由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 非生物专业,转一科学网文章
相关主题
名校面试已开始 (转载)进化论发展的最大障碍是什么?
版上筒子们有多少知道李森科的?问下,非生物专业的想自学生物有机化学,这个在你们
转一笑话同样的学校生物和非生物位置工资差距很大
有做生物研究的转做非生物行业一年后再回到生物行业的吗?Re: 搞DNA microarray的老兄
非生物专业问马桶里浸泡的厕纸如何长出蛆来的?我国第一片DNA芯片批准试生产
cell应该达不到nature和Science等同的地步吧!Re: 请同行帮助解决分子克隆问题
生物这行还是挺有意思的Journal Club 拒绝沉默的synonymous cSNP
公布答案,非生物口的出局,不丢人[合集] 双酶切连接转化一问,谢谢!
相关话题的讨论汇总
话题: 科学网话题: 非生物话题: 转一话题: 文章话题: trouble
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
x*******6
发帖数: 994
1
http://blog.sciencenet.cn/blog-533418-994090.html
澳大利亚国立大学Gaetan Burgio博士公布的实验结果Sanger测序图。该图看起来很混
乱,但仔细观察可以发现,每一个碱基的峰图,后面都跟着一个滞后的峰,如下图所示
,我们用与碱基相同颜色的箭头标出了峰的位移,这实际上是移码突变造成的。我们在
一个诱变/恢复试验中,将发生移码突变的片段和野生型的片段的混合物进行Sanger测
序,就会出现类似的峰图。
原图来自:http://www.ipscell.com/2016/07/gaetan-burgio-new-data-theory-on-ngago-versus-crispr/
因此事实上,Burgio博士的实验中,目的基因发生了移码突变,造成这种峰图,可能恰
恰证实了NgAgo有效。不过似乎NgAgo切割基因组的效率并不高,造成了多种移码型的混
合物。众所周知,基因编辑技术的主要作用质之一,就是在基因中造成移码突变,使其失
去功能.
Burgio博士说他们所用的引物已经过验证,是特异性的,那么,如果NgAgo无效,实验
中除了目的基因的完整片段以外,不会出现任何额外条带,更不会出现移码现象。
那么出现的那些额外条带,为什么经过Sanger测序,序列是非特性的呢?我估计是因为
他们设计的guider ssDNA的序列特异性不好导致的。他们的guider序列,应该就是之前
CRISP/CAS9实验所用的guider,但CRISP/CAS9识别序列必须包含PAM序列,所以对序列
特异性的要求没有那么高,而NgAgo方法采用ssDNA作为guider,没有PAM序列的限制,
但同时对guider序列的特异性要求就高了。如果guider序列的特异性不够,肯定会对基
因组序列乱切。
打个比方,这就像用google查找一个词“韩春雨”,找到的一定是“韩春雨”,但是如
果你只输入“春雨”,那么出来的就不一定是“韩春雨”,还有“春雨贵如油”,“春
雨医生”,…,等等。
一种新技术在诞生之际,一般都存在很多问题。如果韩春雨没有造假, 那么NgAgo技术
作为一种新技术,前途是光明的,但无疑需要针对不同的生物、细胞和基因序列,进行
设计、实验条件优化,提高基因组切割和编辑效率。
转载本文请联系原作者获取授权,同时请注明本文来自汪小龙科学网博客。
链接地址:http://blog.sciencenet.cn/blog-533418-994090.html
n**********g
发帖数: 196
2
哪来的自信到生物版贴自己看不懂的文章?
P****R
发帖数: 22479
3
说再多没用。韩的文章必须同他说的实验条件一致重复出来才能过关。
不管韩以后有2.0,3.0版本可以工作,那是以后,现在1.0版本不能work,那么就撤稿
,就是这么简单,不要唧唧歪歪了。
r*****2
发帖数: 9
4
民科有强烈的参与科研问题的兴趣,这是好事,也是坏事。
几十个碱基的事,肉眼都看得过来,搞这么多是个什么鬼
C*****l
发帖数: 3211
5
同非生物专业,但是我觉得这篇文章的观点图样图森破。。。
g******r
发帖数: 204
6
其他人提这些hypothesis完全没意义,一来只是说说,并不动手验证,跟没说基本等效
;再者,别人根本没有替韩trouble shoot的义务;更何况,如今这volunteer的
trouble shoot都已经层出不穷了,真正有这义务的韩只是一句trouble和他无关。就这
态度值当你们越俎代庖吗?
1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
[合集] 双酶切连接转化一问,谢谢!非生物专业问马桶里浸泡的厕纸如何长出蛆来的?
[合集] Journal Club 拒绝沉默的synonymous cSNPcell应该达不到nature和Science等同的地步吧!
克隆小贴示。生物这行还是挺有意思的
[合集] 问个基因克隆的事情 烦了快一年了公布答案,非生物口的出局,不丢人
名校面试已开始 (转载)进化论发展的最大障碍是什么?
版上筒子们有多少知道李森科的?问下,非生物专业的想自学生物有机化学,这个在你们
转一笑话同样的学校生物和非生物位置工资差距很大
有做生物研究的转做非生物行业一年后再回到生物行业的吗?Re: 搞DNA microarray的老兄
相关话题的讨论汇总
话题: 科学网话题: 非生物话题: 转一话题: 文章话题: trouble