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Biology版 - Pac Bio 的技术怎么样?
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1 (共1页)
s****l
发帖数: 10462
1
有经验的给讲讲?
G***y
发帖数: 1082
2
so far no good.

【在 s****l 的大作中提到】
: 有经验的给讲讲?
s****l
发帖数: 10462
3
他家的仪器没卖多少出去吧,好像大家都不太有hands-on experience.
去年底的文章倒是发的挺高级的,新英格兰。

【在 G***y 的大作中提到】
: so far no good.
s****l
发帖数: 10462
4
会不会是第二个helicos?
其实helicos不算真正的sms,他这个是,但是single read accuracy太低,通量也不行
f**********e
发帖数: 1994
5
他家牛皮已经吹三年了,Field 还是没多少 users。 拿到文章上发表的
数字是 75% 1X accuracy,这种精度不太像人类能用的机器。通量也
不行。我看好他家是下一个 Helicos。
m***T
发帖数: 11058
6
哈哈,最近还好吧?是呀,PacBio现在压力肯定非常大。资金也不象当初那么充足了(
VC的钱应该不会再有大的进项了。IPO的钱不知道还能维持多久?如果error rate
在一年内没有质的提高,估计就不会再有太好的机会了。庆幸当初没选择它家。这里谁
买了它家的股票了?

【在 f**********e 的大作中提到】
: 他家牛皮已经吹三年了,Field 还是没多少 users。 拿到文章上发表的
: 数字是 75% 1X accuracy,这种精度不太像人类能用的机器。通量也
: 不行。我看好他家是下一个 Helicos。

s******9
发帖数: 283
7
几个月前San Diego会仪上,他们强调他们的real time优势最大的应用是在epigenetics,是其他测序技术无法做到的。
A*****n
发帖数: 243
8
被套中,可惜没有买complete genomics的
rate
s******9
发帖数: 283
9
DNA nanoball arrays现在用的人多吗?

【在 A*****n 的大作中提到】
: 被套中,可惜没有买complete genomics的
: rate

s******s
发帖数: 13035
10
//nod. 他们原来想和life/illumina竞争,显然是自视过高了。
现在终于明白了,还是退回来搞小众市场,不至于倒闭

epigenetics,是其他测序技术无法做到的。

【在 s******9 的大作中提到】
: 几个月前San Diego会仪上,他们强调他们的real time优势最大的应用是在epigenetics,是其他测序技术无法做到的。
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有illumina股票的这会儿应该高兴坏了solexa高通量测序时,library最长可以达到多少?
Science报道Next Gen Sequencing在基因疾病检测中的应用及请教问题大家都是用什么tools分析HiSeq & MiSeq data的?
Position reopenPacBio or SOLiD
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A*****n
发帖数: 243
11
最近听到的一些报告都提到他们在用complete genomics测病人的基因组数据。
而且他们家的股票从3月份开始已经翻了一倍多了。

【在 s******9 的大作中提到】
: DNA nanoball arrays现在用的人多吗?
A*****n
发帖数: 243
12
要是他们的正确率能够高一点的,metagenome倒是个很好的市场。

【在 s******s 的大作中提到】
: //nod. 他们原来想和life/illumina竞争,显然是自视过高了。
: 现在终于明白了,还是退回来搞小众市场,不至于倒闭
:
: epigenetics,是其他测序技术无法做到的。

m***T
发帖数: 11058
13
这个正确率提高比较难呀,越到最后越难。所以面临这么这么残酷竞争的市场,他们的
压力实在太大。

【在 A*****n 的大作中提到】
: 要是他们的正确率能够高一点的,metagenome倒是个很好的市场。
m***T
发帖数: 11058
14
complete genomics的模式注定它做不大(就是个拥有自己技术的service provider)。
随着越来越多的benchtop的sequencers进入市场(而且throughput越来越高),它的生
意一到两年后应该不会这么好了。

【在 A*****n 的大作中提到】
: 被套中,可惜没有买complete genomics的
: rate

s******9
发帖数: 283
15
从技术上讲,我觉得DNA nanoball(rolony)比DNA cluster(polony)在测序上有先天不
足,而且sequence by ligation限制了read length。
所以现阶段能让Illumina有压力的还是Ion Torrent,Illumina正在研发的技术融入了
Ion Torrent的一些东西。

【在 m***T 的大作中提到】
: complete genomics的模式注定它做不大(就是个拥有自己技术的service provider)。
: 随着越来越多的benchtop的sequencers进入市场(而且throughput越来越高),它的生
: 意一到两年后应该不会这么好了。

w******y
发帖数: 8040
16
Life就靠Ion Torrent了
Solid已经是一塌糊涂了

【在 s******9 的大作中提到】
: 从技术上讲,我觉得DNA nanoball(rolony)比DNA cluster(polony)在测序上有先天不
: 足,而且sequence by ligation限制了read length。
: 所以现阶段能让Illumina有压力的还是Ion Torrent,Illumina正在研发的技术融入了
: Ion Torrent的一些东西。

s****l
发帖数: 10462
17
有同感

【在 m***T 的大作中提到】
: complete genomics的模式注定它做不大(就是个拥有自己技术的service provider)。
: 随着越来越多的benchtop的sequencers进入市场(而且throughput越来越高),它的生
: 意一到两年后应该不会这么好了。

s****l
发帖数: 10462
18
呵呵,老实说,我就是想空它,才问的。IPO的钱也就够烧两年的。
不过它反复测能提高准确率。长度也还行。
至少有一点,它家的市场大不起来。机器那么贵。

rate

【在 m***T 的大作中提到】
: 哈哈,最近还好吧?是呀,PacBio现在压力肯定非常大。资金也不象当初那么充足了(
: VC的钱应该不会再有大的进项了。IPO的钱不知道还能维持多久?如果error rate
: 在一年内没有质的提高,估计就不会再有太好的机会了。庆幸当初没选择它家。这里谁
: 买了它家的股票了?

s****l
发帖数: 10462
19
为什么在epigenetics上有优势?

epigenetics,是其他测序技术无法做到的。

【在 s******9 的大作中提到】
: 几个月前San Diego会仪上,他们强调他们的real time优势最大的应用是在epigenetics,是其他测序技术无法做到的。
s****l
发帖数: 10462
20
怎么知道solid不行了?

【在 w******y 的大作中提到】
: Life就靠Ion Torrent了
: Solid已经是一塌糊涂了

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next generation sequencing technology请问大家美国哪里454测序比较便宜
Helicos BioSciences申请破产保护the first NGS System get FDA approval (Miseq, Illumina)
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m***T
发帖数: 11058
21
反复测就和HiSeq和SOLiD区别不大了,running cost一下子就上去了,而且大家肯定不
希望在一个还没被证明的平台上花那么多的钱。唯一的优势是read length长。
不过它家这几天刚release了Ecoli的data,似乎别人的总体评价还相对正面。只是内部
data有多大水分这个不好说。

【在 s****l 的大作中提到】
: 呵呵,老实说,我就是想空它,才问的。IPO的钱也就够烧两年的。
: 不过它反复测能提高准确率。长度也还行。
: 至少有一点,它家的市场大不起来。机器那么贵。
:
: rate

f**********e
发帖数: 1994
22
还好啊。不碰生物了以后人生快乐了不少。

【在 m***T 的大作中提到】
: 哈哈,最近还好吧?是呀,PacBio现在压力肯定非常大。资金也不象当初那么充足了(
: VC的钱应该不会再有大的进项了。IPO的钱不知道还能维持多久?如果error rate
: 在一年内没有质的提高,估计就不会再有太好的机会了。庆幸当初没选择它家。这里谁
: 买了它家的股票了?

s******s
发帖数: 13035
23
我不这样觉得。complete genomics可以从成本方面下苦工,如果
你请他们做比自己做不仅省时省力,而且省钱

【在 m***T 的大作中提到】
: complete genomics的模式注定它做不大(就是个拥有自己技术的service provider)。
: 随着越来越多的benchtop的sequencers进入市场(而且throughput越来越高),它的生
: 意一到两年后应该不会这么好了。

s******s
发帖数: 13035
24
illumina那个cluster是不是有专利?ms别人都被逼着搞emulsified PCR,
这个啥时候过期?

【在 s******9 的大作中提到】
: 从技术上讲,我觉得DNA nanoball(rolony)比DNA cluster(polony)在测序上有先天不
: 足,而且sequence by ligation限制了read length。
: 所以现阶段能让Illumina有压力的还是Ion Torrent,Illumina正在研发的技术融入了
: Ion Torrent的一些东西。

s******s
发帖数: 13035
25
如果能直接读modified DNA

【在 s****l 的大作中提到】
: 为什么在epigenetics上有优势?
:
: epigenetics,是其他测序技术无法做到的。

A*****n
发帖数: 243
26
没有买GNOM就是不看好他的business model,可惜股票的短期表现还真是不错。

【在 m***T 的大作中提到】
: complete genomics的模式注定它做不大(就是个拥有自己技术的service provider)。
: 随着越来越多的benchtop的sequencers进入市场(而且throughput越来越高),它的生
: 意一到两年后应该不会这么好了。

A*****n
发帖数: 243
27
316的数据貌似看上去还可以,至少Ion Torrent进步的速度挺快的。
不过能从hiseq和miseq那里抢到多少份额还真不好说,

【在 w******y 的大作中提到】
: Life就靠Ion Torrent了
: Solid已经是一塌糊涂了

m***T
发帖数: 11058
28
它市场肯定会一直有,因为它规模化的流程成本可能比自己实验室做要低些。不过它和
BGI有太大的区别吗?只是多了自己的技术而已。如果business model一直如此,除
非它的技术有质的飞跃,否则不大可能在NGS市场上有太大的作为。

【在 s******s 的大作中提到】
: 如果能直接读modified DNA
m***T
发帖数: 11058
29
和hiseq针对的不是一个市场,所以抢不到什么份额。主要是和miseq争,但miseq还没
上市,所以它暂时还没份额。
我个人的感觉,miseq可能会因为hiseq在ultra-high throughput市场上的domination
而受影响。为什么这么说?因为hiseq的data不能用和其chemistry一样的miseq平台来
validate,所以势必在一定程度上会影响它的销量。当然对于新进入NGS领域的,不存
在这个问题。
另外,Ion能进步这么快基本上是靠lifetech这条大船。Invitrogen和ambion可以有多少resources供它调用,再加上AB在instrument方面的expertise?你看看现在Ion的protocol和kits里面有多少SOLiD的痕迹就知道了

【在 A*****n 的大作中提到】
: 316的数据貌似看上去还可以,至少Ion Torrent进步的速度挺快的。
: 不过能从hiseq和miseq那里抢到多少份额还真不好说,

a***e
发帖数: 1010
30
这里谁有 Ion Torrent 的使用经验? 到底怎么样?
1 (共1页)
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