u*******1
发帖数: 4 | 1 准备做small RNA seq。
看了NEB的protocol， 跟illumina的protocol，有些不一样。比如1.）连5‘adapter之
前，就先让RT primer 跟3’adapter hybrid。2.）推荐XPbeads 纯化而不是PAGE跑胶
纯化。
个人感觉NEB的方法更好一些，RT primer 跟3’adapter hybrid看起来更合理。
XPbeads 纯化操作起来也更容易一些。
现在手里有illumina的kit，不知道可不可以用NEB的方法做。
本人菜鸟，请班上有经验的大侠给的建议！
不甚感激！ |
c********b
发帖数: 363 | 2 推荐这个方法，kit太贵，如果样品不多的话不值得。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22995534
【在 u*******1 的大作中提到】
: 准备做small RNA seq。
: 看了NEB的protocol， 跟illumina的protocol，有些不一样。比如1.）连5‘adapter之
: 前，就先让RT primer 跟3’adapter hybrid。2.）推荐XPbeads 纯化而不是PAGE跑胶
: 纯化。
: 个人感觉NEB的方法更好一些，RT primer 跟3’adapter hybrid看起来更合理。
: XPbeads 纯化操作起来也更容易一些。
: 现在手里有illumina的kit，不知道可不可以用NEB的方法做。
: 本人菜鸟，请班上有经验的大侠给的建议！
: 不甚感激！
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u*******1
发帖数: 4 | 3 多谢回复！
kit都已经买了，我估计不会用这个方法去搞。
就是想知道这两个kit里的RA3， RA5，RTprimer是不是完全一样的？NEB的会不会里面
多加了什么东西。 |
C***Y
发帖数: 61 | 4 It is necessary to perform PAGE purification for small RNA sequencing
library construction. Based on my experience, Ampure XP beads purification
is not sufficient enough to separate 160 bp from 120 bp. |
k*****n
发帖数: 323 | 5 都有kit了，那我手头上的梅洛的protocol估计也没啥用了。。。。。 |
