y*****w
发帖数: 146 | 1 我现在得到一个mutant，我想在原来native的structure 的 active sites 中把
mutation展示出来，同时保留原来native 的residue （就是做一个residue 的
mutagenesis and overlay)。请问大家知道是怎么做的嘛？
我知道Pymol 中有mutagenesis function， 但是这个function就是直接把原来的
residue替代了，我还想把原来的residue保留，这样可以看到一些比较。
因为是pymol的初级使用者，十分感谢大家的帮忙！ |
b******n
发帖数: 4225 | 2 两张图（mutant和wt）overlay就行了吧
【在 y*****w 的大作中提到】
: 我现在得到一个mutant，我想在原来native的structure 的 active sites 中把
: mutation展示出来，同时保留原来native 的residue （就是做一个residue 的
: mutagenesis and overlay)。请问大家知道是怎么做的嘛？
: 我知道Pymol 中有mutagenesis function， 但是这个function就是直接把原来的
: residue替代了，我还想把原来的residue保留，这样可以看到一些比较。
: 因为是pymol的初级使用者，十分感谢大家的帮忙！
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C*******e
发帖数: 4348 | 3 把mutant residue存成另外一个object
然后跟native structure一起显示
或者整个mutant structure另存
两个结构一起打开显示
mutant只显示active site，别的隐藏
不过你这个mutant的结构没有拿到吧
也是以native structure为模版建的模型吧 |
y*****w
发帖数: 146 | 4 Thank you very much! Your instruction works.
Yes, I did not get the structure for the mutant. I am just curious what
the difference might be between the WT and mutant.
【在 C*******e 的大作中提到】
: 把mutant residue存成另外一个object
: 然后跟native structure一起显示
: 或者整个mutant structure另存
: 两个结构一起打开显示
: mutant只显示active site，别的隐藏
: 不过你这个mutant的结构没有拿到吧
: 也是以native structure为模版建的模型吧
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