snp序列中的U和H是什么？ - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - snp序列中的U和H是什么？

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话题: snp话题: 序列话题: 简并话题: cultivar

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d******y 发帖数: 11545	1 在snp序列中出现了U和H，H是不是应该是杂合性，对应H=（A/T/C），那U是不是可以看作T？我没有找到U所代表的简并碱基。谢谢。
T**********t 发帖数: 1604	2 你确定是U而不是V？
d******y 发帖数: 11545	3 电脑给出来是U，没发现有V，难道是不同的简写方式？ Thanks. BTW，序列是从这个地方下载下来的，应该没问题： http://www.soybase.org/dlpages/index.php 【在 T**********t 的大作中提到】 : 你确定是U而不是V？
T**********t 发帖数: 1604	4 这个文件？ http://www.soybase.org/dlpages/SoyBase_SNPs.txt.zip 我下载下来看了，里面有一个V，有一个H，没有U。你再double check一下。 V是简并code，代表A/C/G。这里有简并code的列表： http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleic_acid_notation 【在 d******y 的大作中提到】 : : 电脑给出来是U，没发现有V，难道是不同的简写方式？ : Thanks. : BTW，序列是从这个地方下载下来的，应该没问题： : http://www.soybase.org/dlpages/index.php
d******y 发帖数: 11545	5 Thanks for your help. I get their official answer: Thanks for your email. H is used to indicate the cultivar was heterozygous at that SNP while U means there is no allele information for that SNP. 【在 T**********t 的大作中提到】 : 这个文件？ : http://www.soybase.org/dlpages/SoyBase_SNPs.txt.zip : 我下载下来看了，里面有一个V，有一个H，没有U。你再double check一下。 : V是简并code，代表A/C/G。 : 这里有简并code的列表： : http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleic_acid_notation

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