有关DNMT和DNA结合的问题 - Biology版

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Biology版 - 有关DNMT和DNA结合的问题

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s****s
发帖数: 16

我们在一个基因启动子发现一个CpG island，Bisulfide sequencing证实高度甲基化。
用gel shift 检测DNMT是否和这个启动子binding：具体就是用PCR放大的启动子片断和
细胞核提取物室温下培养30 分钟，然后作native gel shift 电泳。在胶经Etbr染色后
，把shift DNA带切下来送mass spec。结果显示没有检测到任何DNMT，当然有一些其它
的核蛋白。我们的解释是：DNMT的pI ＝ 9.4，running buffer 的pH是7.4, 因此在这
种条件下DNMT是positive charge，在胶上是往反方向跑。不知道这种介绍对不对？还
有其它的解释吗？谢谢。

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