k****n
发帖数: 158 | 1 请问： functional clustering annotation 和 gene functional classification 有
什么不同，分别主要用来解释什么问题？
问题由来；
有2组microarray 数据（control/patients）分析得出200个显著差异表达的genes(
gene list),把这个gene list 输入DAVID， 希望得到这200个基因的相关性， 比如得
到某个信号通路被放大，或者某个生物功能（migration，division）被改变，以便进
行后续wet分析， 请问应该采用上述那个分析方法？
谢谢 | t******g
发帖数: 372 | 2 前者类似go/kegg的enrichment，告诉你你这些gene更可能影响哪个子集not by chance
， 你可以根据这个子集和你研究的目标的相关性找接下来要test的gene
后者是根据input gene在各个子集内的分布 按相似性把这些gene分组，分组内的gene
不一定对他们所在的子集有显著的影响
【在 k****n 的大作中提到】
: 请问： functional clustering annotation 和 gene functional classification 有
: 什么不同，分别主要用来解释什么问题？
: 问题由来；
: 有2组microarray 数据（control/patients）分析得出200个显著差异表达的genes(
: gene list),把这个gene list 输入DAVID， 希望得到这200个基因的相关性， 比如得
: 到某个信号通路被放大，或者某个生物功能（migration，division）被改变，以便进
: 行后续wet分析， 请问应该采用上述那个分析方法？
: 谢谢
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