b******n
发帖数: 4225 | 1 现在有一个基因的标准序列，可编码功能性蛋白
然后发现多条突变序列，发生了插入，缺失，替换等等突变
导致该基因不能编码蛋白
自己blast之后用眼睛去找这些突变太费力了，而且容易发生错误
请问有什么软件能迅速的帮助寻找这些突变的位点，类型，以及突变的结果
结果最好能给出一个列表的形式
谢谢 |
M*****n
发帖数: 16729 | 2 how much are you willing to invest?
with tens of thousands dollars you can get a software for next-gen
sequencing
analysis.
with a few thousand dollars you can get sequencher
with $0 you can find cracked version of Lasergene on internet.
【在 b******n 的大作中提到】
: 现在有一个基因的标准序列，可编码功能性蛋白
: 然后发现多条突变序列，发生了插入，缺失，替换等等突变
: 导致该基因不能编码蛋白
: 自己blast之后用眼睛去找这些突变太费力了，而且容易发生错误
: 请问有什么软件能迅速的帮助寻找这些突变的位点，类型，以及突变的结果
: 结果最好能给出一个列表的形式
: 谢谢
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s*********s
发帖数: 110 | 3 我给你推荐一个吧
DNAstar软件里有个Seqman,很好用，虽然没有你说的那么自动化
google一下，网上有破解版
good luck
【在 b******n 的大作中提到】
: 现在有一个基因的标准序列，可编码功能性蛋白
: 然后发现多条突变序列，发生了插入，缺失，替换等等突变
: 导致该基因不能编码蛋白
: 自己blast之后用眼睛去找这些突变太费力了，而且容易发生错误
: 请问有什么软件能迅速的帮助寻找这些突变的位点，类型，以及突变的结果
: 结果最好能给出一个列表的形式
: 谢谢
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l******n
发帖数: 520 | 4 好像有个online程序可以把你的DNA seq map到amino acid seq上
然后看你的突变点处于intron还是exon，对翻译产物有无影响一目了然
其实也可以写个perl |
