要拿绿卡,生物信息发的
: 文章可能引用和影响因子都不是非常多,所以走EB1比较难,但是工作机会多很多,那
: 样的话,走EB2还是很有希望了。如果是未来怎么样,那我觉得谁也不敢打包票的~毕竟
: 生物经常就是热一阵,然后冷下来。。。不知道这一阵可以热多久。。可以安慰的是,
: 生物信息对于转行计算机还是相对容易些的。

l**********1
发帖数: 5204
23
Math统计和ICT~=Bioinfomatics two legs, then plus Bio stuff
LZ now only holds half leg about Bio stuff?

【在 B*******c 的大作中提到】
: 楼上这些反对我的,全都是人云己云,拾人牙慧,
: 没说出半点新鲜的东西。

B*******c
发帖数: 5056
24
别一个劲儿往自己脸上贴金了
绝大多数搞生信的人,说到底不就是个软件操作员吗?

【在 l**********1 的大作中提到】
: Math统计和ICT~=Bioinfomatics two legs, then plus Bio stuff
: LZ now only holds half leg about Bio stuff?

j****x
发帖数: 1704
25
以纯生物学背景转行去做生物信息,确实面临你说的这个问题,大多只是应用现成的软
件来解决手头的生物学问题而已,这种情况下,着实没什么前途,虽然各种core
facility里充斥的都是这类技术人员。
但我并不同意生物信息学只是单纯为生物学服务的,或者确切说,生物信息学并非仅仅
为生物学家打下手而存在,作为一门交叉学科,生物信息学本事有其自身独有的发展方
向和模式,有心情的话以后可以另开一贴展开来扯。
至于生物信息软件,实际上分两种,一种是直接面向前面所说的生物学背景的实验人员
或软件操作人员,自然越傻瓜越好,界面友好当然非常重要,好比你说的傻瓜相机,让
大部分非专业人士能够很快的上手解决实际问题。这其实也是眼下大多数商业软件的套
路,而基于命令行模式的生物信息商业软件,确实已经寥寥了。但这毕竟不是全部,以
bioconductor为代表的生物信息开源社区,对于CS或者统计背景的生物信息学家而言,
目的不再只是生产傻瓜相机让普通人拍出到此一游照,这个时候,命令行模式反而是最
有效率的开发模式,并非装逼而是相对图形界面要简单直接的多,至于有人抱怨不好用
不会用,那只能说,这就不是为你而准备的,各取所需罢了,没必要相互不待见甚至恶
语相向了。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 别一个劲儿往自己脸上贴金了
: 绝大多数搞生信的人,说到底不就是个软件操作员吗?

m*********r
发帖数: 2456
26
这好比说做生物实验的就是刷刷瓶子,倒倒培养基的么?
你对一门学科一点不了解没关系,但是不能妄加评论!

【在 B*******c 的大作中提到】
: 别一个劲儿往自己脸上贴金了
: 绝大多数搞生信的人,说到底不就是个软件操作员吗?

v*******e
发帖数: 11604
27

这些软件的最终需求者是bioinfomatician和biostatistician,不是biologist or
physicist。
Biologist希望点点鼠标就得到结果,可是下次点鼠标的顺序?如果有人质疑你的结果
,你还记得点了哪些鼠标吗?
Bioinformatician和biostatistician用字符界面的软件,一句命令就都有了,这句命
令可以和latex文件写在一起,用knitr写,任何人拿到这个文件,就可以reproduce整
个计算结果,包括写好的文章。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 觉得这个解释挺牵强的。当然,软件能坚持字符界面,也反映出这个行业现在比较火,
: 还可以撒撒娇,装装逼,不必去讨好最终需求者。

c********e
发帖数: 598
28

你还是先学CS吧,大潮还没来,你已经死了。
“生物信息”的大潮过后,众喽啰可以做data science.

【在 B*******c 的大作中提到】
: 多谢指导,
: 最怕的是“生物信息”的大潮过后,众喽啰们晒死在沙滩上……

B*******c
发帖数: 5056
29
所以我说绝大多数是软件操作员,而不是全部。
还以照相来打比方。设计、制造新相机的工程师当然值得尊重,但需求量并不大。
如果我去照相馆照个证件照,照相馆老板给我扯什么CMOS点阵算法对量子偏振的影响,
我想我还是有呕吐的权利的。
生信领域的一大任务,就是为biologist提供简单好用的软件,但现在刚刚起步,加上
测序技术的原始,导致软件种类繁杂、不好用,以至于需要专门的软件操作员。
最终的趋势是:普通的biologist几个小时就可以熟练掌握软件的操作,core facility
里面的这类技术员消失。
这时,生信专业尘埃落定,从业人数急剧减少,回到它应有的规模。

【在 j****x 的大作中提到】
: 以纯生物学背景转行去做生物信息,确实面临你说的这个问题,大多只是应用现成的软
: 件来解决手头的生物学问题而已,这种情况下,着实没什么前途,虽然各种core
: facility里充斥的都是这类技术人员。
: 但我并不同意生物信息学只是单纯为生物学服务的,或者确切说,生物信息学并非仅仅
: 为生物学家打下手而存在,作为一门交叉学科,生物信息学本事有其自身独有的发展方
: 向和模式,有心情的话以后可以另开一贴展开来扯。
: 至于生物信息软件,实际上分两种,一种是直接面向前面所说的生物学背景的实验人员
: 或软件操作人员,自然越傻瓜越好,界面友好当然非常重要,好比你说的傻瓜相机,让
: 大部分非专业人士能够很快的上手解决实际问题。这其实也是眼下大多数商业软件的套
: 路,而基于命令行模式的生物信息商业软件,确实已经寥寥了。但这毕竟不是全部,以

B*******c
发帖数: 5056
30
Biologist这点儿简单的需求,Bioinformatician都满足不了?以至于不得不用字符界
面?
那真成了Bioinformatics之耻了。

【在 v*******e 的大作中提到】
:
: 这些软件的最终需求者是bioinfomatician和biostatistician,不是biologist or
: physicist。
: Biologist希望点点鼠标就得到结果,可是下次点鼠标的顺序?如果有人质疑你的结果
: ,你还记得点了哪些鼠标吗?
: Bioinformatician和biostatistician用字符界面的软件,一句命令就都有了,这句命
: 令可以和latex文件写在一起,用knitr写,任何人拿到这个文件,就可以reproduce整
: 个计算结果,包括写好的文章。

相关主题
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Bioinformatician position at John Innes Centre, UK转行 bioinformatics
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x********e
发帖数: 35261
31
或许你对生物信息学的界定就是错的

【在 B*******c 的大作中提到】
: 好吧您有随意评价我的权力。
: 字符界面转化成图形界面又不难,是那些开发软件的人不会吗?
: 生物信息学就应该为生物学者提供简单易用的工具。它们现在似乎忘记了自己的本分。

m*********r
发帖数: 2456
32
你就这点见识?最终目标怎么样也是所有技术员全部机器人代替,剩下几个做生信的分
析分析结果,写写code实现全部自动化

facility

【在 B*******c 的大作中提到】
: 所以我说绝大多数是软件操作员,而不是全部。
: 还以照相来打比方。设计、制造新相机的工程师当然值得尊重,但需求量并不大。
: 如果我去照相馆照个证件照,照相馆老板给我扯什么CMOS点阵算法对量子偏振的影响,
: 我想我还是有呕吐的权利的。
: 生信领域的一大任务,就是为biologist提供简单好用的软件,但现在刚刚起步,加上
: 测序技术的原始,导致软件种类繁杂、不好用,以至于需要专门的软件操作员。
: 最终的趋势是:普通的biologist几个小时就可以熟练掌握软件的操作,core facility
: 里面的这类技术员消失。
: 这时,生信专业尘埃落定,从业人数急剧减少,回到它应有的规模。

B*******c
发帖数: 5056
33
对不起我忘了,生信专业还培养您这种供人发笑的小丑
^_^

【在 m*********r 的大作中提到】
: 你就这点见识?最终目标怎么样也是所有技术员全部机器人代替,剩下几个做生信的分
: 析分析结果,写写code实现全部自动化
:
: facility

k****z
发帖数: 1863
34
无知者武威

【在 B*******c 的大作中提到】
: 对不起我忘了,生信专业还培养您这种供人发笑的小丑
: ^_^

c********e
发帖数: 598
35

如果你不会字符界面,我确实担忧你的前途。

【在 B*******c 的大作中提到】
: Biologist这点儿简单的需求,Bioinformatician都满足不了?以至于不得不用字符界
: 面?
: 那真成了Bioinformatics之耻了。

m*********r
发帖数: 2456
36
你记性不好没关系,你的智商才是你的硬伤!
建议你全家做一下whole genome seq,看看是不是什么variants引起的遗传病

【在 B*******c 的大作中提到】
: 对不起我忘了,生信专业还培养您这种供人发笑的小丑
: ^_^

c********e
发帖数: 598
37

Biology problems are Ad hoc, it is not worth making a GUI.

【在 B*******c 的大作中提到】
: 觉得这个解释挺牵强的。当然,软件能坚持字符界面,也反映出这个行业现在比较火,
: 还可以撒撒娇,装装逼,不必去讨好最终需求者。

B*******c
发帖数: 5056
38
开始下三滥,扯家人了?
说您是小丑,因为您真的让我发笑了

【在 m*********r 的大作中提到】
: 你记性不好没关系,你的智商才是你的硬伤!
: 建议你全家做一下whole genome seq,看看是不是什么variants引起的遗传病

m*********r
发帖数: 2456
39
对不起,根据你的表型,我给你一个建议,我相信你的家庭医生也会这样建议的,如果
楼主没有保险建议你等等回国在做。
至于提到你的家人,因为有直系亲属的话一般比较容易找到治病原因,如果实在没有,
那找到相关遗传病因的几率就会低很多。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 开始下三滥,扯家人了?
: 说您是小丑,因为您真的让我发笑了

j****x
发帖数: 1704
40
给biologist提供简单好用的软件,从来都不是生物信息学的主要任务。你说的这个最
终趋势,在可以预见的未来我也实在看不出来。

facility

【在 B*******c 的大作中提到】
: 所以我说绝大多数是软件操作员,而不是全部。
: 还以照相来打比方。设计、制造新相机的工程师当然值得尊重,但需求量并不大。
: 如果我去照相馆照个证件照,照相馆老板给我扯什么CMOS点阵算法对量子偏振的影响,
: 我想我还是有呕吐的权利的。
: 生信领域的一大任务,就是为biologist提供简单好用的软件,但现在刚刚起步,加上
: 测序技术的原始,导致软件种类繁杂、不好用,以至于需要专门的软件操作员。
: 最终的趋势是:普通的biologist几个小时就可以熟练掌握软件的操作,core facility
: 里面的这类技术员消失。
: 这时,生信专业尘埃落定,从业人数急剧减少,回到它应有的规模。

相关主题
求推荐基础生物信息学书籍生信这个方向怎么样?
继续读PhD还是转行?(情况稍特殊)练好coding是一切的基础
请问现在bioinfo薄厚一般是什么价钱阿?生信是master 工作还是phd
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B*******c
发帖数: 5056
41
请问您是搞生信的吗?真给您的专业丢人。
从此我不再回你的贴。

【在 m*********r 的大作中提到】
: 对不起,根据你的表型,我给你一个建议,我相信你的家庭医生也会这样建议的,如果
: 楼主没有保险建议你等等回国在做。
: 至于提到你的家人,因为有直系亲属的话一般比较容易找到治病原因,如果实在没有,
: 那找到相关遗传病因的几率就会低很多。

B*******c
发帖数: 5056
42
靠,还要甩开别人吃独食?
做为biologist的奴仆,这就叫摆不正自己的位置。

【在 j****x 的大作中提到】
: 给biologist提供简单好用的软件,从来都不是生物信息学的主要任务。你说的这个最
: 终趋势,在可以预见的未来我也实在看不出来。
:
: facility

m*********r
发帖数: 2456
43
不回帖没关系,但是我给你的建议你应该考虑一下的,有病得治,药不能停!

【在 B*******c 的大作中提到】
: 请问您是搞生信的吗?真给您的专业丢人。
: 从此我不再回你的贴。

j****x
发帖数: 1704
44
说实话你对生物信息学的理解实在太狭隘了,个人建议,这个坑你还是别跳了,眼高手
低很容易两边都不搭两边都浅尝辄止半吊子,这种情况在职场的竞争力会很差,而且看
起来你和两边的沟通都会有很大的问题

【在 B*******c 的大作中提到】
: Biologist这点儿简单的需求,Bioinformatician都满足不了?以至于不得不用字符界
: 面?
: 那真成了Bioinformatics之耻了。

x********e
发帖数: 35261
45
真是无知者什么都说得出

【在 B*******c 的大作中提到】
: 靠,还要甩开别人吃独食?
: 做为biologist的奴仆,这就叫摆不正自己的位置。

B*******c
发帖数: 5056
46
本来我是抱着学习的态度来的,
希望从生信从业人员那里获得些以前所不知道的新知识
现在发现,我高估这个行业了。
m*********r
发帖数: 2456
47
你这样的学习态度学什么都不成啊!

【在 B*******c 的大作中提到】
: 本来我是抱着学习的态度来的,
: 希望从生信从业人员那里获得些以前所不知道的新知识
: 现在发现,我高估这个行业了。

v*******e
发帖数: 11604
48

他学成了生物。

【在 m*********r 的大作中提到】
: 你这样的学习态度学什么都不成啊!
s******y
发帖数: 17729
49
完全看不懂你在说啥
生物信息学灌水的文章引用过百满地都是,吭哧吭哧倒腾半天显微镜和杂交,敲除,要
不是灌水热门方向沾边,哪怕十分八分的文章也死在个位数引用上

【在 l********8 的大作中提到】
: 我觉得你能够去认真思考这个专业其实挺好的,因为很多人去做bioinf自己也没有搞清
: 楚自己喜不喜欢,适不适合,以及未来的发展如何。不过我觉得,相比于传统的生物,
: 生信的机会多了不是一点点,但是一个比较大的缺点是,如果要拿绿卡,生物信息发的
: 文章可能引用和影响因子都不是非常多,所以走EB1比较难,但是工作机会多很多,那
: 样的话,走EB2还是很有希望了。如果是未来怎么样,那我觉得谁也不敢打包票的~毕竟
: 生物经常就是热一阵,然后冷下来。。。不知道这一阵可以热多久。。可以安慰的是,
: 生物信息对于转行计算机还是相对容易些的。

D*a
发帖数: 6830
50
受不了,这么水的帖真是少见。
相关主题
大家没事不要跳nextgen seq这个坑生物信息学Phd毕业直接找top10pharm生统的工作,如何?
Start to learn coding as a beginner of bioinformaticsa bioinformatician/statistician position is opened at NYC
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w*****r
发帖数: 2061
51
同感
照相的比喻真不错

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

B*******c
发帖数: 5056
52
正是那寥寥的几篇paper吹起了bioinfo的泡沫,
就像搞传销,总得找个商品来卖。

【在 s******y 的大作中提到】
: 完全看不懂你在说啥
: 生物信息学灌水的文章引用过百满地都是,吭哧吭哧倒腾半天显微镜和杂交,敲除,要
: 不是灌水热门方向沾边,哪怕十分八分的文章也死在个位数引用上

k****z
发帖数: 1863
53
真是池浅王八多
你对生物信息的理解还是小学生级别,还在大放厥词
你的那个软件理解跟生物信息基本无关,随便找个做gui的给你弄个就行
发展完美的测序技术绝不是几年的事情,要很多年的工作,就是测序技术完美,产生的
大量数据也需要
发展新的工具来分析,测序只是一项技术,以后肯定会有其他类型技术和的数据大量产生
学生物的要都是这样,真是堪忧

【在 B*******c 的大作中提到】
: 正是那寥寥的几篇paper吹起了bioinfo的泡沫,
: 就像搞传销,总得找个商品来卖。

D*a
发帖数: 6830
54
他学生物的时候是小本,还不是这个态度的

【在 v*******e 的大作中提到】
:
: 他学成了生物。

M***7
发帖数: 2420
55
我只能说你对GUI不太了解。
而且现在大部分bioinformatics tools都是半成品,life cycle很短,没人愿意搞GUI.

【在 B*******c 的大作中提到】
: 好吧您有随意评价我的权力。
: 字符界面转化成图形界面又不难,是那些开发软件的人不会吗?
: 生物信息学就应该为生物学者提供简单易用的工具。它们现在似乎忘记了自己的本分。

k****z
发帖数: 1863
56
你的简单易用的工具是给搞搞小儿科还行
我要处理两百个样品的测序,命令行写好,自动执行,睡大觉去,
给你gui,两百个,你一个一个搞吧

【在 B*******c 的大作中提到】
: 好吧您有随意评价我的权力。
: 字符界面转化成图形界面又不难,是那些开发软件的人不会吗?
: 生物信息学就应该为生物学者提供简单易用的工具。它们现在似乎忘记了自己的本分。

s******y
发帖数: 17729
57
他估计认为,用过现成的软件blast一下序列或者用JMP这种图形界面的现成软件照着pr
otocol分析一下数据在他眼里就是生物信息

产生

【在 k****z 的大作中提到】
: 真是池浅王八多
: 你对生物信息的理解还是小学生级别,还在大放厥词
: 你的那个软件理解跟生物信息基本无关,随便找个做gui的给你弄个就行
: 发展完美的测序技术绝不是几年的事情,要很多年的工作,就是测序技术完美,产生的
: 大量数据也需要
: 发展新的工具来分析,测序只是一项技术,以后肯定会有其他类型技术和的数据大量产生
: 学生物的要都是这样,真是堪忧

a***r
发帖数: 2677
58
你这个太过分了。

【在 m*********r 的大作中提到】
: 对不起,根据你的表型,我给你一个建议,我相信你的家庭医生也会这样建议的,如果
: 楼主没有保险建议你等等回国在做。
: 至于提到你的家人,因为有直系亲属的话一般比较容易找到治病原因,如果实在没有,
: 那找到相关遗传病因的几率就会低很多。

m*********r
发帖数: 2456
59
请看上下文,谁先过分啊

【在 a***r 的大作中提到】
: 你这个太过分了。
K******S
发帖数: 10109
60
只要生物实验没有标准化,生物信息就死不了

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

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M***7
发帖数: 2420
61
LZ的理解确实很片面,不过有一句倒没说错:估计有50%的bioinformatician就是写点
简单的script,跑跑pipeline, 对开发工具和算法完全力不从心。
B*******c
发帖数: 5056
62
多谢您的回复,虽然您歇斯底里地要证明bioinfo是多么的牛逼,但我还是从侧面认识
到:
1,作为一个单独的专业,生信是没有必要存在的。即使现在出现了,寿命也不会太长。
2,biologist面对大量的、不完美的数据,只好请统计学家来帮忙。统计学家给出解决
方案,但算法比较繁杂,于是找来码工,编成软件,方便使用。
3,但现在的问题是:测序技术飞速发展、统计学家各抒己见,还处于群雄逐鹿阶段。
但总有一天,会尘埃落定,出现几个靠谱的、大家还都能接受的软件(也就是几套方法
)来使用。当然,这个领域还会缓慢向前发展,也会留少量的从业人员继续做。
4,bioinfo众喽啰不甘退出,挣扎一段,然后消失。

【在 k****z 的大作中提到】
: 你的简单易用的工具是给搞搞小儿科还行
: 我要处理两百个样品的测序,命令行写好,自动执行,睡大觉去,
: 给你gui,两百个,你一个一个搞吧

g*******9
发帖数: 138
63
生物的复杂程度,其实已经超越了目前计算机的处理极限的。所以,实验科学家,如果
没有生物信息的辅助,那就是些体力劳动者加机会主义者。
B*******c
发帖数: 5056
64
完全同意你的看法,生物信息只是辅助。
现在的问题是,那些搞bioinfo的老想装逼蒙人,还想搞谶越。

【在 g*******9 的大作中提到】
: 生物的复杂程度,其实已经超越了目前计算机的处理极限的。所以,实验科学家,如果
: 没有生物信息的辅助,那就是些体力劳动者加机会主义者。

B*******c
发帖数: 5056
65
其实也根本不需要那么多人搞开发工具、搞算法。这个行业太虚胖了。

【在 M***7 的大作中提到】
: LZ的理解确实很片面,不过有一句倒没说错:估计有50%的bioinformatician就是写点
: 简单的script,跑跑pipeline, 对开发工具和算法完全力不从心。

M***7
发帖数: 2420
66
很多人就是搞一些customized tools,应用范围很小,但因为没有统一标准,所以很多
公司/实验室都需要。

看到有人讨论”能打五个位置“的秃头猩猩VS中年人,我觉得这两个人严格意义上都不
能打五个位置。河田吨位和身高无法安全在外线运球,牧叔比普通内线矮了5,6cm+的
身高会在内线比较吃力。说到SD中最能胜任五个位置的球员,我倒觉得仙道比他俩都更
符合这一点,仙道190cm,79KG比起神奈川有名有姓的中锋高砂191cm80KG几乎无差距,
身体上打C估计可以虐菜鸟中锋。至于4号位,练习赛上仙道就是打的这个位置。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 其实也根本不需要那么多人搞开发工具、搞算法。这个行业太虚胖了。
x********e
发帖数: 35261
67
不说多的,你编个完美的序列比对算法来证明基因进化啊?或者你完全不依赖生信,用实
验证明看看

【在 B*******c 的大作中提到】
: 完全同意你的看法,生物信息只是辅助。
: 现在的问题是,那些搞bioinfo的老想装逼蒙人,还想搞谶越。

B*******c
发帖数: 5056
68
又在故意偷换概念。
我明明说生物学需要bioinfo的辅助嘛,快来辅助我吧

【在 x********e 的大作中提到】
: 不说多的,你编个完美的序列比对算法来证明基因进化啊?或者你完全不依赖生信,用实
: 验证明看看

w***g
发帖数: 5958
69
所有的方向都是这样的。一个方向成熟后大家就会move on去研究新东西了。
没有成熟的时候总有人浑水摸鱼。得到利益的往往是搞politics的而不是真正对科学有
贡献的。
关于热门的机器学习技术在生物学上的应用,我可以这么argue。
一般能总结成规律的都是一些strong signal,可能>95%的情况都满足这些规律。用这
些规律做预测
也很容易。但很多情况下规律没有被总结出来,已知的信息都是一些weak signal,可
能只对10%的样本
有60%的可能性是正确的。目前同过各种途径可以很便宜地得到大量这种weak signal,
比如测序和
基因芯片,甚至挖掘论文文本等显然有问题的方法。机器学习可以以一种暴力的方法把
众多含有独立成分的weak signal
融合在一起产生一个strong signal。机器学习得到的不是真正的知识,但是一方面,
机器学习使得
人们在真正的规律被总结出来之前有了另一个进行预测的手段。另一方面,生物专家对
机器学习的调优
和对结果的解读可能会帮助总结出真正的规律。

长。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 多谢您的回复,虽然您歇斯底里地要证明bioinfo是多么的牛逼,但我还是从侧面认识
: 到:
: 1,作为一个单独的专业,生信是没有必要存在的。即使现在出现了,寿命也不会太长。
: 2,biologist面对大量的、不完美的数据,只好请统计学家来帮忙。统计学家给出解决
: 方案,但算法比较繁杂,于是找来码工,编成软件,方便使用。
: 3,但现在的问题是:测序技术飞速发展、统计学家各抒己见,还处于群雄逐鹿阶段。
: 但总有一天,会尘埃落定,出现几个靠谱的、大家还都能接受的软件(也就是几套方法
: )来使用。当然,这个领域还会缓慢向前发展,也会留少量的从业人员继续做。
: 4,bioinfo众喽啰不甘退出,挣扎一段,然后消失。

s******s
发帖数: 13035
70
这个说的在理。
life cycle短,而且多数是scientist写的,没空搞什么gui.
再说,大多数原始数据和中间数据体积极大,对biologist
又没啥意义,不需要编出简单的gui给外行用

GUI.

【在 M***7 的大作中提到】
: 我只能说你对GUI不太了解。
: 而且现在大部分bioinformatics tools都是半成品,life cycle很短,没人愿意搞GUI.

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生物信息学继续读PhD还是转行?(情况稍特殊)
转行 bioinformatics请问现在bioinfo薄厚一般是什么价钱阿?
求推荐基础生物信息学书籍生信这个方向怎么样?
进入Biology版参与讨论
K****n
发帖数: 5970
71
严重谴责字符界面装逼

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

p*******i
发帖数: 1181
72
楼主可以参考生统来理解生物信息,长远来看这个专业从业人员数量会趋于稳定,消亡
是不太可能的,对科研机构来说bioinfo可能只是灌水,对制药公司来说biology反而是
没那么大需求的了
K****n
发帖数: 5970
73
最好能写个软件来操作软件,把软件操作员都替换掉,啊哈哈

【在 B*******c 的大作中提到】
: 别一个劲儿往自己脸上贴金了
: 绝大多数搞生信的人,说到底不就是个软件操作员吗?

p*******i
发帖数: 1181
74
同意这一点,Rnaseq的原始数据随便就是十几G的,根本没可能在Windows系统里处理,
内存都load不进去,在Linux下面写GUI显然是浪费时间了。当然某些展示分析结果用的
软件没搞GUI就是作者偷懒了,尤其是非盈利的软件,很多就是为了发个文章毕业(我
当年phd论文也是如此),肯定不会花时间去写GUI了。

【在 s******s 的大作中提到】
: 这个说的在理。
: life cycle短,而且多数是scientist写的,没空搞什么gui.
: 再说,大多数原始数据和中间数据体积极大,对biologist
: 又没啥意义,不需要编出简单的gui给外行用
:
: GUI.

B*******c
发帖数: 5056
75
我想您就是一位生信从业人员吧?
前几个跟帖,还说出了些干货,现在已经只是满篇的激愤之词了。
这说明:你也开始认同我对这个行业的现状分析和前途预测了,只是感情上不愿意接受。

【在 k****z 的大作中提到】
: 你的简单易用的工具是给搞搞小儿科还行
: 我要处理两百个样品的测序,命令行写好,自动执行,睡大觉去,
: 给你gui,两百个,你一个一个搞吧

B*******c
发帖数: 5056
76
也谢谢各位的跟帖,让我以前模糊的认识越来越清晰明朗,
看来我对bioinfo的评价没错。
h********3
发帖数: 2075
77
很赞同。都是bioinfo自己圈子引用没多大意义。恰好说明是泡沫。生物信息学很大程
度就是因为发paper容易,鼓捣一下数学公式,就可以出paper,不用做什么实际的工作
。看paper引用数量是相当bias的评估方法。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 正是那寥寥的几篇paper吹起了bioinfo的泡沫,
: 就像搞传销,总得找个商品来卖。

c*****g
发帖数: 66
78
楼主不要用RNA-Seq数据分析和软件开发来代替生物信息,你这是典型的偷换概念。照
你这么个说法,大部分你在实验室里做的实验都可以被机器代替了,是不是你都要下岗
了。
事实是,现在绝大部分包括楼主在内的生物学家缺乏最基本的统计,信息学的训练。每
每遇到大型数据,甚至小型数据只需要做个t检验报告P值,就一团浆糊,这已经开始严
重影响他们的职业生涯了。
x********e
发帖数: 35261
79
先声明我不是学bioinfo的
不知道你哪里来的优越感
好的生物学家关注的是问题本身,根据需求会用不同的方法手段去address那个问题。不
管是用bioinfo,computational biology,生化,genetics,biophysics,甚至struct
ure biology和evo-devo的手段,或者不同的模式生物,都只是手段而已,从不同角度去
研究问题。所以你看那些大牛是什么都懂的。就只有你这种混饭吃的人会在意领域,甚
至还有优越感的错觉。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 又在故意偷换概念。
: 我明明说生物学需要bioinfo的辅助嘛,快来辅助我吧

N******n
发帖数: 3003
80
你这个说法就像很多年前,上大学报专业,说不要报计算机科学,因为未来每个人都有
个人电脑,都会用。 还是学点深奥的,生物科学。
我被他们坑死了。
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练好coding是一切的基础Start to learn coding as a beginner of bioinformatics
生信是master 工作还是phdbioinformatics postdoc poition($35,000 - $40,000)
大家没事不要跳nextgen seq这个坑生物信息学Phd毕业直接找top10pharm生统的工作,如何?
进入Biology版参与讨论
k**n
发帖数: 6198
81
re你一下
先说我不是大牛,也不是作生物的,但是我实在同意这些只是手段.以领域自居的话,永远
是给别人打下手的,就是高级技术员.那么作生物,化学的,物理的,生统的,生物信息学的
,地位都一样,不过报酬有一定区别.
泛泛的要想对生物数据整个行业的了解,除了生统,生物信息,最好长远的还要和
epidemiology, 等等联系起来.现代科学的发展,注定了一家之言和有限的资源做不成大
事.这些也是funding的一个尴尬局面,一来新生后起之秀难以扶持,二来大牛占据山头和
资源的确是资源的比较合理分配.无解.
楼主那样想,还是转行去华尔街做个分析员比较符合他的分析,但是工作的风险性又不想
承担.

。不
struct
度去

【在 x********e 的大作中提到】
: 先声明我不是学bioinfo的
: 不知道你哪里来的优越感
: 好的生物学家关注的是问题本身,根据需求会用不同的方法手段去address那个问题。不
: 管是用bioinfo,computational biology,生化,genetics,biophysics,甚至struct
: ure biology和evo-devo的手段,或者不同的模式生物,都只是手段而已,从不同角度去
: 研究问题。所以你看那些大牛是什么都懂的。就只有你这种混饭吃的人会在意领域,甚
: 至还有优越感的错觉。

l*****8
发帖数: 16949
82
这种现象那个专业都是一样的。80%以上搞生物的也就是稍微改动一下设置,重复别人
的实验。任何一个专业里这类人都是大多数。能发展出自己的一套东西的毕竟只能是很
少一部分人。

【在 M***7 的大作中提到】
: LZ的理解确实很片面,不过有一句倒没说错:估计有50%的bioinformatician就是写点
: 简单的script,跑跑pipeline, 对开发工具和算法完全力不从心。

l********k
发帖数: 14844
83
你去随便哪个招工搜索引擎搜一下data scientist, data mining,你就明白,21世纪
根本就是信息世纪。你生物连毛都不是。生物信息,是生物搭了data science的车,占
了信息学的光,解决了一大帮千老的就业问题,而不是反之。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

l********k
发帖数: 14844
84
他们可以花几个月时间转行去google, amazon。也不知道是谁在温水锅里呱呱呱。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 多谢指导,
: 最怕的是“生物信息”的大潮过后,众喽啰们晒死在沙滩上……

l********k
发帖数: 14844
85
最终的趋势是生命科学定量化,凡是不懂计算、不懂统计的,逐渐被边缘化。看看现在
的化学和200年前的化学,就知道生物的前景在哪里了。

【在 j****x 的大作中提到】
: 给biologist提供简单好用的软件,从来都不是生物信息学的主要任务。你说的这个最
: 终趋势,在可以预见的未来我也实在看不出来。
:
: facility

l********k
发帖数: 14844
86
你是不是总听别人吹生物信息多牛逼多牛逼,然后抱着忐忑的心情去听了个报告,结果
发现完全听不懂,但是后面一大堆publication,一大堆funding,听报告的人个个呈陶
醉状。
你肥肠忿怒,跑这儿来吐槽,结果现眼了?

【在 B*******c 的大作中提到】
: 完全同意你的看法,生物信息只是辅助。
: 现在的问题是,那些搞bioinfo的老想装逼蒙人,还想搞谶越。

l********k
发帖数: 14844
87
生物学要发动文化革命,宁要定性的草,不要定量的苗。打倒一切数学公式。

【在 h********3 的大作中提到】
: 很赞同。都是bioinfo自己圈子引用没多大意义。恰好说明是泡沫。生物信息学很大程
: 度就是因为发paper容易,鼓捣一下数学公式,就可以出paper,不用做什么实际的工作
: 。看paper引用数量是相当bias的评估方法。

l********k
发帖数: 14844
88
lol
楼主这样的显然不怕坑。

【在 N******n 的大作中提到】
: 你这个说法就像很多年前,上大学报专业,说不要报计算机科学,因为未来每个人都有
: 个人电脑,都会用。 还是学点深奥的,生物科学。
: 我被他们坑死了。

m*********r
发帖数: 2456
89
他的思维很混乱,完全不懂什么是生物信息,估计看到手头一堆数据傻眼了。

【在 l********k 的大作中提到】
: lol
: 楼主这样的显然不怕坑。

p*******i
发帖数: 1181
90
Re这个!哈哈

【在 N******n 的大作中提到】
: 你这个说法就像很多年前,上大学报专业,说不要报计算机科学,因为未来每个人都有
: 个人电脑,都会用。 还是学点深奥的,生物科学。
: 我被他们坑死了。

相关主题
a bioinformatician/statistician position is opened at NYCUCSF opening for a bioinformatician/computational biologist
关于美国的生统博后!生物信息学求职
Bioinformatics (生物信息学) PositionBioinformatician position at John Innes Centre, UK
进入Biology版参与讨论
B*******c
发帖数: 5056
91
现在的生物领域,没有水浴锅操作员,没有PCR仪操作员。但有大量的bioinfo软件操作
员。
还是那句话,这些以“生信”自居的操作员会很快消失,bioinfo专业急剧缩水到应有
的规模。
B*******c
发帖数: 5056
92
这是众多回帖中唯一有养分的,
请问能简要介绍一下化学的发展吗?洗耳恭听!

【在 l********k 的大作中提到】
: 最终的趋势是生命科学定量化,凡是不懂计算、不懂统计的,逐渐被边缘化。看看现在
: 的化学和200年前的化学,就知道生物的前景在哪里了。

m*********r
发帖数: 2456
93
他也就当当水浴锅操作员,还能咋?

【在 k****z 的大作中提到】
: 你的简单易用的工具是给搞搞小儿科还行
: 我要处理两百个样品的测序,命令行写好,自动执行,睡大觉去,
: 给你gui,两百个,你一个一个搞吧

a******s
发帖数: 267
94
我是从纯生物转到生物信息的,已经干了7-8年了,总体还算成功。个人感觉生物背景
的干这行计算机知识容易补但是统计知识比较难补。

【在 k****z 的大作中提到】
: 你的简单易用的工具是给搞搞小儿科还行
: 我要处理两百个样品的测序,命令行写好,自动执行,睡大觉去,
: 给你gui,两百个,你一个一个搞吧

B*******c
发帖数: 5056
95
讨论到现在,生信的人已经发生了改变。一开始强调自己的专业很神秘,很牛逼,是独
立于传统生物学的全新领域。
现在又改口说生物学家离不了他们,因为biologist这个不行,那个不行。不过口干舌
燥地扯半天,最终还是眼巴巴地看着biologist的脸色,祈求biologist用他们。

【在 k****z 的大作中提到】
: 你的简单易用的工具是给搞搞小儿科还行
: 我要处理两百个样品的测序,命令行写好,自动执行,睡大觉去,
: 给你gui,两百个,你一个一个搞吧

k****z
发帖数: 1863
96
算了,我会把我的帖子全删掉(除了这个), 你自娱自乐吧,呵呵

【在 B*******c 的大作中提到】
: 讨论到现在,生信的人已经发生了改变。一开始强调自己的专业很神秘,很牛逼,是独
: 立于传统生物学的全新领域。
: 现在又改口说生物学家离不了他们,因为biologist这个不行,那个不行。不过口干舌
: 燥地扯半天,最终还是眼巴巴地看着biologist的脸色,祈求biologist用他们。

m*********r
发帖数: 2456
97
他这种抽风型的你不下点猛药你是甩不掉的

【在 k****z 的大作中提到】
: 算了,我会把我的帖子全删掉(除了这个), 你自娱自乐吧,呵呵
k****z
发帖数: 1863
98
已全删,自己觉得犯贱,呵呵

【在 m*********r 的大作中提到】
: 他这种抽风型的你不下点猛药你是甩不掉的
B*******c
发帖数: 5056
99
这是不是传说中的尿遁?
好走不送。不过还是感谢您的发言,让我知道了bioinfo到底几斤几两。

【在 k****z 的大作中提到】
: 已全删,自己觉得犯贱,呵呵
k****z
发帖数: 1863
100
你脑子真有病吧?!

【在 B*******c 的大作中提到】
: 这是不是传说中的尿遁?
: 好走不送。不过还是感谢您的发言,让我知道了bioinfo到底几斤几两。

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scientific programmer 和 bioinformatician 的区别?求推荐基础生物信息学书籍
生物信息学继续读PhD还是转行?(情况稍特殊)
转行 bioinformatics请问现在bioinfo薄厚一般是什么价钱阿?
进入Biology版参与讨论
k*****1
发帖数: 454
101
2013的诺贝尔化学奖就是给了做纯理论计算的
The Nobel Prize in Chemistry 2013 was awarded jointly to Martin Karplus,
Michael Levitt and Arieh Warshel "for the development of multiscale models
for complex chemical systems".
生物还没到这一步,再过十年如果诺奖生理学给了做理论的,也不惊讶。另外,你对生
物信息这个领域了解太少了

【在 B*******c 的大作中提到】
: 这是众多回帖中唯一有养分的,
: 请问能简要介绍一下化学的发展吗?洗耳恭听!

N******n
发帖数: 3003
102
I am still in the whole after almost 10 years climbing back.

【在 p*******i 的大作中提到】
: Re这个!哈哈
z******n
发帖数: 397
103
你在win下跑rna-seq?

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

c********h
发帖数: 18
104
还好我从生物这个火坑跳出来了……
原来做生物的思想那么闭塞啊……
我觉得吧,生物实验哪时候能自动化了,哪时候才会是生物的时代。
其实命令行多爽啊……vim用得飞起
z******n
发帖数: 397
105
辅你个头啊,明明是没有bioinfoer的帮忙寸步难行,却一定要把别人的地位放在自己
之下。谁说过bioinfo比bio本身重要么?但你也不用这么嚣张地抬高自己吧?真是无知
者无畏

【在 B*******c 的大作中提到】
: 又在故意偷换概念。
: 我明明说生物学需要bioinfo的辅助嘛,快来辅助我吧

z******n
发帖数: 397
106
还僭越,我了个去,你以为你谁啊?

【在 B*******c 的大作中提到】
: 完全同意你的看法,生物信息只是辅助。
: 现在的问题是,那些搞bioinfo的老想装逼蒙人,还想搞谶越。

t****a
发帖数: 1212
107
生物信息学现在还在协助生物技术工程师造能看清楚星星的望远镜。等望远镜普及了,
数据大量观测纪录总结之后,就会有牛顿这样的人物出现给出漂亮,统一,可预测的理
论,来解释所有的这些事情。当然现在就有很多做生物信息的科学家在试图做牛顿做的
事情,试图从不完整不准确的数据里归纳结论,可我个人总觉得还为时稍早。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

s*****g
发帖数: 7857
108
“不需要智商的活儿”?

【在 s******y 的大作中提到】
: 只会做各种blot,ps图片的传统分子生物学,细胞生物学基本上就是不需要智商的活儿
: ,淘汰是早晚的事儿。在杂交炉旁边,倒倒buffer就行,或者对着显微镜里面咔嚓咔嚓
: ,放个猴子和放个人没有啥显著性差异

s*****g
发帖数: 7857
109
一地鸡毛!
k*****1
发帖数: 454
110
very good point

【在 t****a 的大作中提到】
: 生物信息学现在还在协助生物技术工程师造能看清楚星星的望远镜。等望远镜普及了,
: 数据大量观测纪录总结之后,就会有牛顿这样的人物出现给出漂亮,统一,可预测的理
: 论,来解释所有的这些事情。当然现在就有很多做生物信息的科学家在试图做牛顿做的
: 事情,试图从不完整不准确的数据里归纳结论,可我个人总觉得还为时稍早。

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s*****j
发帖数: 6435
111
当年 Steve Chu 说Biology is still in gathering and hunting stage. 气到一批
生物学家.
你这一说, 好象生物根本连 gathering 的阶段都还没正式开始呢.

【在 t****a 的大作中提到】
: 生物信息学现在还在协助生物技术工程师造能看清楚星星的望远镜。等望远镜普及了,
: 数据大量观测纪录总结之后,就会有牛顿这样的人物出现给出漂亮,统一,可预测的理
: 论,来解释所有的这些事情。当然现在就有很多做生物信息的科学家在试图做牛顿做的
: 事情,试图从不完整不准确的数据里归纳结论,可我个人总觉得还为时稍早。

k*****1
发帖数: 454
112
可以这么说。因为生物学当中的测量仪器相对要解决的问题来说,是非常落后的,这就
意味着现在很多数据的gathering还是停留在很原始的阶段。
就拿neuroscience来说,一个最基本的问题就是看neuron之间是怎么连接的。但是直到
现在,主流的做法还是靠人工数染色的neuron之间的连接。假设一个脑区有几十万个
neuron,你觉得要出多少篇文章才能证明一个脑区的connectivity?
所以我觉得前面那位的评级很对,生物现在还属于造望远镜的时期,大规模的数据采集
还没有来临,更谈不上牛顿时代了

【在 s*****j 的大作中提到】
: 当年 Steve Chu 说Biology is still in gathering and hunting stage. 气到一批
: 生物学家.
: 你这一说, 好象生物根本连 gathering 的阶段都还没正式开始呢.

t****a
发帖数: 1212
113
嗯,就是因为数据不足不完整,所以比较难于下确实可靠的结论来。未观测到的东西太
多了。但是饭还是要吃啊,文章还是要发呀,怎么办呢?结果有一批论文看起来比牛顿
时代的科学来更像希腊时期亚里士多德的哲学,看起来好像能解释一切,换个条件,一
重复一预测就挂,无通用性可言。
当然,思考这些事情本身是很欢乐的。

【在 k*****1 的大作中提到】
: 可以这么说。因为生物学当中的测量仪器相对要解决的问题来说,是非常落后的,这就
: 意味着现在很多数据的gathering还是停留在很原始的阶段。
: 就拿neuroscience来说,一个最基本的问题就是看neuron之间是怎么连接的。但是直到
: 现在,主流的做法还是靠人工数染色的neuron之间的连接。假设一个脑区有几十万个
: neuron,你觉得要出多少篇文章才能证明一个脑区的connectivity?
: 所以我觉得前面那位的评级很对,生物现在还属于造望远镜的时期,大规模的数据采集
: 还没有来临,更谈不上牛顿时代了

a*l
发帖数: 2685
114
这个楼爬的真欢乐~
楼主对生信的认识确实太片面了,后面好多回帖该说的都说了
但是有几个points讲的也不算太错。
如果为找工业界工作的话,除非靠编程能力转成码工,不然还是别跳这个坑,机会没有
生统计算机什么的多,但比纯生物的还是好些
生信的数据跟big data比,也是一忽悠,呵呵
另外生信就算发了文章引用、影响因子低(其实不少也很高),也不影响申绿卡什么的
a*l
发帖数: 2685
115
谴责+1!

【在 K****n 的大作中提到】
: 严重谴责字符界面装逼
a*l
发帖数: 2685
116
被坑+1!

【在 N******n 的大作中提到】
: 你这个说法就像很多年前,上大学报专业,说不要报计算机科学,因为未来每个人都有
: 个人电脑,都会用。 还是学点深奥的,生物科学。
: 我被他们坑死了。

x********e
发帖数: 35261
117
你还是代表你自己吧,千万不要说你是做生物的。真丢脸

【在 B*******c 的大作中提到】
: 这是不是传说中的尿遁?
: 好走不送。不过还是感谢您的发言,让我知道了bioinfo到底几斤几两。

B*******c
发帖数: 5056
118
我也没说要代表别人啊,怎么?丢了您的脸了?

【在 x********e 的大作中提到】
: 你还是代表你自己吧,千万不要说你是做生物的。真丢脸
l**********1
发帖数: 5204
119
So bio of iPS needs STORM and Seesaw model what esbablished by XW Zhuang and
Deng/Tang ..

【在 t****a 的大作中提到】
: 嗯,就是因为数据不足不完整,所以比较难于下确实可靠的结论来。未观测到的东西太
: 多了。但是饭还是要吃啊,文章还是要发呀,怎么办呢?结果有一批论文看起来比牛顿
: 时代的科学来更像希腊时期亚里士多德的哲学,看起来好像能解释一切,换个条件,一
: 重复一预测就挂,无通用性可言。
: 当然,思考这些事情本身是很欢乐的。

T**N
发帖数: 129
120
你说的和我见到的正好相反
做老鼠的,经常3-5年才发一篇paper。 但是做数据那些人,随便1-2个月测序的结果
,分析起来头头是道,一年发3-5篇文章的都遍地都是。 关键他们的图太多了。 一上
午就做出来5张图。
那些用病人细胞做rna seq, chip seq的,通常if都过10。 时不时就冲一下cns。

【在 l********8 的大作中提到】
: 我觉得你能够去认真思考这个专业其实挺好的,因为很多人去做bioinf自己也没有搞清
: 楚自己喜不喜欢,适不适合,以及未来的发展如何。不过我觉得,相比于传统的生物,
: 生信的机会多了不是一点点,但是一个比较大的缺点是,如果要拿绿卡,生物信息发的
: 文章可能引用和影响因子都不是非常多,所以走EB1比较难,但是工作机会多很多,那
: 样的话,走EB2还是很有希望了。如果是未来怎么样,那我觉得谁也不敢打包票的~毕竟
: 生物经常就是热一阵,然后冷下来。。。不知道这一阵可以热多久。。可以安慰的是,
: 生物信息对于转行计算机还是相对容易些的。

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y****t
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使用数据的大多数人并不是计算机或者统计专业人士,所以就需要大量的生物信息学的
人来帮助他们分析和挖掘数据。 相机技术转向电子化,本身就是因为有大量的计算机
人员开发网络平台,开发好用的App。 所以生物信息学也会造成传统生物行业的萎缩。
十年间,生物信息学一直在壮大,跟大公司的data mining部门一样在不断增加。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

w*****y
发帖数: 506
122
我理解的生物信息学从业人员,主要工作是把生命科学家的需求翻译成程序员可以理解
的文档,然后由程序员完成具体工作。当然生物信息的人如果本身就是程序员,那更好
,只是这个培养难度太大了。从我的界定出发,生物信息学需要的人应该不多,现在培
养的太多,以后就业会有问题。
s*********t
发帖数: 464
123
生物信息越来越火,做传统生物的越来越苦逼,做数据分析的越来越多,产生数据的越
来越少,验证分析的越来越少,最后会是这个结局么?
我听过的报告,分析了几十,上百或者更多的病人样品后,这个,那个还有那个突变或
基因和这个疾病有关,要验证这些东西,幸运的话也要几十号人几年或更长时间的工作
,高贵的生物信息学家不做试验了,苦逼的千老都跑了,看来只能期待前面有人说的高
大上千老free的生物学时代。
n******7
发帖数: 12463
124
我擦 标题还可以,内容纯搞笑
现在照相是简单了,存照片,改照片,分享照片,哪个不是一大坨商业机会?
拜托用用脑子再来发帖
字符界面的事情,跟你这说不清楚
U*******a
发帖数: 1
125
楼主傻瓜相机想必用的不错,但是不知单反用的如何呢
B*******c
发帖数: 5056
126
和傻瓜相比,单反小众多了。
这就是生信以后的发展趋势。

【在 U*******a 的大作中提到】
: 楼主傻瓜相机想必用的不错,但是不知单反用的如何呢
n******7
发帖数: 12463
127
唉,发现你和那些自以为是的人真的没啥好说的
全凭想象就开喷了
我科研很弱,但是现在不是大project都要数据分析吗,花个几天时间打点杂就可以混
个CNS或者子刊的挂名了,引用率根本不是问题

【在 T**N 的大作中提到】
: 你说的和我见到的正好相反
: 做老鼠的,经常3-5年才发一篇paper。 但是做数据那些人,随便1-2个月测序的结果
: ,分析起来头头是道,一年发3-5篇文章的都遍地都是。 关键他们的图太多了。 一上
: 午就做出来5张图。
: 那些用病人细胞做rna seq, chip seq的,通常if都过10。 时不时就冲一下cns。

B*******c
发帖数: 5056
128
好吧,我自以为是,
但感觉你是个势利小人,
完全从功利的角度来看问题。

【在 n******7 的大作中提到】
: 唉,发现你和那些自以为是的人真的没啥好说的
: 全凭想象就开喷了
: 我科研很弱,但是现在不是大project都要数据分析吗,花个几天时间打点杂就可以混
: 个CNS或者子刊的挂名了,引用率根本不是问题

n******7
发帖数: 12463
129
我批驳一下这个谬论就成了势利小人?这都是什么猪脑子...
“生信的机会多了不是一点点,但是一个比较大的缺点是,如果要拿绿卡,生物信息发
的文章可能引用和影响因子都不是非常多,所以走EB1比较难”
好吧,我不仅势利,还喜欢用字符界面装逼。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 好吧,我自以为是,
: 但感觉你是个势利小人,
: 完全从功利的角度来看问题。

B*******c
发帖数: 5056
130
猪脑子表示生信热潮马上就会退去,价值急剧缩水。

【在 n******7 的大作中提到】
: 我批驳一下这个谬论就成了势利小人?这都是什么猪脑子...
: “生信的机会多了不是一点点,但是一个比较大的缺点是,如果要拿绿卡,生物信息发
: 的文章可能引用和影响因子都不是非常多,所以走EB1比较难”
: 好吧,我不仅势利,还喜欢用字符界面装逼。

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n******7
发帖数: 12463
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哈哈,我正相反。我确信的东西不多,也不觉得生信市场会有多大,但是未来绝对的快
速上升的。
这样挺好,你继续你快乐的水浴锅,我继续字符界面装逼。
所谓求仁得仁,以后不要觉得自作自受便好。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 猪脑子表示生信热潮马上就会退去,价值急剧缩水。
B*******c
发帖数: 5056
132
生信会像PCR技术一样,成为一个常规的、常用的生物研究技术。
回归它应有的角色。

【在 n******7 的大作中提到】
: 哈哈,我正相反。我确信的东西不多,也不觉得生信市场会有多大,但是未来绝对的快
: 速上升的。
: 这样挺好,你继续你快乐的水浴锅,我继续字符界面装逼。
: 所谓求仁得仁,以后不要觉得自作自受便好。

n******7
发帖数: 12463
133
time will tell

【在 B*******c 的大作中提到】
: 生信会像PCR技术一样,成为一个常规的、常用的生物研究技术。
: 回归它应有的角色。

B*******c
发帖数: 5056
134
现在的生信技术,就像PCR技术的初期。
概念刚提出来,不同的人做出了不同的PCR仪,但都不大好用,有这样那样的缺陷,所
以发展出了很多“技巧”(或者说补救措施)。以至于每个PCR仪要配一个专门的操作
员。
现在的PCR仪全都标准化、傻瓜化了,根本用不到以前的那些tricks,点点按钮,谁都
会用。

【在 n******7 的大作中提到】
: time will tell
c********e
发帖数: 598
135

那我问你,统计为啥还有人用command line?

【在 B*******c 的大作中提到】
: 现在的生信技术,就像PCR技术的初期。
: 概念刚提出来,不同的人做出了不同的PCR仪,但都不大好用,有这样那样的缺陷,所
: 以发展出了很多“技巧”(或者说补救措施)。以至于每个PCR仪要配一个专门的操作
: 员。
: 现在的PCR仪全都标准化、傻瓜化了,根本用不到以前的那些tricks,点点按钮,谁都
: 会用。

t*****z
发帖数: 1598
136
这楼主是来耍宝的么?或者高级黑(黑水浴锅操作员的)?
B*******c
发帖数: 5056
137
统计是一个独立的专业好伐? 与生信没有可比性。

【在 c********e 的大作中提到】
:
: 那我问你,统计为啥还有人用command line?

t*****z
发帖数: 1598
138
我看明白了,楼主这讨论态度八成就是被三楼给激的。
不过我很同意三楼,哈哈哈
n******7
发帖数: 12463
139
你这个类比说明你的见地太狭隘了,
自己树了一个靶子打得起劲,唐吉可德兄
这注定不会是个constructive的讨论
你觉得不靠谱就不靠谱吧

【在 B*******c 的大作中提到】
: 现在的生信技术,就像PCR技术的初期。
: 概念刚提出来,不同的人做出了不同的PCR仪,但都不大好用,有这样那样的缺陷,所
: 以发展出了很多“技巧”(或者说补救措施)。以至于每个PCR仪要配一个专门的操作
: 员。
: 现在的PCR仪全都标准化、傻瓜化了,根本用不到以前的那些tricks,点点按钮,谁都
: 会用。

B*******c
发帖数: 5056
140
这几天接触了一下bioinfo,更确信了自己的观点。
字符界面,是生信专业的人故意的,目的就是提高使用门槛、增加神秘性,不让其它行
业的人轻易学会,否则,自己饭碗不保啊。
不过好在这个专业人数众多,相信总有公司会推出简单易用的软件,等到这个公司赚得
盆满钵满之时,也是生信人大量失业之际。
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c********e
发帖数: 598
141

It is not hard at all to use command line software even if you don't like it.
Or maybe you are too dumb.
This is such a small market for software developer company.
Good bioinformatician has no problem to work for amazon and google
for data science research.

【在 B*******c 的大作中提到】
: 这几天接触了一下bioinfo,更确信了自己的观点。
: 字符界面,是生信专业的人故意的,目的就是提高使用门槛、增加神秘性,不让其它行
: 业的人轻易学会,否则,自己饭碗不保啊。
: 不过好在这个专业人数众多,相信总有公司会推出简单易用的软件,等到这个公司赚得
: 盆满钵满之时,也是生信人大量失业之际。

B*******c
发帖数: 5056
142
好的软件应该让外行在1小时之内上手,学会基本操作。字符界面显然达不到这个标准。
呵呵,你已经为bioinfo们想退路了?他们去amazon或google干啥?也有类似的软件让
他们操作吗?

it.

【在 c********e 的大作中提到】
:
: It is not hard at all to use command line software even if you don't like it.
: Or maybe you are too dumb.
: This is such a small market for software developer company.
: Good bioinformatician has no problem to work for amazon and google
: for data science research.

M*P
发帖数: 6456
143
终于让你识破了。
确实是这样。字符界面就是不想让外行上手。要是都跟PCR/Western那样的技术,中专
水平的学生培训一下就能做,那我们还怎么挣钱?不都成生物千老了?
你说的公司搞出容易用的界面的软件,然后我们就没工作了。 这个不太可能发生。为
什么?你看affymetrix?他们的软件界面简单,容易操作。但是没人用。原因一是贵,
好几千一个license,做生物的都抠门不愿意买。生物信息软件我们写的都是免费,自然
会有人来用。好不好用再说。有的是人排着队学用字符界面。
公司的软件不会替代我们的软件,还有一个原因,那就是我们会组织起来discredit那
些公司。再看affymetrix,他们一开始自己有个软件做芯片分析,后来怎么样?
Berkeley,Priceton,UW Seatle,Harvard的统计系元老们起头搞自己的软件,用各种
方法证明affymetrix的软件有问题。你是信这些教授还是信公司?人民大众生来就是不
信任大公司,认为所有公司都有自己的阴谋. 特别是搞科研的,认为公司搞统计的都是
吃干饭的,当不了教授才去的公司。最后结果就没人用affy他们的软件,bioconductor
一统江湖。实际上,affy那个方法其实差不了太多。现在换RNA-seq,一行软件直接全
部淘汰。咱们再来,我看还是academic会赢。
所有领域能混下去都是因为有自己的edge。领域里的人不会随便就把自己的edge放弃。
貌似生物信息目前还混得不错,前几年是array,现在是NGS,不知道过几年还会有什么
出来。总之有数据就有生物信息。你完全可以等图形界面的软件出来再做NGS,不过那
时候你的文章估计只能跟现在的array的文章一样,只能发在影响因子3以下的杂志里了。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 我是说没必要这么火,生物信息学应该是很小众的,不需要太多的人。
: 举个例子,现在RNA-seq之所以需要生物信息学,是因为测序技术刚起步,有很多缺陷
: ,不得不用统计学弥补一下,把现今所能拿到的不完美data凑合着用。这就给所谓的“
: 生物信息学”提供了空间。
: 以后测序技术进步了、可靠了,生物信息学的重要性也就大幅下降了。
: 这就像在几十年前,照相是一项非常隆重的事情,要去专门的照相馆、找专业的技师。
: 现在技术进步了,绝大多数人都是拿着傻瓜相机随手拍一张。当然照相馆、以及制造相
: 机的人并不会消失,只是行业萎缩。
: ps:很多生物信息学软件为什么退化成了字符界面?是故意装逼吗?

B*******c
发帖数: 5056
144
呵呵,终于来了个明白人。
其实很多搞生信的人也没有这样的智商,知道自己本行业的trick。
他们天生就是随波逐流的小喽啰。

【在 M*P 的大作中提到】
: 终于让你识破了。
: 确实是这样。字符界面就是不想让外行上手。要是都跟PCR/Western那样的技术,中专
: 水平的学生培训一下就能做,那我们还怎么挣钱?不都成生物千老了?
: 你说的公司搞出容易用的界面的软件,然后我们就没工作了。 这个不太可能发生。为
: 什么?你看affymetrix?他们的软件界面简单,容易操作。但是没人用。原因一是贵,
: 好几千一个license,做生物的都抠门不愿意买。生物信息软件我们写的都是免费,自然
: 会有人来用。好不好用再说。有的是人排着队学用字符界面。
: 公司的软件不会替代我们的软件,还有一个原因,那就是我们会组织起来discredit那
: 些公司。再看affymetrix,他们一开始自己有个软件做芯片分析,后来怎么样?
: Berkeley,Priceton,UW Seatle,Harvard的统计系元老们起头搞自己的软件,用各种

c********e
发帖数: 598
145

准。
It's fine that you don't have a vision for the future.
But guess what? Even chip company does not want you to be able to accurately
measure genes so that you will be on hook forever. Idea technology and
software will never be there for you.

【在 B*******c 的大作中提到】
: 好的软件应该让外行在1小时之内上手,学会基本操作。字符界面显然达不到这个标准。
: 呵呵,你已经为bioinfo们想退路了?他们去amazon或google干啥?也有类似的软件让
: 他们操作吗?
:
: it.

l***s
发帖数: 841
146
觉得挺可笑的。隔行如隔山,对自己不熟悉的领域,最好慎言。 大路朝天,各走一边
。不喜欢生物信息的,绕着走就是了,如果你能绕开的话。当然错失机会,也怨不得别
人。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 呵呵,终于来了个明白人。
: 其实很多搞生信的人也没有这样的智商,知道自己本行业的trick。
: 他们天生就是随波逐流的小喽啰。

B*******c
发帖数: 5056
147
呵呵,你们这些跟帖的口风转变也太戏剧化了,虽然还是一如既往地否定嘲笑我。
一开始,每个人都在异口同声地声称软件的字符界面在技术上是迫不得已。
现在呢,又异口同声地说生信人就是要故意装逼耍流氓,而你毫无办法。
我想说的是:好在生信领域人数众多,总会有人在near future捷足先登,推出操作简
单的傻瓜化软件,这就是竞争的力量。

accurately

【在 c********e 的大作中提到】
:
: 准。
: It's fine that you don't have a vision for the future.
: But guess what? Even chip company does not want you to be able to accurately
: measure genes so that you will be on hook forever. Idea technology and
: software will never be there for you.

t****a
发帖数: 1212
148
等你啥时候管funding的时候,生信的人可能就会竞争着出你喜欢的GUI程序

【在 B*******c 的大作中提到】
: 呵呵,你们这些跟帖的口风转变也太戏剧化了,虽然还是一如既往地否定嘲笑我。
: 一开始,每个人都在异口同声地声称软件的字符界面在技术上是迫不得已。
: 现在呢,又异口同声地说生信人就是要故意装逼耍流氓,而你毫无办法。
: 我想说的是:好在生信领域人数众多,总会有人在near future捷足先登,推出操作简
: 单的傻瓜化软件,这就是竞争的力量。
:
: accurately

e*******o
发帖数: 4654
149
lz 你太外行,虽然我也不是搞生信的,不过我了解一些,我现在也是做软件的,虽然
不是生信软件。
你自己学一门编程语言,学学linux,就明白怎么回事了。
你这么搞叫人笑掉大牙。
推荐你看一本我大二的时候看的bioinformatics的入门书,
http://oreilly.com/catalog/bioskills/chapter/ch01.html
s******s
发帖数: 13035
150
这个不是竞争不竞争的问题。大多数都是搞科研的,要求多种多样,
方法又一直再改进更新,很难出傻瓜软件。另一方面,现在最新的
是做deepseq,这种东西就算有傻瓜软件,你普通一个laptop还跑
不下来,自然不是给dummy用的。
话说回来,有些生物信息的东西比较稳定了,自然有些比较好GUI
的软件。另外,如果Input不太大,其实无数web service也够用了

【在 B*******c 的大作中提到】
: 呵呵,你们这些跟帖的口风转变也太戏剧化了,虽然还是一如既往地否定嘲笑我。
: 一开始,每个人都在异口同声地声称软件的字符界面在技术上是迫不得已。
: 现在呢,又异口同声地说生信人就是要故意装逼耍流氓,而你毫无办法。
: 我想说的是:好在生信领域人数众多,总会有人在near future捷足先登,推出操作简
: 单的傻瓜化软件,这就是竞争的力量。
:
: accurately

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大家没事不要跳nextgen seq这个坑生物信息学Phd毕业直接找top10pharm生统的工作,如何?
Start to learn coding as a beginner of bioinformaticsa bioinformatician/statistician position is opened at NYC
bioinformatics postdoc poition($35,000 - $40,000)关于美国的生统博后!
进入Biology版参与讨论
B*******c
发帖数: 5056
151
发现中国已经推出操作简单、界面友好的web service了,基于R。
相信在不久的将来,会进军美国市场,大赚特赚。
对于很多商品,似乎有这样的范式:美国人innovate出新的草胚,东亚人polish后做成
商品赚钱。
那么对于bioinfor软件来讲,美国生信人过度自私的行业保护造成了这一结果。

【在 s******s 的大作中提到】
: 这个不是竞争不竞争的问题。大多数都是搞科研的,要求多种多样,
: 方法又一直再改进更新,很难出傻瓜软件。另一方面,现在最新的
: 是做deepseq,这种东西就算有傻瓜软件,你普通一个laptop还跑
: 不下来,自然不是给dummy用的。
: 话说回来,有些生物信息的东西比较稳定了,自然有些比较好GUI
: 的软件。另外,如果Input不太大,其实无数web service也够用了

s******s
发帖数: 13035
152
你都不知道自己说的是什么。
我说过,成熟的东西,自然有人做GUI。deep-seq最标准的那些,
很多GUI可以做,比如galaxy。问题是,大多数做研究的,不用
成熟的东西

【在 B*******c 的大作中提到】
: 发现中国已经推出操作简单、界面友好的web service了,基于R。
: 相信在不久的将来,会进军美国市场,大赚特赚。
: 对于很多商品,似乎有这样的范式:美国人innovate出新的草胚,东亚人polish后做成
: 商品赚钱。
: 那么对于bioinfor软件来讲,美国生信人过度自私的行业保护造成了这一结果。

B*******c
发帖数: 5056
153
呵呵,看不懂我的话,是你智力有障碍。
一个新技术出现后,不去积极商品化。而是以“研究”为理由,刻意增加行业壁垒来维
持利润。
这样的懒惰+自私,注定是要遭天谴的。

【在 s******s 的大作中提到】
: 你都不知道自己说的是什么。
: 我说过,成熟的东西,自然有人做GUI。deep-seq最标准的那些,
: 很多GUI可以做,比如galaxy。问题是,大多数做研究的,不用
: 成熟的东西

x********e
发帖数: 35261
154
商品所对应的需求跟前沿研究的着眼点是不一样的。很少有研发人员自己去做商品化。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 呵呵,看不懂我的话,是你智力有障碍。
: 一个新技术出现后,不去积极商品化。而是以“研究”为理由,刻意增加行业壁垒来维
: 持利润。
: 这样的懒惰+自私,注定是要遭天谴的。

x********e
发帖数: 35261
155
如果一个东西没有成熟商业化,只说明市场不够。什么行业壁垒,不是你说制造就制造的
。有钱赚的话谁不去做谁是傻子。至少现在大部分人不需要花冤枉钱来搞生信。你大概
属于那少数自己不行只能花钱的人, 还是舍不得多出几个钱的那种。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 呵呵,看不懂我的话,是你智力有障碍。
: 一个新技术出现后,不去积极商品化。而是以“研究”为理由,刻意增加行业壁垒来维
: 持利润。
: 这样的懒惰+自私,注定是要遭天谴的。

y*********o
发帖数: 37
156
同意楼上,实验室最怕摊上楼主这样的,我们实验室就有一个,BWA,Bowtie学不会,
非要老板买CLC,产出来很多中间文档,也不知道删,把实验室的server都给填满了。
。。
c********e
发帖数: 598
157

1)这玩意美国早有了,框架open source了。美国生信人最大公无私了。
2)看来你不了解R和算法。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 发现中国已经推出操作简单、界面友好的web service了,基于R。
: 相信在不久的将来,会进军美国市场,大赚特赚。
: 对于很多商品,似乎有这样的范式:美国人innovate出新的草胚,东亚人polish后做成
: 商品赚钱。
: 那么对于bioinfor软件来讲,美国生信人过度自私的行业保护造成了这一结果。

c********e
发帖数: 598
158

1)这玩意美国早有了,框架open source了。美国生信人最大公无私了。
2)看来你不了解R和算法。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 发现中国已经推出操作简单、界面友好的web service了,基于R。
: 相信在不久的将来,会进军美国市场,大赚特赚。
: 对于很多商品,似乎有这样的范式:美国人innovate出新的草胚,东亚人polish后做成
: 商品赚钱。
: 那么对于bioinfor软件来讲,美国生信人过度自私的行业保护造成了这一结果。

c********e
发帖数: 598
159

你是不是小学生?
你想转行,浪费资源是遭天谴的。

【在 B*******c 的大作中提到】
: 呵呵,看不懂我的话,是你智力有障碍。
: 一个新技术出现后,不去积极商品化。而是以“研究”为理由,刻意增加行业壁垒来维
: 持利润。
: 这样的懒惰+自私,注定是要遭天谴的。

m*********r
发帖数: 2456
160
因为他只知道PC,只能用windows.

【在 y*********o 的大作中提到】
: 同意楼上,实验室最怕摊上楼主这样的,我们实验室就有一个,BWA,Bowtie学不会,
: 非要老板买CLC,产出来很多中间文档,也不知道删,把实验室的server都给填满了。
: 。。

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m*********r
发帖数: 2456
161
你也太抬举这种抽风的了!

【在 c********e 的大作中提到】
:
: 你是不是小学生?
: 你想转行,浪费资源是遭天谴的。

p*******i
发帖数: 1181
162
太好玩了 一周过去了 楼主居然还在回这个帖 水浴操作员果然很闲
p*******i
发帖数: 1181
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