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n********k
发帖数: 2818 | 2 well, u'd better establish that Cre doesn't pose toxicity in your system
first...it seems trivial but I think many
studies in the literature could be resulted from Cre-phenotype:)))...I
personally prefer Cre/Cre F/+ versa F/+
breeding...that way u can everything...and u could unexpectedly notice hez
phenotype too...And I see I might
kill a MS if they don't show this cre control esp when the phenotype is
subtle and cell death related... |
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c**a
发帖数: 94 | 3 一组4个条件,分别是
1, 不给药
2, 给药
3, 在另一条件下,不给药
4, 在与3同样条件下,给药
想知道, 1和2之间, 3和4之间, 1和3之间有没有显著差异.
用什么?
1-way ANOVA+ Bonferroni?
另外一种情况,
数细胞个数, 2种条件(给药和不给药), 每个条件下有2个phenotype(方的圆的), 所以一共4个数据,
想比较同种phenotype, 在给药和不给药之间的不同.
用什么?
t test?
还有一个情况,类似上面
6个条件,每个条件4种phenotype, 一共24个数据, 相互比较. 用什么?
1-way ANOVA?
快崩溃了... |
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D*a
发帖数: 6830 | 4 你这种情况是+/0， +/-是非常错误的写法。
没必要测背景情况，你测一堆snp又能说明什么？你又不是要写哪个snp跟哪个
phenotype有关系。20只不少了，没有phenotype就是没有phenotype了，不会是背景的
问题。就算是背景的问题你也不能把一顿有tendency的数据都归结到背景上，基本上就
可以换project了。否则只要significant，就算reviewer非要说背景问题，你也可以回
答得了。
我知道很多做转基因的想要换背景，也是backcross两到三代就开始实验的，之后重复
重复看看吧，没有人等到20代才正式开始做实验的。 |
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m*****n
发帖数: 760 | 5 we want to determine if the phenotypes of the transgenic animals
are specifically caused by GFP-GOI transgene.
if by knocking down GFP-GOI transgene only, but not endougeneous GOI,
the phenotypes are gone or less severe, then we are more confident that
ectopic expression of GOI induces the phenotypes. |
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p*****m
发帖数: 7030 | 6 今天无厘头ametuer journal club下。。很神的paper
http://www.cell.com/abstract/S0092-8674%2810%2901133-5
很神奇的paper...第一眼我还没明白为啥一片果蝇paper可以有17个机构42个作者 等我
扫了一眼figure就全明白了...
简单来说就是 这票人首先在果蝇里搞了个很简单的行为范式看果蝇对heat的逃避反应
（可以间接的反映nociception 痛觉），然后做了个>10000 RNAi line的screen，找到
些许mutant，挑了一个叫straightjacket看了看expression,也看了看其他种类的行为
，然后声称，自己发现了个新的种类的参与nociception behavior的gene。(PS 这个
gene straightjacket名字咋来的？原来伊之前被发现参与了突触结构的调节，该基因
mutant会表现出seizure-like phenotype，简单说就是癫痫了。。于是作者们可能就根
据这个给它起了个“约束带”的名字 就跟一个癫痫病人被绑在床上差不多。。此为... 阅读全帖 |
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e*****t
发帖数: 642 | 7 任何有现代生物学概念的人，也不会认为bioinfo会萎缩。
很多东西是有软件用，不需要编程技巧。但是编程永远是高于软件使用，因为编程有很
高的flexibility.
就拿你说的qtl为例。我们实验室有一堆以前做的phenotype and genotype,做diabetes
qtl mapping. 但是这个phenotype有一些特别，不是正态分布.linkage study中，主
要都是linear model来建立模型，都要求phenotype是或者接近于正态分布。这个数据
是right-censored,属于survival studies.目前还没有任何软件可以做semi-
parametric survival studies in qtl mapping. 我们实验室的人都没辙了，我们老板
就招了我。其实也不难，就是用R 的一个package，轻松搞定.
生物技术在evovle,数据复杂度也在evolve |
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c******r
发帖数: 3778 | 8 具体的实验背景不是很了解，所以瞎说几句，错了概不负责哦
你说的第一种情况确实比较简单。只要array就可以了。当然也取决于你的A基因是什么
。如果是个transcription factor，可以做oligo array。如果是个kinase也可以做
phosphoprotein array。这完全取决于你的具体情况。数据分析也比较简单，因为因已
经知道了，所有发生的都是果，只需要知道这个果的cascade就可以了。
你说的第二种情况就比较复杂点，但是也不是不可解决的。我不太理解你没有
manipulation那么哪里来的phenotype，不过假定你完全不知道这个manipulation，那
么当你做array或者其他screen的时候，你发现的改变可能是这个phenotype的因，也可
能是这个phenotype的果。但无论如何，通过screen你可以把这个可能基因的list缩小
到几十甚至十几个。这个时候可以再在这个list里面二次screen。这时候由于比较有限
的范围，就可以直接siRNA或者overexpression啥的，看你发现的情况来决定了。
如果你说具体点儿，班上热... 阅读全帖 |
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D***y
发帖数: 693 | 9 如果研究signal transduction pathway B
如果gene A activates pathway B, let's say in 1 hrs. but gene A could
possibly activates other unknown pathways. Treating cells with A leads to a
certain cell phenotype.
knockdown an essential component of transduction pathway B blocks this
phenotype induced by A.
Can I say that the cell phenotype induced by A is due to activating this
transduction pathway? |
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h*******o
发帖数: 4884 | 10 同意
但是这里given 后面的that 不能省略,或者把后面改成短语也行
Given/Considering the dichotomous role of XXX in regulating the
susceptibility of A and B, we would predict that knockdown of XXX in A or
overexpression of XXX in B results in a similar phenotype.
另外,除非楼主上下文里面提到了另外一个phenotype,并且想表达 knockdown of XXX in A or overexpression of XXX in B能够产生相反的phenotype, 否则楼主的原句有歧义. 如果是在这种假设情况下, 用reverse是可以的.
A |
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z****u
发帖数: 1007 | 11 多谢楼上分享。看来只是技术还不成熟，暂时不available.
我以前读一些paper,说RNAi knockdown 对老鼠的问题在于transgenic mice对于
heterozygou 非常耐受，就是说knockdown 50%都不会有明显phenotype. 而RNAi 在体
外也就70% 的knockdown, 所以构建transgenic line没啥phenotype,不知道是不是这个
原因以前一直没有line 出来。
我做transgenic RNAi老鼠主要目的是研究成体的KO phenotype.当然，reversible也是很重要的原因。 唯一办法就是构建XXX
-rtTA；teto-shRNA 来在成体knock down. |
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a*****g
发帖数: 543 | 12 More trouble than KO
1) efficiency is variable.
2) when you get efficient knockdown and beautiful phenotype, the interpretat
ion is much more complicated。
“Gene A knockdown causes developmental defects?”
while the more accurate discription will be "a short nucleotide targeting ge
ne A (and MANY OTHER GENES!) causes phenotype."
Given the time and money spent to generate a mouse model, the RNAi-in vivo s
ystem is not worth it...
Plus there is an international effort to produce conditional knockout... 阅读全帖 |
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F******p
发帖数: 2099 | 13 If phenotype is only seen in homozygous then mixed genetic bacgound is fine.
However the phenotype is only seen in heterozygous mice, this complicated
the issue. you better explain it in a gain-of-function way and use knockout
mice as control.
see
phenotype
of |
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u*********1
发帖数: 2518 | 14 不晓得大家有没有看这个文章：
http://www.cell.com/abstract/S0092-8674%2812%2900166-3
Personal Omics Profiling Reveals Dynamic Molecular and Medical Phenotypes
Michael Synder在14个月内各种genomics，transcriptome，proteomics，
metabolomics的数据叠加起来，最后准确的预测了他要得糖尿病
我觉得只要：
1.DNA测序技术本身质量足够高（比如更加准确，read更加长），价格足够低；那么需
求量会越来越大。你看几年前exome sequencing还是不多；而现在成百上千的exome
sequencing都满天飞了。DNA测序可以解决genomics和transcriptome这两样最重要的
omics
2.搞清楚这些sequences到底干啥的。coding protein到底什么作用；noncoding区域
regulatory function（比如ENCODE project），以及这些regulato... 阅读全帖 |
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s****9
发帖数: 932 | 15 你要求太高了。已经做了Chip－seq发现bind很多 adipocyte-specific genes，还比较
了和PPARg binding motif overlap。
文章找到一个tissue specific transcription factor。KO和overexpression都有
phenotype，phenotype还是和fat development相关的，临床意义很强。还做了chip－
seq发现bind tissue specific genes 还和已知的 master regulator binding region
重合。很strong了。太多的CNS有个比较强phenotype却没什么explanation的。
一座的还是个中国人。不知道会不会上网和你argue一下。这个放在Cell或者Nature中
，质量也是上等的。 |
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u*********1
发帖数: 2518 | 16 你做生物的人，难道不知道连身高这种最简单的phenotype也是上百个基因相互作用的
结果吗？
人的性心理是个极端复杂的性状，谁告诉你是单基因遗传了？
卷头发的爹生的儿子一定卷头发？左撇子的妈生的儿子一定是左撇字？
如果真的存在同性恋基因，或者更严格的说是各种homosexutiality-determining loci
，这么多不同的loci当然必然是通过有性生殖来遗传，但通过极端复杂的排列组合以及
interaction，自然是未必都产生phenotype出来
严格的说，你想通过基因/genetics来攻击同性恋，麻烦你先解释清楚如何用genetics
来解释complex phenotype
更不要说，以上是基于genetics的假说。同性恋倾向也完全可能是后天影响的结果；（
蠢货们和基督徒们不要看到后天/acquired behavior就要高潮）。。纵然是后天，那也
是在第二性征出现之前就决定了的human nature，你无法改变，更无需改变
reproduction |
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D*a
发帖数: 6830 | 17 所以说片面的说某种phenotype只要不能产生后代就会很容易被进化消灭了（从而推出
来某种phenotype至今存在是因为乱性好传播自己的基因），是很无知的说法。因为有
的phenotype连传播自己的基因的机会都没有，还是没有被进化消灭了。 |
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g***n
发帖数: 14 | 18 小弟我研究的是寄生线虫。我的课题基本是找一个phenotype的相关基因。
我手上有两个wildtype (A和B)，phenotype在这两个wildtype之间的表型非常不一样，
A为0%，B为100%
用A做突变体，筛了几个phenotype在30%-40%之间的突变体。
然后对全基因组测序，拿到差异snps
请问有什么方法可以确定最有可能的基因或者最有可能的snps吗？
急等毕业，可是本来做数据分析的合作者换工作跑路了，指望不上了。
求教各位指点一下后续分析的方法，小弟在此拜谢了！ |
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l**********1
发帖数: 5204 | 19 Before NGS 2.0 or 3.0 Illumina platform can read enough longer different
isoforms within Exome sequencing and systems biology aspect,
it is still elusive to answer the linkage between SNP2.0 or 3.0 alternative
splicing with
syndromic disease...
Pls check,
>Although previously described in TS, no CACNA1C mutations have been
reported for
>non-syndromic LQTS. With our functional studies confirming Cav1.2 gain-of-
function as the cellular basis for the CACNA1C mutation-positive patient’s
LQTS pheno... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 20 Before NGS 2.0 or 3.0 Illumina platform can read enough longer different
isoforms within Exome sequencing and systems biology aspect,
it is still elusive to answer the linkage between SNP2.0 or 3.0 alternative
splicing with
syndromic disease...
Pls check,
>Although previously described in TS, no CACNA1C mutations have been
reported for
>non-syndromic LQTS. With our functional studies confirming Cav1.2 gain-of-
function as the cellular basis for the CACNA1C mutation-positive patient’s
LQTS pheno... 阅读全帖 |
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f**u
发帖数: 346 | 21 谢谢包子。
要搜dominant phenotype，你可以在flybase主页输入*，然后再点gene，就拿到所有果
蝇的基因列表。如果第一个字母是大写，说明有dominant phenotype，如果是小写，就
是recessive.CG和CR开头的基因可以忽略不计。
还有就是有些基因有dominant的allele，也有recessive的，所以最好是搜allele。你
可以在主页搜索栏里面选phenotype，然后住搜索栏输入visible,再在那个refinement
里面选dominant。 |
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x********e
发帖数: 35261 | 22 你自己用果蝇做一个inbreed的实验就知道了
如果是balancer chromosome over wt，要不了几代balancer就会丢。balancer不丢的只
有over lethal或者infertile的基因。不过这种stock也会积累让果蝇不那么sick的bac
kground mutation
phenotye就是phenotype，疾病不过是人为定义的影响正常生活的phenotype。果蝇眼睛
都没了还不活得好好的，那你到底算这是phenotype还是病呢？
嘛，反正你认定了你的理论就说别人的都是错误的。那还来装模作样问毛啊。不过想法
跟大部分人相左的不是天才就是脑残，你可以考虑下你是哪种。 |
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T****i
发帖数: 15191 | 23 混沌理论，分形几何，耗散结构论，都是二战后出现的理论，建立者应该是最高级的。
生物学从博物学开始算，能上第一级的就没几个。
我不认为生物学的最大问题是数据不够。大数据的想法本质上还是插值的想法，适合线
性和简单polynomial问题。而非线性系统想做插值运算，难度很大。 生物系统很可能
是非线性系统很多问题还可能是NP hard 问题。没有好的理论指导，有时都无法分辨那
些是有用的数据那些是噪音，也就不能从数据里得到好的结论。比如癌症领域一大堆
association study，有用的结论没多少。这么多年的omics研究，最成功的也就是
phenotype/genotype correlation一类的，也就是生物体黑箱的两端，中间还得靠一点
一滴做。至于interactome，有很多noise。
把生物体比作黑箱，黑箱两端（gene/allele 和phenotype）好办。中间的某些可以局
部分离的问题，比如信号通路，比如secretory pathway，也可以近似为一环扣一环，
线性的，也还好办。而黑箱中间很多过程（比如大多数miRNA功能，信号通路的整合，
细胞之间的通讯... 阅读全帖 |
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d******1
发帖数: 709 | 24 【 以下文字转载自 Boston 讨论区 】
发信人: santa2009 (santa), 信区: Boston
标 题: 羊穿microarray 发现8号染色体多了一点点怎么办？
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Dec 10 19:34:30 2014, 美东)
高龄产妇， 二胎，等明年生产时已经39了.先做了maternity T21 plus正常。觉得不放
心，在18周时做了一个羊穿，自己掏腰包加选了microarray （这个查得更细，不加选
这个就是普通的羊穿）。 普通的羊穿结果没问题，但是microarray 发现了8号染色体
上多了一小块（8p23.1), 大小大约0.73Mb。
下面是报告的原文， 觉得写的有点模糊：
No diagnostic copy number were observed, however, one variant of uncertain
significance was identified: a heterozygous copy number gain of 0.73 Mb on
8p23.1 (10,875, 772-11... 阅读全帖 |
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d***s
发帖数: 1062 | 25
give
不能同意在多。
本人硕士毕业来美国，现在二流学校博士第五年，老板半放羊状态。一共做了5个课题
，都是从零开始的knockout或者transgenic小鼠相关的课题。
前三个课题不是没有phenotype就是系统有问题。
第四个课题估计只能发片plos one，虽然最主要的phenotype很strong，但是就是得不
到其他文章中下游的phenotype。我老板开玩笑的说:"The results of this project
are amazingly negative!"
第五个课题，运气还好，估计能发篇中等的文章。
四年下来的体会是，不管是技术还是idea方面，至少要有一项能得到帮助，要不然效率
太低，时间就久了压力就来了。
选课题太重要了，尽量选实验室之前有积淀的方向，这样老板也比较上心。 |
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r******g
发帖数: 600 | 26 最近 对这个领域 稍微研究了一下，懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
但是，你如果仔细听听RP lifton的讲座，你会发现 “发现rare disease其实并不是RP
lifton的目的”！！ 通过 研究 ext... 阅读全帖 |
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b****r
发帖数: 17995 | 27
懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
--你不能把眼球停留在眼前，应该放眼10年以后，你职业生涯的成熟期。100，000人一
例患者，全世界有多少患者？数十万！测序技术的普及以及互联网，在几年后就会把这
几十万人基本... 阅读全帖 |
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r******g
发帖数: 600 | 28 最近 对这个领域 稍微研究了一下，懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
但是，你如果仔细听听RP lifton的讲座，你会发现 “发现rare disease其实并不是RP
lifton的目的”！！ 通过 研究 ext... 阅读全帖 |
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b****r
发帖数: 17995 | 29
懂得不多，只是提提个人观点
其实你们两个人 说的是对的
你可能看过RP Lifton的papers。他一直致力于 研究 rare mendelian diseases。 他
目前和BCM,Wash U@SL 和 JHU 一起在做 mendelian genetics consortium。 通过在
全世界找 “extreme phenotype - disease outliers” 和 “inbred family的疾病”
来寻找 human knockout的phenotype。
通过 RP Lifton的实验，你发现，这个世界上 仍然有很多 monogenic的病。 但是从
临床的角度来考虑， 研究 monogenic的疾病 究竟有治疗价值吗？ 1/100,000 的
mutation导致的 rare disease, 有哪个药厂会愿意生产药物来治疗呢？ 所以，工业圈
自然也不会对这个领域感兴趣...
--你不能把眼球停留在眼前，应该放眼10年以后，你职业生涯的成熟期。100，000人一
例患者，全世界有多少患者？数十万！测序技术的普及以及互联网，在几年后就会把这
几十万人基本... 阅读全帖 |
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z*******6
发帖数: 679 | 30 实验室一老博后十多年前“花了老大功夫”做了个knockin老鼠，我当然知道当年做老
鼠难做，他看了下没有想要的大phenotype，完了他就基本没往下做了，又做了几个其
他的老鼠，发现好phenotype就去做其他的了。五年前我进实验室，他就把老鼠转给我
了，我也基本没咋做，直到两年前才正式开始做，完了很快就做出点小phenotype和一
些in vivo的实验，老板也说可以了，我就写了manuscript，老板改完准备投，完了这
哥们说我要做cofirst author的第一位，结果我就无语了，毕竟是实验室的老人，而且
平常也帮了我不少，我就没说啥，老板也不知道咋弄，我就退一步让给他了...
最关键的是这哥们自己也说了，要是我不做，这个老鼠也就费了，估计永远也不会发了
；我这做完写完了，他突然来这么一下，我只能憋着了，谁让咱是苦逼学生没地位呢...
现在也就安慰安慰自己了，至少还是个cofirst，也不损失太多，没必要纠结了，况且
已经板上钉钉了，在郁闷也是自己受着了，没啥意思... 赶紧整完另一篇paper早毕业
闪人才是王道... |
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x****6
发帖数: 4339 | 31 近5年，随着crispr/cas9的技术越来越成熟，它被越来越多的人关注，影响力延伸到普
罗大众。在学术界，这门技术已经普及；在工业界，一系列初创公司应运而生，以
editas为代表，它已经通过第二轮融资，已然是生技初创公司的巨无霸。
在承认它在提高基因编辑，特别是在高等生物里，起到巨大作用的同时，我不禁要问：
它到底解决了什么实际问题？
Genotype-phenotype mapping仍然是一个巨大的黑匣子，我想在未来的几代科学家这个
时间尺度内都将不会改变。人类/动物基因组编码序列就是本天书，现在基本上是看不
懂的；而绝大多数表型，包括疾病，都是多因子影响的。连书都没看懂，怎么去朝着特
定目标去搞修？！请不要举乳腺癌等单基因个例来反驳我，我是在全局的角度说事。
看看当初吊足了科学界和大众口味的ENCODE，一个举国（际）体制项目，就是想搞清基
因组测序之后有什么用。最后只能骗骗看热闹的外行，而在业内早已沦为笑柄，甚至都
有科学家出书来埋汰它。
我认为crispr/cas9是一个极其方便的perturbation tool,能够来帮助我们探索
Genotype-phenotype... 阅读全帖 |
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s*******9
发帖数: 177 | 32 高龄产妇， 二胎，等明年生产时已经39了.先做了maternity T21 plus正常。觉得不放
心，在18周时做了一个羊穿，自己掏腰包加选了microarray （这个查得更细，不加选
这个就是普通的羊穿， 心想既然反正做羊穿要扎一针的， 还不如就这个机会做的全面
一些）。 普通的羊穿结果没问题，但是microarray 发现了8号染色体
上多了一小块（8p23.1), 大小大约0.73Mb。
下面是报告的原文， 觉得写的有点模糊：
No diagnostic copy number were observed, however, one variant of uncertain
significance was identified: a heterozygous copy number gain of 0.73 Mb on
8p23.1 (10,875, 772-11,603,171): MIR598,XKR6,MTMR9,SLC35G5,TDH,C8orf12,
FAM167A,BLK,LINC00208, GATA4 (partial).
This region has n... 阅读全帖 |
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v**********m
发帖数: 5516 | 33 楼上文章的comments
Not yet but stay tuned. But a definite fact and you can review it in the FDA
's analysis in the briefing document is that there was no SS of astrocytomas
in male rats or female rats.
Dr. Alavi had concerns about how Arena calculated the exposure margin for
Lorcaserin, that is why it appeared in the CRL. When Arena met directly with
the FDA on December 15th and 16th at the FDA, both Arena and the FDA agreed
on the CSF methodology and the number of participants that would be
acceptab... 阅读全帖 |
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S*******l
发帖数: 4637 | 34 可能看new phenotype 的有利程度和环境压力吧。感兴趣可以看看 stickleback 的进
化。
种群本身就有很大的遗传的多样性，没有环境选择压力的时候，就没有哪一种是
dorminant.如果环境因素变了，某种phenotype就在种群里凸显了。别的被压制了。但
还可以在 heterozygotes 个体里保存下来。
所以我觉着模拟的模型要做成二倍体，基因突变可以不必每次都表达，这样可以提高适
应性。不必每次筛选就完全剔除不适应当下的那个基因。也许环境变化，后来那个基因
又变成有利的了。
DNA的双螺旋结构是生命的核心，既保证稳定性又保证适应性。 |
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d*b
发帖数: 4184 | 35 【 以下文字转载自 Gay_Pathology_and_Therapy 俱乐部 】
发信人: dcb (奉钻风之命删除), 信区: Gay_Pathology_and_Therapy
标 题: gay基因如果存在，对女性也是有害的
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jul 26 23:12:55 2015, 美东)
1993年，一个骗子提出gay基因的概念并将之定位在Xq28，后来无数学者都证明题其研
究是无法重复的，但gay基因的概念不断被无良政客用来欺骗就缺乏常识的民众。 稍微
有点遗传学常识的人都会有个疑问，在遗传上极其不利的gay基因如果存在也应该在进
化中被淘汰，于是其它骗子为了圆谎有抛出gay uncle 理论，即gay 基因会对女性携带
者繁衍有利所以能够通过女性隐性遗传。
本研究通过对gay的女性长辈（有gay 子/侄者，虚构的gay 基因携带者非发病者）研究
，得出其与非gay亲属女性的区别：
1. 较少妇科病
2. 较少复杂怀孕（多胞胎等）
3. 对生育不感兴趣（解释1）
4. 不太重视夫妻间浪漫的爱情
5，缺少社会生活
6. 家庭的稳定降低
7. 更外向（... 阅读全帖 |
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m******1
发帖数: 19713 | 36 When Tim Pawlenty said the science was "in dispute” about whether being gay
is genetic, that sure came as surprise to molecular biologist Dean Hamer.
By Dr. Dean Hamer, op-ed contributor
In a recent interview, Tim Pawlenty was asked “Is being gay a choice?” The
presidential hopeful replied that “the science in that regard is in
dispute.”
As a working molecular biologist, that was certainly a surprise to me.
In fact, the scientific community has long regarded sexual orientation –
whether gay, str... 阅读全帖 |
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l****z
发帖数: 29846 | 37 作者:关启文 贺志勇
2012-07-13 16:24:52
导言：一个变成无神论的主教进化生物学家
道金斯在牛津大学取得博士学位，在生态学领域声名卓著。他的两本书《自私的基因》
以及《扩展表现型》对进化论贡献不小。他有不少畅销的著作，并经常在媒体上发表言
论及作通俗性演讲。道金斯的第一本著作《自私的基因》（The Selfish Gene）令他声
名大躁，自1976年出版以来便不断重印，据称未曾断过市。1 1982年出版的第二本书《
扩展表现型》（The Extended Phenotype）阐明生物性状和基因的关系，是他在生物学
的最重要学术著作。2 1986年出版另一本畅销书《盲目的钟表匠》（The Blind
Watchmaker）3，此后又陆续出版《伊甸园外的生命长河》（River out of Eden）4，
《攀登不太可能的高山》（Climbing Mount Improbable）5，《刃解彩虹》（
Unweaving the Rainbow）6，以及《鬼魔的教士》（A Devil’s Chaplain) 7 等书。
道金斯在牛津大学攻读生态学(ethology)... 阅读全帖 |
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d*b
发帖数: 4184 | 38 【 以下文字转载自 Gay_Pathology_and_Therapy 俱乐部 】
发信人: dcb (奉钻风之命删除), 信区: Gay_Pathology_and_Therapy
标 题: gay基因如果存在，对女性也是有害的
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jul 26 23:12:55 2015, 美东)
1993年，一个骗子提出gay基因的概念并将之定位在Xq28，后来无数学者都证明题其研
究是无法重复的，但gay基因的概念不断被无良政客用来欺骗就缺乏常识的民众。 稍微
有点遗传学常识的人都会有个疑问，在遗传上极其不利的gay基因如果存在也应该在进
化中被淘汰，于是其它骗子为了圆谎有抛出gay uncle 理论，即gay 基因会对女性携带
者繁衍有利所以能够通过女性隐性遗传。
本研究通过对gay的女性长辈（有gay 子/侄者，虚构的gay 基因携带者非发病者）研究
，得出其与非gay亲属女性的区别：
1. 较少妇科病
2. 较少复杂怀孕（多胞胎等）
3. 对生育不感兴趣（解释1）
4. 不太重视夫妻间浪漫的爱情
5，缺少社会生活
6. 家庭的稳定降低
7. 更外向（... 阅读全帖 |
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A********e
发帖数: 354 | 39 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时，深深的鄙视一下自己的无聊行径！！
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖 |
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w******y
发帖数: 4871 | 40 Chapter 11: the infant and toddler with wheezing.
AuthorsRobison RG, et al. Show all Journal
Allergy Asthma Proc. 2012 May-Jun;33 Suppl 1:S36-8. doi: 10.2500/aap.2012.33
.3543.
Affiliation
Division of Allergy-Immunology, Department of Medicine, Northwestern
University Feinberg School of Medicine, Chicago, Illinois, USA.
Abstract
Recurrent wheezing is common in young infants and toddlers with 27% of all
children having at least one wheezing episode by the age of 9 years. The
initial wheezing epis... 阅读全帖 |
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l******a
发帖数: 16364 | 41 ☆─────────────────────────────────────☆
break8811 (池蛙) 于 (Thu Nov 8 15:06:11 2012, 美东) 提到:
我最近才开始了解自闭症。一些不成熟的想法抛出来，请大家指正。
Autistic disorder(严重自闭症)和ASD(autism spectrum disorder，泛自闭症，也包
含Autistic disorder)都是受遗传影响，神经系统发育不全而导致的语言社交能力障碍
。ASD很多症状和汞中毒接近，但后者不是遗传导致的。诊断ASD时都要排除汞中毒的可
能。
ASD和正常小孩之间其实没有明显的界限，本来"正常"就只有统计学意义。很多被诊断
为ASD的小孩的神经发育，只是比较缓慢而已，只要父母有耐心，更大点之后小孩就正
常了。但也有很多ASD小孩的神经系统，如果不人工干预，就永远无法发育正常--其实
即使人工干预，也往往只能做点改善，难以完全正常。
说到这儿，我觉得有必要引入“基因表达”的概念。曾看过一篇报导(对不起原文找不
到了)，说某个村庄的风俗，小孩老绑着不让到处跑，导致当地人群的... 阅读全帖 |
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l********n
发帖数: 260 | 42 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: liujiatian (liujiatian), 信区: Biology
标 题: paper wanted.Thanks
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 11 14:31:26 2012, 美东)
paper wanted
Phenotypic Heterogeneity of Genomic Disorders and Rare Copy-Number Variants
S. Girirajan and Others
Most chromosomal deletions and duplications (copy-number variants) that are
associated with neurodevelopmental disorders are known to result in a wide
variation of clinical phenotypes. This study describes a genetic mechanism
for such variation.
ple... 阅读全帖 |
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s*****u
发帖数: 407 | 43 Applications are invited for Postdoctoral Researchers to join Dr. Xiang Zhou
’s research group in the Department of Biostatistics at the University of
Michigan. Research in the Zhou lab focuses on the development of statistical
methods and computational tools for the analysis of large-scale and high-
dimensional biological data from genetic association studies and functional
genomic sequencing studies. Recent work includes: Bayesian hierarchical
models to quantify genome-wide inheritance, Bayesi... 阅读全帖 |
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p*******g
发帖数: 2976 | 44 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时，深深的鄙视一下自己的无聊行径！！
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖 |
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O***n
发帖数: 13127 | 45 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时，深深的鄙视一下自己的无聊行径！！
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖 |
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x********o
发帖数: 897 | 46 1. Scientist, Cellular Immunology (29LN)
The Celluar Immunologist on this team will play an important role in studies
to elucidate the underlying biological mechanisms of Physiocrine proteins,
and will participate in execution of the aTyr Pharma discovery programs and
the advancement of current Physiocrine leads into clinical development. The
successful candidate for this position should have a strong background in
cellular immunology with a deep understanding of the cellular and molecular
proce... 阅读全帖 |
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x********o
发帖数: 897 | 47 1. Scientist, Cellular Immunology (29LN)
The Celluar Immunologist on this team will play an important role in studies
to elucidate the underlying biological mechanisms of Physiocrine proteins,
and will participate in execution of the aTyr Pharma discovery programs and
the advancement of current Physiocrine leads into clinical development. The
successful candidate for this position should have a strong background in
cellular immunology with a deep understanding of the cellular and molecular
proce... 阅读全帖 |
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j**p
发帖数: 1257 | 48 我觉得Dawkins《自私的基因》的贡献是在DNA发现之后重新普及了进化论。进化论不还
原到DNA/gene大分子水平是解释不清的，所以现代的进化论信徒很多都是Dawkins的影
响下产生的。原本进化论很难解释利他行为，但是自从发现了遗传物质之后，利他行为
也合理化了，Dawkins做了很重要的普及工作。把“自私”加在gene上其实不太合适，
因为gene没有主观能动性，gene只能无方向的变异，然后在性状phenotype这个层次被
选择。
拉马克理论/“用进废退”也能解释进化，只不过不是通过gene这个机制。如果狭义的
解读拉马克理论，韩国女性长期整容之后，整容的作用会整合到遗传物质，韩国女性就
越来越漂亮了；我们都知道这是错误的。但是无论如何韩国女性在phenotype层次确实
变漂亮了；变漂亮的机制是Dawkins提出的meme（迷因/文化基因）。因为韩国有整容
meme流行，母亲再传给女儿，韩国女性确实在容貌上发生了进化。如果把遗传的机制从
gene扩展到meme，拉马克理论还是成立的。Dawkins的meme是全书中我最喜欢的东西。
扯回法律：
如果从法律的历史来看，确实法... 阅读全帖 |
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D***r
发帖数: 7511 | 49 你所谓“天生”是什么意思呢？基因和环境都算天生，那还说什么？
同性恋不单纯是一种phenotype,黑皮肤白皮肤是phenotype
同性恋是一种行为倾向 |
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D***r
发帖数: 7511 | 50 重申：同性恋不是phenotype
phenotype可以用蛋白质合成来解释
同性恋能吗？
有些同性恋者是不是企图为自己的行为找excuse呢？ |
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