j*********g 发帖数: 463 | 1 听说韩春雨现在也在重复自己的实验,成百成百地送克隆出去测序。我想说的是,即使
看到一两个indel,也是不算数的。
我知道国内也有一两家实验室测几十上百个克隆的序,也是能看到indel的。
但是如果对不加任何处理的细胞测几十上百个克隆,我猜也是有可能看到一两个indel
的,这是实验本身的系统误差、背景噪声。所以实验组测的样本数量,对照组也得相应
有足够,而且要有充分的对照(不加NgAgo只加gDNA,以及什么都不加)。不然统计显
著性就过不去。
所以测序也不是标准,统计才是。 |
j******i 发帖数: 939 | 2 测序的结果跟T7EI要一起看才完整 两者最后的indel百分比应该是接近的 你咋知道他
成百成百的送啊 他文章里indel都是20-40% 意味这测几十个克隆就能看到好几个indel了 |
c********6 发帖数: 693 | 3 你昨天不是说有人可能重复出来韩春雨的结果了吗
又是虚晃一枪啊?
indel
【在 j*********g 的大作中提到】 : 听说韩春雨现在也在重复自己的实验,成百成百地送克隆出去测序。我想说的是,即使 : 看到一两个indel,也是不算数的。 : 我知道国内也有一两家实验室测几十上百个克隆的序,也是能看到indel的。 : 但是如果对不加任何处理的细胞测几十上百个克隆,我猜也是有可能看到一两个indel : 的,这是实验本身的系统误差、背景噪声。所以实验组测的样本数量,对照组也得相应 : 有足够,而且要有充分的对照(不加NgAgo只加gDNA,以及什么都不加)。不然统计显 : 著性就过不去。 : 所以测序也不是标准,统计才是。
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j*********g 发帖数: 463 | 4 不是,我轻信了。实际情况就是我上面说的。
[在 crispr2016 () 的大作中提到:]
:你昨天不是说有人可能重复出来韩春雨的结果了吗
:又是虚晃一枪啊?
:indel |
P****R 发帖数: 22479 | 5 测序是一个标准。
关键当然要加对照。
对来讲,要同CRISPR比较才有实际意义。
现在NgAgo连概念都无法重复和建立。
看来是个fake。 |
c********6 发帖数: 693 | 6 测一百个的话,有一两个少读一两个碱基是正常的
把所谓有indel的克隆再次测序可能就又是没有indel了
【在 j*********g 的大作中提到】 : 不是,我轻信了。实际情况就是我上面说的。 : [在 crispr2016 () 的大作中提到:] : :你昨天不是说有人可能重复出来韩春雨的结果了吗 : :又是虚晃一枪啊? : :indel
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c********6 发帖数: 693 | 7 我现在是想知道韩实验室所谓编辑了50个位点,难道测了总共5000个序 |
P****R 发帖数: 22479 | 8 老兄逻辑厉害。
【在 c********6 的大作中提到】 : 我现在是想知道韩实验室所谓编辑了50个位点,难道测了总共5000个序
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