由买买提看人间百态
登录
首页
论坛
未名存档
话题女王
小圈子
马甲追踪
版面排名
流量曲线
水枪排名
发帖量曲线
发帖版面饼图
发帖时间柱图
关于本站
帮助
boards
本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字
访问原贴
Biology版
- snp序列中的U和H是什么?
相关主题
●
两个只有一个碱基不同的DNA怎么区分?
●
学术问题:另一个我?
●
问个基因组的问题
●
Journal Club 拒绝沉默的synonymous cSNP
●
【求推荐】获得SNP information的网页
●
[合集] Journal Club 拒绝沉默的synonymous cSNP
●
吵起来了,关于GWAS
●
怎么从ncbi大批量下载基因序列
●
有奖问答:每个细胞所含的dna是完全一样的吗?
●
请教基因克隆以后的测序问题
●
两个靠近的SNP的transmission是独立的吗?
●
真心请教SNP跟疾病相关的文章一般发啥杂志
●
怎样检测一个基因的变异与疾病的关系
●
怎样检测肿瘤样本里单个基因的LOH(loss of heterozygosity)?
●
做线虫的有人试过WGS+SNP的方法一步测序出mutant吗?
●
怎么克隆出未知基因,真心请教各位牛人们
相关话题的讨论汇总
话题: snp
话题: 序列
话题: 简并
话题: cultivar
进入Biology版参与讨论
1
(共1页)
d******y
发帖数: 11545
1
在snp序列中出现了U和H,H是不是应该是杂合性,对应H=(A/T/C),那U是不是可以看
作T?我没有找到U所代表的简并碱基。
谢谢。
T**********t
发帖数: 1604
2
你确定是U而不是V?
d******y
发帖数: 11545
3
电脑给出来是U,没发现有V,难道是不同的简写方式?
Thanks.
BTW, 序列是从这个地方下载下来的,应该没问题:
http://www.soybase.org/dlpages/index.php
【在 T**********t 的大作中提到】
: 你确定是U而不是V?
T**********t
发帖数: 1604
4
这个文件?
http://www.soybase.org/dlpages/SoyBase_SNPs.txt.zip
我下载下来看了,里面有一个V,有一个H,没有U。你再double check一下。
V是简并code,代表A/C/G。
这里有简并code的列表:
http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleic_acid_notation
【在 d******y 的大作中提到】
:
: 电脑给出来是U,没发现有V,难道是不同的简写方式?
: Thanks.
: BTW, 序列是从这个地方下载下来的,应该没问题:
:
http://www.soybase.org/dlpages/index.php
d******y
发帖数: 11545
5
Thanks for your help. I get their official answer:
Thanks for your email. H is used to indicate the cultivar was
heterozygous at that SNP while U means there is no allele information
for that SNP.
【在 T**********t 的大作中提到】
: 这个文件?
:
http://www.soybase.org/dlpages/SoyBase_SNPs.txt.zip
: 我下载下来看了,里面有一个V,有一个H,没有U。你再double check一下。
: V是简并code,代表A/C/G。
: 这里有简并code的列表:
:
http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleic_acid_notation
1
(共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
●
怎么克隆出未知基因,真心请教各位牛人们
●
有奖问答:每个细胞所含的dna是完全一样的吗?
●
深度测序的精确度会随被测的目的基因改变吗?
●
两个靠近的SNP的transmission是独立的吗?
●
R 编程面试题,被弄残废了,在这里求解,钱不多,但会鼎力散财(转载)
●
怎样检测一个基因的变异与疾病的关系
●
SNP 分析请教
●
做线虫的有人试过WGS+SNP的方法一步测序出mutant吗?
●
两个只有一个碱基不同的DNA怎么区分?
●
学术问题:另一个我?
●
问个基因组的问题
●
Journal Club 拒绝沉默的synonymous cSNP
●
【求推荐】获得SNP information的网页
●
[合集] Journal Club 拒绝沉默的synonymous cSNP
●
吵起来了,关于GWAS
●
怎么从ncbi大批量下载基因序列
相关话题的讨论汇总
话题: snp
话题: 序列
话题: 简并
话题: cultivar
未名新帖统计
// 7月16日
#
版面
帖数(主题数)
-
全站
4871 (796)
1
Military
3777 (569)
2
Stock
341 (51)
3
Joke
117 (17)
4
History
116 (3)
5
Automobile
100 (9)
6
USANews
55 (9)
7
Midlife
45 (1)
8
Headline
41 (41)
9
Dreamer
33 (13)
10
FleaMarket
32 (20)
11
Living
30 (7)
* 这里只显示发帖超过25的版面,努力灌水吧:-)
历史上的今天
faintcat妹妹看进来~~
发表于12年前.
NSC, PD 1/7/2007, EB2, ...
发表于11年前.
[FBA求购]MJVE2 758 MJVM2 ...
发表于6年前.
老生常谈,归与不归
发表于10年前.
【申请】Seattle西雅图 版版主——申请人...
发表于9年前.
宝宝出生,头骨骨折,求祝福
发表于9年前.
求推荐舒缓优美的古典音乐
发表于11年前.
百分之一的北京人上北大 中国网友愤怒(转载)
发表于10年前.
新人带狗狗Bailey来报道
发表于12年前.
全世界最有价值的运动队
发表于10年前.
请问大切诺基的质量如何
发表于6年前.
TNND,军版全是BKC
发表于15年前.
Inception
发表于12年前.
微软的有些家属可真恶心,为了卖保险脸都不要了
发表于10年前.
每周坐高铁的苦逼来说说感受吧!!
发表于9年前.