s********x 发帖数: 472 | 1 做分子的经验很少,限于简单clone和点突变。
最近需要把三个蛋白片段连起来,实在没有什么经验,请教板上的大牛一般这种
chimera protein怎么做。
有人建议我用一些多酶切位点的载体例如T vector或者bluescript之类,然后把三个片
段依次找好酶切位点连进去,但是我发现这三个片段可用的酶切位点很有限,而且要in
frame,很不好做;
还有策略是先酶切连接两个片段,可以用同尾酶使产物不再具有被切的危险,然后做
PCR扩增连接产物,然后再连接另外的片段,这个方案感觉快一些,但是不知道应该如
何具体做?酶切后连接后要不要纯化(用quick spin一类的column回收全部片段)?用
多少产物做下一步PCR?这种用连接产物做的PCR是否有需要特别注意的条件?
还有的策略就是用类似传统点突变的方法,先PCR出两个片段,中间有overlap,然后用
两头的primer把两个片段连接的片段P出来,不知道一般这种overlap的区域有多大?
PCR有何需要注意的?
不知道大家一般怎么做这种chimera,几种策略有何优缺点,恳请指教。万分感谢! |
e****s 发帖数: 1125 | 2 overlapping pcr 应该最好。
overlapping区域不用很多,我一般把Tm 设成 40以上就足够了。
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【在 s********x 的大作中提到】 : 做分子的经验很少,限于简单clone和点突变。 : 最近需要把三个蛋白片段连起来,实在没有什么经验,请教板上的大牛一般这种 : chimera protein怎么做。 : 有人建议我用一些多酶切位点的载体例如T vector或者bluescript之类,然后把三个片 : 段依次找好酶切位点连进去,但是我发现这三个片段可用的酶切位点很有限,而且要in : frame,很不好做; : 还有策略是先酶切连接两个片段,可以用同尾酶使产物不再具有被切的危险,然后做 : PCR扩增连接产物,然后再连接另外的片段,这个方案感觉快一些,但是不知道应该如 : 何具体做?酶切后连接后要不要纯化(用quick spin一类的column回收全部片段)?用 : 多少产物做下一步PCR?这种用连接产物做的PCR是否有需要特别注意的条件?
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s********n 发帖数: 2939 | 3 Overlap pcr和restriction enzymes digestion(可用酶切位点不在识别位点内的RE,
如BsaI)都可以,最简单就是直接合成基因。 |
g********4 发帖数: 4959 | 4 题目很误导人啊。我以为是问protein engineering问题的,其实问的是cloning问题。
实际上,chimera protein除了常见的GUS,GFP, LUC之外,其它蛋白fusion 表达成有
功能的还是蛮难的。 |
s********x 发帖数: 472 | 5 No need to mention it is not easy.
I did a lot of tag fusion before.
【在 g********4 的大作中提到】 : 题目很误导人啊。我以为是问protein engineering问题的,其实问的是cloning问题。 : 实际上,chimera protein除了常见的GUS,GFP, LUC之外,其它蛋白fusion 表达成有 : 功能的还是蛮难的。
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i***R 发帖数: 663 | |
d******1 发帖数: 709 | 7 In-Fusion® PCR Cloning System |