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Biology版 - 花了一个月克隆LncRNA,发现一个大问题,我想跳楼。。。
相关主题
lentivirus表达问题求助Seeking advice on ChIP-Seq, RNA-Seq and/or miRNA array
有用pll3.7包装病毒做蛋白表达的吗?请问有多少lncRNA是没有PolyA尾巴的?
请问双荧光reporter老鼠的问题请教RNA-seq里面,reads是怎么计数的
被慢病毒折腾惨了,大家帮忙看看吧如何检测 long noncoding RNA
求救:Lentivirus表达蛋白死胡同lncRNA有什么特别之处吗?跟mRNA相比
也问牛牛们关于lentivirus表达蛋白表达microRNA或者LincRNA遇到的问题
求助:MSCV载体最大可以deliver多大的片段真核生物的启动子有严格的方向性吧?
问knockin或转基因小保方晴子的文章还有抄袭的可能
相关话题的讨论汇总
话题: lncrna话题: gfp话题: vector话题: ires话题: polya
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i********y
发帖数: 23
1
当初从别的实验室弄来一个带GFP的lentiviral vector.刚开始的时候还想着这个载体
不错,到时可以通过看GFP来估量感染效率。
结果今天把cDNA终于克完之后,突然意识到一个问题。载体里的GFP序列也会链接到我
的LncRNA的序列后面,等于最后出来的transcript是:
5'LncRNA---GFP 3'
考!!!!
所以想请问各位大侠,有没有表达LncRNA的经验。
我现在有个想法,就是:
1. 首先确认GFP前面有没有IRES
2. 如果有,我可否在我的LncRNA后面加一段polyA,所以最后的序列就是:
5' LncRNA---polyA----IRES----GFP 3'
可行否?
i********y
发帖数: 23
2
Actually, 我想到了一个更好的方法
https://www.systembio.com/lentiviral-technology/expression-vectors/cdna/
vector-maps-bidirectional
去买bidirectional 或者dual-promoter lentiviral vector? 哪位大侠有用过这两种
vector的经验嘛?
W*********1
发帖数: 2
3
你个傻逼 lncRNA不编码coding gene, 也就是说不会被翻译 串联GFP有毛线用
W*********1
发帖数: 2
4
我可以打折卖给你一套lentivirus系统来表达lncRNA
w******n
发帖数: 767
5
老实交代你是怎么混进来的?

【在 i********y 的大作中提到】
: 当初从别的实验室弄来一个带GFP的lentiviral vector.刚开始的时候还想着这个载体
: 不错,到时可以通过看GFP来估量感染效率。
: 结果今天把cDNA终于克完之后,突然意识到一个问题。载体里的GFP序列也会链接到我
: 的LncRNA的序列后面,等于最后出来的transcript是:
: 5'LncRNA---GFP 3'
: 考!!!!
: 所以想请问各位大侠,有没有表达LncRNA的经验。
: 我现在有个想法,就是:
: 1. 首先确认GFP前面有没有IRES
: 2. 如果有,我可否在我的LncRNA后面加一段polyA,所以最后的序列就是:

j*******u
发帖数: 81
6
我看着也纳闷

【在 w******n 的大作中提到】
: 老实交代你是怎么混进来的?
w******n
发帖数: 767
7
老实交代你是怎么混进来的?

【在 i********y 的大作中提到】
: 当初从别的实验室弄来一个带GFP的lentiviral vector.刚开始的时候还想着这个载体
: 不错,到时可以通过看GFP来估量感染效率。
: 结果今天把cDNA终于克完之后,突然意识到一个问题。载体里的GFP序列也会链接到我
: 的LncRNA的序列后面,等于最后出来的transcript是:
: 5'LncRNA---GFP 3'
: 考!!!!
: 所以想请问各位大侠,有没有表达LncRNA的经验。
: 我现在有个想法,就是:
: 1. 首先确认GFP前面有没有IRES
: 2. 如果有,我可否在我的LncRNA后面加一段polyA,所以最后的序列就是:

D****n
发帖数: 14
8
人家没准是想检测一下这个LncRNA是否表达未知peptide,你们这么激动干啥?
x********e
发帖数: 35261
9
人说了啊,看GFP表达估计感染效率

【在 W*********1 的大作中提到】
: 你个傻逼 lncRNA不编码coding gene, 也就是说不会被翻译 串联GFP有毛线用
x********e
发帖数: 35261
10
不了解lncRNA, 不过我会担心lncRNA跟mRNA的结合蛋白不同,带到的地方也不同。所以
最后你的核糖体不一定有机会接触到lncRNA。另外,lncRNA后面挂那么大一坨,肯定会
影响它的功能吧。

【在 i********y 的大作中提到】
: 当初从别的实验室弄来一个带GFP的lentiviral vector.刚开始的时候还想着这个载体
: 不错,到时可以通过看GFP来估量感染效率。
: 结果今天把cDNA终于克完之后,突然意识到一个问题。载体里的GFP序列也会链接到我
: 的LncRNA的序列后面,等于最后出来的transcript是:
: 5'LncRNA---GFP 3'
: 考!!!!
: 所以想请问各位大侠,有没有表达LncRNA的经验。
: 我现在有个想法,就是:
: 1. 首先确认GFP前面有没有IRES
: 2. 如果有,我可否在我的LncRNA后面加一段polyA,所以最后的序列就是:

i********y
发帖数: 23
11
我是楼主。当时被告知是和链接里的plasmid类似的东西(CD550A-1)
https://www.systembio.com/lentiviral-technology/expression-vectors/cdna/
vector-maps
结果后来发现是个N-term GFP tag...Anyways, 反正cDNA也还没克完,也不算浪费时间
i********y
发帖数: 23
12
对,所以我准备买这个载体(CD550A-1)
https://www.systembio.com/lentiviral-technology/expression-vectors/cdna/
vector-maps

【在 x********e 的大作中提到】
: 不了解lncRNA, 不过我会担心lncRNA跟mRNA的结合蛋白不同,带到的地方也不同。所以
: 最后你的核糖体不一定有机会接触到lncRNA。另外,lncRNA后面挂那么大一坨,肯定会
: 影响它的功能吧。

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小保方晴子的文章还有抄袭的可能求救:Lentivirus表达蛋白死胡同
Re: Help! Lentiviral expression system也问牛牛们关于lentivirus表达蛋白
也问gateway vector: 有没有可以同时放shRNA和cDNA的求助:MSCV载体最大可以deliver多大的片段
how to add poly A sequence when making knock in vector?问knockin或转基因
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