D***e
发帖数: 44 | 1 手头的KO小鼠一直没做出来任何预设的结果。现在考虑把WT和KO去进行一下在做组织的
蛋白/基因表达分析，想看看可能的pathways和相关的蛋白表达是否有变化（如一些比
较关心的蛋白家族）。懂行的人说说这个思路靠谱不？靠谱的话，该用Microarray，
RNA-Seq还是DGE？已海归在国内，问了些公司，他们的销售都讲不清楚，有推荐
Microarray的，也有大力鼓吹RNA-Seq的。我以前没接触过这一块。其实我的诉求很简
单，就是做不下去了不想浪费，想扩大范围撞撞运气，但这个范围还是在我划定的一块
里面，而上述的测序之类看起来很庞杂的样子，不确定是否为我想要的。而且后期的数
据我不确定公司是否会分析到位。
如果有感兴趣的高手帮助我一起进行分析，可以给劳务费，也可以选择合作文章挂名。 |
k*****2
发帖数: 135 | 2 不太了解DGE，但是RNA-seq比microarray要好。RNA-seq做起来也简单。 |
b******c
发帖数: 27 | 3 Microarray 基本被淘汰了。如果要看的基因不是非常特殊，需要特殊探针才能检测的
话。全都用RNAseq。 |
g*********3
发帖数: 177 | |
D***e
发帖数: 44 | 5 谢谢楼上2位的解答，那就打算用RNA-seq了
【在 b******c 的大作中提到】
: Microarray 基本被淘汰了。如果要看的基因不是非常特殊，需要特殊探针才能检测的
: 话。全都用RNAseq。
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i*********0
发帖数: 915 | 6 Rna-Seq, 不但可以看DEG, 还可以看AS， 这个现在还在浪头上呀， |
