v*********i
发帖数: 40 | 1 要别人一个拟南芥突变体；对方要求签一个协议。
协议包括：不用于商业用途；不转给第三方；要用这个材料发表论文的话需要提前30天
把论文手稿给对方。
前两条都很正常；最后一个要求是不是比较奇怪啊？还是要突变体都要签这个？
以前没有要这种材料的经验，请教一下。
谢谢。 |
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p*******1
发帖数: 495 | 2 实验室一直用Unmarked Mutagenesis（using Flp Recombinase）做定点突变，用Tn5做
随机突变。
不知道这几年有什么最新的技术可以采用来创建细菌突变体，CRISPR技术就不用提了。
谢谢了先！ |
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z**m
发帖数: 50 | 3 请教版上有没有了解E.coli beta galactosidase结构功能的大牛？目前准备个试验，
需要构建无活性的beta galactosidase突变体做control，因为不是生物背景，查了很
多文献，还是没有头绪，不知道哪些位点的突变或者缺失可以完全abolish beta
galactosidase的活性但是又不影响酶的正常tetramer结构的。有没有哪位大牛可以指
点一下或者提供一两篇类似的文献报道？包子答谢！谢谢！ |
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p****t
发帖数: 72 | 4 师弟的一篇文章！大致内容是从一个T-DNA插入突变体克隆了一个与叶绿体功能相关的
基因。若有兴趣，请站内联系。他会在coverletter中把你列为建议审稿人！
谢谢了！ |
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p****t
发帖数: 72 | 5 是实验室师弟的一篇文章，投过两次plant physiology和PLOSgenetics，总是一个
review说好，另一个被批的一塌糊涂，现在师弟跳楼的心都有了！下次准备投个2-3分
的杂志，我可以让他在coverletter中把你列在建议的审稿人中。如果你是做这个的或
是相关方向的最好，如果 不是，至少要有研究突变体的背景并发过PP或PJ。请站内联
系，并简要介绍下publication。多谢了！ |
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B****w
发帖数: 48 | 6 RT
我有一个长3KB的转录因子，中间的1000-2000是DNA binding domain。我想对中间
的1000-2000 DNA binding domain用PCR构建突变体库,两端的序列（1-1000和2000-
3000）保持不变。不知道有什么好办法？
谢谢！ |
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d*********o
发帖数: 6388 | 7 http://science.caixin.com/2020-03-20/101531574.html
【财新网】（记者 杨睿）新冠病毒在繁殖倍增的过程中若发生了基因突变，会否影响
其感染能力？3月17日，论文预印平台bioRxiv上发表了一篇与新冠病毒的受体结合结构
域（RBD）突变有关的研究，称突变增强了新冠病毒表面刺突蛋白的结构稳定性，突变
病毒株与受体结合的亲和力显著增强。论文作者强调，病毒的传染性还受其他因素的影
响，尽管如此，传染性提高应该是大概率事件。
这篇题为《从流行的新冠病毒序列中发现的RBD突变会增强刺突蛋白结构稳定性及
传染性》的论文，由南方医科大学公共卫生学院教授张其威、暨南大学生命与健康工程
研究院张弓共同担任通讯作者。研究团队从公共数据库（NCBI GenBank和GISAID等）下
载了244条新冠病毒毒株的基因序列全长，并筛选出S蛋白及其RBD区域发生突变的序列
进行分析。从研究者绘制的毒株序列分布地图来看，现阶段这244个新冠病毒毒株中绝
大多数毒株的S蛋白受体结合结构域（RBD）没有发生突变。只有10条序列在RBD区域存
在氨基酸突变，它们分别采集自... 阅读全帖 |
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e********r
发帖数: 147 | 8 A和B的突变体都是删除突变体，所以是null mutation.
A把受体B的信号识别区降解掉，这个结果是完全抑制了B的激酶活性。
不知有何建议？ |
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g*****n
发帖数: 241 | 9 假设我有两个突变体，都是weak allele (hypomorph)，a的penetrance是30%，b的
penetrance是20%。
如果ab双突变的结果有四种情况，分别是1）80%（synergistic），2）50% (additive)
，3）40%（比单突变高，但比additive低），和4）30%（等同于最高的单突变）。请问
该怎么解释a和b的关系？哪种情况代表他们在同一个信号通路，哪种情况代表他们
independent pathway
非常感谢！ |
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e********r
发帖数: 147 | 10 我们研究一个病原细菌的蛋白酶A，发现它能把一个受体B的信号识别区降解掉。A能够
切割B的生化证据和蛋白互作的证据都是明确的，已经拿到手了。
但遗传分析不知该作如何解释，请大家看一看：
事实一：蛋白酶A突变以后会使细菌致病力下降
事实二：受体B突变以后也会使细菌致病力下降
结果我们在蛋白酶A突变体里过表达受体B，细菌致病力照理说恢复一些是正常的，可这
个菌株的致病力下降得更严重！
做A和B双突的结果还没出来，所以暂时木有更多的提示。
这个我怎么解释，或者用什么样的model，才能把遗传数据和生化数据捏到一起呢？ |
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m*****z
发帖数: 1451 | 11 哪个突变？是那些hotspot吗？可能是突变体不能被MDM2降解，导致表达量增加。建议
看几篇P53 pathway的review，先有点常识认识吧 |
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s****n
发帖数: 43 | 12 IDH1主要定位在线粒体中，即使机体被诱导产生了抗体，该怎么中和这些致病突变体呢
？ |
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g*****n
发帖数: 241 | 13 问两个问题
1：A和B的突变体都是null mutation吗？
2：你说“A能把一个受体B的信号识别区降解掉”，这个降解是激活还是抑制B？ |
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v*******e
发帖数: 11604 | 14
说得对，我读过P53，最早人家以为是oncogene，就是因为一个突变体在cancer里面表
达很高。原因也是不被MDM2降解。 |
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c****t
发帖数: 19049 | 15 ☆─────────────────────────────────────☆
casact (尝尝也) 于 (Fri Jul 22 20:55:29 2011, 美东) 提到:
刘慈欣
《三体》终于能与科幻朋友们见面了，用连载的方式事先谁都没有想到，也是无奈之举
。之前就
题材问题与编辑们仔细商讨过，感觉没有什么问题，但没想到今年是文革三十周年这事
儿，单行
本一时出不了，也只能这样了。
其实这本书不是文革题材的，文革内容在其中只占不到十分之一，但却是一个漂荡在故
事中挥之
不去的精神幽灵。
本书虽不是《球状闪电》的续集，但可以看做那个故事所发生的世界在其后的延续，那
个物理学
家在故事中出现但已不重要，其他的人则永远消失了，林云真的死了，虽然我有时在想
，如果她
活下来，最后是不是这个主人公的样子？
这是一个暂名为《地球往事》的系列的第一部，可以看做一个更长的故事的开始。
这是一个关于背叛的故事，也是一个生存与死亡的故事，有时候，比起生存还是死亡来
，忠诚与
背叛可能更是一个问题。
疯狂与偏执，最终将在人类文明的内部异化出怎样的力量？冷酷的星空将... 阅读全帖 |
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g*********d
发帖数: 233 | 16 《Cell》文献翻译:基因表达的小RNA调节因子
Cell 134, 899 – 902, September 19, 2008
Joel R. Neilson and Philip A. Sharp
今年Lasker基金会承认了Victor Ambros、Gary Ruvkun和David Baulcombe在推断
小RNA分子在真核基因表达的转录后调节中所进行的开创性工作。
分子生物学是一门年轻的学科，如同充满了未开发土地的新大陆。有关小RNA在基
因调节中的作用的重要发现是这门年轻学科中还有许多未开发的重要领域的一个例证。
9月26日，几位先驱（麻州大学医学院的Victor Ambros、麻州总医院和哈佛大学医学院
的Gary Ruvkun和剑桥大学的David Bulcombe有关小RNA的发现将被授予2008年Albert
Lasker基础医学研究奖。
历史上先驱者以及他们的发现的意义通常被忽略，只是在很多年之后才被承认。
Ambros和Ruvkun所发表的描述第一个微RNA及其标靶的优秀论文（发表在高深的Cell杂
志上）被忽略了近10年。与此同时，... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 17 我倒。。。
气死我了。。。为什么我们版上没有学进化的人？半天都没有人出来帮我说话。
明明是oct4 和 Peoplem两个家伙学艺不深，却害得我被骂。..
你们两个家伙赶快滚出来让我再好好批斗一番。
你们两个一直说突变体不需要比野生体优越也能由此出现新物种，这个其实是
不正确的。这里有两个因素你们两都没有考虑到，一个就是，突变的几率非常
低，第二就是，在绝大部分情况下，单点突变不足以产生一个新物种。如果新种是在旧
种基础上产生的话必须有一个突变积累的过程。
产生突变的过程我就不用讲了，你我都同意这个基本上不太受进化压力影响，但是积累
突变的过程，则绝对需要进化压力来对此进行加速。
为什么？对于有性生殖的个体而言，因为突变体出现的概率非常非常的小，
如果没有外部原因（进化压力）对此进行筛选和富集的话，很快就会因为数目
大大小于野生种，要么就是在竞争资源的时候被淘汰掉了（既然你们假设这个
突变体并不比野生体优越），要么就是因为和野生体回交而把突变冲淡了。
所以如果突变体没有任何优越性的话，最多只能昙花一现然后就没有了，根本
不能构成一个产生新物种的要素。
上面有另外一个同学很敏感的问了一个... 阅读全帖 |
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l*****g
发帖数: 2087 | 18 中国科学院院士李家洋
生平简介
李家洋（1956.7-）安徽肥西人。植物分子遗传学家，中国科学院院士，研究员。
中国
科学院副院长、党组成员。1982年毕业于安徽农学院（现安徽农业大学），1991年获美国
布兰代斯（Brandeis）大学博士学位，1991—1994年在美国康乃尔大学汤普逊（Boyce
Th
ompson）植物研究所进行博士后研究工作。历任中国科学院遗传研究所所长助理、所长，
遗传与发育生物学研究所所长。
李家洋主要从事植物分子遗传学研究，他利用模式植物拟南芥与重要粮食作物水稻探
索植物生长发育的调控机理。近年来的主要研究工作包括：采用图位法克隆了水稻分蘖控
制基因MOC1，开拓了水稻分蘖控制分子机理研究的新领域；利用水稻脆秆突变体分离了
B
C1基因，阐述了水稻机械强度的控制机理；通过获得的拟南芥胆碱生物合成突变体，初步
明确了胆碱合成与植物温度敏感雄性不育性的关系；通过图位克隆法分离出导致细胞死亡
的基因MOD1，明确了初级代谢途径的缺陷会导致植物细胞凋亡；利用转基因技术，创制出
色氨酸与吲哚乙酸合成量改变的转基因植物，从而提出植物生长素吲哚乙酸生物合成途径
的新模... 阅读全帖 |
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C*******h
发帖数: 75 | 19 大约一年半载前，跟我一起奋斗的小兄弟纯属偶然从我们自己建立的EMS突变体库中筛
选出一个有细胞死亡现象的突变体。接下来，我们主要做了以下两个方面的工作：
确立表现型与基因之间的因果关系
(A) 锁定细胞死亡，用传统的位置克隆法克隆到了基因。
(B) 用遗传互补的方式也确证了突变中的点突和包括细胞死亡在内的多种表型之间的
直接因果关系。
其二是涉及蛋白层次
(A) 全多肽链丙氨酸替代扫描，通过转基因手段在突变体 (系KNOCKOUT) 背景上转入
自身启动子驱动的携带某个位点丙氨酸替代的突变基因，考察替代位点和表型之间的关
系。工作量庞大，但所得并不多，虽找到了几个残基位点突变导致蛋白完全没有活性的
突变位点。总的来说，性价比不是太高，人力物力财力消耗都相当的大。但也算是有得
有失吧，比竟这个蛋白目前没有任何人有任何已知的认识。
(B) 用GUS标定，确定了组织和器官水平上该蛋白在活体内的表达模式。
(C) 用GFP标定，完成了该蛋白的亚细胞定位工作；而且也确定了该蛋白中存在一个非
常规或者说不同任何已知核定位信号的核定位信号。
(D) 也用删除多肽链前后的办法搞清楚了真正和... 阅读全帖 |
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m*****u
发帖数: 15526 | 20 看google map? 地图是一成不变的么？你不知道冰川期导致海平面大大降低，会产生陆
桥么？否则人类怎么从欧亚大陆到美洲的？至于L3突变体，还是那句话，现在没有任何信息可以证明
突变产生的时间先后顺序，那我就给你个合理的解释：就是除了L3之外的L1,L2突变是携带L3突变体的
人群进入非洲后突变来的。或者携带L1,L2突变体的人群完全进入非洲大陆。极少量非洲大陆以外的都
灭绝了。因为携带不同突变体的人群是组成不同部落的 |
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f***y
发帖数: 4447 | 21 http://www.simm.cas.cn/xwzx/kydt/201309/t20130911_3929864.html
9月12日，美国《科学》杂志-美国科学促进会（Science-AAAS）在中国科学院上海药物
研究所召开新闻发布会，介绍中科院上海药物研究所吴蓓丽研究员研究组在趋化因子受
体CCR5结构生物学领域取得重大突破性进展。相关研究成果发表在Science上，吴蓓丽
研究员为唯一通讯作者，上海药物研究所为第一单位。这也是《科学》杂志-美国科学
促进会第一次在上海召开的新闻发布会，之前仅在北京做过一次新闻发布。
CCR5是一种位于细胞表面的受体蛋白质，作为艾滋病毒共受体之一，在大多数种类
艾滋病毒感染人体免疫细胞时发挥重要作用。然而，其三维结构的解析极具挑战性，长
久以来一直困扰着国内外科学家。日前，由中国科学院上海药物研究所和美国Scripps
研究所的科学家组成的研究团队终于在该项研究中取得了突破性研究成果，成功解析了
CCR5蛋白质分子的高分辨率三维结构，并据此揭示了抗艾滋病毒感染的药物马拉维若是
如何作用于该受体分子进而阻断病毒入侵的分子机制。
“这些结构信息将帮... 阅读全帖 |
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d*****0
发帖数: 68029 | 22 【 以下文字转载自 Joke 讨论区 】
发信人: rl1231 (上官青青), 信区: Joke
标 题: 生物学男的一个梦（转自开心） (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Nov 13 09:04:33 2010, 美东)
发信人: platinumegg (蛋,纯铂金的), 信区: Biology
标 题: 生物学男的一个梦（转自开心） (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 12 12:42:07 2010, 美东)
发信人: cdlqin (cdlqin), 信区: Joke
标 题: 生物学男的一个梦（转自开心）
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 12 09:00:09 2010, 美东)
房子不要很大，但是要一个很大的地下室，干什么用，待会儿再说。 大理石地砖，波
斯羊毛地毯，法国的桌子，意大利的椅子，此类物品一概杜绝，墙面，地面，桌面，全
采用PFA材料，耐酸耐碱耐高温易清扫，不用担心污渍，脏了，盐酸，烧碱，双氧水，
换着泼，刷完了，用自来水洗15遍，蒸馏水洗5遍，超纯水洗3遍。（当然是花钱雇人刷
，小姐我养细胞刷的瓶... 阅读全帖 |
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c****n
发帖数: 15245 | 23 房子不要很大，但是要一个很大的地下室，干什么用，待会儿再说。 大理石地砖，波
斯羊毛地毯，法国的桌子，意大利的椅子，此类物品一概杜绝，墙面，地面，桌面，全
采用PFA材料，耐酸耐碱耐高温易清扫，不用担心污渍，脏了，盐酸，烧碱，双氧水，
换着泼，刷完了，用自来水洗15遍，蒸馏水洗5遍，超纯水洗3遍。（当然是花钱雇人刷
，小姐我养细胞刷的瓶子表面积加起来都铺N 间房的地板了，看见国产玻璃细胞培养瓶
就感觉吃了一口臭鸭蛋。）
德国schott的试剂瓶，大中小买全套，500mL的拿来喝茶，2L的插花，100mL
以下的是佐料瓶，密封好，定量超准，还耐热冲击（这点是我最欣赏的，非常精准的工
艺。国产玻璃器皿，热冲击很容易就爆裂，拿去灭菌，十个有八个拿出来是碎的。）玻
璃的觉得重，还可以用硅化塑料的，防水不吸附，不用刷子也能洗干净。
METTLER TOLEDO的电子天平，称佐料的。Eppendorf的移液枪，Axygen的吸头
，当然是炒菜时用来加酱油和料酒的，用汤勺多不准阿，还容易撒出来。洗碗，安利洗
洁精多土啊，sigma进口分装的NP40,triton ... 阅读全帖 |
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r****1
发帖数: 2299 | 24 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: platinumegg (蛋,纯铂金的), 信区: Biology
标 题: 生物学男的一个梦（转自开心） (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 12 12:42:07 2010, 美东)
发信人: cdlqin (cdlqin), 信区: Joke
标 题: 生物学男的一个梦（转自开心）
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 12 09:00:09 2010, 美东)
房子不要很大，但是要一个很大的地下室，干什么用，待会儿再说。 大理石地砖，波
斯羊毛地毯，法国的桌子，意大利的椅子，此类物品一概杜绝，墙面，地面，桌面，全
采用PFA材料，耐酸耐碱耐高温易清扫，不用担心污渍，脏了，盐酸，烧碱，双氧水，
换着泼，刷完了，用自来水洗15遍，蒸馏水洗5遍，超纯水洗3遍。（当然是花钱雇人刷
，小姐我养细胞刷的瓶子表面积加起来都铺N 间房的地板了，看见国产玻璃细胞培养瓶
就感觉吃了一口臭鸭蛋。）
德国schott的试剂瓶，大中小买全套，500mL的拿来喝茶，2L的插花，100mL
以下... 阅读全帖 |
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t******y
发帖数: 716 | 25 自然进化应该有2个方向含义才能导致人类的最终出现。一个是适者生存；一个是能者
生存。前者倾向于对环境的适应，或者倾向于对同类的优化。当然2者是交互作用，共
同推进物种的进化。
举例来说，野生型和突变型就是一对很好的适者生存或能者生存的例子。野生型往往代
表了当前环境下最优化的生存方式，而突变体则往往有一定的缺陷，虽然时不时出现在
这个世界上，但是在当前环境下很快就被淘汰掉没有任何前途。但是外界环境并不是一
层不变的。在一定条件下，野生型的适应性并没有突变型更高，甚至反而更低。这样就
给突变体一次成为“野生型”的机会。这个“野生型”在积累了大量突变体后就会形成
一个新物种。而在这种能者生存的力量支配下，功能越多，结构越复杂的生物就越有适
应环境的机会。
所以今天这个多彩的世界既不是由最高等的生物构成，也不是由最能繁殖的最低等的生
物构成，正是因为自然进化的2个方向的共同作用保证了物种的多样性。过于强调任何
一方都会造成对自然进化的误解。
因此理解《进化论》不能光从字面上去解读。因为字面上“进化”应该是讲述“能者”
的历史，或者“突变体”的历史，但是它实际上却包括了适者生存和能者生存这两个 |
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t******y
发帖数: 716 | 26 表达一个人体蛋白的突变体。这个蛋白的突变体（pCDNA3质粒上）中有一个点突变在
293T细胞表达量检测不到（其他几个突变体都可以检测到）。所以想用体外表达系统来
表达，不知道有没有人用过这个系统，推荐一下哪个公司的产品比较好。
因为初步判断突变体影响蛋白结构，在293T细胞体内表达时可能被降解了。所以想通过
体外表达，防止降解发生。因为以前没有做个这个实验，所以有几个问题。
1）体外表达是否可以防止突变蛋白降解？
2）选择哪个来源的系统表达我的蛋白？源自human是否比源自wheat的系统或者yeast的
系统更容易降解我的蛋白？
3）打算用质粒DNA直接做，有什么要注意的情况？
4）市场上的kits，哪个比较好？
先谢谢了。 |
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p*********g
发帖数: 9527 | 27 【 以下文字转载自 Joke 讨论区 】
发信人: cdlqin (cdlqin), 信区: Joke
标 题: 生物学男的一个梦（转自开心）
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 12 09:00:09 2010, 美东)
房子不要很大，但是要一个很大的地下室，干什么用，待会儿再说。 大理石地砖，波
斯羊毛地毯，法国的桌子，意大利的椅子，此类物品一概杜绝，墙面，地面，桌面，全
采用PFA材料，耐酸耐碱耐高温易清扫，不用担心污渍，脏了，盐酸，烧碱，双氧水，
换着泼，刷完了，用自来水洗15遍，蒸馏水洗5遍，超纯水洗3遍。（当然是花钱雇人刷
，小姐我养细胞刷的瓶子表面积加起来都铺N 间房的地板了，看见国产玻璃细胞培养瓶
就感觉吃了一口臭鸭蛋。）
德国schott的试剂瓶，大中小买全套，500mL的拿来喝茶，2L的插花，100mL
以下的是佐料瓶，密封好，定量超准，还耐热冲击（这点是我最欣赏的，非常精准的工
艺。国产玻璃器皿，热冲击很容易就爆裂，拿去灭菌，十个有八个拿出来是碎的。）玻
璃的觉得重，还可以用硅化塑料的，防水不吸附，不用刷子也能洗干净。
... 阅读全帖 |
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I****p
发帖数: 101 | 28 去年8月份PNAS刊登一个撤稿，老板说她从来没见过一个突变体的基因竟然克隆错了，
2005年刊出至今，已被引用几十次，估计是因为很多人不能重复，作者才重新仔细观察
，最后决定撤稿。首先PCR片段测序认为是该基因，如果是的话，用野生型基因应当能
够互补。既然互补对了，从突变体库分离的该基因的突变位点也自然要有相似的表型，
检测结果也符合，很完美。老板说，现在作者认为是首先PCR有错，突变体表型又自动
回复，所以不是真正的互补，那为什么用作对照的突变体在当时又不回复？又说，如果
用更可靠的方法，该基因其它突变位点就不再显示那种表型。
哎，老板总结：每一步或每一个角度的实验都要很严谨，否则总是要用一个似是而非的
结果去解释上一步或其它角度的结果，最后结果是：各个角度都指向某个结论，很完美
，但是早晚要面临撤稿的命运。牛人或牛组可能一点事都没有，但是换成一般的或年轻
的实验室就多少会受到影响。她很不希望我们实验室在她退休前碰到这事。听后，受到
不少启发。 |
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j*b
发帖数: 20 | 29 9月12日，美国《科学》杂志-美国科学促进会（Science-AAAS）在中国科学院上海药物
研究所召开新闻发布会，介绍中科院上海药物研究所吴蓓丽研究员研究组在趋化因子受
体CCR5结构生物学领域取得重大突破性进展。相关研究成果发表在Science上，吴蓓丽
研究员为唯一通讯作者，上海药物研究所为第一单位。这也是《科学》杂志-美国科学
促进会第一次在上海召开的新闻发布会，之前仅在北京做过一次新闻发布。
http://phdtree.org/scholar/wu-beili/
CCR5是一种位于细胞表面的受体蛋白质，作为艾滋病毒共受体之一，在大多数种类
艾滋病毒感染人体免疫细胞时发挥重要作用。然而，其三维结构的解析极具挑战性，长
久以来一直困扰着国内外科学家。日前，由中国科学院上海药物研究所和美国Scripps
研究所的科学家组成的研究团队终于在该项研究中取得了突破性研究成果，成功解析了
CCR5蛋白质分子的高分辨率三维结构，并据此揭示了抗艾滋病毒感染的药物马拉维若是
如何作用于该受体分子进而阻断病毒入侵的分子机制。
“这些结构信息将帮助我们更加准确地理解艾滋病毒感染细胞的机制，并有助于... 阅读全帖 |
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a**********c
发帖数: 13 | 30 藻类不能做同源重组，所以之前反向遗传很难做。我们通过随机插入产生了藻类当中的
第一个突变体库，然后进行大规模mapping，对于 25%左右的基因我们能提供突变体。
作为 proof of concept 用这个突变体库我们做了反向遗传，选了10来个基因的突变体
，觉得可能跟我们感兴趣的过程相关，然后发现当中有一个基因的突变体有很明显的表
型，做了互补验证。
我们考虑这几个期刊 Nature communications, ELIFE, PNAS, Plant Cell
麻烦大家说一下自己最看好哪一个期刊，拒了也没关系，再投下一个
lz 可能两年后找工作
谢谢大家！ |
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t**m
发帖数: 158 | 31 http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature1
结合以前发表的工作, 可以看出她的工作是相当成体系的.
在糖转运蛋白结构及作用机制这个领域, 颜宁应该具有无可争议的地位.
以下是清华的新闻稿
====================================
颜宁研究组揭示人源葡萄糖转运蛋白 GLUT1的结构及工作机理
2014年5月18日，清华大学医学院教授颜宁研究组在Nature在线发表了题为 “Crystal
structure of the human glucose transporter GLUT1”的Article，在世界上首次报
道了人源葡萄糖转运蛋白GLUT1的晶体结构，初步揭示其工作机制以及相关疾病的致病
机理。
葡萄糖（D-glucose）是地球上包括从细菌到人类各种生物已知最重要、最基本的能量
来源，也是人脑和神经系统最主要的供能物质；据估算，大脑平均每天消耗约120克葡
萄糖，占人体葡萄糖总消耗量的一半以上。葡萄糖代谢的第一步就是进入细胞：亲水的
葡萄糖不能自由穿透疏水的细胞... 阅读全帖 |
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d**b
发帖数: 1286 | 32 房子不要很大，但是要一个很大的地下室，干什么用，待会儿再说。
大理石地砖，波斯羊毛地毯，法国的桌子，意大利的椅子，此类物品一概杜绝，墙面，
地面，桌面，全采用PFA材料，耐酸耐碱耐高温易清扫，不用担心污渍，脏了，盐酸，
烧碱，双氧水，换着泼，刷完了，用自来水洗15遍，蒸馏水洗5遍，超纯水洗3遍。（当
然是花钱雇人刷，小姐我养细胞刷的瓶子表面积加起来都铺N间房的地板了，看见国产
玻璃细胞培养瓶就感觉吃了一口臭鸭蛋。）
德国schott的试剂瓶，大中小买全套，500mL的拿来喝茶，2L的插花，100mL以下的是佐
料瓶，密封好，定量超准，还耐热冲击（这点是我最欣赏的，非常精准的工艺。国产玻
璃器皿，热冲击很容易就爆裂，拿去灭菌，十个有八个拿出来是碎的。）
玻璃的觉得重，还可以用硅化塑料的，防水不吸附，不用刷子也能洗干净。
METTLER TOLEDO的电子天平，称佐料的。
Eppendorf的移液枪，Axygen的吸头，当然是炒菜时用来加酱油和料酒的，用汤勺多不
准阿，还容易撒出来。
洗碗，安利洗洁精多土啊，sigma进口分装的NP40，triton X-100，triton X-114和... 阅读全帖 |
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d********i
发帖数: 113 | 33 全文转载如下。
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起初神创造－评进化论的由来与谬误
“起初神创造诸天与地”（创一1），这是圣经开宗明义的第一句话，这也是阿波罗八
号登月宇宙飞船上的宇航员首次到达月球外围时，发到地球上的第一个讯息。
当人观赏宇宙的伟大、恢宏、规则、精确，不能不想到其设计者；当人细察地球上亿万
生物的奇姿多彩、变化万千和巧妙配搭，也不能不联想到生命的源头和创始者（徒三15
）；当人站在镜子前观看自己身体构造的奇妙，或在夜深人静时思想内心世界的丰富和
良心感觉的可畏，不能不赞叹“因我受造奇妙可畏；你的作为奇妙，这是我心深知道的
”（诗一三九14）。
然而，自一八五九年达尔文发表《物种起源》（The Origin of Species）（这是达尔
文所提出的解释宇宙、生命和人起源的假说），提出进化学说之后，进化的思想就如野
火蔓延，甚至写进许多国家的教科书里。因着进化论的教育，许多人误把进化论当作科
学真理，而把圣经中所启示的“起初神创造”当作不合科学的神话。这一进化学说蒙蔽
人的心思，拦阻人对宇宙创造者和宇宙存在意义的追寻，贬低人生存的意义和价值，导
致社会道德的退化。
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r****o
发帖数: 105 | 34 DNA Shuffling 可以归结成一种体外基因重组技术。操作原理其实很简单，比如说如
果
你有一个抗生素分解酶的基因，现在你想引入一些突变使它变得活性更高，但是你并不知
道
应该突变哪些位点以及如何突变，DNA Shuffling 就可以解决这个问题。首先，用"错误
导向
PCR”扩增出这个基因的片断，这个过程中，引入了一定比率的随机突变。然后克隆进载
体，
表达然后用抗生素筛选出有进步的克隆。第二，分离出这些克隆，用DNAse I 随机切成小
片段，
然后退火，进行self-annealing. 这样小片断又重新恢复成一个基因，这里请注意，在这
个
过程中，不同的克隆发生了重组，所以“好”的突变有可能被积累在一个重组克隆里。第
三，
重新引入载体，表达并且筛选，这样往往会拿到更好的克隆，第四重复以上步骤只到找到
最佳
突变体为止。
从以上可知，这种技术实际上是一种靠组合然后筛选逐步找到最优突变体的过程，模
拟了
生物进化的过程，所以又称为“定向进化”(directed evolution). |
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发帖数: 1 | 35 分子进化论可以根据基因的突变积累推测生物的产生年代和相互关系。
简单说，每一次基因复制都会有些变异，有些可以造成编码蛋白的变化甚至功能的变化
（如癌症），有些是没有意义的突变（多态性）。虽然每个突变发生的机率都很低，但
这些突变是可以逐渐积累的。
假如又个原始病毒，其复制过程中产生突变A，带有突变A的病毒继续复制，过程中产生
很多带突变A并产生少量突变B，下一代又产生少量突变C，这就是一个进化链。实际情
况会更复杂，因为带又A的突变体在产生B突变后，还要继续存在，并且继续积累其他突
变。
现在的病毒库中已经存在大量的突变体了，而且我们不知道谁是原始序列或者原始病毒
已经消失。但是只要数据足够大，就能够分析出其中的关系，出现先后顺序。这些对于
成天吹嘘数学的低端人口应该不难理解吧。
现在已经积累了足够的病毒序列，可以得出海鲜市场不是病毒源头的道理。不仅如此，
还能证实爆发疫情时间（大幅提前），也就是党妈掩盖疫情的证据。 |
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n***c
发帖数: 7400 | 36 昨天在车上忽听以前舍友打电话说“老板”出事了，我还因为是前些日子的“学术诬告
”事件，本来感觉这个事情就是无理取闹，清者自清，没有放在心上。随后舍友说不是
这件事，让我赶快看新闻。随机打开手机网易看到不幸消息，与实验室倪君确认，事情
确然，随即感到无名的悲伤和怀念。
我是2005年考上吴老师的硕士研究生的，那时实验室还在华家池校区，怀着对科学的崇
敬和热爱，我进入了吴老师实验室。那时我对实验基本不懂，PCR、克隆、构载体… …
很多新鲜名词，好奇心也是我惹了不少麻烦。随即吴老师把我叫到办公室让我先跟着一
东北大哥张**师兄筛选水稻突变体。
于是在接下来的半年里，我们从大批量水稻的突变体库种子中筛选相关突变体。从播种
、育秧、Gus染色检验，到把筛选到的突变体材料种到土里直到收获，逐渐对水稻的整
个生长过程和表型特征有了深刻的了解。这半年里，由于实验的不顺利和结果不理想，
没少挨“老板”的批评。
临近年底，东北大哥家远，我也没买到回家的票，就都留在了学校。寒假期间还时不时
的照顾一下实验室的“苗儿”。那时整个生科院大楼房间基本上房间都黑着，只有吴老
师一个人的房间灯亮着。有一次大约是初一... 阅读全帖 |
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d*********o
发帖数: 6388 | 37 https://www.cell.com/pb-assets/journals/research/cell/Cell_S0092-8674(20)
30262-2.pdf
子陵在听歌
Cell出版社preprint了华盛顿大学Veesler组关于SARS-CoV-2生化特性和结构生物学的
重要文章。这篇文章十分严谨也十分重要，它同时进行了生化功能研究和结构生物学研
究，给出了更高分辨率的S蛋白三聚体两种状态结构。研究反驳了网络传言如“插入论
”。研究发现不具有“插入RRAR”的病毒S蛋白具有更强的细胞结合能力。因此可以推
论，所谓的“人工合成”病毒，其实本身感染细胞的能力更低。而另一方面，它的部分
结论较McLellan组Science文章更有逻辑。
研究首先通过假病毒融合实验，证明了一个重要结论，就是SARS-CoV-2与SARS-CoV具有
几乎相同的Vero E6细胞受体细胞结合能力，这与McLellan组应用SPR得出的结论不同。
而非常有意思的是，该研究设计了一个突变体，Q677TILR SV683，这个突变体敲除了饱
受争议的4个插入氨基酸序列RRAR和furin切割位点。... 阅读全帖 |
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S**y
发帖数: 283 | 38 我们用qPCR通过计算基因，来比较细菌的数目，
一个是野生型，一个是突变体；
有两对引物，一对是16s，一对是特异基因B的，
用16s引物，野生型和突变体比较没问题，结果都正常；
但是用基因B的引物，在突变体中比野生型高100000倍，
检查各种情况，多次重复，基因B引物总是在突变体中比野生型高100000倍。 |
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x*****9
发帖数: 48 | 39 光明网应该是国内主流媒体了，近日报道了一篇则鸣所写的文章：《科学新闻》不实报
道引发二方被打和肖传国入狱。光明网大概是这次肖方事件中唯一能持客观公平态度的
主流媒体。当然这几天其它一边倒支持方的主流媒体渐渐收声了，舆论有转向的趋势。
http://topics.gmw.cn/2010-10/04/content_1289408.htm
《科学新闻》不实报道引发二方被打和肖传国入狱
《科学新闻》不实报道引发二方被打和肖传国入狱
——兼评肖氏反射弧是否可能获诺贝尔奖
则鸣 刊发时间：2010-10-04 13:17:27 光明网综述整理 [字体：大 中 小]
Ke Hua,
I registered at the Rainbow Plan wed site as Ze Ming several hours ago
but didn't receive my password. Please either alert the web master to send
me my password, or post the article below for me.
I saw your e m... 阅读全帖 |
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x*****9
发帖数: 48 | 40 《科学新闻》不实报道引发二方被打和肖传国入狱
——兼评肖氏反射弧是否可能获诺贝尔奖
则鸣 刊发时间：2010-10-04 13:17:27 光明网综述整理 [字体：大 中 小]
Ke Hua,
I registered at the Rainbow Plan wed site as Ze Ming several hours ago
but didn't receive my password. Please either alert the web master to send
me my password, or post the article below for me.
I saw your e mail addresses in your message to Shen Yang. Thanks. --Ze
Ming
9月21日从吴发天的微博上看到肖传国被捕, 其震惊程度不亚于萨达姆被俘和迈克
尔·杰克逊猝死(都是先从网上看到). 方舟子被打后一直想看到凶手被抓. 特别是看了
刘菊花的《活着》, 对她和她的女儿充满同情. 肖传国被抓, 震惊之余是失望, 然后是
愤怒... 阅读全帖 |
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w********2
发帖数: 632 | 41 进化论本身的错误
（一）脆弱的逻辑基础
一八五九年，达尔文在《物种起源》中根据一些零散的事例，鲜明地提出了进化的观点
，认为今天复杂的生物界是从简单的原始生物一步步进化而来。历史好像总要在重复中
循环前进。随着科学深入广泛的发展，历史流转到今天，昔日“解决”了的问题又转了
回来，许多人重新陷入古老的疑问：生命到底从何而来？近二十年，大量的事实使进化
论陷入了真正的危机。众多的科学发现使真理的天平明显地向人们意想不到的地方倾斜
了。
比较解剖学，暴露了进化论的逻辑错误──循环论证
科学上，如果一个理论的证明违背逻辑，这个理论就不能成立，但是人们对进化论的逻
辑错误却不予深究，也是因为深究起来，就没有证据可言了。许多人对这话感到惊讶？
其实，问题的揭示会使你更惊讶。用比较解剖学来论证进化，形象地说就是：“如果人
是猿进化来的，人和猿就会有许多相近的特征；因为人和猿有许多近似之处，所以人就
是猿进化来的。”这是典型的“循环论证”，前面在逻辑上没问题（逻辑上没问题不等
于合乎事实），后面就是狡辩了。换一个通俗的说法更清楚些：“如果甲是乙的弟弟，
甲就比乙小；因为甲比乙小，甲就一定是乙的弟弟。”... 阅读全帖 |
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c****t
发帖数: 19049 | 42 一股悲观情绪在互联网业蔓延，一群自称为“心理阴暗”的从业者，纠结于那些没有底
线的竞争、大公司的抄袭、小公司不再创新、最终生态的破坏。这些都与当下大热的科
幻小说《三体》不谋而合。这本书里，地球人面临来自更高等文明的进攻，不得以而适
应残酷的黑暗森林法则，奋力搏斗，但最终与敌对星球同归于尽。
在第一期《产品家》沙龙上，四位互联网人讨论了行业现实与星战中黑暗森林法则
和降维武器的关联，以及如何解救的方法。这四位分别是KPCB管理合伙人周炜，纵横中
文CEO张云帆，金山网络CEO傅盛，创业家杂志社长牛文文。主持人是《产品家》沙龙发
起人程苓峰。
周炜：人类会变成蚂蚁？“中国诅咒”无可避免。生命必须扩张，大公司也是一个
生命。
科幻小说本质上必须是哲学小说。因为科幻的想象力让你能够在时间、空间上来回
变化，这就会涉及到人类终极问题：生命从哪来？到哪去？意义是什么？第二，科幻必
须关心存在于内心深处的人性。当地球人争相杀死同类抢夺飞船时，这是非常发人深省
的。接下来就必须有第三点，科幻要架构庞大，思维没有疆界，时空横亘全宇宙。这一
点跟互联网极为相似。如果没有防火墙，全世界的人都通过Faceb... 阅读全帖 |
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j*******7
发帖数: 6300 | 43 http://tieba.baidu.com/p/1749516667
概率计算否定了进化论的核心——基因突变机制
达尔文时代，近代西方科学正处于奠基阶段，对生命现象的认识还很肤浅。那时的人看
到了家养动物的诸多杂种变异，就认为物种也能这样变成其它种，这就是进化。后来，
随着基因的发现和深入研究，学者们才意识到如果基因不发生根本的变化，不管后代表
面与祖先有什么差异，也没有进化意义。然而基因又是极其稳定的，只有不正常的「基
因突变」才能使之发生改变，那么「基因突变」也就成了现代进化论的核心了。这是现
代所有的进化论者公认的。这里，我们就集中分析这个核心理论。
理论和实际上，基因突变产生高级性状的机率几乎是零
基因突变，是一种在基因复制或修复损伤等过程中发生的随机错误，所以又叫随机突变
，本身就是一种病态现象。它发生的机率非常低，大约在万分之一到十亿分之一之间。
低等原核生物的突变率较高，大约为千分之一，而高等类型的生物中，许多基因的突变
率是十万分之一到一亿分之一。
基因突变能否产生高级特征（性状）呢？对基因的深入研究发现∶这种情况发生的机率
极低。我们知道一个基因的核心是由几百到几千... 阅读全帖 |
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m*********D
发帖数: 1727 | 44 （CRISPR的背景资料请参阅Feng Zhang的“Genome engineering using the CRISPR-
Cas9 system”，Nature Protocols 8, 2281–2308 (2013)）
背景
我们是作一个与激素相关的肿瘤的。这个肿瘤的治疗方法已经相当完善，就是让身体里
不能生产激素或用一个小分子化合物抢占激素受体上激素的结合部位。但多年治疗后，
会有相当比例的病人产生抗药性。这个抗药性机理相当复杂。我们实验室一直致力于筛
选和现有药物不同的机理的小分子化合物，包括受体和DNA的结合或其他与受体相关的
pathway的inhibitors。前几年成功地筛选出了几个不同机理的化合物，个别在细胞水
平达到了nM的级别，动物测试也在10 mg/kg的水平。
最近在这个领域对抗药性肿瘤的研究发现，部分病人的抗药性是因为受体激素结合部位
发生了突变。一个或几个氨基酸的突变就能导致肿瘤细胞的生长不能被现有药物抑制。
所以，我们很想知道我们筛选出来的化合物对这些突变受体是不是也起作用。理论上来
说，我们的化合物不和激素竞争，突变不会影响我们化合物的效果。但只... 阅读全帖 |
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H****r
发帖数: 16240 | 45 大刘拟的太祖批示，相当像那么回事啊——比不少传统文学界人物在作品中拟的太祖体
都要
出彩；
最后他那段广播稿定版，也挺有水平，基本算是共产主义版的普世价值大旗吧：
（文章列出最有可能发生技术突变的领域：
1、物理学：【略】
2、生物学：【略】
3、计算机科学：【略】
4、寻找外星文明：这是所有技术突变的可能性中变数最大的领域，极有可能产生突然
性的
巨大突破，该领域的技术突变一旦发生，其影响力将超过以上三个领域技术突变的总和
。）
【批示】将该文印发下去。在适当的范围内组织讨论。文章的观点可能不合一些人的胃口
。但不要扣帽子，关键要看作者的长远思考。一些同志现在是一叶障目，有大环境的原
因，也有很多人是自以为是。这样不好，战略视野的盲区是危险的。我看文章中提到的
四个可能产生技术突变的领域中。最后一个是我们考虑最少的。值得注意，应该系统深
入地研究一下。
（4、与外星文明可能的接触对当前世界格局产生的影响的初步分析
（1）单向接触（仅接收外星文明已发出的信息）【略】
（2）双向接触（与外星文明发生交流和直接接触）【略】
5、超级大国首先与外星文明接触并垄断接触的危险和后果
（1）美帝及... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 46 不用谢
Li D et al. (2011)
HSP90 Causes Aberrant Stabilization of Mutant p53 in
Functional Inactivation of Endogenous MDM2 and CHIP by human cancer cells
Mol Cancer Res. 9: 577–588.
HTTP: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3097033/
plus
参看艳阳天jj/mm 的原帖下吧
昨天晚上听了Susan Lindquist 有关HSP90 的讲座后被震惊了。虽然以前这里也有人提
起过她以前的文章，但是那些文章都是一些计算分析为主的，所以我也比较不怎么当一
回事。昨天她谈了她们做的一些关于防止真菌进化出抗药性的实验，HSP90
抑制剂对于真菌没有直接杀伤力，但是综合和其他有直接杀伤力的药一起用的时候可以
非常好的防止真菌出现抗药性而复发。她最后的结论是HSP90的活性对于容忍机体的进
化有重要作用。高活性的HSP90会导致突变体能够成功存活下来。听完之后我忍不住跑... 阅读全帖 |
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f********e
发帖数: 15 | 47 筛了四五十个，只有一个发生同源重组的是三个同样的突变，其他的突变体都是
heterozygous。我的问题在于，我不只是想把基因全本KO，还想研究基因的dosage效应
，所以还想要筛到只敲掉一个或者两个allele的突变体，难啊。
以前在euploid细胞里做突变的时候，倒是看到一些两个allele一样的突变，但是现在
变成三个allele，indel mutation就没有看到homozygous的情况了，可能allele太多了
吧，呵呵。 |
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c****t
发帖数: 19049 | 48 13. 红红红红岸之三
红岸工程部分文件，这批文件的解密时间是叶文洁向汪淼讲述红岸内幕三年之后。
一、世界基础科学研究趋势中一个被忽略的重要问题（原载《内部参考》196口年口月
口日）
【提要】从近代史和现代史上看，科学基础理论研究成果转化为实用技术有两种模式：
渐进型和
突变型。
渐进型：基础理论成果被逐步转化为应用技术，技术逐渐积累，最后产生突破。最近的
例子有宇
航技术的发展和突破。
突变型：基础理论成果被迅速转化为实用技术。产生技术突变。最近的例子是核武器的
出现，直
到四十年代，还有一部分最优秀的物理学家认为释放原子能是永远不可能的事。但核武
器在极短
的时间内突然出现，基础科学向应用技术的转化跨度极大，时间极短，我们定义为技术
突变。
目前，北约和华约集团基础研究空前活跃，投入巨大。所以一项或多项技术突变随时都
可能发生
，这将对我战略规划构成重大威胁。
文章认为，我们目前的目光主要集中在技术的渐进型发展上，而对可能发生的技术突变
没有给予
足够的重视。应当从战略高度，制定一套完整策略和原则，当技术突变发生时能够正确
地应对。
文章列出最有可能发生技... 阅读全帖 |
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f********n
发帖数: 6465 | 49 我当时就是太省事了。都是我不好。
我当时要制备8个突变体的单克隆细胞系。
每一种突变体都要挑选很多细胞系来筛选。
但是我是累到不行。就RT-PCR后，每个突变体就只保留了2个细胞系。
结果就发现，有的细胞根本就没有表达还活着呢。
不会让我又从头来一次吧。
还是在现有的基础上再挑呢? |
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b******s
发帖数: 1089 | 50 现在应该不可以这么随便命名了吧
我这个领域只见过有个人命名一个突变体叫feifei，还有日本人命名他们的突变体用日
语的’猪‘
但是都是相当针对突变体的形态学特征。 |
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