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全部话题 - 话题: pcdna
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l********t
发帖数: 2
1
来自主题: Biology版 - 问一个PCDNA质粒的问题
pcdna3.1 v5-his和PCAGGS-GFP磷酸钙共转染原代神经细胞,然后染色GFP和V5tag,GFP
信号很强,但是V5信号非常弱,表达很低。但是HEK上共转染,GFP和V5都很强。是因为
PCDNA的promoter在神经细胞里不太好使吗?考虑要不要subclone到pcaggs载体里去。
w*******i
发帖数: 477
2
求助, 请问哪位战友有 pcDNA dest40 (gateway) ,可以寄我一点吗? 谢谢。 请
站内
z*********s
发帖数: 38
3
最近用pCDNA 3.1+质粒表达蛋白,请问质粒是在哪个位置被切开加上polyA尾巴的,具
体是怎么样一个过程?
S******y
发帖数: 2
4
as i can recollect, pcdna was generated by synthesis.
b******r
发帖数: 111
5
Note: NHEs is membrane proteins that transmembrane 12 times. NHE5 is
localized to the plasma membrane;NHE6-9 reside on organellar membranes(
endosome,Golgi);
1. pcDNA transfects NHE5-9 through Fugene 6(ratio is 3 uL of Fugene/2 ug of
DNA) in 293 cells. After three days,collect cells.
2. Cold PBS washes cells. Add 150 uL of lysis buffer(final concentration:
50mM Tris pH7.4, 150mM NaCl, 1% triton, 0.1% sds, cocktail inhibitor)
into each well of 6-well plate. Scrape cells.
3. The lysate gets st... 阅读全帖
g*********5
发帖数: 2533
6
谢谢牛牛。
1。我设计引物直接把ORF从pcdna质粒上扩增出来,然后装入pENTR,再到destination
病毒载体。
pcdna质粒表达没有问题,wb检测多次;pENTR也测了序。kozak序列倒是没有,因为
pcmv是强启动子。我将试试单转lentiv vector.看看表达与否。
2。p24是病毒的蛋白吗?
3。infection效率不知道。我要老老实实地作一次。
p*******r
发帖数: 156
7
来自主题: Postdoc版 - 真心请教载体连接的问题
最近本人在将一个6000-8000bp连接到pcDNA 3.1(+)(5400bp)中去, 使用普通的连接
酶至今都没有连接进去,真心向各位大虾请教,大家通常如何使用什么神奇的连接方法
和kit,thanks a lot
c*******r
发帖数: 440
8
1. 是不是转染的外源基因片段越小越容易整合? 多大的片段不容易整合(既极限有多
大)
2. 如何筛选悬浮细胞的稳定表达系? (用G418) 要挑琼脂糖板吗? 本人只做过贴壁
细胞的筛选,方法有什么不同?
请做过该实验的多多指导,多谢!
c*********n
发帖数: 205
z*******6
发帖数: 679
10
来自主题: Biology版 - 这种老板危险吗?
还在rotation选实验室,有个实验室蛮喜欢,方向什么的都还行,实验室宽松,有钱,
paper也还可以,能发个pnas,唯一感觉不放心的就是之前有篇pnas paper的数据有问
题,但不是他们故意的,发了之后才发现细胞系污染了,当初用的A549最后不知道怎么
变成Hela了,他们就当作A549发了paper。。。这种事情会不会被发现以后影响老板的
credit,对我以后影响也不好。。。
大家怎么说?
PS 主要还是觉得实验室有钱,花起来基本不用考虑的,前阵子就为要个带另一个抗性的pcdna,稍微做个克隆估计就出来了,或者borrow一下也不是多大的事,然后基本想都没想就从invitrogen上买了,500多刀,我看着就心疼,后来貌似就没用上。。。枪头什么的也都是买现成的带filter的。。。我以前呆过没钱的国内实验室,做起实验来真郁闷,所以了。。。
另外就是课题比较吸引我,刚拿到的一个R01做HIV的,貌似用他们的系统有希望搞定HIV似的,不小心激发了我的一点点野心。。。
i******m
发帖数: 495
11
来自主题: Biology版 - 这种老板危险吗?
不好意思,没看出来这个实验室特别有钱
我用vector从来都是买的
借来的东西没有保证。 自己以前吃过这个亏, 看到身边的人也吃过这个亏, 所以
就直接买了。 filtered tips。。。没多少钱吧

性的pcdna,稍微做个克隆估计就出来了,或者borrow一下也不是多大的事,然后基本
想都没想就从invitrogen上买了,500多刀,我看着就心疼,后来貌似就没用上。。。
枪头什么的也都是买现成的带f
HIV似的,不小心激发了我的一点点野心。。。
o*****a
发帖数: 2335
12
歪个楼请教一下,你的pCDNA转染293后能稳定保持多长时间?为什么有人说传几代后就
没了
c********u
发帖数: 250
13
来自主题: Biology版 - 问个V5抗体的问题
最近克隆了几个基因进Invitrogen pcDNA 3.2/V5-DEST,测序什么的都没问题,可是在
293细胞表达后用invitrogen自己的anti-V5做immunocytochemistry的时候总是有比较
强的background staining,我用的是10% goat serum blocking and goat anti-mouse
Alexa 594.请问哪位用过这个antibody,什么条件可以降低噪声呢
s*********y
发帖数: 387
14
处理了大概30个质粒,还有30-50个需要大提,
处理的30个中,主要是pCDNA和peGFP的质粒,插入大概3k 到 8k的基因片段
部分比较好,150ml菌,能有1000ng per ul浓度,有1ml体积
部分比较的诡异,浓度只有30 ng per ul,在1ml的体积中。
但是测序的 时候 都是 对的!!!!而且浓度低的 mini prep没有任何的问题
浓度在200 ng per ul,体积在 50ul
a****d
发帖数: 1919
15
来自主题: Biology版 - 问一个PCDNA质粒的问题
CMV is a weak promoter. pcaggs is much better for gene expression in neurons
.
S*****s
发帖数: 287
16
NMD 也不一定是 100% 降解。没有被降解的 RNA 还是会翻译成蛋白。我觉得是 LZ 的
检测方法有问题。建议用 pcDNA vector 克隆然后在细胞里面表达,先看看表达产物是
不是稳定。一个例子是 http://www.jneurosci.org/content/29/9/2833.full.
m******5
发帖数: 1383
17
来自主题: Biology版 - BGH polyA signal
5'
CTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCC
CACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGG
GTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGG 3'
I am currently designing a transgenic vector, I cloned this BGH polyA signal
from PCDNA 3.0
could anyone here familiar with it help me to check if this poly A signal is
complete enough?
m******5
发帖数: 1383
18
来自主题: Biology版 - BGH polyA signal
我是按照invitrogen PCDNA 3.0的annotation做下来的,以前吃过别的质粒的亏 (那个
质粒只把部分GT rich region标出来,turns out不够)

transgene
CTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCC
CACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGG
c********u
发帖数: 250
19
来自主题: Biology版 - 为啥我的Gateway GFP vector 不好用
Invitrogen Gateway C-terminal GFP destination vector pcDNA-DEST47 克隆的蛋白
为什么不亮呐?非得每次再用anti-GFP染一遍才有暴亮的荧光,为啥啊为啥,有没人碰
到过同样的问题?
g*********5
发帖数: 2533
20
谢谢。以前用pcdna座的稳定转染也应该是单拷贝的,但是表达还可以阿。
r*****t
发帖数: 4793
21
来自主题: Biology版 - 为什么转染后没表达?
建了一个质粒,pcdna 的表达His9(6-FLAG tagged 一个基因
用最开始得到的质粒作转染,有表达
用这个最初的质粒去扩增,大提得到的质粒,再去做转染,就怎么也看不到重组蛋白的
表达了
为什么为什么?
C**S
发帖数: 522
22
来自主题: Biology版 - 问一个病毒载体的问题
谢谢。我是担心这样筛,会不会像pcDNA质粒一样,出现好多假阳性的克隆。
刚刚想起来retro和lenti都是RNA病毒,我前面几贴的显得很白痴,让大家笑话了。

transfection.
b***2
发帖数: 348
23
来自主题: Biology版 - 求助Hela transfection
HeLa很好转的。会不会是质粒的问题。我用2000转PCDNA一点问题都没有。
p*******r
发帖数: 156
24
来自主题: Biology版 - 请教大家一个载体连接的问题
最近本人在将一个6000-8000bp连接到pcDNA 3.1(+)(5400bp)中去, 使用普通的连接
酶至今都没有连接进去,真心向各位大虾请教,大家通常如何使用什么神奇的连接方法
和kit,thanks a lot
b***2
发帖数: 348
25
如果是类似于pcdna的系统的话,G418筛出来的克隆大部分是假的。我用荧光蛋白试过
。能有10%的真阳性就不错了

-阳
s********x
发帖数: 472
26
一些virus的dna 序列是帮助质粒入核的. 但是有没有人知道是那段序列?比如常见的
pcdna系列vector.
S**********e
发帖数: 1789
27
来自主题: Biology版 - 请教个microRNA的问题
转染效率的确是个问题。这个细胞对质粒转染效率是没问题的,但miRNA的确不知道。
看样子要搞一个对照看看了。
载体表达miRNA没问题,这个我知道,我也买了一个表达miRNA的质粒,但pcDNA表达
miRNA不知道是否正确。 表达蛋白的载体也可以表达miRNA?

tricky
h*****n
发帖数: 47
28
来自主题: Biology版 - 包子贴,全部身家 16个包子
请教克隆大牛和电生理大牛,现在要研究一种叫hERG的钾通道在 HEK293 细胞上的表达
,把这个hERG转到哪种vector 上表达强呢?为了以后做电生理记录的电流可以大点。
除了pcDNA3,还有在HEK上表达好的载体吗?pcDNA 的话,是3.1比3.0更好吗?大牛见
笑,穷人,所有家当16个包子奉上!
d*****r
发帖数: 45
29
来自主题: Biology版 - 包子贴,全部身家 16个包子
不是大牛
pcDNA 完全可以,你也可以试试vectors with CAG promoter,理论上表达更强.
另外,你可能要先make sure HEK293 里有没有内源性的potassium currents , 会不
会干扰hERG currents.
z*********s
发帖数: 38
30
我的问题可能没有问清楚,我想问的是对于pCDNA3.1质粒,polyA是加在质粒对应的哪
个位置的?
S******y
发帖数: 2
31
after every eukaryotic gene cds. So in this case, after mcs and neomycin.
T*****e
发帖数: 247
32
从manual里面copy过来的:
Bovine growth hormone (BGH) polyadenylation signal
Efficient transcription termination and polyadenylation of mRNA (Goodwin and
Rottman, 1992)
这应该是3'UTR吧,正常就是3'UTR后面
肯定在neomycin和它的SV40启动子前面,也跟f1 ori没啥关系
所以就在bgh signal的后面
n**u
发帖数: 87
33
This is polyA you are asking.....

:从manual里面copy过来的:
:Bovine growth hormone (BGH) polyadenylation signal

发帖数: 1
34
其实就是最基本的pcDNA3.1 plasmid。
以前他做实验都用没有质粒的做对照,有一次labmeeting我show出来的用pcDNA做对照
然后他就一直问我要。一开始我就给了100ug,现在用完了又来问我要。关键是这东西
可以自己养细菌扩增纯化,东西不值钱,但是每次纯化我还需要时间。
怎么拒绝比较好些?
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