d*****a
发帖数: 46 | 1 博士期间5篇文章，一作两篇，IF累计35了，还有3篇正在投，文章里面两个是统计软件
，一个图像处理的软件，一个文献挖掘的软件。这样的简历去做Biostatistics有压力
吗？另外，请各位大牛也指点下面试。
ps：老婆不想出去，打算就先国内混了，想找的是国内的这几个top10pharm外企。
Specialties也写下：
• Language: Python, C++/Java, R/Splus/SAS/Matlab, SQL and HTML/XML;
• Database: ORACLE, MYSQL, Postgresql, SQLite;
• Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
• Bioinformatics: Analysis with Microarray/cDNA array, Chip-Seq,
RNA-Seq, Methyl-seq, or other deep sequencing data, homology/comparative
modeling of protein 3D structure, Functional genomics, Comparative genomics;
• Biostatistics: Statistics, Data analysis, Machine learning, Data
mining, Text mining, Bayesian network analysis; |
c********e
发帖数: 598 | 2
XML;
少吹牛，Java, oracle 就行了，
大公司不用Python, Django。
【在 d*****a 的大作中提到】
: 博士期间5篇文章，一作两篇，IF累计35了，还有3篇正在投，文章里面两个是统计软件
: ，一个图像处理的软件，一个文献挖掘的软件。这样的简历去做Biostatistics有压力
: 吗？另外，请各位大牛也指点下面试。
: ps：老婆不想出去，打算就先国内混了，想找的是国内的这几个top10pharm外企。
: Specialties也写下：
: • Language: Python, C++/Java, R/Splus/SAS/Matlab, SQL and HTML/XML;
: • Database: ORACLE, MYSQL, Postgresql, SQLite;
: • Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
: • Bioinformatics: Analysis with Microarray/cDNA array, Chip-Seq,
: RNA-Seq, Methyl-seq, or other deep sequencing data, homology/comparative
|
d*****a
发帖数: 46 | 3 那句吹牛了哈，指出来我给你reference，我又不是在这里求职，没必要吹牛。
pharm的大公司可能很少用python，SAS会多些，不过python还是很方便的，多多少少会
有些应用吧，6年前我开始用python做生信的时候，大多数人都在用perl呢。
【在 c********e 的大作中提到】
:
: XML;
: 少吹牛，Java, oracle 就行了，
: 大公司不用Python, Django。
|
a*******n
发帖数: 156 | |
d*****a
发帖数: 46 | 5 好吧，不知道小弟还有啥不够的地方么？
【在 a*******n 的大作中提到】
: 可以试试，不过前提是没有正经的生统跟你竞争
|
e*******o
发帖数: 4654 | 6 Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
PHP 应该归到language？
Machine learning, Data mining, Text mining, Bayesian network analysis;
后面几个与machine learning 有区别？
另，
为啥要外企啊？ |
d*****a
发帖数: 46 | 7
嗯，PHP可以归到language里，不过鉴于除了web服务外从来不用php，就扔那里了。
这个，增加搜索量，你懂的~
不知道哪家国企或者私企有前途，另外，不想自己的英语毕业就拉下了。。。
【在 e*******o 的大作中提到】
: Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
: PHP 应该归到language？
: Machine learning, Data mining, Text mining, Bayesian network analysis;
: 后面几个与machine learning 有区别？
: 另，
: 为啥要外企啊？
|
x******m
发帖数: 736 | 8 你这个简历找生统的有问题，我就来喷喷吧，总比等到面试的时候被喷好。
首先，你把这么多堆砌到一起，有没有想过遇到一两个行家问问题，怎么办？
你要是申生统计，好歹放几个统计模型上去吧，survival, logistic,categorical,
longitudinal.
data mining你总要提一提是做过哪些，比如svm, ann, decision tree, association,
clustering.
你一股脑把所有东西都堆砌上去，只有害无益。 |
s****l
发帖数: 10462 | |
d********h
发帖数: 2048 | 10 所谓伤其十指，不如断其一指。你自问你精通精通几个，别跟我说你做过这些。这些你
真正精通一个找工作是没问题了。
如果我是招聘人，这样的简历我直接扔垃圾桶。
XML;
【在 d*****a 的大作中提到】
: 博士期间5篇文章，一作两篇，IF累计35了，还有3篇正在投，文章里面两个是统计软件
: ，一个图像处理的软件，一个文献挖掘的软件。这样的简历去做Biostatistics有压力
: 吗？另外，请各位大牛也指点下面试。
: ps：老婆不想出去，打算就先国内混了，想找的是国内的这几个top10pharm外企。
: Specialties也写下：
: • Language: Python, C++/Java, R/Splus/SAS/Matlab, SQL and HTML/XML;
: • Database: ORACLE, MYSQL, Postgresql, SQLite;
: • Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
: • Bioinformatics: Analysis with Microarray/cDNA array, Chip-Seq,
: RNA-Seq, Methyl-seq, or other deep sequencing data, homology/comparative
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t*d
发帖数: 1290 | 11 为什么申请 Biostatistics，不是 bioinformatician？
XML;
【在 d*****a 的大作中提到】
: 博士期间5篇文章，一作两篇，IF累计35了，还有3篇正在投，文章里面两个是统计软件
: ，一个图像处理的软件，一个文献挖掘的软件。这样的简历去做Biostatistics有压力
: 吗？另外，请各位大牛也指点下面试。
: ps：老婆不想出去，打算就先国内混了，想找的是国内的这几个top10pharm外企。
: Specialties也写下：
: • Language: Python, C++/Java, R/Splus/SAS/Matlab, SQL and HTML/XML;
: • Database: ORACLE, MYSQL, Postgresql, SQLite;
: • Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
: • Bioinformatics: Analysis with Microarray/cDNA array, Chip-Seq,
: RNA-Seq, Methyl-seq, or other deep sequencing data, homology/comparative
|
K****n
发帖数: 5970 | 12 简历嘛，就是要所有沾边儿的和热门儿的都给丫咋上去
面试嘛，就是要把面试官给丫侃晕 |
K****n
发帖数: 5970 | 13 啊你也太狠了，这得扔90％简历到乐涩桶啦
【在 d********h 的大作中提到】
: 所谓伤其十指，不如断其一指。你自问你精通精通几个，别跟我说你做过这些。这些你
: 真正精通一个找工作是没问题了。
: 如果我是招聘人，这样的简历我直接扔垃圾桶。
:
: XML;
|
K****n
发帖数: 5970 | 14 我觉得lz的策略就是要引一些觉得自己非常专家的面试官问深入，然后再将这些难题全
都答出来，最后博得面试官滔滔江水，刮目相看，相见恨晚。
博士博士，就是要skill set很全很博，列得内些东西有个一两年肯定都学回了，再花
个3年搞搞research，发5篇文章，顺便就把这些skills搞熟了。
association,
【在 x******m 的大作中提到】
: 你这个简历找生统的有问题，我就来喷喷吧，总比等到面试的时候被喷好。
: 首先，你把这么多堆砌到一起，有没有想过遇到一两个行家问问题，怎么办？
: 你要是申生统计，好歹放几个统计模型上去吧，survival, logistic,categorical,
: longitudinal.
: data mining你总要提一提是做过哪些，比如svm, ann, decision tree, association,
: clustering.
: 你一股脑把所有东西都堆砌上去，只有害无益。
|
H**n
发帖数: 43 | 15 这种背景确实更适合bioinformatician.会这么多种语言，如果都用的熟练甚至精通的
话，那是很了不起的。biostatistics对统计要求比较高，对统计理论和那些统计模型
要有比较深的理解。specialties的最后一项把statistics,data analysis列进去显得
不太专业 |
c********e
发帖数: 598 | 16
用Perl和Python有差别吗？
【在 d*****a 的大作中提到】
: 那句吹牛了哈，指出来我给你reference，我又不是在这里求职，没必要吹牛。
: pharm的大公司可能很少用python，SAS会多些，不过python还是很方便的，多多少少会
: 有些应用吧，6年前我开始用python做生信的时候，大多数人都在用perl呢。
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c********e
发帖数: 598 | 17
你到底用PHP 还是 Django framewrok? 不是一家人呀。
【在 e*******o 的大作中提到】
: Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
: PHP 应该归到language？
: Machine learning, Data mining, Text mining, Bayesian network analysis;
: 后面几个与machine learning 有区别？
: 另，
: 为啥要外企啊？
|
d*****a
发帖数: 46 | 18 哈哈，喷的好~
这些模型要从实验设计开始了吧，简单的一般的biology差不多就搞定了，送给我们
bioinformatician的很少，至于regression, ttest, anova，这些，我也不好意思放简
历里。
association,
做过svm，Bayesian，decision tree，PCA，clustering，觉得太normal sense了，忘
记放了，等下简历添上~
总之我做的是太杂了，先都放上去，面试的时候可以给他们相信介绍下几个项目
【在 x******m 的大作中提到】
: 你这个简历找生统的有问题，我就来喷喷吧，总比等到面试的时候被喷好。
: 首先，你把这么多堆砌到一起，有没有想过遇到一两个行家问问题，怎么办？
: 你要是申生统计，好歹放几个统计模型上去吧，survival, logistic,categorical,
: longitudinal.
: data mining你总要提一提是做过哪些，比如svm, ann, decision tree, association,
: clustering.
: 你一股脑把所有东西都堆砌上去，只有害无益。
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d*****a
发帖数: 46 | 19 其实语言学的多了，精通一两个就可以了，别的需要的时候都很容易上手的，所谓触类
旁通吧。
反过来，如果你只精通一门语言，你永远不可能深入的领会这门语言，所谓坐井观天吧。
【在 d********h 的大作中提到】
: 所谓伤其十指，不如断其一指。你自问你精通精通几个，别跟我说你做过这些。这些你
: 真正精通一个找工作是没问题了。
: 如果我是招聘人，这样的简历我直接扔垃圾桶。
:
: XML;
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d*****a
发帖数: 46 | 20 bioinformatician我看的的职位比较少，只有novonordisk一个偏向structure biology
的，Deep-seq相关的我会更感兴趣一些,只是没有合适的。
Biostatistics一方面职位比较多，另外也想换个职业体会下~
【在 t*d 的大作中提到】
: 为什么申请 Biostatistics，不是 bioinformatician？
:
: XML;
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d*****a
发帖数: 46 | 21 哈哈，我也这么想的~
【在 K****n 的大作中提到】
: 简历嘛，就是要所有沾边儿的和热门儿的都给丫咋上去
: 面试嘛，就是要把面试官给丫侃晕
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d*****a
发帖数: 46 | 22 兄弟之言听的我内牛满面啊，知音啊！
【在 K****n 的大作中提到】
: 我觉得lz的策略就是要引一些觉得自己非常专家的面试官问深入，然后再将这些难题全
: 都答出来，最后博得面试官滔滔江水，刮目相看，相见恨晚。
: 博士博士，就是要skill set很全很博，列得内些东西有个一两年肯定都学回了，再花
: 个3年搞搞research，发5篇文章，顺便就把这些skills搞熟了。
:
: association,
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d*****a
发帖数: 46 | 23 有，如果你perl是godlike的程度的话，请继续，否则还是python吧，越来越多的
bioinformatics都开始用python做了。这里就不发辩论帖了。
【在 c********e 的大作中提到】
:
: 你到底用PHP 还是 Django framewrok? 不是一家人呀。
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d*****a
发帖数: 46 | 24 想挑战一把，在国内活，不容易啊，北京的房价还要再涨20年，你懂的~
【在 H**n 的大作中提到】
: 这种背景确实更适合bioinformatician.会这么多种语言，如果都用的熟练甚至精通的
: 话，那是很了不起的。biostatistics对统计要求比较高，对统计理论和那些统计模型
: 要有比较深的理解。specialties的最后一项把statistics,data analysis列进去显得
: 不太专业
|
d*****a
发帖数: 46 | 25 我自己写网站用django，有时候会用一些php的东西，比如cms,blog神马的，php这方面
的优势资源得天独厚。
【在 c********e 的大作中提到】
:
: 你到底用PHP 还是 Django framewrok? 不是一家人呀。
|
d*****a
发帖数: 46 | 26 看到还是有蛮多热心人关心这个帖子的，索性把自己linkedin profile贴出来，我觉得
自己算是比较典型的第二代bioinformatician，第一代是伴随着HGP兴起的一波，第二
代是伴随着Deep-sequencing的这波。觉得该学的基本都已经学了，只是国内
bioinformatics在top10里面的机会不多啊。。。
欢迎批评指正，谢绝人身攻击！
http://www.linkedin.com/pub/nan-qiao/35/7a7/7a0 |
x******m
发帖数: 736 | 27 我倒，纽约找quant的职位更多，你咋不去体验一下？
找工作不是你挑人，是人挑你。你这个背景，离生统差十万八千里了，还是脚踏实地吧
～～～。
biology
【在 d*****a 的大作中提到】
: bioinformatician我看的的职位比较少，只有novonordisk一个偏向structure biology
: 的，Deep-seq相关的我会更感兴趣一些,只是没有合适的。
: Biostatistics一方面职位比较多，另外也想换个职业体会下~
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K****n
发帖数: 5970 | 28 不客气不客气，不过还是要说一下。
凡是简历里写自己用过哪些算法的，尤其是machine learning算法的，我都会问
implementation细节，当然不是很刁难的细节。凡是简历里写前台技术和mvc技术的，
我都会问server side怎么实现的，能不能scale，让把网站架出来给俺瞅一眼。不过我
是IT口的
【在 d*****a 的大作中提到】
: 兄弟之言听的我内牛满面啊，知音啊！
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d*****a
发帖数: 46 | 29 嗯，简历上提到的肯定都会想好怎么对应到实际做过的项目上，其实好说，把几篇文章
介绍下就行了。
【在 K****n 的大作中提到】
: 不客气不客气，不过还是要说一下。
: 凡是简历里写自己用过哪些算法的，尤其是machine learning算法的，我都会问
: implementation细节，当然不是很刁难的细节。凡是简历里写前台技术和mvc技术的，
: 我都会问server side怎么实现的，能不能scale，让把网站架出来给俺瞅一眼。不过我
: 是IT口的
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l**********1
发帖数: 5204 | 30 本科非 北清协和医的 别想入北京的 Global Top10pharm生统的offshore based R&D
branch Scientist researcher 工作
本科非复上交上一医的 别想入上海的Global Top10pharm生统的同岗位工作
Biostatistics PhD 那怕是哈耶牛剑毕业的 记住那个职位的工资是海外外派职员 比
在博士屯还要高二倍的 usd pay scale
ps: 如找fixed contract 药厂的剥蚀猴 比如one year or can expand to three Ys
不如在西德或英国 瑞士 等地 找吧 楼主
【在 d*****a 的大作中提到】
: 看到还是有蛮多热心人关心这个帖子的，索性把自己linkedin profile贴出来，我觉得
: 自己算是比较典型的第二代bioinformatician，第一代是伴随着HGP兴起的一波，第二
: 代是伴随着Deep-sequencing的这波。觉得该学的基本都已经学了，只是国内
: bioinformatics在top10里面的机会不多啊。。。
: 欢迎批评指正，谢绝人身攻击！
: http://www.linkedin.com/pub/nan-qiao/35/7a7/7a0
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c**********e
发帖数: 70 | |
d*****a
发帖数: 46 | 32 中科院比你列的这些学校差？
中国人做生信的比作生统的多得多，生信转生统本来就是一条道道而已，为啥折腾，就
是不甘心哈，路，都是人走的。
【在 l**********1 的大作中提到】
: 本科非 北清协和医的 别想入北京的 Global Top10pharm生统的offshore based R&D
: branch Scientist researcher 工作
: 本科非复上交上一医的 别想入上海的Global Top10pharm生统的同岗位工作
: Biostatistics PhD 那怕是哈耶牛剑毕业的 记住那个职位的工资是海外外派职员 比
: 在博士屯还要高二倍的 usd pay scale
: ps: 如找fixed contract 药厂的剥蚀猴 比如one year or can expand to three Ys
: 不如在西德或英国 瑞士 等地 找吧 楼主
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w*******e
发帖数: 100 | 33 svm，Bayesian，decision tree,这些其中任何一个你能够学得很精通,而且能够真正理
解都很不错,如果你能够真正理解这些东西,做统计学根本就不是问题.而且用不着来这
里问,去CS 版,其实这就是cs 里面作生物信息学的和biology department 里面作
bioinfo的区别. biology 中作bioinfo 的一半就是把人家简单的软件拿过来run 下,根
本不理解其背后的思想,那
样就没意思了,找生物统计就很难了.
【在 d*****a 的大作中提到】
: 哈哈，喷的好~
:
: 这些模型要从实验设计开始了吧，简单的一般的biology差不多就搞定了，送给我们
: bioinformatician的很少，至于regression, ttest, anova，这些，我也不好意思放简
: 历里。
: association,
: 做过svm，Bayesian，decision tree，PCA，clustering，觉得太normal sense了，忘
: 记放了，等下简历添上~
: 总之我做的是太杂了，先都放上去，面试的时候可以给他们相信介绍下几个项目
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s****l
发帖数: 10462 | 34 想了半天，明白了乐涩是嘛意思
【在 K****n 的大作中提到】
: 啊你也太狠了，这得扔90％简历到乐涩桶啦
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l**********1
发帖数: 5204 | 35 Golbal Top 10 Pharm 找人 看血(学)统的 要查 博士后 博士课程 硕士课程 本科课
程 的所属的 World Ranking credit:
HTTP ://www.timeshighereducation.co.uk/world-university-rankings/2011-12/
world-ranking/region/asia
本科的中科院大学 刚刚成立 学士毕业的话 楼主 除非穿越到未来一次
还有 LZ 本科的 北林业大 1980s 改校名/tg 吹泡沫 前 不叫 大学吧
北京林业大学_百度百科
baike.baidu.com/view/8870.htm
北京林业大学，简称北林，原名北京林学院，是北京学院路八大学院之一。学校位于北
京市海淀区清华东路35号，创办于1952年10月16日，是中华人民共和国的重点
【在 d*****a 的大作中提到】
: 中科院比你列的这些学校差？
: 中国人做生信的比作生统的多得多，生信转生统本来就是一条道道而已，为啥折腾，就
: 是不甘心哈，路，都是人走的。
|
c********e
发帖数: 598 | 36
Why not become a web developer? I like python too. But i cannot find
your website developed with django. Where is it?
bioinformatics phD is a waste of time because:
1)Compared to Biology phD, You do not know much about
the core Biology/Biomed problem you need to address.
2)You may not have enough time to learn statistics like a PhD in statistics.
3)You programming skills? You can prove it with your dynamic website.
【在 d*****a 的大作中提到】
: 有，如果你perl是godlike的程度的话，请继续，否则还是python吧，越来越多的
: bioinformatics都开始用python做了。这里就不发辩论帖了。
|
d*****a
发帖数: 46 | 37 http://www.picb.ac.cn/hanlab/cociter
http://www.picb.ac.cn/hanlab/eResponseNet
http://www.picb.ac.cn/hanlab/Rhesus-TSS
http://www.picb.ac.cn/hanlab/DDI
这些都是django做的，大部分比较简单，5年前用ROR做的那个前一阵子实验室搬家，
passenger那个模块貌似更新了，还没部署好。
ps：I don't think Bioinformatics Ph. D is a waste of time, at least for me.
Lots of people hold their Deep-sequencing data and don't know what to do,
and they come to bioinformaticians for help. In any period of my Ph. D, I
held at least three projects. (most are collaborative projects)
statistics.
【在 c********e 的大作中提到】
:
: Why not become a web developer? I like python too. But i cannot find
: your website developed with django. Where is it?
: bioinformatics phD is a waste of time because:
: 1)Compared to Biology phD, You do not know much about
: the core Biology/Biomed problem you need to address.
: 2)You may not have enough time to learn statistics like a PhD in statistics.
: 3)You programming skills? You can prove it with your dynamic website.
:
|
d*****a
发帖数: 46 | 38 考古不错哈~
不过血统查的不够深，林大前身是北京林学院，为啥叫林学院？因为它的前身是京师大
学堂林学院，现在林大很多标本上面还标着京师大学堂林学院。
http://zh.wikipedia.org/zh-hk/%E5%8C%97%E4%BA%AC%E6%9E%97%E4%B8
不知道biostatistics这么多道道，总之试试吧，看给不给面试，给面试的话，我觉得
希望还是蛮大的。
ps：中科院大学不招本科生。
【在 l**********1 的大作中提到】
: Golbal Top 10 Pharm 找人 看血(学)统的 要查 博士后 博士课程 硕士课程 本科课
: 程 的所属的 World Ranking credit:
: HTTP ://www.timeshighereducation.co.uk/world-university-rankings/2011-12/
: world-ranking/region/asia
: 本科的中科院大学 刚刚成立 学士毕业的话 楼主 除非穿越到未来一次
: 还有 LZ 本科的 北林业大 1980s 改校名/tg 吹泡沫 前 不叫 大学吧
: 北京林业大学_百度百科
: baike.baidu.com/view/8870.htm
: 北京林业大学，简称北林，原名北京林学院，是北京学院路八大学院之一。学校位于北
: 京市海淀区清华东路35号，创办于1952年10月16日，是中华人民共和国的重点
|
d*****a
发帖数: 46 | 39 SeqSpider: A novel Bayesian network inference algorithm for analysis of
heterogeneous data
SeqSpider is a novel algorithm that we developed to deal with heterogeneous
data (discretized data, continuous data, vector data),which is particularly
useful in integrating multi-source and multi-type NGS data to infer a
regulatory network for a certain cellular context.The paper has been
accepted by Cell Research (in press).
我co-frist的一篇。
【在 w*******e 的大作中提到】
: svm，Bayesian，decision tree,这些其中任何一个你能够学得很精通,而且能够真正理
: 解都很不错,如果你能够真正理解这些东西,做统计学根本就不是问题.而且用不着来这
: 里问,去CS 版,其实这就是cs 里面作生物信息学的和biology department 里面作
: bioinfo的区别. biology 中作bioinfo 的一半就是把人家简单的软件拿过来run 下,根
: 本不理解其背后的思想,那
: 样就没意思了,找生物统计就很难了.
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w******e
发帖数: 42 | 40 对lz比较中肯的评价：
听了两天戏，就敢到处唱叫小番！
而且你到mitbbs问中国pharma的情况，这不是犯j吗？
还biostatistician, 按美国big pharma 的标准，你得回炉。别现了！别人说你跟不红
，喵不正。你是没见过牛的。一个井底之蛙而已！
还喜欢算累计if，国内那点臭毛病，就别在这里抖s了。
既是按bioinformatician，你也没什么出彩，能跟上这里就不错。你一个土薄，还没博
呢，解决什么实际科学问题了？工作被Nature Reviews highlight 过吗？跑到这里来
现眼。欠骂呀！
话糙了些。只希望你知道自己几斤几两。
XML;
【在 d*****a 的大作中提到】
: 博士期间5篇文章，一作两篇，IF累计35了，还有3篇正在投，文章里面两个是统计软件
: ，一个图像处理的软件，一个文献挖掘的软件。这样的简历去做Biostatistics有压力
: 吗？另外，请各位大牛也指点下面试。
: ps：老婆不想出去，打算就先国内混了，想找的是国内的这几个top10pharm外企。
: Specialties也写下：
: • Language: Python, C++/Java, R/Splus/SAS/Matlab, SQL and HTML/XML;
: • Database: ORACLE, MYSQL, Postgresql, SQLite;
: • Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
: • Bioinformatics: Analysis with Microarray/cDNA array, Chip-Seq,
: RNA-Seq, Methyl-seq, or other deep sequencing data, homology/comparative
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d*****a
发帖数: 46 | 41 不想删你帖子，路走的多了，总会踩到翔的。
我5年发了5篇，2个co-1st，还有3篇co-1st在review，作为一个biostatistician的Ph.
D，我
问心无愧。
我做的十几个项目，大部分都是合作的，都是解决实际问题的，像白血病分型，NTD（
没发表），家蚕病毒相互作用，还有一些工具。
我的工作没一个被nature review highlight过的，so what？我就不能在mitbbs上发帖
讨论找工作的事情了？
【在 w******e 的大作中提到】
: 对lz比较中肯的评价：
: 听了两天戏，就敢到处唱叫小番！
: 而且你到mitbbs问中国pharma的情况，这不是犯j吗？
: 还biostatistician, 按美国big pharma 的标准，你得回炉。别现了！别人说你跟不红
: ，喵不正。你是没见过牛的。一个井底之蛙而已！
: 还喜欢算累计if，国内那点臭毛病，就别在这里抖s了。
: 既是按bioinformatician，你也没什么出彩，能跟上这里就不错。你一个土薄，还没博
: 呢，解决什么实际科学问题了？工作被Nature Reviews highlight 过吗？跑到这里来
: 现眼。欠骂呀！
: 话糙了些。只希望你知道自己几斤几两。
|
a*******n
发帖数: 156 | 42 你做的东西跟生统不怎么搭边，虽然很多统计模型都是相通的
这就像你明明是个高中生却去找一个本科生的工作，虽然你可能有本科生同等学力，但
是如果同时有一个本科生竞争，你很难拿到面试机会,别人反而觉得你是来捣乱的
【在 d*****a 的大作中提到】
: 好吧，不知道小弟还有啥不够的地方么？
|
w******e
发帖数: 42 | 43 你这辉煌phd生涯中， 见过比你强的吗？我觉得你可能没有吧！你还不知道什么是真牛。
你的工作还不至于让你这么high! 在biologist眼中，你这种工作就是bitch干的。合作
，狗屁！你只是自己美意识到罢了。你在你们那个小坑里可能很unusual吧，被当个宝
吧！我今年还去你们那跟过个talk呢。你这背景在这里，真的真的很普通。
你可以晒背景，发帖找工作。看看别人怎么回你的，心里也算有个数了吧。别太
defensive就好。
再有，你裸奔，就要allow别人骂你身材差！
别人说你一句，你就回一句。you need to learn how to listen first! 典型土薄！
这是损你的－
你宇宙第一，求你了，删了我的贴吧！ |
l****t
发帖数: 1454 | 44 我敢说这哥们儿在就业市场上，肯定会比你说的很多biologist要hot，不管是在美国还
是国内，没办法，市场决定的，你眼红，你悲愤，也没有用的
要是他是美国这边毕业的，这水平去湾区随便当硅工了，一年随便挣个小10w的，你所
谓的biologist们只能眼红的份了
不过我同意上面很多的评论，这水平做生统还是够呛的
牛。
【在 w******e 的大作中提到】
: 你这辉煌phd生涯中， 见过比你强的吗？我觉得你可能没有吧！你还不知道什么是真牛。
: 你的工作还不至于让你这么high! 在biologist眼中，你这种工作就是bitch干的。合作
: ，狗屁！你只是自己美意识到罢了。你在你们那个小坑里可能很unusual吧，被当个宝
: 吧！我今年还去你们那跟过个talk呢。你这背景在这里，真的真的很普通。
: 你可以晒背景，发帖找工作。看看别人怎么回你的，心里也算有个数了吧。别太
: defensive就好。
: 再有，你裸奔，就要allow别人骂你身材差！
: 别人说你一句，你就回一句。you need to learn how to listen first! 典型土薄！
: 这是损你的－
: 你宇宙第一，求你了，删了我的贴吧！
|
d*****a
发帖数: 46 | 45 嗯，转生统这个话题在这里蛮敏感貌似。其实我是习惯了，本科从自动化转到生物，研
究生又转到生物信息学，如果毕业真弄了个biostatisticsian，确实有点那个，哈哈~
我还是先看看top10里面bioinformatics的吧。。。
【在 l****t 的大作中提到】
: 我敢说这哥们儿在就业市场上，肯定会比你说的很多biologist要hot，不管是在美国还
: 是国内，没办法，市场决定的，你眼红，你悲愤，也没有用的
: 要是他是美国这边毕业的，这水平去湾区随便当硅工了，一年随便挣个小10w的，你所
: 谓的biologist们只能眼红的份了
: 不过我同意上面很多的评论，这水平做生统还是够呛的
:
: 牛。
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x******m
发帖数: 736 | 46 别去，这里人说点意见，你就不转生统了？太脆弱了吧。
赶紧弄个biostatisticsian，回头别忘了上来报喜，给黑暗中的生物wsn们也有点盼头。
【在 d*****a 的大作中提到】
: 嗯，转生统这个话题在这里蛮敏感貌似。其实我是习惯了，本科从自动化转到生物，研
: 究生又转到生物信息学，如果毕业真弄了个biostatisticsian，确实有点那个，哈哈~
: 我还是先看看top10里面bioinformatics的吧。。。
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K****n
发帖数: 5970 | 47 wokao
弱问一下儿美国top10 pharm的biostatistician要咋样地简历才可能有面试？ |
K****n
发帖数: 5970 | 48 嗯，其实我是福建人
【在 s****l 的大作中提到】
: 想了半天，明白了乐涩是嘛意思
|
x******m
发帖数: 736 | 49 lz都给答案了：
• Language: Python, C++/Java, R/Splus/SAS/Matlab, SQL and HTML/XML;
• Database: ORACLE, MYSQL, Postgresql, SQLite;
• Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
• Bioinformatics: Analysis with Microarray/cDNA array, Chip-Seq,
RNA-Seq, Methyl-seq, or other deep sequencing data, homology/comparative
modeling of protein 3D structure, Functional genomics, Comparative genomics;
• Biostatistics: Statistics, Data analysis, Machine learning, Data
mining, Text mining, Bayesian network analysis;
【在 K****n 的大作中提到】
: wokao
: 弱问一下儿美国top10 pharm的biostatistician要咋样地简历才可能有面试？
|
K****n
发帖数: 5970 | 50 诶，我是带着诚意的
我脚着R，SAS，Statistics这几个会了不就成了么？又是生物口儿的，肯定细胞分子都
懂点儿？
XML;
genomics;
Data
【在 x******m 的大作中提到】
: lz都给答案了：
: • Language: Python, C++/Java, R/Splus/SAS/Matlab, SQL and HTML/XML;
: • Database: ORACLE, MYSQL, Postgresql, SQLite;
: • Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
: • Bioinformatics: Analysis with Microarray/cDNA array, Chip-Seq,
: RNA-Seq, Methyl-seq, or other deep sequencing data, homology/comparative
: modeling of protein 3D structure, Functional genomics, Comparative genomics;
: • Biostatistics: Statistics, Data analysis, Machine learning, Data
: mining, Text mining, Bayesian network analysis;
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a********k
发帖数: 2273 | 51 这年头不搞会10钟语言你都不好意思上job market。你是马工你懂的。
【在 K****n 的大作中提到】
: 诶，我是带着诚意的
: 我脚着R，SAS，Statistics这几个会了不就成了么？又是生物口儿的，肯定细胞分子都
: 懂点儿？
:
: XML;
: genomics;
: Data
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K****n
发帖数: 5970 | 52 我找到工作的内会儿，真心只会matlab，主要用那个plot函数，给paper做做图。简历
上强装会写C++，其实经常编译通不过。面试的时候最后一道难题，让我把一个string
给反转过来，我想了半天写了一个for loop，由于对c++不熟，险些没做出来，还好骗
过了面试官，拿到了offer。
但是我这个人比较用功。这不，工作两年多了，每天晚上苦练，学会了一种叫python的
语言，写写script啥的，还别说，挺好使。我看到lz这样牛的简历，实在是很崇拜啊
【在 a********k 的大作中提到】
: 这年头不搞会10钟语言你都不好意思上job market。你是马工你懂的。
|
b*******n
发帖数: 8420 | 53 楼主的简历比较吓人，可以秒杀美国这里90%以上的生统PHD
所以有可能面试官看到简历后认真了，在大到课题研究经历小到代码语言细节等各方面
技术性击倒楼主。。
【在 K****n 的大作中提到】
: 诶，我是带着诚意的
: 我脚着R，SAS，Statistics这几个会了不就成了么？又是生物口儿的，肯定细胞分子都
: 懂点儿？
:
: XML;
: genomics;
: Data
|
b*******n
发帖数: 8420 | 54 原来你就是那个准备技术性击倒楼主的面试官，失敬失敬。。
string
【在 K****n 的大作中提到】
: 我找到工作的内会儿，真心只会matlab，主要用那个plot函数，给paper做做图。简历
: 上强装会写C++，其实经常编译通不过。面试的时候最后一道难题，让我把一个string
: 给反转过来，我想了半天写了一个for loop，由于对c++不熟，险些没做出来，还好骗
: 过了面试官，拿到了offer。
: 但是我这个人比较用功。这不，工作两年多了，每天晚上苦练，学会了一种叫python的
: 语言，写写script啥的，还别说，挺好使。我看到lz这样牛的简历，实在是很崇拜啊
|
K****n
发帖数: 5970 | 55 这。。。嗯，技术性击倒听起来很操蛋啊。可以这么考，如果用django做rest api，有
哪些常用的egg可以直接拿来用；RoR 1.x和RoR 3.x的default javascript库有什么区
别，这两个题很操蛋吧，我还可以写一个20行的method，让candidate用ruby必须用一
行code重新写出来。当然，如果有一个公司问我这种问题，我是绝逼不去的。Machine
learning除了证明题没什么可考的，我可以给一个小时，让在白板上推一遍svm的在线
性可分情况下的证明，或者给一个小时把PCA和Feedforward Neural Network一块儿推
一遍，这都是最基本的。
不过真面试的时候，一般随便出俩小破题就能难倒一片了，清华的博士，史丹佛的博士
，没干过正经项目的都有可能被刷。lz似乎颇做过一些像样儿的project，这个很不错
嘛，skill set还是ok的，就看和其它candidate比，能不能在技术面试的时候表现出聪
明来了
【在 b*******n 的大作中提到】
: 原来你就是那个准备技术性击倒楼主的面试官，失敬失敬。。
:
: string
|
d*****a
发帖数: 46 | 56 哈哈，好，人活着不就争一口气嘛，我还非乱投了试试~
再说，乱投又不会怀孕~
头。
【在 x******m 的大作中提到】
: 别去，这里人说点意见，你就不转生统了？太脆弱了吧。
: 赶紧弄个biostatisticsian，回头别忘了上来报喜，给黑暗中的生物wsn们也有点盼头。
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d*****a
发帖数: 46 | 57 说实话，以前我还会把Perl，Ruby这些也都放上去，现在是Python不离手，C++写高性
能的处理，Java写GUI跨平台很爽，这三个在，真想不出用别的的理由了。
【在 a********k 的大作中提到】
: 这年头不搞会10钟语言你都不好意思上job market。你是马工你懂的。
|
d*****a
发帖数: 46 | 58 嘿嘿，怕他不聊课题，我bayesian那个课题投了3年才投出去，各种变态的reviewer都
见过，哎，本来是个学术派好青年，文章投的心都凉了。。。
【在 b*******n 的大作中提到】
: 楼主的简历比较吓人，可以秒杀美国这里90%以上的生统PHD
: 所以有可能面试官看到简历后认真了，在大到课题研究经历小到代码语言细节等各方面
: 技术性击倒楼主。。
|
d*****a
发帖数: 46 | 59 哎，最烦推公式。。。，我们还是讨论项目吧。。。
我面试小弟们的时候，都是给一周时间写算PCC的程序,在这里，谁有兴趣做^=^
https://github.com/downsea/calculating_pcc_case_study
Machine
【在 K****n 的大作中提到】
: 这。。。嗯，技术性击倒听起来很操蛋啊。可以这么考，如果用django做rest api，有
: 哪些常用的egg可以直接拿来用；RoR 1.x和RoR 3.x的default javascript库有什么区
: 别，这两个题很操蛋吧，我还可以写一个20行的method，让candidate用ruby必须用一
: 行code重新写出来。当然，如果有一个公司问我这种问题，我是绝逼不去的。Machine
: learning除了证明题没什么可考的，我可以给一个小时，让在白板上推一遍svm的在线
: 性可分情况下的证明，或者给一个小时把PCA和Feedforward Neural Network一块儿推
: 一遍，这都是最基本的。
: 不过真面试的时候，一般随便出俩小破题就能难倒一片了，清华的博士，史丹佛的博士
: ，没干过正经项目的都有可能被刷。lz似乎颇做过一些像样儿的project，这个很不错
: 嘛，skill set还是ok的，就看和其它candidate比，能不能在技术面试的时候表现出聪
|
l**********1
发帖数: 5204 | 60 哈佛的以下的生统 PD traning 类似的 是进入 US/EC Top ten Pharm R&D Scientist
position 的 必要条件 之一
HTTP: //liulab.dfci.harvard.edu/positions.htm
发信人: nowhere7 (折腾), 信区: Biology
标 题: Re: 千人课题组招聘CO-PI, 讲师，博士后
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Aug 15 17:51:50 2012, 美东)
前两年tongji想挖wong的徒子，结果徒子派了一个徒孙过去
同主题阅读：Re: 千人课题组招聘CO-PI, 讲师，博士后
[版面:生物学][首篇作者：neverthink] , 2012年08月14日
http://www.mitbbs.com/article_t1/Biology/31716431_0_2.html
【在 d*****a 的大作中提到】
: 考古不错哈~
: 不过血统查的不够深，林大前身是北京林学院，为啥叫林学院？因为它的前身是京师大
: 学堂林学院，现在林大很多标本上面还标着京师大学堂林学院。
: http://zh.wikipedia.org/zh-hk/%E5%8C%97%E4%BA%AC%E6%9E%97%E4%B8
: 不知道biostatistics这么多道道，总之试试吧，看给不给面试，给面试的话，我觉得
: 希望还是蛮大的。
: ps：中科院大学不招本科生。
|
|
|
s*****r
发帖数: 1426 | 61 现在都有生物信息学的PhD了......
Biostatistics是statistics下的一门学科
Bioinformatics是一个应用而已，CS和Biostatistics的人在做，需要较强的数学知识
，不只是写程序。LZ phd毕业最好别做药厂做码农，就算要做也得去湾区做C++/Java，
至少图个快钱。
如果LZ找的是研究职位，博士期间一作两篇的话，算一般水平。如果是application
notes那还得减分
XML;
【在 d*****a 的大作中提到】
: 博士期间5篇文章，一作两篇，IF累计35了，还有3篇正在投，文章里面两个是统计软件
: ，一个图像处理的软件，一个文献挖掘的软件。这样的简历去做Biostatistics有压力
: 吗？另外，请各位大牛也指点下面试。
: ps：老婆不想出去，打算就先国内混了，想找的是国内的这几个top10pharm外企。
: Specialties也写下：
: • Language: Python, C++/Java, R/Splus/SAS/Matlab, SQL and HTML/XML;
: • Database: ORACLE, MYSQL, Postgresql, SQLite;
: • Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
: • Bioinformatics: Analysis with Microarray/cDNA array, Chip-Seq,
: RNA-Seq, Methyl-seq, or other deep sequencing data, homology/comparative
|
k*****1
发帖数: 454 | 62 hi dude,
Believe or not, it would be much easier for HIM to find a good job than YOU!
Try to put your CV in the market, what kind of job you will have? even if
you have tons of CNS? so what?
you are absolutely mad.
牛。
【在 w******e 的大作中提到】
: 你这辉煌phd生涯中， 见过比你强的吗？我觉得你可能没有吧！你还不知道什么是真牛。
: 你的工作还不至于让你这么high! 在biologist眼中，你这种工作就是bitch干的。合作
: ，狗屁！你只是自己美意识到罢了。你在你们那个小坑里可能很unusual吧，被当个宝
: 吧！我今年还去你们那跟过个talk呢。你这背景在这里，真的真的很普通。
: 你可以晒背景，发帖找工作。看看别人怎么回你的，心里也算有个数了吧。别太
: defensive就好。
: 再有，你裸奔，就要allow别人骂你身材差！
: 别人说你一句，你就回一句。you need to learn how to listen first! 典型土薄！
: 这是损你的－
: 你宇宙第一，求你了，删了我的贴吧！
|
e******y
发帖数: 209 | 63 why are you guys referring to biostatistician like it`s a dream job?
It is a boring job with no impact on the business at all |
l****t
发帖数: 1454 | 64 对于这个版的多数苦逼来说，这个就是dream job
真正干了这行，其实也是一样boring
但是钱多点，相对做实验，活轻松很多，压力小，你说是不是生物版人的dream job
一旦有人想跳，大家就像打了鸡血一样，生怕别人成功了，一个个跳出来打击一下
不过拍一下还是应该的，至少这个情况现在在美国这边是不能做statistician的，好多
年前只要会SAS就可以了，现在水涨船高了，需要MS的学历才行了
【在 e******y 的大作中提到】
: why are you guys referring to biostatistician like it`s a dream job?
: It is a boring job with no impact on the business at all
|
K****n
发帖数: 5970 | 65 嗯，不错，不过这应该是一个小时的题目。
一个礼拜可以implement下面这个：
http://www.uvm.edu/~cmplxsys/newsevents/pdfs/2012/reshef-correl
【在 d*****a 的大作中提到】
: 哎，最烦推公式。。。，我们还是讨论项目吧。。。
: 我面试小弟们的时候，都是给一周时间写算PCC的程序,在这里，谁有兴趣做^=^
: https://github.com/downsea/calculating_pcc_case_study
:
: Machine
|
e*******o
发帖数: 4654 | 66 那些语言，框架你可能都是只用，都是别人的。
PhD了肯定要讲下，你自己独有的东西在哪。
【在 d*****a 的大作中提到】
: 嗯，简历上提到的肯定都会想好怎么对应到实际做过的项目上，其实好说，把几篇文章
: 介绍下就行了。
|
e*******o
发帖数: 4654 | 67 这些，已经工作了的，都不一定能按要求全搞定。
Machine
【在 K****n 的大作中提到】
: 这。。。嗯，技术性击倒听起来很操蛋啊。可以这么考，如果用django做rest api，有
: 哪些常用的egg可以直接拿来用；RoR 1.x和RoR 3.x的default javascript库有什么区
: 别，这两个题很操蛋吧，我还可以写一个20行的method，让candidate用ruby必须用一
: 行code重新写出来。当然，如果有一个公司问我这种问题，我是绝逼不去的。Machine
: learning除了证明题没什么可考的，我可以给一个小时，让在白板上推一遍svm的在线
: 性可分情况下的证明，或者给一个小时把PCA和Feedforward Neural Network一块儿推
: 一遍，这都是最基本的。
: 不过真面试的时候，一般随便出俩小破题就能难倒一片了，清华的博士，史丹佛的博士
: ，没干过正经项目的都有可能被刷。lz似乎颇做过一些像样儿的project，这个很不错
: 嘛，skill set还是ok的，就看和其它candidate比，能不能在技术面试的时候表现出聪
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h****a
发帖数: 1098 | 68 好像大家对国内博士有些歧视。
我碰到过好几位国内的博士水平非常好，英语也不错。
是金子，到哪里都发光。
YOU!
【在 k*****1 的大作中提到】
: hi dude,
: Believe or not, it would be much easier for HIM to find a good job than YOU!
: Try to put your CV in the market, what kind of job you will have? even if
: you have tons of CNS? so what?
: you are absolutely mad.
:
: 牛。
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d*****a
发帖数: 46 | 69 一个Cell Res， 一个Journal of Virology,还有个aging cell， review回来还不错，
有希望。既然打算跳出来了，就不在乎IF了，刚投到plos one上的一个工具，
bioinformatics都不review，但是cite的文章都有3个了。
【在 s*****r 的大作中提到】
: 现在都有生物信息学的PhD了......
: Biostatistics是statistics下的一门学科
: Bioinformatics是一个应用而已，CS和Biostatistics的人在做，需要较强的数学知识
: ，不只是写程序。LZ phd毕业最好别做药厂做码农，就算要做也得去湾区做C++/Java，
: 至少图个快钱。
: 如果LZ找的是研究职位，博士期间一作两篇的话，算一般水平。如果是application
: notes那还得减分
:
: XML;
|
d*****a
发帖数: 46 | 70 嗯，给他们讲做过的项目。
【在 e*******o 的大作中提到】
: 那些语言，框架你可能都是只用，都是别人的。
: PhD了肯定要讲下，你自己独有的东西在哪。
|
|
|
K****n
发帖数: 5970 | 71 嗯，所以码农只好考算法。不知道生统面试是考计算还是考证明还是考概念还是考英俊
呢？
【在 e*******o 的大作中提到】
: 这些，已经工作了的，都不一定能按要求全搞定。
:
: Machine
|
b******s
发帖数: 37 | 72 please contact me by bbs mail. I can help you with this.
XML;
【在 d*****a 的大作中提到】
: 博士期间5篇文章，一作两篇，IF累计35了，还有3篇正在投，文章里面两个是统计软件
: ，一个图像处理的软件，一个文献挖掘的软件。这样的简历去做Biostatistics有压力
: 吗？另外，请各位大牛也指点下面试。
: ps：老婆不想出去，打算就先国内混了，想找的是国内的这几个top10pharm外企。
: Specialties也写下：
: • Language: Python, C++/Java, R/Splus/SAS/Matlab, SQL and HTML/XML;
: • Database: ORACLE, MYSQL, Postgresql, SQLite;
: • Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
: • Bioinformatics: Analysis with Microarray/cDNA array, Chip-Seq,
: RNA-Seq, Methyl-seq, or other deep sequencing data, homology/comparative
|
d*****a
发帖数: 46 | 73 Please check your bbs mail, thanks for your help!
【在 b******s 的大作中提到】
: please contact me by bbs mail. I can help you with this.
:
: XML;
|
a****y
发帖数: 143 | 74 你不是读生物的吗? 也会懂这么多编程? 咋学的这么牛X
【在 c********e 的大作中提到】
:
: Why not become a web developer? I like python too. But i cannot find
: your website developed with django. Where is it?
: bioinformatics phD is a waste of time because:
: 1)Compared to Biology phD, You do not know much about
: the core Biology/Biomed problem you need to address.
: 2)You may not have enough time to learn statistics like a PhD in statistics.
: 3)You programming skills? You can prove it with your dynamic website.
:
|
d*****a
发帖数: 46 | 75 我大学开始学的自动化，计算机基础比较好，后来转到生物技术了，做了两年实验后发
现还是做生物数学计算机的交叉学科比较好，就读了生信的博士。
有兴趣，自然学的快~
【在 a****y 的大作中提到】
: 你不是读生物的吗? 也会懂这么多编程? 咋学的这么牛X
|
e*******o
发帖数: 4654 | 76 编程那块
-------------
如果有人指导：
语言能用的程度，半年。学一个，其余的一星期内可以上手。 haskell等变态的除外。
DB（SQL） 一个月，
web framework 一个月。
注：我说的只是能用，做出来简单的东西。与专业无关，关键是自己不断摸索，高中辍
学成技术大牛的也有。
ML 那一块，比较难些。我一直一头雾水。
--------------
【在 a****y 的大作中提到】
: 你不是读生物的吗? 也会懂这么多编程? 咋学的这么牛X
|
p*******i
发帖数: 1181 | 77 楼主的背景，在美国想找Bioinformatics Research Scientist很难 因为本身是国内的
学历就比较吃亏，在加上文章不够牛（是真的不够牛，total IF这边没人看的。楼主也
许在国内能发5篇确实很不容易，但是Bioinfo在美国想混挂名文章真心很容易，我室友
Bioinfo Phd 5年11篇文章，一作四篇，包括NAR，总引用数100多了，投
Bioinformatics Research Scientist也没找到好位置，只有好些博后的offer。最近几
年药厂裁人很厉害，这个行业美国过剩的很，不建议楼主过来找。国内最近这个行业发
展的很快，应该机会要多很多。
至于直接投生统，我自己是统计的Phd，在生统行业工作。以我的经验来说，生统Phd的
工作已经不是编程的了（编程的话MS的SAS Programmer一大把，年薪5万能招一堆），
核心是modeling,楼主建议你至少Linear Model，Multivariate ANOVA之类的系统学一
遍，不仅仅要知道怎么看SAS或者R的输出结果，还必须要知道为什么（比如说residual
不Normal的时候怎么transform,transform以后的结果又怎么向Clinical team的人解释
等等，其中后面一点又难很多）。
至于Java PHP什么的我们这里没任何需求，网页什么的有专门的IT人处理，正统的生统
Scientist不需要管那些，也没机会接触那些。
最后说一点，生统真的挺无聊的，Bioinfo我还觉得更有趣一些，楼主三思~ |
f*********e
发帖数: 1144 | 78 楼主要能有做proteomics/mass spec data的经历就完美了。
当时找工作记得还是蛮多要会这方面的phd level的大药厂
我赞同楼上某位说的能真正知道biology problem,然后可以translate to bioinfo, 还
是挺不容易的，CS强的要去理解某个深入的biology problem还是蛮困难的
bioinfo这个专业，关键在自己到底做什么方向，水平如何，好的去大药厂没问题； 差
的。。。恩。。比如我。。恩。。。
XML;
genomics;
Data
【在 x******m 的大作中提到】
: lz都给答案了：
: • Language: Python, C++/Java, R/Splus/SAS/Matlab, SQL and HTML/XML;
: • Database: ORACLE, MYSQL, Postgresql, SQLite;
: • Web service: Apache, PHP, ROR, Django;
: • Bioinformatics: Analysis with Microarray/cDNA array, Chip-Seq,
: RNA-Seq, Methyl-seq, or other deep sequencing data, homology/comparative
: modeling of protein 3D structure, Functional genomics, Comparative genomics;
: • Biostatistics: Statistics, Data analysis, Machine learning, Data
: mining, Text mining, Bayesian network analysis;
|
f*********e
发帖数: 1144 | 79 呵呵，我找工作的时候顶着bioinfo phd,可是只会R,还只是皮毛。。。根本就不敢找跟
bioinfo相关的，碰到懂行的，一碰就坏了。 不过好处就是找其他领域的时候，让别人
比较肃然起敬，经常面完了之后，突然来一句，"oh,just noticed u got your phd in
bioinfo, tell me about it...impressive..."
总结，要懂其他的，顶一个bioinfo名头还是蛮能唬人
hahahahahha
string
【在 K****n 的大作中提到】
: 我找到工作的内会儿，真心只会matlab，主要用那个plot函数，给paper做做图。简历
: 上强装会写C++，其实经常编译通不过。面试的时候最后一道难题，让我把一个string
: 给反转过来，我想了半天写了一个for loop，由于对c++不熟，险些没做出来，还好骗
: 过了面试官，拿到了offer。
: 但是我这个人比较用功。这不，工作两年多了，每天晚上苦练，学会了一种叫python的
: 语言，写写script啥的，还别说，挺好使。我看到lz这样牛的简历，实在是很崇拜啊
|
a*******n
发帖数: 156 | 80 感觉这里很多人都在误导人啊。
lz说的很多大公司都招的生统，是biometrician而不是biostatistician.小公司这两者
可能都是一个部门的，但在大公司两者是严格区分的 |
|
|
a*******n
发帖数: 156 | 81 PCC怎么进行多核运算？能说说你的思路么？
【在 d*****a 的大作中提到】
: 哎，最烦推公式。。。，我们还是讨论项目吧。。。
: 我面试小弟们的时候，都是给一周时间写算PCC的程序,在这里，谁有兴趣做^=^
: https://github.com/downsea/calculating_pcc_case_study
:
: Machine
|
d*****a
发帖数: 46 | 82 这是要技术性击倒么。。。
最简单的是数据分块。。。
【在 a*******n 的大作中提到】
: PCC怎么进行多核运算？能说说你的思路么？
|
d*****a
发帖数: 46 | 83 那个一直不感兴趣，既然工作了，更想做一些能解决实际问题的项目，比如疾病，
cancer。
【在 f*********e 的大作中提到】
: 楼主要能有做proteomics/mass spec data的经历就完美了。
: 当时找工作记得还是蛮多要会这方面的phd level的大药厂
: 我赞同楼上某位说的能真正知道biology problem,然后可以translate to bioinfo, 还
: 是挺不容易的，CS强的要去理解某个深入的biology problem还是蛮困难的
: bioinfo这个专业，关键在自己到底做什么方向，水平如何，好的去大药厂没问题； 差
: 的。。。恩。。比如我。。恩。。。
:
: XML;
: genomics;
: Data
|
d*****a
发帖数: 46 | 84 sigh，在国内发top杂志真心难，和能力无关。。。
确实现在不管是economics，还是biology，都是国内就业要好些。
modeling我觉得挺简单的，本科的时候我就用R coding过一本生统书的所有题，数据只
要整好，每种情况写一个程序就行了，其他就是解释结果了。如果天天干这个，确实是
挺boring的。。。
【在 p*******i 的大作中提到】
: 楼主的背景，在美国想找Bioinformatics Research Scientist很难 因为本身是国内的
: 学历就比较吃亏，在加上文章不够牛（是真的不够牛，total IF这边没人看的。楼主也
: 许在国内能发5篇确实很不容易，但是Bioinfo在美国想混挂名文章真心很容易，我室友
: Bioinfo Phd 5年11篇文章，一作四篇，包括NAR，总引用数100多了，投
: Bioinformatics Research Scientist也没找到好位置，只有好些博后的offer。最近几
: 年药厂裁人很厉害，这个行业美国过剩的很，不建议楼主过来找。国内最近这个行业发
: 展的很快，应该机会要多很多。
: 至于直接投生统，我自己是统计的Phd，在生统行业工作。以我的经验来说，生统Phd的
: 工作已经不是编程的了（编程的话MS的SAS Programmer一大把，年薪5万能招一堆），
: 核心是modeling,楼主建议你至少Linear Model，Multivariate ANOVA之类的系统学一
|
K****n
发帖数: 5970 | 85 有24004个row。。。两两算lol
如果只有两个变量，减Expectation的时候并行就是了
【在 a*******n 的大作中提到】
: PCC怎么进行多核运算？能说说你的思路么？
|
K****n
发帖数: 5970 | 86 好像是column，anyway
【在 K****n 的大作中提到】
: 有24004个row。。。两两算lol
: 如果只有两个变量，减Expectation的时候并行就是了
|
w*****n
发帖数: 375 | 87 硅工不都是起薪十四万以上吗？ 在找工作版的印象。
【在 l****t 的大作中提到】
: 我敢说这哥们儿在就业市场上，肯定会比你说的很多biologist要hot，不管是在美国还
: 是国内，没办法，市场决定的，你眼红，你悲愤，也没有用的
: 要是他是美国这边毕业的，这水平去湾区随便当硅工了，一年随便挣个小10w的，你所
: 谓的biologist们只能眼红的份了
: 不过我同意上面很多的评论，这水平做生统还是够呛的
:
: 牛。
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K****n
发帖数: 5970 | 88 那是把公司厨房里的power bar暗暗下决心每天吃三根儿，再把这三根儿的钱折合市价
加到公司单里，再暗暗下决心努力工作，帮助公司把股票推到翻两番，再把还没拿到的
股票按翻完之后的价钱算到现在的工资单里，再暗暗下决心生两个娃，把医院的bill按
没保险的balance加到自己的工资单里
【在 w*****n 的大作中提到】
: 硅工不都是起薪十四万以上吗？ 在找工作版的印象。
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d*****r
发帖数: 2583 | 89 加州同志们都太牛了。。
【在 K****n 的大作中提到】
: 那是把公司厨房里的power bar暗暗下决心每天吃三根儿，再把这三根儿的钱折合市价
: 加到公司单里，再暗暗下决心努力工作，帮助公司把股票推到翻两番，再把还没拿到的
: 股票按翻完之后的价钱算到现在的工资单里，再暗暗下决心生两个娃，把医院的bill按
: 没保险的balance加到自己的工资单里
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K****n
发帖数: 5970 | 90 热烈欢迎版主回米国～
【在 d*****r 的大作中提到】
: 加州同志们都太牛了。。
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K****n
发帖数: 5970 | 91 刚看见
他是要考考你，python多核怎么实现？
【在 d*****a 的大作中提到】
: 这是要技术性击倒么。。。
: 最简单的是数据分块。。。
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d*****a
发帖数: 46 | 92 我最喜欢用Pool，简单粗暴：
from multiprocessing import Pool
pool = Pool(processes=20)
pool.map(fun, para_list)
如何，给offer吧~ :)
【在 K****n 的大作中提到】
: 刚看见
: 他是要考考你，python多核怎么实现？
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K****n
发帖数: 5970 | 93 呵呵，可以给onsite。pitfall是不能用多线程:)
你对比过multiprocess开20个进程和单进程的速度吗？这个数据很小啊
【在 d*****a 的大作中提到】
: 我最喜欢用Pool，简单粗暴：
: from multiprocessing import Pool
: pool = Pool(processes=20)
: pool.map(fun, para_list)
: 如何，给offer吧~ :)
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K****n
发帖数: 5970 | 94 concurrency是你这个题里唯一好玩儿的地方，说实话我最讨厌gui和前台了
其实我用python做过一个实验，不用multiprocessing，就用multithreading，有GIL，
运行单进程。在16核, Ubuntu里，用numactl -c，速度可以提高n倍。我觉得可能用
cpuset也行，
【在 d*****a 的大作中提到】
: 我最喜欢用Pool，简单粗暴：
: from multiprocessing import Pool
: pool = Pool(processes=20)
: pool.map(fun, para_list)
: 如何，给offer吧~ :)
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d*****a
发帖数: 46 | 95 要算将近20000*20000/2个PCC，用pool调20个核，每个核都可以跑满的（理论上是单核
的20倍吧），这时threading基本没用，所以强调用multiprocessing。pool就相当于把
程序多开，一个给一个进程，简单粗暴~
threading我基本不用，GUI用Java做才是王道,从source 编译QT，GTK能把人弄死。。。
【在 K****n 的大作中提到】
: concurrency是你这个题里唯一好玩儿的地方，说实话我最讨厌gui和前台了
: 其实我用python做过一个实验，不用multiprocessing，就用multithreading，有GIL，
: 运行单进程。在16核, Ubuntu里，用numactl -c，速度可以提高n倍。我觉得可能用
: cpuset也行，
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l**********1
发帖数: 5204 | 96 2 Y wet Bio experience is enough to be a Global top 10 pharm生统的PhD
level graduated 工作?
if LZ does not think so,
pls try free onine web lectures:
by 弯立 陽明大學 生命科學系& 基因科學研究所
生化及細胞分子生物學 I (Biochemistry & Molecular Cell Biology Ⅰ)
pls visit below web link:
HTTP: //dls.ym.edu.tw/sa/dls/dls02/dls02-3/dls2-3-1/newssig.asp?id=13
then selct
10/29 王廷方 講義 click here please download compressed rar file.
more Global top 10 pharm生统的工作
may be neded,
選修 生物科技產業與管理（含上課講義下載） 下載 web link:
HTTP : //dls.ym.edu.tw/sa/dls/dls02/dls02-3/dls2-3-1/newssig.asp?id=60
all lectures summary link:
HTTP : //dls.ym.edu.tw/sa/dls/dls02/dls02-3/dls2-3-1/newssig.asp?id=23
or this one:
HTTP: //dls.ym.edu.tw/sa/dls/dls02/dls02-3/dls2-3-1/dls2-3.asp
【在 d*****a 的大作中提到】
: 我大学开始学的自动化，计算机基础比较好，后来转到生物技术了，做了两年实验后发
: 现还是做生物数学计算机的交叉学科比较好，就读了生信的博士。
: 有兴趣，自然学的快~
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l**********1
发帖数: 5204 | 97 >>在生统行业工作。以我的经验来说，生统Phd的
工作已经不是编程的了（编程的话MS的SAS Programmer一大把，年薪5万能招一堆），
核心是modeling,
LZ can put below top figure shown model to package souce code with Python or
C++ Matlab or Wolfram Mathematica ?
If Yes, please just put on below stair/s.
>>
发信人: pegasusii (Pegasusii), 信区: Biology
标 题: Re: 生物信息学Phd毕业直接找top10pharm生统的工作，如何？
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Dec 19 17:11:06 2012, 美东)
楼主的背景，在美国想找Bioinformatics Research Scientist很难 因为本身是国内的
学历就比较吃亏，在加上文章不够牛（是真的不够牛，total IF这边没人看的。楼主也
许在国内能发5篇确实很不容易，但是Bioinfo在美国想混挂名文章真心很容易，我室友
Bioinfo Phd 5年11篇文章，一作四篇，包括NAR，总引用数100多了，投
Bioinformatics Research Scientist也没找到好位置，只有好些博后的offer。最近几
年药厂裁人很厉害，这个行业美国过剩的很，不建议楼主过来找。国内最近这个行业发
展的很快，应该机会要多很多。
至于直接投生统，我自己是统计的Phd，在生统行业工作。以我的经验来说，生统Phd的
工作已经不是编程的了（编程的话MS的SAS Programmer一大把，年薪5万能招一堆），
核心是modeling,
【在 l**********1 的大作中提到】
: 2 Y wet Bio experience is enough to be a Global top 10 pharm生统的PhD
: level graduated 工作?
: if LZ does not think so,
: pls try free onine web lectures:
: by 弯立 陽明大學 生命科學系& 基因科學研究所
: 生化及細胞分子生物學 I (Biochemistry & Molecular Cell Biology Ⅰ)
: pls visit below web link:
: HTTP: //dls.ym.edu.tw/sa/dls/dls02/dls02-3/dls2-3-1/newssig.asp?id=13
: then selct
: 10/29 王廷方 講義 click here please download compressed rar file.
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w********m
发帖数: 1137 | 98 从生物信息转到生物统计不是不可能，只要统计知识扎实就可以了。
面试的时候，面试官看到你的编程背景，肯定会问你一些统计方面的问题。比如说，如
何不借助现有的库，用你熟悉的语言写一个多元回归的程序。我当然就是挂在这道题上
面了。 |
K****n
发帖数: 5970 | 99 t = Xw
X_trans*t = X_trans*X*w
inv(X_trans*X)*X_trans*t = w
好像就完了
可以argue这个语言支持矩阵和求逆
【在 w********m 的大作中提到】
: 从生物信息转到生物统计不是不可能，只要统计知识扎实就可以了。
: 面试的时候，面试官看到你的编程背景，肯定会问你一些统计方面的问题。比如说，如
: 何不借助现有的库，用你熟悉的语言写一个多元回归的程序。我当然就是挂在这道题上
: 面了。
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w********m
发帖数: 1137 | 100 CS的难点是数据结构，怎么用基本数据结构构造矩阵和inverse的routine。不过这不是
这道题要考的重点。
关键矩阵不是每个都能inverse的，full rank的矩阵才行。统计研究的对象里面，大部
分矩阵都是不能inverse的。这就是统计学研究的对象，包括ANOVA，multiple
comparison, clinic trial等等。
有没有统计背景，这道题一问就问出来了。 |
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K****n
发帖数: 5970 | 101 所以才要先乘transpose矩阵，如果乘完了不可求逆就直接throw exception，线性回归
数据错误。
这些都是可以和面试官商量的
我也不喜欢求逆，避开矩阵直接求导就行了，也很trivial嘛
【在 w********m 的大作中提到】
: CS的难点是数据结构，怎么用基本数据结构构造矩阵和inverse的routine。不过这不是
: 这道题要考的重点。
: 关键矩阵不是每个都能inverse的，full rank的矩阵才行。统计研究的对象里面，大部
: 分矩阵都是不能inverse的。这就是统计学研究的对象，包括ANOVA，multiple
: comparison, clinic trial等等。
: 有没有统计背景，这道题一问就问出来了。
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K****n
发帖数: 5970 | 102 其实乘完了转质应该就是positive semidefinite，万一真的不能求逆，可以在对角线
上加一点儿噪音，也是可以再求逆的吧
【在 K****n 的大作中提到】
: 所以才要先乘transpose矩阵，如果乘完了不可求逆就直接throw exception，线性回归
: 数据错误。
: 这些都是可以和面试官商量的
: 我也不喜欢求逆，避开矩阵直接求导就行了，也很trivial嘛
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K****n
发帖数: 5970 | |
w********m
发帖数: 1137 | 104 统计和CS思维的区别是--
# 不可逆的矩阵怎么办？怎么处理？CS可能就到此为止了。统计里是用Generalized
Inverse解决这个问题的。
# 你用的公式为什么？有没有前提条件？如何验证？没达到前提条件如何处理数据。这
是一个statistician 天天要做的。 |
K****n
发帖数: 5970 | 105 http://en.wikipedia.org/wiki/Generalized_inverse
大哥
generalized inverse和我最早写的公试一样一样一样啊。我就记得吗，我的numerical
analysis真心得的是A+
【在 w********m 的大作中提到】
: 统计和CS思维的区别是--
: # 不可逆的矩阵怎么办？怎么处理？CS可能就到此为止了。统计里是用Generalized
: Inverse解决这个问题的。
: # 你用的公式为什么？有没有前提条件？如何验证？没达到前提条件如何处理数据。这
: 是一个statistician 天天要做的。
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w********m
发帖数: 1137 | |
K****n
发帖数: 5970 | 107 谢大哥
这个有点儿长，下班儿再看。。。
【在 w********m 的大作中提到】
: inv != g-inv
: 看一看Moore–Penrose pseudoinverse，说不定你就对统计感兴趣了。
: http://en.wikipedia.org/wiki/Moore%E2%80%93Penrose_pseudoinvers
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d*****a
发帖数: 46 | 108 merk 真把我CV收了。。。
他们估计也很头疼。。。
http://app.qpic.cn/mblogpic/a7016ea6b08ccbddc824/2000
【在 K****n 的大作中提到】
: 谢大哥
: 这个有点儿长，下班儿再看。。。
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K****n
发帖数: 5970 | 109 NB！
写code要注意indention
找对象要叫对名字
其实你github那道题的readme.rm，英语也可以稍微改改
你看除了我都没人给你挑毛病了，我看我们都要低调了
为了面试生统，这里已经套出了个现成的题 －－ implement linear regression，我
们已经把各种link都贴出来了，不如你来看看，我之前写的答案到底对不对。顺着这个
思路，再多推两道题：用gradient method再implement linear regression；用
gradient method 把logistic regression也implement一遍？
我们程序怨实在是太没有credit了，我要从这个thread move on了。
这个之前说的threading啊，除了python，.net和java之类的都是可以用好多核的，
multithreading还是比multiprocessing有好处的，比如计算那20000个mean，如果能分
享在memory里，就比multiprocess更快一点儿点儿。
祝面试成功！
大哥大姐过年好！
【在 d*****a 的大作中提到】
: merk 真把我CV收了。。。
: 他们估计也很头疼。。。
: http://app.qpic.cn/mblogpic/a7016ea6b08ccbddc824/2000
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