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Biology版 - ChIP-qPCR问题求助
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相关话题的讨论汇总
话题: chip话题: qpcr话题: enrichment话题: 抗体话题: igg
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l*********e
发帖数: 118
1
请问qPCR结果,如果IgG control也有enrichment,是不是表示这些都是background
noise? 我测了四对primer,fold enrichment relative to input大概在3-10倍.
qpcr产物跑了胶,size都是正确的.
另外请问,如果不确定我的抗体的binding region,怎么才能证明抗体能work in ChIP?
我想用这个抗体做ChIP-Seq
a****o
发帖数: 1786
2
it depends on the relative ratio. if IgG control enrichment is 2 fold, while
antibody enrichment is 10 fold.There is some enrichment.
Before doing ChIP-seq, you need to test some known binding sites with ChIP-
rtPCR to make sure it works.

?

【在 l*********e 的大作中提到】
: 请问qPCR结果,如果IgG control也有enrichment,是不是表示这些都是background
: noise? 我测了四对primer,fold enrichment relative to input大概在3-10倍.
: qpcr产物跑了胶,size都是正确的.
: 另外请问,如果不确定我的抗体的binding region,怎么才能证明抗体能work in ChIP?
: 我想用这个抗体做ChIP-Seq

k*****n
发帖数: 323
3
唉,都跟你说了,我trouble shooting不出来,哪都没用了。。。。。。。。。

?

【在 l*********e 的大作中提到】
: 请问qPCR结果,如果IgG control也有enrichment,是不是表示这些都是background
: noise? 我测了四对primer,fold enrichment relative to input大概在3-10倍.
: qpcr产物跑了胶,size都是正确的.
: 另外请问,如果不确定我的抗体的binding region,怎么才能证明抗体能work in ChIP?
: 我想用这个抗体做ChIP-Seq

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问一个学术问题: 怎样高通量地测量基因表达水平?请教ChIP-Q-PCR
WES bs RNA-Seqchip 实验困惑,请大拿指教!!!
Re: chip, TF binding 多强才算数?CHIP qpcr中的 negative control (mock antibody)
真心求教:关于CHIP-Seq library 的数据分析问题请教ChIP-seq做library的问题。
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