由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - microarray
相关主题
[合集] 非affy的芯片如何用R进行annotation?Re: Also microarray questions
怎样将 Go 的 基因 转换到 affymetrix ID为什么我拿到的microarray data里重名的基因特别
求助:Unique ID of Microarray by AffymetrixPosition Opening-RAII-Genomics Core-South CA Area
菜鸟请教:affymetrix array data求助 microarray .cel 文件
怎么分析microarray数据啊?谁能帮忙下篇文章? 谢谢
急求助,懂microarray的人看过来求推荐一个做microarray比较好的公司!
Affymetrix microarray data analysis怎么得到GEO芯片数据中的.CEL文件
Re: ask: Affymetrix P Call %microarray要这个价贵不贵?
相关话题的讨论汇总
话题: microarray话题: apt话题: affy话题: cel话题: expression
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
A*******e
发帖数: 284
1
请问如何将microarray 的cel file转化成可读的文件,如txt或者excel,有工具吗?
多谢了
d*******e
发帖数: 1649
2
you have to use exising software (e.g. R affy package) depending on your
platform.



【在 A*******e 的大作中提到】
: 请问如何将microarray 的cel file转化成可读的文件,如txt或者excel,有工具吗?
: 多谢了

A*******e
发帖数: 284
3
you mean APT? I have it, but it seems i'll spend some time to lean the
command first.

【在 d*******e 的大作中提到】
: you have to use exising software (e.g. R affy package) depending on your
: platform.
:
: ?

d*******e
发帖数: 1649
4
i have no idea about what APT is. It seems you need find someone nearby to
show you the procedure.

【在 A*******e 的大作中提到】
: you mean APT? I have it, but it seems i'll spend some time to lean the
: command first.

m***T
发帖数: 11058
5
APT虽然比Expression Console功能强一些,但对于没有command line经验的人来说比
较challenge。如果是expression array,就用affy自己的expression console(EC)。
相对简单,还能连annotation一起export,output就是txt文件,只是size很大。很多
第三方的软件也支持CEL文件格式,去affy的网站上查查就知道有哪些了。
m***T
发帖数: 11058
6
APT - Affymetrix Power Tools,是Affy自己的软件工具,但不是commercial one。

【在 d*******e 的大作中提到】
: i have no idea about what APT is. It seems you need find someone nearby to
: show you the procedure.

d*******e
发帖数: 1649
7
thanks... i am not familiar with this abbreviation

【在 m***T 的大作中提到】
: APT - Affymetrix Power Tools,是Affy自己的软件工具,但不是commercial one。
A*******e
发帖数: 284
8
多谢了,我下载安装了,在摸索使用中
1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
microarray要这个价贵不贵?怎么分析microarray数据啊?
求救:谁知道在 microarray analysis 中实现 Absent/Present c急求助,懂microarray的人看过来
请教一个Ease software使用问题Affymetrix microarray data analysis
Affymetrix microarray 只有15个基因有差异,请教可能的原因Re: ask: Affymetrix P Call %
[合集] 非affy的芯片如何用R进行annotation?Re: Also microarray questions
怎样将 Go 的 基因 转换到 affymetrix ID为什么我拿到的microarray data里重名的基因特别
求助:Unique ID of Microarray by AffymetrixPosition Opening-RAII-Genomics Core-South CA Area
菜鸟请教:affymetrix array data求助 microarray .cel 文件
相关话题的讨论汇总
话题: microarray话题: apt话题: affy话题: cel话题: expression