a******e
发帖数: 570 | 1 我做一个革兰氏阳性菌的microarray，用不同的天然产物（主要是高分子多酚类）处理
细菌，发现基因表达和对照组没有啥区别，连一个基因都没有选出来（P=0.05)，这个
看起来正常么？我怀疑高分子多酚不能渗透到细胞里所以不能影响其表达。希望经验多
的牛人给点意见。 |
c*********t
发帖数: 340 | 2 sample size多大?预期的effect size多大？实验design具体细节？另外，在t-test +
multiple comparison correction之前可以先Filter掉low variance genes,也对power
有帮助 |
a******e
发帖数: 570 | 3 你指的是把高误差的gene去掉？先谢了
+
power
【在 c*********t 的大作中提到】
: sample size多大?预期的effect size多大？实验design具体细节？另外，在t-test +
: multiple comparison correction之前可以先Filter掉low variance genes,也对power
: 有帮助
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S****w
发帖数: 70 | 4 experienced
+
power
【在 c*********t 的大作中提到】
: sample size多大?预期的effect size多大？实验design具体细节？另外，在t-test +
: multiple comparison correction之前可以先Filter掉low variance genes,也对power
: 有帮助
|
P****d
发帖数: 564 | 5
Then why do you expect to see differences? Or, why did you do the
experiment in the first place?
【在 a******e 的大作中提到】
: 你指的是把高误差的gene去掉？先谢了
:
: +
: power
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d******u
发帖数: 178 | 6 每组的replicates数目。差异比较小的话要比较多的replicate才探测得到。 |
M*****e
发帖数: 279 | 7 How about your RNA sample quality? Did you check the quality (purity and
integrity) of your RNA samples?
RNA quality is the most critical factor for a successful microarray. |
