variants - Biology版 - 未名存档

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G***G
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问个用genetic variant or mutants for biomarker的问题
假设，你发现了一个variant，它的高表达表示癌症，低表达表示正常
但是如果没有发现这个variant，则无法预测。
那么，你怎么能把这个biomarker用在blind testing set中呢？
因为testing set是blind，可能出现这个marker根本就不存在这个病人中
也就是无法预测。但是有时候，不存在和低表达之间很难区分，就是0和0.0005的关系。
而且不同的样本这个threshold很难一样。有的样本0.5才是低表达，有的样本0.00005
才是低表达。
请问这个问题如何解决？

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