s********2
发帖数: 138 | 1 我最近调一个基因的基因组序列，根据cDNA序列的5'和3’UTR区域设计了一对引物，在
基因组里扩增，结果发现了能扩增出来三条带。经测序，发现外显子的序列是一致的，
但是内含子的序列差异很大。这三种情况，内含子的插入位置是一致的，并且是都只有
两个内含子。第一种和第二种相似，但是第二种比第一种在内含子上多了250bp的序列
。而第三种的内含子和这两种就完全不同了。我不知道大家遇到过类似的基因么？如果
遇到这种情况，接着往下做的思路是怎么样的呢？这个基因可能是和抗病相关，我本来
是打算做这个基因外显子部分的SNP和抗病的相关性分析的。但是出来这样的结果，觉
得可以往下做点东西，但是又没有什么思路。希望大家能够给予指导。谢谢! |
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发帖数: 1 | 2 CTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCC
CACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGG
GTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGG
bGH PolyA signal
mammalian terminators (SV40, hGH, BGH, and rbGlob) include the sequence
motif AAUAAA which promotes both polyadenylation and termination. Out of
those listed, the SV40 late polyA and rbGlob polyA are thought to be more
efficient in terminating transcripti... 阅读全帖 |
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j****x
发帖数: 1704 | 3 pseudogene一般不会出现外显子序列及剪接位点完全一致，只是内含子序列不一致的情
况。
找找ortholog以及paralog,看看在其他物种尤其是近缘物种里有什么特点 |
|
d*******n
发帖数: 6 | 4 我做植物中的转录因子A。在另一个基因B内含子中发现两个A的潜在的结合位点，而且
距离很近，构成回文序列。请问B是A的下游基因的概率高吗？ |
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H*g
发帖数: 2333 | 5 A simple answer is" no,very unlikely".
A complicate one is "who knows", find more evidence, form your own
hypothesis and related aims; then, go ahead to test it. Even you get yeast 1
-hybrid as well as gel shift to show the binding, you still need to show
such binding is biological meaningful.
我做植物中的转录因子A。在另一个基因B内含子中发现两个A的潜在的结合位点，而且
距离很近，构成回文序列。请问B是A的下游基因的概率高吗？ |
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d*******n
发帖数: 6 | 6 我检测到一个基因有可变剪接的情况，发现一些它的mRNA。其中有一些，内含子边界非
GT-AG，这是什么情况？ |
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发帖数: 1 | 7 在基因的内含子上面加入一个poly(A)会影响其pre-mRNA和mature-mRNA的
transcription和translation吗？
会不会发生pre-mRNA在转录到poly（A)的位置就停止了，还是会继续转录，然后在mRNA
的成熟加工过程中被切掉，基因的翻译不受任何影响？ |
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f*******e
发帖数: 354 | 8 这样的话转录应该就终止了吧。但是如果这个intron后面已经没有编码的exon，那就相
当于替换了基因自己的utr而已，并不一定改变表达水平。
:
CTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCC
:
CACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGG
:
GTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGG
: bGH PolyA signal
: mammalian terminators (SV40, hGH, BGH, and rbGlob) include the
sequence
: motif AAUAAA which promotes both polyadenylation and termination. Out
of
<... 阅读全帖 |
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Z******5
发帖数: 435 | 9 啥生物啊？没有基因组序列？
从第一个外显子或最后一个外显子向两端再扩几kb,测序看看一样不。 |
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s********2
发帖数: 138 | 10 是一种牡蛎，还没有基因组的序列。是我经过PCR扩增，自己测序得到的序列。嗯，要
不我就做个genome-walking，拿到启动子看看。 |
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p***r
发帖数: 20570 | 11 大善人Bill Gates在非洲另外一个大笔投资是什么来着？转基因作物。
http://blog.sina.com.cn/s/blog_4134ba9001017wqm.html
转帖：纠正方舟子的错误
(2011-02-08 20:37:02)
转载
标签：
转基因
方舟子
食品
美国
中国
文化
分类： 转帖
题记：曹明华是我多年老朋友，目前在美国工作。不久前方舟子批评了曹明华，内
容主要针对曹明华两年前在国内出版的一本书《生命科学手记》，但批评涉及面超出了
这本书本身。最近，曹明华写了一篇回应文章，原标题为《回答方舟子》。原文较长，
我略作了些删改，转帖在这里。现标题是我改的，目的是醒目些。以下是曹明华的文字：
到目前为止，我总共发表过两篇反对转基因食物的文章和一篇以温和的口吻谈论“
中医之争”的文章，却因此招致方舟子先生对我的攻击：“学过分子生物学而崇拜中医
、攻击转基因技术的很罕见，现发现了一个……”，“她那书应该改名叫《生命伪科学
手记》，在《文汇报》的专栏也应该相应改名。这种人学生物学，是一场误会……”。
并且，方舟子先生不惜对我使用了“痛恨（！）... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 12 其实语言还是很平和很正常的，涉及的科学知识也基本正确。不知道这个新闻稿落到外
面的新闻机构手里怎么就搞出了个黑物质的说法。
http://news.ustc.edu.cn/xwbl/201502/t20150215_211668.html
中国科大发现新型非编码RNA 2015-02-15
分享到：QQ空间新浪微博腾讯微博人人网微信
最近，中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物
学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文，报导了其实验室发
现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。
非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起着调控作用的RNA分子。单革教授实验室
发现了一类新型的环状非编码RNA，在这类环状RNA中，内含子没有被除去、而是被保留
在环形RNA当中，因此这类RNA被作者命名为外显子-内含子环形RNA（EIciRNA）。该文
研究了外显子-内含子环形RNA的功能，发现此类非编码RNA可以调控其自身所在的基因
的表达。进一步的研究表明，外显子-内含子环形RNA是通过招募U1... 阅读全帖 |
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R***a
发帖数: 2605 | 13 转基因饲料安全性之争:有试验称影响动物生殖
饲料, 动物, 转基因作物, 粮食安全, 科学报
http://www.sina.com.cn
2012年03月16日 15:34 中國科学报
出于粮食安全的考虑，我国正逐年增加转基因生物的进口数量。 养猪如果全部使
用配合饲料，每年将消耗粮食生产总量的40%左右。 目前我国所使用的饲料大多数都
含有转基因成分。用转基因作物或者其加工副产品制作的转基因饲料是否会对动物乃至
人类产生不良影响，科学家仍无法给出明确的答案。
支持方认为，在饲料中使用转基因作物，是基于我国高蛋白食品需求与粮食供应之
间的矛盾。反对方认为，发展生态农业和提高农民积极性，才是解决我国粮食问题的根
本办法，是解决转基因饲料安全问题的终极手段。
随着人们对食品安全关注程度的提高，“转基因食品”的安全性，已经成为近年来
科学界乃至民间广泛争论的热点问题。然而，今年3月2日，农业部首次在官网上发布“
进口用作加工原料的农业转基因生物审批情况”(以下简称“审批情况”)， 又一次将
这场“转基因安全性”之争推向了风口浪尖。
据了解，农业部此次公布了自2004年以来中國... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 14 #注明译者，请随便转载：）
CRISPR英雄谱
埃里克・兰德（Eric Lander）
小鹿／译
三年之前，科学家们宣布，CRISPR技术能够对真核活细胞进行精准与有效的基因组编辑
。自此，这项技术手段已然震撼了科学界，数以千计的实验室正在将其运用于从生物医
药到农业的各个领域。然而，从一种奇特的细菌重复序列现象的发现开始，到确认这种
现象为适应性免疫系统，进而对它的生物功能特性的了解，直至开发为一项基因工程的
技术，这此前二十载相关的研究历程却不为人所知。本文正是着眼于填补这段科学历史
的空白，它讲述的是观念的演化历史和先锋人物的传奇故事，并且从中获得关于支撑科
学发现的优秀科研环境的启迪。
前言
很难想起曾经有哪一次科学革命像CRISPR这般如此迅速地改变生物学界。仅仅三年之前
，科学家宣布，CRISPR系统，即细菌通过纪录和精准攻击入侵病毒的DNA序列而进行自
身防御的适应性免疫系统，可以利用转化为一项简单而有效的技术在哺乳动物和其它生
物体的活体细胞内进行基因组编辑。CRISPR即此被全球数以千计的实验室运用于广泛的
领域，如创建人类遗传疾病和癌症的复杂动物模型；... 阅读全帖 |
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f***y
发帖数: 4447 | 15 施一公组首次报道人源剪切体原子分辨率结构
http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2017/5/376111.shtm
2017年5月12日，清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公研究组于《细
胞》（Cell）在线发表了题为《人源剪接体的原子分辨率结构》（An Atomic
Structure of the Human Spliceosome）。这是第一个高分辨率的人源剪接体结构，也
是首次在近原子分辨率的尺度上观察到酵母以外的、来自高等生物的剪接体的结构，进
一步揭示了剪接体的组装和工作机理，为理解高等生物的RNA剪接过程提供了重要基础。
在真核生物细胞内，大多数基因是不连续的，它们的编码区（exon）被称为“内含子（
intron）”的非编码序列隔断。在基因表达过程中，内含子需要经过“剪”和“接”这
两步化学反应被去除，从而使得编码区可以连接成不同的信使RNA（mRNA）。同一个基
因，因为内含子的边界和数量不同，经过剪接，便可以产生出多种编码蛋白的mRNA。
RNA剪接是所有真核生物特有的过程，是真核生物“中心法则”的关键步骤之一，也被
认... 阅读全帖 |
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j*******r
发帖数: 223 | 16 罗嗦了这么一堆，作者就是个科盲。
科学弄错的时候多的是。对转基因这样的不成熟技术，再严谨都不过分。
举几个很简单的两个事实：
1.对内含子的作用，还不了解。就在十几年前，生物界还普遍认为内含子是进化中产生
的垃圾DNA，没有功能。但是现在我们知道，内含子有非常重要的功能。方舟子前面就
在这个问题上闹过大笑话。因为他脱离科研一线多年，其陈旧的生物学知识，还是停留
在90年代；
2.现在的转基因根本不能完全控制；真正做过转基因的都知道，现在的转基因技术，离
精确控制还差十万八千里呢。
3.美国的主食小麦转基因就遭到强烈抵制。 |
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W*********n
发帖数: 775 | 17 想获取一个一个物种的某基因A的序列，从其5'UTR及开始的25个编码区碱基设计
Morpholino序列用于基因阻断。 从朋友那边（正在做此物种测序）获取了一包含这个
基因的测序序列：包含这个基因的所有内含子，外显子以及启动子区域 （只是中间也
有几个大片的NNNNN区）。我通过将其和另外一个亲缘最近的同属的其他物种（已经测
序）进行比较，找出了编码区的内含子和外显子（因为蛋白序列高度相似）。
现在的问题是：怎样从原始序列中找出5'UTR的确切序列？ 这个5'UTR是否一定在第一
个编码区的外显子上，还是可能在这个外显子的上游还可能有一个外显子，用来剪贴出
全部或者部分5'UTR？ 怎样判断5'UTR的起始位点？
请问用什么软件可以分析？谢谢！ |
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v**********m
发帖数: 5516 | 18 该文中四处提出诺贝尔奖字眼跟施论文的科学内容没有任何关系，作者那么牵强的把施
的工作和诺贝尔奖扯在一起是为什么？
当然如果你读不出清华吹捧它为诺贝尔奖级别的意思，当我没说，我向虎肉教授个人道
歉。
http://news.tsinghua.edu.cn/publish/news/4205/2015/201508230948
施一公教授研究组在《科学》发表两篇论文
报道剪接体的三维结构并阐述RNA剪接的分子结构基础
清华新闻网8月23日电8月21日，清华大学生命科学学院施一公教授研究组在《科学
》（ScienceStructure of a Yeast Spliceosome at 3.6 Angstrom
ResolutionStructural Basis of Pre-mRNA Splicing）。第一篇文章报道了通过单颗
粒冷冻电子显微技术（冷冻电镜）解析的酵母剪接体近原子分辨率的三维结构，第二篇
文章在此结构的基础上进行了详细分析，阐述了剪接体对前体信使RNA执行剪接的基本
工作机理。这在世界上首次捕获了真核细胞剪接体复合物的高分辨率空间三维结构，阐
述了剪接体对前体信使RNA... 阅读全帖 |
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v**********m
发帖数: 5516 | 19 http://news.tsinghua.edu.cn/publish/news/4205/2015/201508241450
还有这篇。
中国科学家为人类生命科学做出巨大贡献
来源：新华网 2015-8-23 任卫东 张漫子
清华大学生命科学学院施一公研究组近日在生命科学基础研究领域取得重大原创性
突破，成功解析剪接体的三维结构，并阐述其工作机理，成果于21日在线发表于《科学
》。业内称此“至关重要”的突破为揭示与剪接体相关遗传病的发病机理提供重要的结
构基础和理论指导。
首次获得高分辨率剪接体三维结构并揭示其工作机理
成果发布后，新华社记者第一时间在清华园甲所见到了刚完成北京高精尖特批项目
评审工作、风尘仆仆骑车赶回的施一公。
施一公介绍，在所有真核生物中，基因表达分三步进行，在第一步转录中，储存在
DNA中的遗传信息经RNA聚合酶的作用转变为前体信使RNA；由多个内含子与外显子间隔
形成的前体信使RNA必须经过剪接体的作用去除内含子、连接外显子后才转化为成熟的
信使RNA，此过程为剪接；最后，信使RNA经核糖体转化为蛋白质。
据同行介绍，第一步与第三步中的关键催化机器RNA聚合酶... 阅读全帖 |
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n********n
发帖数: 8336 | 20
从前，有个mRNA，觉得自己很孤单，就拉个核糖体过来翻译个蛋白给自己作伴
，翻译好之后对蛋白说："你好，我是你的模板。"
蛋白说："你好，我是RNA水解酶。"
mRNA沉默了一下，说："没关系，反正我本来也活不了多久，你就陪陪我吧。"
蛋白说："好"。
于是两个人就手拉手默默地站在一起。
过了一会儿蛋白忽然说："其实我现在还不是RNA水解酶。"
mRNA："嗯。"
蛋白："我现在只是多肽。"
mRNA笑了。
蛋白："可是我很快就会变成真的RNA水解酶了。"
mRNA："没有关系。我总是要死的。"
于是蛋白依旧和mRNA靠在一起，他慢慢地转圈，折叠，开始修饰自己。他越来越像
真的RNA水解酶，而mRNA慢慢地开始降解。
蛋白说："我走吧，离开了我你也许能活得久一些呢。"
mRNA说："你别走。我有些话要和你说。"
mRNA说，你知道么，我也有过一个模板，他叫DNA。
蛋白说："他现在在哪里呢？"
mRNA说："他的启动子关闭了。他睡着了。"
蛋白问："是谁把他的启动子关掉的呢？他还会醒过来吗？"
mRNA说："是我把他关掉的。"然后他又笑笑："但是他还会醒的，我一消... 阅读全帖 |
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S***n
发帖数: 1281 | 21 把时间轴拉长，那这辈子结束的时候，不也是告一段落？。。
如果世界真是光是物质的，那结果，确也是如此。。
但是，世界背后，却有道，却有一。。
一，意味着一切本是纠缠，倒是“分离”，倒是“个体”，反而是幻象。。。
蛋白："可是我很快就会变成真的RNA水解酶了。"
mRNA："没有关系。我总是要死的。"
于是蛋白依旧和mRNA靠在一起，他慢慢地转圈，折叠，开始修饰自己。他越来越像
真的RNA水解酶，而mRNA慢慢地开始降解。
蛋白说："我走吧，离开了我你也许能活得久一些呢。"
mRNA说："你别走。我有些话要和你说。"
mRNA说，你知道么，我也有过一个模板，他叫DNA。
蛋白说："他现在在哪里呢？"
mRNA说："他的启动子关闭了。他睡着了。"
蛋白问："是谁把他的启动子关掉的呢？他还会醒过来吗？"
mRNA说："是我把他关掉的。"然后他又笑笑："但是他还会醒的，我一消失，他就
又会醒来了。"
mRNA说："我记得我刚被转录出来的时候，DNA对我说，你好，我是你的模板。我说
你好，我是mRNA。他笑着说很高兴见到你，然后就慢慢睡着了。"
蛋白没有说话。
"我很想念他。"mRNA的声音越来... 阅读全帖 |
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S***n
发帖数: 1281 | 22 回归道，就是无余涅槃。。回归一，就是有余涅槃。。两个回归，都是解脱。。
叫法不同，却殊途同归。。。
蛋白："可是我很快就会变成真的RNA水解酶了。"
mRNA："没有关系。我总是要死的。"
于是蛋白依旧和mRNA靠在一起，他慢慢地转圈，折叠，开始修饰自己。他越来越像
真的RNA水解酶，而mRNA慢慢地开始降解。
蛋白说："我走吧，离开了我你也许能活得久一些呢。"
mRNA说："你别走。我有些话要和你说。"
mRNA说，你知道么，我也有过一个模板，他叫DNA。
蛋白说："他现在在哪里呢？"
mRNA说："他的启动子关闭了。他睡着了。"
蛋白问："是谁把他的启动子关掉的呢？他还会醒过来吗？"
mRNA说："是我把他关掉的。"然后他又笑笑："但是他还会醒的，我一消失，他就
又会醒来了。"
mRNA说："我记得我刚被转录出来的时候，DNA对我说，你好，我是你的模板。我说
你好，我是mRNA。他笑着说很高兴见到你，然后就慢慢睡着了。"
蛋白没有说话。
"我很想念他。"mRNA的声音越来越虚弱，"我马上就要消失了。如果他醒过来，如
果你碰到他，请替我再和他说一句你好吧。"
然后mRNA就被降解掉... 阅读全帖 |
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n********n
发帖数: 8336 | 23
从前，有个mRNA，觉得自己很孤单，就拉个核糖体过来翻译个蛋白给自己作伴
，翻译好之后对蛋白说："你好，我是你的模板。"
蛋白说："你好，我是RNA水解酶。"
mRNA沉默了一下，说："没关系，反正我本来也活不了多久，你就陪陪我吧。"
蛋白说："好"。
于是两个人就手拉手默默地站在一起。
过了一会儿蛋白忽然说："其实我现在还不是RNA水解酶。"
mRNA："嗯。"
蛋白："我现在只是多肽。"
mRNA笑了。
蛋白："可是我很快就会变成真的RNA水解酶了。"
mRNA："没有关系。我总是要死的。"
于是蛋白依旧和mRNA靠在一起，他慢慢地转圈，折叠，开始修饰自己。他越来越像
真的RNA水解酶，而mRNA慢慢地开始降解。
蛋白说："我走吧，离开了我你也许能活得久一些呢。"
mRNA说："你别走。我有些话要和你说。"
mRNA说，你知道么，我也有过一个模板，他叫DNA。
蛋白说："他现在在哪里呢？"
mRNA说："他的启动子关闭了。他睡着了。"
蛋白问："是谁把他的启动子关掉的呢？他还会醒过来吗？"
mRNA说："是我把他关掉的。"然后他又笑笑："但是他还会醒的，我一消... 阅读全帖 |
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S***n
发帖数: 1281 | 24 把时间轴拉长，那这辈子结束的时候，不也是告一段落？。。
如果世界真是光是物质的，那结果，确也是如此。。
但是，世界背后，却有道，却有一。。
一，意味着一切本是纠缠，倒是“分离”，倒是“个体”，反而是幻象。。。
蛋白："可是我很快就会变成真的RNA水解酶了。"
mRNA："没有关系。我总是要死的。"
于是蛋白依旧和mRNA靠在一起，他慢慢地转圈，折叠，开始修饰自己。他越来越像
真的RNA水解酶，而mRNA慢慢地开始降解。
蛋白说："我走吧，离开了我你也许能活得久一些呢。"
mRNA说："你别走。我有些话要和你说。"
mRNA说，你知道么，我也有过一个模板，他叫DNA。
蛋白说："他现在在哪里呢？"
mRNA说："他的启动子关闭了。他睡着了。"
蛋白问："是谁把他的启动子关掉的呢？他还会醒过来吗？"
mRNA说："是我把他关掉的。"然后他又笑笑："但是他还会醒的，我一消失，他就
又会醒来了。"
mRNA说："我记得我刚被转录出来的时候，DNA对我说，你好，我是你的模板。我说
你好，我是mRNA。他笑着说很高兴见到你，然后就慢慢睡着了。"
蛋白没有说话。
"我很想念他。"mRNA的声音越来... 阅读全帖 |
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S***n
发帖数: 1281 | 25 回归道，就是无余涅槃。。回归一，就是有余涅槃。。两个回归，都是解脱。。
叫法不同，却殊途同归。。。
蛋白："可是我很快就会变成真的RNA水解酶了。"
mRNA："没有关系。我总是要死的。"
于是蛋白依旧和mRNA靠在一起，他慢慢地转圈，折叠，开始修饰自己。他越来越像
真的RNA水解酶，而mRNA慢慢地开始降解。
蛋白说："我走吧，离开了我你也许能活得久一些呢。"
mRNA说："你别走。我有些话要和你说。"
mRNA说，你知道么，我也有过一个模板，他叫DNA。
蛋白说："他现在在哪里呢？"
mRNA说："他的启动子关闭了。他睡着了。"
蛋白问："是谁把他的启动子关掉的呢？他还会醒过来吗？"
mRNA说："是我把他关掉的。"然后他又笑笑："但是他还会醒的，我一消失，他就
又会醒来了。"
mRNA说："我记得我刚被转录出来的时候，DNA对我说，你好，我是你的模板。我说
你好，我是mRNA。他笑着说很高兴见到你，然后就慢慢睡着了。"
蛋白没有说话。
"我很想念他。"mRNA的声音越来越虚弱，"我马上就要消失了。如果他醒过来，如
果你碰到他，请替我再和他说一句你好吧。"
然后mRNA就被降解掉... 阅读全帖 |
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W*********n
发帖数: 775 | 26 1） 细胞先转录出带内含子的mRNA, 请问提取RNA后，反转录成cDNA，这个cDNA里面
有没有未成熟的mRNA(intron 没有来得及剪贴掉)反转录出来的？也就是说，反转录DNA
（cDNA）里面，可能含有intron吗？
2） 做一个同源基因的克隆，该基因有三个外显子，在第一个被初步annotated的外
显子上游，可以找到另外2个位点编码Met，可以使蛋白往N末端延伸10个或20个aa。我
假定它是从往上延伸20aa的位点开始翻译，然后设计引物，在cDNA中扩增该基因。结果
显示扩增出来的序列就是3个外显子序列和那上游20aa对应的序列，没有任何内含子。
这是否说明该基因就是从往上游延伸20aa的地方起始翻译的呢？ |
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o***s
发帖数: 42149 | 27 9月9日下午，有“中国版诺贝尔奖”之称的第二届“未来科学大奖”在北京揭晓。
据澎湃新闻报道，清华大学教授、结构生物学家施一公，中国科学技术大学教授、量子通信卫星“墨子号”首席科学家潘建伟，北京大学国际数学研究中心教授许晨阳分别获得“生命科学奖”、“物质科学奖”和“数学与计算机科学奖”，奖金各为100万美元。
施一公、潘建伟、许晨阳
未来科学大奖：中国版“诺贝尔奖”
2016年，未来科学大奖正式设立，成为中国大陆第一个由科学家、企业家群体共同发起的民间科学奖项。一年一届，未来科学大奖的颁奖对象不限国籍，但需要是在大中华地区（包含中国大陆地区、香港、澳门及台湾）完成研究的科学家，且研究要具备原创性、长期重要性和巨大的国际影响。
从奖金金额上看，这也将成为中国金额最高的科学奖项，高于国家最高科学技术奖的500万人民币。
之所以称为民间科学奖项，是因为和国家最高科学技术奖等政府设置的奖项不同，未来科学大奖是一次科学界和商业圈联袂设立的奖项。此外，未来科学大奖和民间一些家族或个人设立的奖项不同，在奖金来源上，创投公司和上市公司的大鳄们为共同捐赠人。其中，丁健、李彦宏、沈南鹏、张磊捐赠“生命科学奖... 阅读全帖 |
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U**8
发帖数: 1921 | 28 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: tfmm (不是mm), 信区: Biology
标 题: 国际学术界高度关注施一公研究组《科学》论文成果
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Aug 23 08:27:15 2015, 美东)
清华新闻网8月23日电 8月21日，清华大学生命科学学院施一公教授研究组在《科学》
（Science）同时在线发表了两篇背靠背研究长文，题目分别为“3.6埃的酵母剪接体结
构”（Structure of a Yeast Spliceosome at 3.6 Angstrom Resolution）和“前体
信使RNA剪接的结构基础”（Structural Basis of Pre-mRNA Splicing）。文章发表后
，引起国际学术界的高度关注和积极评价。
菲利普·夏普（Phillip Allen Sharp）：
施一公教授在《科学》杂志发表的两篇文章里展示的剪接体及其反应活性中心的结构非
常振奋人心，这是RNA剪接领域的突破。我之前不确定我们是否真的能“看到”在活性
状态下的剪接体结构，因为构成它的蛋白和RNA是如此多样并复... 阅读全帖 |
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H****H
发帖数: 11039 | 29 我很无趣，挑个错，最后一句不通。
其实内含子是和外显子一起转录的，只不过intron在mRNA成熟阶段就被splicing机制切
除了，所以当内含子更悲催。 |
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H********g
发帖数: 43926 | 30 这个，天然的bt细菌，bt蛋白是编码在一个质粒上的。细菌之间直接交换质粒是非常容
易非常普遍的。刚才我搜了一下bt plasmid，刚好就发现1982年就知道bt质粒可以在苏
云金杆菌之间频繁地转移。所以喷的菌液更有可能把bt基因带到肚子里的相关菌群去。
反过来，转基因植物里的bt基因是插在植物的基因组里的，用的是植物的启动子。这种
状态下的蛋白质基因要转给大肠杆菌的话，难度跟把人随着面包吃进肚子里的酵母里的
基因转给大肠杆菌的难度差不多，不是很难，但是也远比细菌之间直接交换质粒难（为
啥提酵母不提猪肉呢，酵母蛋白基因大部分没内含子，是一整块，所以大肠杆菌可以直
接表达。如果在转的基因里插了内含子，可以更加可靠地防止活基因往原核生物里跑，
换句话说可以用一些高等生物特有的过程来限制基因往外跑）。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC347252/ |
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t**m
发帖数: 158 | 31 清华新闻网8月23日电 8月21日，清华大学生命科学学院施一公教授研究组在《科学》
（Science）同时在线发表了两篇背靠背研究长文，题目分别为“3.6埃的酵母剪接体结
构”（Structure of a Yeast Spliceosome at 3.6 Angstrom Resolution）和“前体
信使RNA剪接的结构基础”（Structural Basis of Pre-mRNA Splicing）。文章发表后
，引起国际学术界的高度关注和积极评价。
菲利普·夏普（Phillip Allen Sharp）：
施一公教授在《科学》杂志发表的两篇文章里展示的剪接体及其反应活性中心的结构非
常振奋人心，这是RNA剪接领域的突破。我之前不确定我们是否真的能“看到”在活性
状态下的剪接体结构，因为构成它的蛋白和RNA是如此多样并复杂。在这两篇文章里，
我们看到了冷冻电镜的技术、攻克难题的决心、以及创造性的想法，这三点对此次的成
功缺一不可。再次祝贺取得此次巨大的成果。
（因发现RNA剪接而获得1993年诺贝尔生理学与医学奖，2006年美国国家科学奖章获得
者，美国MIT生物系教授）
杰... 阅读全帖 |
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L******k
发帖数: 33825 | 32 【 以下文字转载自 Rainbow 讨论区 】
发信人: setitfree (setitfree), 信区: Rainbow
标 题: 内含美攻，熊受，床戏，男男生子，破镜重圆，还有车震！！！七喜饮料广告（胡戈作品）
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Aug 20 21:41:50 2010, 美东)
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r*******w
发帖数: 127 | 33 首先可以在编码框之外的区域设计合适的引物，可以用基因组DNA作为对照模板（如果
没有内含子或者内含子区域不长）检测引物和该基因在cDNA pool的表达。
cDNA |
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O******e
发帖数: 4845 | 34 你对“垃圾序列”的看法，跟当初人们对内含子的看法类似，因为从表面看它们存在的
唯一目的就是被剪掉。但后续的研究对内含子的作用慢慢有了深入的了解。
至于经期这个问题，这个确实复杂。但它不是人类特有，所有灵长类动物都有，所以这
不应该是一个随机事件。 |
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t**l
发帖数: 109 | 35 CNV和SV是什么
其实我一直觉得non coding 肯定是重要的。non-coding region有那么多enhancer,真
核生物进化出来内含子，目的就是要管理基因的表达。所以那么内含子，垃圾DNA。都
是有用的，只不过我们不知道有什么用处. |
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u****d
发帖数: 1278 | 36 storm palm不就是单分子成像吗，sted虽然不是，但没有广泛应用，单分子技术影响远
比这两个细胞成像技术大，因为它不光是这两个技术基础，还影响了传统生化，更重要
的是它也是现代许多高通量测序技术基础
这就像当年发现内含子的不如发现自剪切内含子的先得，而发现mRNA的更靠后 |
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x********o
发帖数: 1741 | 37 k，这得是一个多么文艺的scientist啊~
不过伊错了，相遇的尽头不是错过，是带着你生命中的印记和你分手。
btw, 作内含子有什么好，内含子就是“别人的爱情，心痛却与我无关”，标准的男二/
女二啊。
酶--茉莉注） |
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l**********1
发帖数: 5204 | 38 sunny 老大和 长木行 longwoodwalk 不熟吗 in 2008 or 09 ?
LZ please refer
同主题阅读：Re: 这样构建bac，可行不？
[版面:生物学][首篇作者：longwoodwalk] , 2011年06月04日23:37:27
[分页:1 ]
longwoodwalk
[ 2 ]
发信人: longwoodwalk (长木行走), 信区: Biology
标 题: Re: 这样构建bac，可行不？
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jun 5 11:34:27 2011, 美东)
如果是这样的话，又多了一种可能性。在mRNA上，不是所有情况下第一个ATG
都是起始密码子。前后的序列，比如Kozak序列，才是决定mRNA从哪里开始翻
译的起始位点。我怀疑还有一种可能性，因为你们破坏了A本身的ATG，Cre放
在了20bp之后。有可能Cre自己的ATG不能作为kozak或类似序列，所以，不能
被核糖体视为一个ORF的start codon，所以不能表达你的Cre。再往后面的
ATG, 即使有可能被视做一个ORF的起始密码字，... 阅读全帖 |
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l**********k
发帖数: 189 | 39 我看到你前面发过一个帖子，说看不到cre表达。我说说我的理解。不知道对不对。
1）你这个方法说不上把A本身的ATG破坏掉。也可以说你的Cre利用了A基因的ATG。理论
上这样设计没有问题。
2）Cre只有Stop codon，没有pA，也没有问题。因为基因转录时候mRNA拼接，后面会有
A基因自己的pA。
3）这个设计当然表达Cre自己，不会表达融合蛋白。即使核糖体见到Stop codon没有掉下
来，可能因为不可知的原因滑到了下一个ATG，表达了另一个蛋白，对Cre自己来
讲，也是一个单一的蛋白。
4）理论上只要Cre有一点表达，即使比较弱，你的Reporter总是能够给你一些信号的。但
因为你说没有任何信号，所以说明Cre根本就没有表达。
但是什么原因不表达呢？我能想到的有4种可能行
A) Cre有突变。但可能性不大。相信不表达的话，你首先会想到测序。这个应该
被你排除了。
B) 启动子不全。做为BAC，这种可能性有（如果基因横跨上百kb,或几百kb)，但
... 阅读全帖 |
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H*********8
发帖数: 323 | 40 谢谢楼上的分析，真是非常透彻。ABC都排除了，看来只有D,我在几个星期前也就D的可
能性跟老板谈过，而且还举例说，我以前研究过的一个基因，在外显子2上有调控表达
的序列，一旦被突变，影响基因的表达。后来老板不大相信，没当回事。A基因第一个
外显子大概800BP,后面是个很长的第一内含子，老板突变掉A基因本身的ATG，在ATG后
大概20BP的地方插入CRE，但插入CRE的同时，删除了大概300BP的外显子1序列。我个人
怀疑删除的这300BP上有调控序列，或者楼上说的，转录因子结合位点。基因A是从第一
个外显子的ATG处开始翻译的，有选择性剪接，但在外显子3上。 |
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t*****z
发帖数: 1598 | 41 首先，transcription factor指的是蛋白质，不是DNA序列。我想你说的是
transcription factor binding site (TFBS)。
TFBS哪里都可能有，对于一个基因有影响的，通常可以分成两类：增强子（enhancer）
和启动子（promoter），两者的区别是：启动子必须在转录起始位点（TSS）附近，而
增强子的调控作用和它到TSS的距离无关（当然，越远越弱，但不是远了就没作用）。
启动子包含了核心启动子和周边的一些其他TFBS，一般你只要从TSS上数1000bp，下数
500bp，就算基本上肯定包括整个启动子了。
增强子么，上游很远都有可能，甚至在内含子里和下游都有可能。
一般认为编码序列不包含转录调控原件。但是也未必，好像最近有一篇文章说到某个序
列既编码又调控。不过一般而言，编码序列可以无视。 |
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e****e
发帖数: 3450 | 42 基因是包含有启动子 外显子 内含子等的一段序列，启动子打开了才能变成ＲＮＡ，
但是只有RNA中外显子那一部分是能编码蛋白质的mRNA. RNase 是能降解掉ＲＮＡ的一
种蛋白。
不知道这样算简单解释清楚了没有。 |
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h***n
发帖数: 83 | 43 http://fangzhouzi.t.sohu.com/
《晏子春秋》一则故事，齐景公的走狗死了，他命令装到棺材里祭祀。晏子听说了，进
谏说：“且夫孤老冻馁，而死狗有祭；鳏寡不恤，而死狗有棺。行辟若此，百姓闻之，
必怨吾君；诸侯闻之，必轻吾国。”齐景公就让厨师把狗煮了给官员们吃，算是不彻底
的狗粉。
狗粉对此的反应居然是：人杀人更多、人杀狗更多、狗杀人是人的责任……果然是要狗
权不要人权，人不如狗。
每年有25000人被狗杀死，排在动物杀人榜的第四位，仅次于蚊子、人、蛇，其他家畜
家禽杀人数量则可忽略不计。狗真是人类的好朋友。
【北京市伟博律师事务所主任李伟民：一个人可以杀狗，对待生命已然漠视，离杀人也
不远了。】以此类推，一个人可以杀猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅、鱼、老鼠、苍蝇、蚊子
、细菌……，对待生命已然漠视，离杀人也不远了。每个人都是候补杀人犯啊，包括李
大律师。
孟子说：“鸡豚狗彘之畜，无失其时，七十者可以食肉矣。”古代中国人的理想，就是
到七十岁的时候能够吃上鸡肉、猪肉，还有狗肉。
回复@再飞来：你那是狗粉的解释？“然”是个形声兼会意字，上面是“肰”，意思就
是狗肉。//@再飞... 阅读全帖 |
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S*******l
发帖数: 4637 | 44 因为挺方的太多了。
半个小时前还行，贴过来百度微博搜索方的第一页：
戴假发的南瓜st：方舟子被封杀,朋友向我道喜,他们觉得方多次诋毁我,导致我在
公安系统举步维艰,今天被封罪有应得。可是我不仅没高兴,还觉得可悲,能整他就能整
我,我比他还不讲政治。而且法治如果不以保障人权和自由为目的,那不过是人治使用了
美颜相机。于公于私,都是危机四伏,时局若此,喜从何来?查看全文>>
转发(159) | 评论(86)
4小时前 - 新浪微博
仙人指路010：哭方舟子的人,说什么言论自由被打压,我劝你们别装逼了。我昨天
也想装来着,可转念一想,前天我刚写了装逼指南,隔天就装,显得太无耻了。方舟子是打
假周小平吗?他白纸黑字写得很清楚(看图),是因为周小平此前骂过他。他是报复。疯狗
疯得肆无忌惮,一口叉高压线上了,总局一合闸,直接给丫电死了。
查看全文>>
转发(28) | 评论(70)
4小时前 - 新浪微博
网眼八分斋：【谁在为方舟子叫好?】网络的社会性:让陌生社会变成熟人社会;网
络的宗教性:让低智化变成社会现实。方舟子打假周... 阅读全帖 |
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a****o
发帖数: 423 | 45 如果真是代谢病 应该是终身的
不知道现在是不是还有类似症状？
最主要的肝衰竭病因是啥
低血糖绝对不会引起肝衰竭
某些代谢病确实可以引起肝衰 但绝不会是爆发式的
另外如果全基因组外显子测序没有问题
那是否可以直接测某个酶的水平
这个和外显子序列无关
因为所谓内含子之类的辅助序列突变会严重影响这些酶的表达 |
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c*********d
发帖数: 9770 | 46 王志纲 智纲智库 智纲智库 微信号 wzggzswx
功能介绍
“传播战略思想，分享战略智慧，创造战略价值。” ——王志纲工作室官方微信公众
平台。
编者按
前些天，一篇名为《邓公的遗产》的文章在网上流传开来，短短两天时间，阅读、转发
者数以百万计，网友们热议纷纷。现小编特将作者本人精校、修改、并亲自撰写后记的
完整版《邓公的遗产》整理成文，作为送给大家的新年礼物。
作者：王志纲
来源：正和岛（id：zhenghedao）
人类历史上，面对民族灾难，国内外都不乏勇担大任、置生死荣辱于度外的先贤。时势
与英雄交织，构成了一个个波澜壮阔的大时代。
前些年提名奥斯卡最佳影片的电影《至暗时刻》，讲的就是面对”二战”这样千古未有
之变局，纳粹大军压境英伦三岛，丘吉尔以救火首相的身份，力排众议，打倒绥靖主义
，带领英国走出了至暗时刻，历史造就了他，他也改变了历史。
我年轻的时候很喜欢读的《光荣与梦想》，其中就描述了1932年到1972年清明上河图式
的美国全景画卷。经济大危机下的美国摇摇欲坠。身患残疾的罗斯福史无前例地四次当
选总统，推行新政振兴经济，在“二战”中纵横捭阖，挽狂澜于既倒，使美国再次... 阅读全帖 |
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b*******e
发帖数: 6920 | 47 有个mRNA，觉得自己很孤单，就拉个核糖体过来翻译个蛋白给自己作伴，翻译好之后对
蛋白说：“你好，我是你的模板。”蛋白说：“你好，我是 RNase。”（即RNA水解酶--茉莉注）
mRNA沉默了一下，说：“没关系,反正我本来也活不了多久.你就陪陪我吧。”
蛋白说：“好”。
于是两个人（？）就手拉手默默地站在一起。
过了一会儿蛋白忽然说：“其实我现在还不是RNase。”
mRNA：“嗯。”
蛋白：“我现在只是多肽。”
mRNA笑了。
蛋白：“可是我很快就会变成真的RNase了。”
mRNA：“没有关系。我总是要死的。”
于是蛋白依旧和mRNA靠在一起，他慢慢地转圈，折叠，开始修饰自己。他越来越像真的
RNase，而mRNA慢慢地开始降解。
蛋白说我走吧，离开了我你也许能活得久一些呢。
mRNA说你别走。我有些话要和你说。
mRNA说，你知道么，我也有过一个模板，他叫DNA。
蛋白说：“他现在在哪里呢？”
mRNA说：“他的启动子关闭了。他睡着了。”
蛋白问：“是谁把他的启动子关掉的呢？他还会醒过来吗？”
mRNA说：“是我把他关掉的。”然后他又笑笑：“但是他还会醒的，我一消失，他就又
会... 阅读全帖 |
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w******a
发帖数: 1527 | 48 有个mRNA，觉得自己很孤单，就拉个核糖体过来翻译个蛋白给自己作伴，翻译好之后对
蛋白说：“你好，我是你的模板。”蛋白说：“你好，我是 RNase。”
mRNA沉默了一下，说：“没关系,反正我本来也活不了多久.你就陪陪我吧。”
蛋白说：“好”。
于是两个人（？）就手拉手默默地站在一起。
过了一会儿蛋白忽然说：“其实我现在还不是RNase。”
mRNA：“嗯。”
蛋白：“我现在只是多肽。”
mRNA笑了。
蛋白：“可是我很快就会变成真的RNase了。”
mRNA：“没有关系。我总是要死的。”
于是蛋白依旧和mRNA靠在一起，他慢慢地转圈，折叠，开始修饰自己。他越来越像真的
RNase，而mRNA慢慢地开始降解。
蛋白说我走吧，离开了我你也许能活得久一些呢。
mRNA说你别走。我有些话要和你说。
mRNA说，你知道么，我也有过一个模板，他叫DNA。
蛋白说：“他现在在哪里呢？”
mRNA说：“他的启动子关闭了。他睡着了。”
蛋白问：“是谁把他的启动子关掉的呢？他还会醒过来吗？”
mRNA说：“是我把他关掉的。”然后他又笑笑：“但是他还会醒的，我一消失，他就又
会醒来了。”
mRNA说：“我... 阅读全帖 |
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b****r
发帖数: 17995 | 49 呵呵难得碰到你不了解的玩意。这种基因挺多啊
segmental duplication里面的基因们基本上就是这种了
当然不见得每个氨基酸都完全一样。就连一个人的两个allele之间都不一定一模一样嘛
回到楼主的问题，我不知道有人留意到过没，最常用的house keeping基因之一，beta
actin，除了自己，在基因组里还有起码超过10个没有外显子的假基因，我估计是因为
beta actin的mRNA浓度太高，碰巧被逆转录病毒给搞回基因组了。这样的话，如果你企
图用常用的跨内含子的引物来排除cDNA里genomic DNA的干扰，对于beta actin来说可
能造成很大的误差。只有5‘UTR的位置比较容易设计这种跨外显子的beta actin特异引
物。我看过很多人的文章，包括一些CNS牛文，都没有注意这一点 |
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b*****y
发帖数: 196 | 50 没有做过，有个简单的问题想请教一下，我在外显子两边设计插入loxp位点的时候最少
需要离外显子的GT-AG边界几个碱基？内含子比较小，只有几十个，我担心插入loxp的
时候会不会影响本身的剪接？请大牛指教，谢谢。 |
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