y***i 发帖数: 11639 | 1 【 以下文字转载自 Statistics 讨论区 】
发信人: yuuli (听,...听), 信区: Statistics
标 题: 请问诸位chi-square test
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Jun 25 18:52:20 2012, 美东)
看文章
http://jcb.rupress.org/content/180/4/665.full.pdf+html?with-ds=
figure 2C 用了chi-square test 不能理解
我的理解数据是这样的:
以figure2 C,chromosome 2的图,第5天的数据为例子 (红框内数据),这一天的数据
是monastrol significant,所以有个星号
control conditon有5%的cell 有deviation (supplimentary tableS2 红框内数据)
monastrol condition下, clone 10 有21.9%的cell 有deviation(supplimentary
tableS2 红框内数据),然后根据chi square test,这是significant.
我的理解是只有一个数据的话,没办法做统计。如果control和monastrol condition分
别有3个数据的话,勉勉强强可以用student t test。请问我的想法对不对。如果我的
想法是错的,这里的数据的确能做chi square test的话,请略解释一下,然后请教一
下两个比较,分别只有一个数据的话,怎么用这两个数据计算这个chi-square test。
多谢! | p*******c 发帖数: 224 | 2 我觉得你说的是对的。似乎不能用Chi-square, 数据类型不符合条件啊。
难道他们有额外的数据吗?
【在 y***i 的大作中提到】 : 【 以下文字转载自 Statistics 讨论区 】 : 发信人: yuuli (听,...听), 信区: Statistics : 标 题: 请问诸位chi-square test : 发信站: BBS 未名空间站 (Mon Jun 25 18:52:20 2012, 美东) : 看文章 : http://jcb.rupress.org/content/180/4/665.full.pdf+html?with-ds= : figure 2C 用了chi-square test 不能理解 : 我的理解数据是这样的: : 以figure2 C,chromosome 2的图,第5天的数据为例子 (红框内数据),这一天的数据 : 是monastrol significant,所以有个星号
| y***i 发帖数: 11639 | 3 我好像明白了。不是用percentage计算出来的,是用cell counting的数据算chi-
square pValue,类似fisher exact test
变化 不变
control A B
treated C D
然后用A/B/C/D这4个数据计算出chi-square pValue
【在 p*******c 的大作中提到】 : 我觉得你说的是对的。似乎不能用Chi-square, 数据类型不符合条件啊。 : 难道他们有额外的数据吗?
| a*******n 发帖数: 156 | 4 chi square 计算goodness of fit吧,跟你说的不是一种东西 |
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