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Biology版 - chip-seq问题请教
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L**o
发帖数: 15
1
最近打算做chip-seq,但是针对感兴趣的那个分子,目前市场上找不到chip-seqs甚至
chip级的抗体。公司提供了两个普通IP级的抗体供我测试,而且也没有该蛋白在基因组
上结合的区域,再加上本身抗体work与否不清楚。这样的情况下怎么设定阳性对照呢?
请指教!
j*********g
发帖数: 463
2
一个是做ChIP-western来验证,还有一种办法是把你target protein,构建一个融合载
体,然后在293细胞里面做ChIPqPCR。
或者干脆就拿这两个抗体做ChIP-seq,反正现在ChIP-seq也不贵了;同时你应该有一个
KO或者shRNA KD的吧,这样也能知道是否work。

【在 L**o 的大作中提到】
: 最近打算做chip-seq,但是针对感兴趣的那个分子,目前市场上找不到chip-seqs甚至
: chip级的抗体。公司提供了两个普通IP级的抗体供我测试,而且也没有该蛋白在基因组
: 上结合的区域,再加上本身抗体work与否不清楚。这样的情况下怎么设定阳性对照呢?
: 请指教!

d***s
发帖数: 1062
3

现在Chip-seq价格多少?有推荐的公司吗?谢谢。

【在 j*********g 的大作中提到】
: 一个是做ChIP-western来验证,还有一种办法是把你target protein,构建一个融合载
: 体,然后在293细胞里面做ChIPqPCR。
: 或者干脆就拿这两个抗体做ChIP-seq,反正现在ChIP-seq也不贵了;同时你应该有一个
: KO或者shRNA KD的吧,这样也能知道是否work。

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设计shRNA的问题请教个Re-CHIP的问题~~
困惑,knock down在蛋白水平work,但qpcr检测不到差别chip-qpcr 结果分析的问题
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