问一下做chip-seq的版友 - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 问一下做chip-seq的版友

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相关话题的讨论汇总
话题: seq话题: chip话题: 版友话题: dataset话题: igv

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p******h 发帖数: 163	1 一篇chip-seq的paper，dataset可以下载到（.bed or .bedgraph format）。用什么工具可以呈现出那种whole genome的peak 图，就是看这个蛋白在基因组哪个地方分布的多。或者需要怎么处理一下下载到的dataset才能看？
k*****n 发帖数: 323	2 IGV http://www.broadinstitute.org/igv/
p******h 发帖数: 163	3 多谢啦【在 k*****n 的大作中提到】 : IGV : http://www.broadinstitute.org/igv/
F*****d 发帖数: 23	4 如果文件不太大，直接用UCSC Genome Browser的custom　track就好。如果要看多个大文件，IGV很不错。把bed换成tdf格式会更快。这里有一个详细的用IGV 看CHIP-Seq数据的说明。 http://bioinforx.com/lims1/blog.php?id=1000022?wm

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