i******w
发帖数: 407 | 1 这玩艺儿从chu开始，接着有block，ha，Bustamante等一堆cns水王，扯扯拽拽DNA和
polymerase有十多年了，业内人士们来说说看，是不是好扯的都扯光了？现在跳进去太
晚否？多谢 | w******n
发帖数: 371 | 2
其实也不晚啊，赶紧入吧，呵呵
【在 i******w 的大作中提到】
: 这玩艺儿从chu开始，接着有block，ha，Bustamante等一堆cns水王，扯扯拽拽DNA和
: polymerase有十多年了，业内人士们来说说看，是不是好扯的都扯光了？现在跳进去太
: 晚否？多谢
| y*****3
发帖数: 961 | 3 同求指点，我也是个做这一块的学生，感觉实验很难做，应用性也不强。不稳定因素太
多了。 | m******h
发帖数: 32 | 4 曾经设计过一个课题想用single molecule的技术，半年后让老板枪毙掉了。不是他的
兴趣所在，不愿意再花更多的人力物力了。 | x*****o
发帖数: 441 | 5 严格来说,single molecule分很多大方向.Chu,ha还有小薇主要是single molecule
FRET, tweezer做得不多 ,不涉及拉扯.主要研究平衡或非平衡态下得分子自发形变.
Bustamante,block主要是optical或者megnet tweezer,荧光涉及比较少,主要是生物分
子受力下的机理.
这两拨人做得东西相差甚远,但都涉及生物过程的动力学. 但是分析数据的方法不太相
同.
其他的single molecule方向还有sunny xie的活细胞confocal,小薇他们在做的super
resolution等等等等
要是想跳最好找个好老板,这行比较看血统,都是嫡系把持的.好老板还是有很多能做的
好方向.还有就是想清楚是想做哪种single molecule,分类太多了.
【在 i******w 的大作中提到】
: 这玩艺儿从chu开始，接着有block，ha，Bustamante等一堆cns水王，扯扯拽拽DNA和
: polymerase有十多年了，业内人士们来说说看，是不是好扯的都扯光了？现在跳进去太
: 晚否？多谢
| s*****j
发帖数: 6435 | 6 "sunny xie的活细胞confocal", 这个是什么东西?
"小薇他们在做的super resolution", super resolution 也算成是single molecule?
【在 x*****o 的大作中提到】
: 严格来说,single molecule分很多大方向.Chu,ha还有小薇主要是single molecule
: FRET, tweezer做得不多 ,不涉及拉扯.主要研究平衡或非平衡态下得分子自发形变.
: Bustamante,block主要是optical或者megnet tweezer,荧光涉及比较少,主要是生物分
: 子受力下的机理.
: 这两拨人做得东西相差甚远,但都涉及生物过程的动力学. 但是分析数据的方法不太相
: 同.
: 其他的single molecule方向还有sunny xie的活细胞confocal,小薇他们在做的super
: resolution等等等等
: 要是想跳最好找个好老板,这行比较看血统,都是嫡系把持的.好老板还是有很多能做的
: 好方向.还有就是想清楚是想做哪种single molecule,分类太多了.
| p*l
发帖数: 1359 | 7 做这行，得物理和生物的底子都有才成。
【在 x*****o 的大作中提到】
: 严格来说,single molecule分很多大方向.Chu,ha还有小薇主要是single molecule
: FRET, tweezer做得不多 ,不涉及拉扯.主要研究平衡或非平衡态下得分子自发形变.
: Bustamante,block主要是optical或者megnet tweezer,荧光涉及比较少,主要是生物分
: 子受力下的机理.
: 这两拨人做得东西相差甚远,但都涉及生物过程的动力学. 但是分析数据的方法不太相
: 同.
: 其他的single molecule方向还有sunny xie的活细胞confocal,小薇他们在做的super
: resolution等等等等
: 要是想跳最好找个好老板,这行比较看血统,都是嫡系把持的.好老板还是有很多能做的
: 好方向.还有就是想清楚是想做哪种single molecule,分类太多了.
| p*l
发帖数: 1359 | 8 PALM STORM这一类的super resolution技术，是基于单分子成像，图像合成就是一个个
单分子数出来。所以算single molecule技术也没说错。
molecule?
【在 s*****j 的大作中提到】
: "sunny xie的活细胞confocal", 这个是什么东西?
: "小薇他们在做的super resolution", super resolution 也算成是single molecule?
| x*****o
发帖数: 441 | 9 就是用confocal显微镜看单个细胞里面的荧光,主要是FRET
molecule?
【在 s*****j 的大作中提到】
: "sunny xie的活细胞confocal", 这个是什么东西?
: "小薇他们在做的super resolution", super resolution 也算成是single molecule?
| b******y
发帖数: 627 | 10 I am not 业内人士. But I am a big fan of single molecule and high resolution
imaging techniques. So are many decent biophysics, biochemistry and cell
biology departments.
For the next few decades, "seeing is believing" is still the rule of thumb
in biology. By that, I mean there are a lot of applications of these
imagining techniques to otherwise intractable biological questions. Be an
expert of it technically and be able to ask the right biological questions (
as pointed out by pll) and you will find academic jobs at semi-first tiers
institutes. | | | p*l
发帖数: 1359 | 11 single molecule和high resolution imaging要做到物理工程加上生物紧密结合，明了各个环节的机会和局限性，这一行才能做下去。生物背景的想跳这一行的，要问问自己，如果要读生物PhD的同时做一个EE或者Physics PhD，有没有这个能力。
resolution
(
【在 b******y 的大作中提到】
: I am not 业内人士. But I am a big fan of single molecule and high resolution
: imaging techniques. So are many decent biophysics, biochemistry and cell
: biology departments.
: For the next few decades, "seeing is believing" is still the rule of thumb
: in biology. By that, I mean there are a lot of applications of these
: imagining techniques to otherwise intractable biological questions. Be an
: expert of it technically and be able to ask the right biological questions (
: as pointed out by pll) and you will find academic jobs at semi-first tiers
: institutes.
| f**u
发帖数: 346 | 12 我觉得你说的这些是怎么用这些技术来解决生物问题，
楼上讨论的好象主要是怎么开发或者完善新的单分子技术。
两个不太一样，是搭显微镜和用显微镜的区别。
resolution
(
【在 b******y 的大作中提到】
: I am not 业内人士. But I am a big fan of single molecule and high resolution
: imaging techniques. So are many decent biophysics, biochemistry and cell
: biology departments.
: For the next few decades, "seeing is believing" is still the rule of thumb
: in biology. By that, I mean there are a lot of applications of these
: imagining techniques to otherwise intractable biological questions. Be an
: expert of it technically and be able to ask the right biological questions (
: as pointed out by pll) and you will find academic jobs at semi-first tiers
: institutes.
| f**u
发帖数: 346 | 13 晓亮好像说要搞一个不用小分子label，而能直接看的东西，有人了解吗？
【在 x*****o 的大作中提到】
: 就是用confocal显微镜看单个细胞里面的荧光,主要是FRET
:
: molecule?
| x*****o
发帖数: 441 | 14 呵呵,如果就是postdoc其实也没那么高的要求了.当然对自己要求高点是对的. single
molecule主要是拼仪器,要是实验室仪器已经有了,实验上手也不是很复杂.新来的阿三
小弟小妹就是一个月就独立做试验了.
当然仪器都没有就不要想了,搭仪器要专业的. 物理的方面的要求主要是搭仪器和数据
分析.要是要求不高,传统的数据分析是很成熟的套路,到专业老板那里学一两年就行了.
要是想通过single molecule data构建复杂的模型就得有点底子.建议看看小薇有的
single molecule paper,数理方程,公式一堆一堆的,砸死你.不过我科大的同事说这个
其实没什么必要, Ha没有这些照样发CNS.
要是想跳super resolution, imaging这方面最好有编程基础,这些主要靠这个.
说道这个技术的局限性,是很大的. 最大的局限就是在数据分析里面的主观性. 数据分
析的时候,都是靠人为选取好得单分子和删除噪音.这里面就有很多主观得因素了.以致
于组里面的mm说觉得自己每次分析数据都是在cheating.........
如果想在这行做PI,一直做这个,还是不易的,竞争比较激烈,学霸比较无礼......看个人
的造化和后台了.
纯生物背景的跳这一行做博后阿什么的比较难,最好有物理,生物物理背景.
了各个环节的机会和局限性，这一行才能做下去。生物背景的想跳这一行的，要问问自
己，如果要读生物PhD的同时做一个EE或者Physics PhD，有没有这个能力。
【在 p*l 的大作中提到】
: single molecule和high resolution imaging要做到物理工程加上生物紧密结合，明了各个环节的机会和局限性，这一行才能做下去。生物背景的想跳这一行的，要问问自己，如果要读生物PhD的同时做一个EE或者Physics PhD，有没有这个能力。
:
: resolution
: (
| x*****o
发帖数: 441 | 15 好像前几年发个一片science,拉曼光谱的,2008吧.
最近拉曼光谱也挺火的,前几年还听一个seminar,是一个是IR的做single molecule的..
......
【在 f**u 的大作中提到】
: 晓亮好像说要搞一个不用小分子label，而能直接看的东西，有人了解吗？
| b******y
发帖数: 627 | 16 I could be wrong. I guess he meant CARD or SRS http://bernstein.harvard.edu/pages/Research.html. This technique is good for lipid studies. I am not sure it can be used to study specific biomacromolecules given that it is based on vibrational spectroscopy.
【在 f**u 的大作中提到】
: 晓亮好像说要搞一个不用小分子label，而能直接看的东西，有人了解吗？
| p*****m
发帖数: 7030 | 17 SRS，Ruvkun lab已经用来看worm lipid发了个应用的paper了。
【在 f**u 的大作中提到】
: 晓亮好像说要搞一个不用小分子label，而能直接看的东西，有人了解吗？
| p*l
发帖数: 1359 | 18 这些新方法，还远没达到能让一个做生物的人打开开关就用的地步，对技术不了解，不
可能做好。而且各个方法也有不同的应用局限性，能不能选到一个有意义的应用，往往
决定了一个新技术的命运。在生物应用上，往往需要根据仪器的局限调整生物方面的实
验方案。在图像数据处理上，也需要根据情况调整处理算法。所以，在single
molecule和super resolution领域，只有做到造显微镜，用显微镜以及分析解释数据一
体，才能有好结果。
这个方向现在百花齐放，机会很多，恰恰是因为并没有一个压倒一切，而且能让一般生
物研究人员就能使用的成熟技术。
【在 f**u 的大作中提到】
: 我觉得你说的这些是怎么用这些技术来解决生物问题，
: 楼上讨论的好象主要是怎么开发或者完善新的单分子技术。
: 两个不太一样，是搭显微镜和用显微镜的区别。
:
: resolution
: (
| p*l
发帖数: 1359 | 19 这要看你想做到什么程度了。理工背景的人做这个，上手快，但是提不出来生物问题，
就只能做显微镜操作员，给人扫数据处理数据。所以理工背景的人想在这上面出头，必
须做新方法。做新方法，要求就很高了，是条回报高但是白骨累累的路。
生物背景的人做这个，得能自己调仪器和编程处理数据。其实有时候数据处理的猫腻很
大，伪造数据和好的处理，只有一线之隔。
single
了.
【在 x*****o 的大作中提到】
: 呵呵,如果就是postdoc其实也没那么高的要求了.当然对自己要求高点是对的. single
: molecule主要是拼仪器,要是实验室仪器已经有了,实验上手也不是很复杂.新来的阿三
: 小弟小妹就是一个月就独立做试验了.
: 当然仪器都没有就不要想了,搭仪器要专业的. 物理的方面的要求主要是搭仪器和数据
: 分析.要是要求不高,传统的数据分析是很成熟的套路,到专业老板那里学一两年就行了.
: 要是想通过single molecule data构建复杂的模型就得有点底子.建议看看小薇有的
: single molecule paper,数理方程,公式一堆一堆的,砸死你.不过我科大的同事说这个
: 其实没什么必要, Ha没有这些照样发CNS.
: 要是想跳super resolution, imaging这方面最好有编程基础,这些主要靠这个.
: 说道这个技术的局限性,是很大的. 最大的局限就是在数据分析里面的主观性. 数据分
| x*****o
发帖数: 441 | 20 这个矛盾是一直有的.
就像我以前的老板,是理工背景的,有single molecule仪器.然后找生物牛人,什么HHMI
的合作,paper可以发的很好. TJ ha也是走这个路子的.
当然我们也有自己的生物系统,就比较难搞,你不是那个圈子里面的,想要做那个,是很难
进人家那个圈子的.
新技术是single molecule人的骄傲. 我老板不管如何巴结大牛发自己系统的paper或者
拉项目,我们实验室发展的新技术都是亲生的.这个很难,以前是一个科大很聪明的男生
在做.
我的建议是: 纯生物背景如果是PI,想做single molecule,就找个人合作,送样品过去,
那边给作了,一起发paper.自己做是不可能的.如果是做postdoc,想学学single
molecule,可以找个好点的组,呆上几年,慢慢学,不必被门槛吓到了.以后出来做faculty
不就两个背景都有了.
【在 p*l 的大作中提到】
: 这要看你想做到什么程度了。理工背景的人做这个，上手快，但是提不出来生物问题，
: 就只能做显微镜操作员，给人扫数据处理数据。所以理工背景的人想在这上面出头，必
: 须做新方法。做新方法，要求就很高了，是条回报高但是白骨累累的路。
: 生物背景的人做这个，得能自己调仪器和编程处理数据。其实有时候数据处理的猫腻很
: 大，伪造数据和好的处理，只有一线之隔。
:
: single
: 了.
| | | e**s
发帖数: 856 | 21 我们拉拉扯扯的容易吗？
【在 i******w 的大作中提到】
: 这玩艺儿从chu开始，接着有block，ha，Bustamante等一堆cns水王，扯扯拽拽DNA和
: polymerase有十多年了，业内人士们来说说看，是不是好扯的都扯光了？现在跳进去太
: 晚否？多谢
| d********m
发帖数: 3662 | 22 的确是这样，非物理背景的，即使做个imaging，也难以保证数据真是可靠的。J CELL
BIOL就有好多评论是关于这方面的，好的图片和伪造的图片，那真是只有一个pixel之
隔。
不过这也没办法，也没什么标准，只能靠自己学术和道德修养。听一老板说过，他
review过炸药奖获得者实验室的文章，那些imaging图片也是很不规范的。
【在 p*l 的大作中提到】
: 这要看你想做到什么程度了。理工背景的人做这个，上手快，但是提不出来生物问题，
: 就只能做显微镜操作员，给人扫数据处理数据。所以理工背景的人想在这上面出头，必
: 须做新方法。做新方法，要求就很高了，是条回报高但是白骨累累的路。
: 生物背景的人做这个，得能自己调仪器和编程处理数据。其实有时候数据处理的猫腻很
: 大，伪造数据和好的处理，只有一线之隔。
:
: single
: 了.
| v*****s
发帖数: 20290 | 23 想当白骨而不得的飘过。
【在 p*l 的大作中提到】
: 这要看你想做到什么程度了。理工背景的人做这个，上手快，但是提不出来生物问题，
: 就只能做显微镜操作员，给人扫数据处理数据。所以理工背景的人想在这上面出头，必
: 须做新方法。做新方法，要求就很高了，是条回报高但是白骨累累的路。
: 生物背景的人做这个，得能自己调仪器和编程处理数据。其实有时候数据处理的猫腻很
: 大，伪造数据和好的处理，只有一线之隔。
:
: single
: 了.
| v*****s
发帖数: 20290 | 24 vibrational spectra至少肯定比electronic spectra更sharp，更容易identify吧。
biomacromolecules峰太多的时候，最多学荧光也往上加label好了，sunney xie不喜欢
加label，又不是一定不能加label。主要的问题还是强度弱。
【在 b******y 的大作中提到】
: I could be wrong. I guess he meant CARD or SRS http://bernstein.harvard.edu/pages/Research.html. This technique is good for lipid studies. I am not sure it can be used to study specific biomacromolecules given that it is based on vibrational spectroscopy.
| p*l
发帖数: 1359 | 25 来我们这里吧！我们实验室，专门培养白骨精。
【在 v*****s 的大作中提到】
: 想当白骨而不得的飘过。
| v*****s
发帖数: 20290 | 26 sunney xie还是xiaowei zhuang？天气太冷，我这把老骨头怕吃不消啊。
【在 p*l 的大作中提到】
: 来我们这里吧！我们实验室，专门培养白骨精。
| p*l
发帖数: 1359 | 27 您老眼光真高。除了这两个在苦寒地带的大白骨精洞，还是有很多小白骨精洞地理气候
很不错的。
【在 v*****s 的大作中提到】
: sunney xie还是xiaowei zhuang？天气太冷，我这把老骨头怕吃不消啊。
| v*****s
发帖数: 20290 | 28 我比较奇怪的是，怎么shuming nie一直没人提呢？这个也很牛的啊。97年那片single
molecule SERS现在引用快4000了吧。
【在 p*l 的大作中提到】
: 您老眼光真高。除了这两个在苦寒地带的大白骨精洞，还是有很多小白骨精洞地理气候
: 很不错的。
| p*l
发帖数: 1359 | 29 SERS主要还是用在化学分析上吧？
single
【在 v*****s 的大作中提到】
: 我比较奇怪的是，怎么shuming nie一直没人提呢？这个也很牛的啊。97年那片single
: molecule SERS现在引用快4000了吧。
| M*****n
发帖数: 16729 | 30 pll那里很暖和的.
只要你不怕热.
【在 v*****s 的大作中提到】
: sunney xie还是xiaowei zhuang？天气太冷，我这把老骨头怕吃不消啊。
| | | i******w
发帖数: 407 | 31 多谢楼上各位的回复，学习了。
【在 x*****o 的大作中提到】
: 严格来说,single molecule分很多大方向.Chu,ha还有小薇主要是single molecule
: FRET, tweezer做得不多 ,不涉及拉扯.主要研究平衡或非平衡态下得分子自发形变.
: Bustamante,block主要是optical或者megnet tweezer,荧光涉及比较少,主要是生物分
: 子受力下的机理.
: 这两拨人做得东西相差甚远,但都涉及生物过程的动力学. 但是分析数据的方法不太相
: 同.
: 其他的single molecule方向还有sunny xie的活细胞confocal,小薇他们在做的super
: resolution等等等等
: 要是想跳最好找个好老板,这行比较看血统,都是嫡系把持的.好老板还是有很多能做的
: 好方向.还有就是想清楚是想做哪种single molecule,分类太多了.
| a***y
发帖数: 19743 | 32 现在否发现叶绿素可能使用了量子物理的原理来达到高效能量传递的结果
说不定生物体内有大量量子物理效应在发挥作用，大家还没发现。
以后做机理的大概要先学量子物理。
～～～
【在 x*****o 的大作中提到】
: 严格来说,single molecule分很多大方向.Chu,ha还有小薇主要是single molecule
: FRET, tweezer做得不多 ,不涉及拉扯.主要研究平衡或非平衡态下得分子自发形变.
: Bustamante,block主要是optical或者megnet tweezer,荧光涉及比较少,主要是生物分
: 子受力下的机理.
: 这两拨人做得东西相差甚远,但都涉及生物过程的动力学. 但是分析数据的方法不太相
: 同.
: 其他的single molecule方向还有sunny xie的活细胞confocal,小薇他们在做的super
: resolution等等等等
: 要是想跳最好找个好老板,这行比较看血统,都是嫡系把持的.好老板还是有很多能做的
: 好方向.还有就是想清楚是想做哪种single molecule,分类太多了.
| S*R
发帖数: 1057 | 33 这个现在在生物学上没啥应用吧。
single
【在 v*****s 的大作中提到】
: 我比较奇怪的是，怎么shuming nie一直没人提呢？这个也很牛的啊。97年那片single
: molecule SERS现在引用快4000了吧。
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