请问有什么做PHI-BLAST的program or software? - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 请问有什么做PHI-BLAST的program or software?

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r******y 发帖数: 21907	1 用了NCBI，但是我的sequence file太大了，30M多，人家不给算，有什么可以下载用于自己电脑blast的软件，而且可以用PHI-BLAST的？或者哪个网站能做>30M的文件的？谢谢！
g*r 发帖数: 67	2 可以在自己电脑上安装blast程序。有一个选项“-remote”可以用来检索ncbi网站的数据库。虽然query依然是有限制，但你可以把大文件分成小块，分别提交任务。remote 模式依赖远程服务器，并受网络状况影响。有时会遇到超时、掉线、没反应等问题，你检查结果发现后可以重新提交哪些没完成的序列。个人感觉remote的速度很不理想。如果你序列很多或者用得比较频繁，可以考虑下载ncbi的database（比较大，起码几十 G，但对当今的硬盘来说小菜一碟）。local blast速度快，想怎么blast就怎么blast。【在 r******y 的大作中提到】 : 用了NCBI，但是我的sequence file太大了，30M多，人家不给算，有什么可以下载用于 : 自己电脑blast的软件，而且可以用PHI-BLAST的？或者哪个网站能做>30M的文件的？谢 : 谢！
i*******i 发帖数: 145	3 楼上正解

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