由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: neuronal
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s*******7
发帖数: 399
1
来自主题: Biology版 - nature communication 杂志如何?

Cell
============
cell系列的瞬时引用率普遍较低,但这不影响后来的IF数值。
举个极端例子,目前neuron目前的瞬时引用率(=2013年的paper在2013年的引用率)在
2.5左右,低于nsmb的3.0,但是未来的neuron的IF(=2012+2013年paper在2014年的引
用率)将是nsmb的 1.5 倍。
瞬时引用率(Immediacy Index)是文章刚发出来当年的引用率,IF则计算的是后2年的
引用率,如果某个杂志的引用率曲线速度不一样的话,视觉上的数字会有偏差,有的开
始低,然后高,有的开始就是高,有的开始高然后低,加速度不一样的,杂志的引用率
曲线速度(加速度)跟出版社有关。
阿戈以前表达过这么一个意思:假设某年 IF 不是 2011+2012 的文章数量在 2013 的
引用率,而是 2011+2012 的文章在 2015 的引用率,那么cell系列的IF将普遍升高。
见以下老贴:
http://www.mitbbs.com/article0/Biology/31819863_0.html
O**U
发帖数: 72
2
来自主题: Biology版 - 你有多想做faculty?
本人一个大牛手下的博后,随便说一下几个身边的朋友。即使大家在小学校混着,即使
NIH多年不给力,但是觉得大家都还是挺希望做research faculty的。觉得自己很难有
朋友们这样的热情,科研坚持下去很难。
A,国内Top5的本科+master,过来在院士手下做PhD学生,现在第七年还没毕业。一篇
PNAS在投。老公本地工作,家里有车有房有小娃一枚。自己准备和老公异地去某名校AP
那里做博士后,希望老公跳槽跟过去。
B,博后,40左右,在一个中牛那里做干细胞。老婆CS在intel,养家糊口。自己做起科
研其乐融融,一直希望能做faculty。
C,大牛手下博后第7年,也是40了。读PhD以前在美国有10万+的年薪。现在博后唯一的
文章在投Neuron,PhD有两篇JBC。自己觉得去公司屈才,而且工作没有保障。
D,国内PhD,快40了,现在中牛手下博后第七年。两篇neuron,非前50的faculty不去,
因此去年据了一个teaching+research的小学校offer。公司基本不考虑。
大牛是院士+HHMI级别,中牛是估计以后有可能院士的级别。
h*******o
发帖数: 4884
3
来自主题: Biology版 - 献给hellozero(血腥,慎入)
hoho 第一次有人发帖专门给我哈哈哈哈哈
我个人没有做过DRG,但是我以前貌似看过一篇文章, DRG的neuron特别容易形成大的
cluster
文章在这里,你可以看看,不过他们养的是embryonic的,要容易不少
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23248613
你的图片里面debris 居多, change media以后养几天看看吧,我看到2个疑似的
neuron,哈哈
b******k
发帖数: 2321
4
来自主题: Biology版 - 庄小威挺失落吧
这东西得奖有几个得法
一个是纯发给ChR2 我觉得也是最没有意思的给法 那么Georg Nagel,Alex Gottschalk
,Karel Deisseroth三个人可以分,一个是clone的人,后两个是PoC和改进的人。当然
这里头也有问题,比如说克隆ChR1的Hegemann也可以分,然后Deisseroth那里出来的Ed
Boyden也一直号称最早是他的idea来试ChR2
还有一个是给广义的optogenetics,那么稍微好玩一点,但是这样能分的人就多了,最
早尝试这个concept的Gero Miesenbock,用的是caged ligand,后来Berkeley的
Isacoff也发站了类似的方法。因此除了上面的几个人,Miesenbock肯定是可以分一份
以奖励其概念上的原创性,这样就有几个组合:要么是Miesenbock+Nagel+Deisseroth,
要么是Miesenbock+Hegemann+Nagel
要么干脆再拓展一点,发给用遗传学方法控制neuron activity的,我觉得这样会更好
玩,但是难度就很大了,毕竟只能发三个人。optogene... 阅读全帖
r**********e
发帖数: 587
5
来自主题: Biology版 - Neuroscience vs Neurology
对于神经相关PhD在医学院里有两种lab,一种就是med school里neurobiology的;一种
是hospital里neurology的
但我发现这两种PI的研究水平(仅仅从publication看)差了十万八千里。
neurobiology的老板的基础研究水平高了NNN个档次。就拿哈佛作为例子:
哈佛医学院的neuron
http://neuro.med.harvard.edu/people?tid=1
麻省总医院:
http://www.massgeneral.org/neurology/research/
Brigham and women医院:
http://www.brighamandwomens.org/research/CND/labs.aspx
仔细观察,医学院neuron项目的老板无数大牛。而医院方面哪怕MGH这种著名医院,也
支持一些基础疾病研究,PI们都是PhD,注意是PhD。可他们的publication要差太多。
所以我好奇的是:
这两类PhD教授的招聘途径是一样的吗,待遇都一样?因为医院是直接做疾病相关的研
究(假设疾病研究更具有挑战性),所以门槛... 阅读全帖
r**********e
发帖数: 587
6
来自主题: Biology版 - Neuroscience vs Neurology
我也基本赞同,从现实funding的角度,跟疾病联系起来的研究也是会容易生存一点。
但你说的什么JAMA-neurology是完全的临床杂志。Neurology的PhD也是锁定什么neuron
,nature neuroscience。
我的问题是,neurology的那些做基础的PhD,第一他们发不了JAMA-neurology;第二他
们也很多也发不了neuron(although they are supposed to),而是发很多我觉得很
crap的工作。但依然可以survive,是沾了disease/neurology的光吗?但这样对
neuroscience的人就很不公平了
P****g
发帖数: 409
7
来自主题: Biology版 - Neuroscience vs Neurology
"Neurology的PhD也是锁定什么neuron,nature neuroscience。"
---no no no 那不是好phd,属于不务正业,在系里面不会受到重视,不会有地位。要
想跟医生打招呼要有临床的paper

neuron
h****i
发帖数: 204
8
Postdoctoral positions are available in Huang Lab in the Department of Cell
and Molecular Biology at Tulane University.
The successful candidates should have strong background in neuroscience and
experience with electrophysiology (perfer patch-clamp). Experience in
computational modeling and two-photon imaging is highly desired but not
required.
Huang lab aims to understand mechanisms of synaptic transmission and neural
integration using a combination of techniques of electrophysiology, two-
pho... 阅读全帖
x********a
发帖数: 230
9
已拷贝复制整理以增加其可读性.欢迎大家不定期更新,帖子变长,但可通过查找方式找
一下自己感兴趣的老板在不在其中。
[转载]美国部分变态导师列表 按学校整理
此贴包含在美PHD STUDENT 和POSTDOC的各种杯具,转自MITBBS,原帖链接如下,
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31350357.html
有人总结,四种PI不能碰,AP(assistant professor),F(female),C/T(Chinese/
Taiwanese), Unmarried.
当然这些都是一家之言,个人对这些说法持保留态度,细节需要继续探究。有一个标准
可以用于大家加入某lab之前的预先判断,就是PI的变态程度和lab里中国大陆人加上印
度人占总人数的比例成正比,因为大陆人和印度人都是典型的吃苦耐劳又老实(聪明与
否另说),所以要不是对这方面有特殊需求的PI,是不会故意招很多中国人和印度人的
,具体来说,这个比例在三分之一以内的,正常;三分之一到三分之二的,仍属正常,
只是人比较tough,可能订立了一些关于工作时间、进度的严格的规定;三分... 阅读全帖
i*****i
发帖数: 154
10
来自主题: Biology版 - Tufts 大学开除造假教授
This article has been retracted at the request of the authors. Donmez et al.
(2010) reported that SIRT1 suppressed Alzheimer’s disease in a mouse model
by upregulating the ADAM 10 α-secretase gene via coactivation of the
retinoic acid receptor, RARβ. Increased α-secretase bypassed the
processing of APP by the β-secretase, thereby reducing the amyloid burden.
It has come to our attention that several figures in the paper contain
images in which gel lanes were spliced together without appropriate
... 阅读全帖
j*****9
发帖数: 716
11
来自主题: Biology版 - Transfection reagent for SH-SY5Y ?
I have tried about 10 lipid-based transfection reagents in SH-SY5Y and
neurons. None of them gave me a decent efficiency. NeuroPORTER (Genlantis or
Sigma-Aldrich) was the best (~30% in SH-SY5Y, 18% in Neurons using FACS).
Good luck

transfection
x********i
发帖数: 905
12
来自主题: Biology版 - 2016 Breakthrough Prize in Life Sciences
2016 Breakthrough Prize in Life Sciences
The Breakthrough Prize in Life Sciences honors transformative advances
toward understanding living systems and extending human life, with one prize
dedicated to work that contributes to the understanding of Parkinson’s
disease and neurodegenerative disorders.
Edward S. Boyden, Massachusetts Institute of Technology: for the development
and implementation of optogenetics – the programming of neurons to express
light-activated ion channels and pumps, so that... 阅读全帖
v********e
发帖数: 1597
13
来自主题: Biology版 - Nature 为谢灿的文章配发的评论
http://www.nature.com/news/long-sought-biological-compass-disco

In the cells of fruit flies, Chinese scientists say that they have found a
biological compass needle: a rod-shaped complex of proteins that can align
with Earth’s weak magnetic field.
The biocompass — whose constituent proteins exist in related forms in other
species, including humans — could explain a long-standing puzzle: how
animals such as birds and insects sense magnetism. It might also become an
invaluable tool for using m... 阅读全帖
v********e
发帖数: 1597
14
来自主题: Biology版 - Nature 为谢灿的文章配发的评论
http://www.nature.com/news/long-sought-biological-compass-discovered-1.18803

In the cells of fruit flies, Chinese scientists say that they have found a
biological compass needle: a rod-shaped complex of proteins that can align
with Earth’s weak magnetic field.
The biocompass — whose constituent proteins exist in related forms in other
species, including humans — could explain a long-standing puzzle: how
animals such as birds and insects sense magnetism. It might also become an
invaluable too... 阅读全帖
T*****e
发帖数: 247
15
说不了下一个热点,莫若说说现在的方向有哪些。
1. 开发工具
A. 监测神经活性
GCaMP到6是不是已经差不多了?但是Ca2+究竟能代表多少neuronal activity?
cAMP的sensor能代表多少?
传统的IEG能代表多少?缺点是什么?记得有人用MAPK磷酸化水平来估计neuronal
activity
几种非电生理的voltage sensor 好用吗?
B. 改变神经活性
大名鼎鼎的optogenetics
恒温动物不能用的温控通道TrpA1
最近热炒的磁感应,还有超声控制的
C. 更高解析度观察突触
几种突触活性区的marker
证明物理联系的比如split GFP
能不能不通过电镜观察synaptic cleft?
D. 各种活体成像 高端显微镜 通过影像(包括电镜)重建神经网络
高解析度
实时成像
快速扫描
高穿透性
2. 具体的问题(水平有限,说说自己熟一点的)
具体的行为模型:学习记忆,生物节律,睡眠,aggressive,mating,social
interaction,decision making, pain, fear, navigation,... 阅读全帖
T*****e
发帖数: 247
16
说不了下一个热点,莫若说说现在的方向有哪些。
1. 开发工具
A. 监测神经活性
GCaMP到6是不是已经差不多了?但是Ca2+究竟能代表多少neuronal activity?
cAMP的sensor能代表多少?
传统的IEG能代表多少?缺点是什么?记得有人用MAPK磷酸化水平来估计neuronal
activity
几种非电生理的voltage sensor 好用吗?
B. 改变神经活性
大名鼎鼎的optogenetics
恒温动物不能用的温控通道TrpA1
最近热炒的磁感应,还有超声控制的
C. 更高解析度观察突触
几种突触活性区的marker
证明物理联系的比如split GFP
能不能不通过电镜观察synaptic cleft?
D. 各种活体成像 高端显微镜 通过影像(包括电镜)重建神经网络
高解析度
实时成像
快速扫描
高穿透性
2. 具体的问题(水平有限,说说自己熟一点的)
具体的行为模型:学习记忆,生物节律,睡眠,aggressive,mating,social
interaction,decision making, pain, fear, navigation,... 阅读全帖
S******i
发帖数: 71
17
来自主题: Biology版 - "关于数周前诽谤的澄清"
应该把自己的出生告诉大家,不要空对空,要留下学校的阳西地址,还有最好把系主任
的联系方式也放这里
Guo Huang Ph.D.
Assistant Professor
CVRI Investigator
Website
Research Interests:
Comparative study of heart development and regeneration, ischemic heart
diseases, stem cell, cardiomyocyte proliferation, regenerative biology
Program Areas
Vascular Biology and Atherothrombosis
Developmental Biology and Congenital Anomalies
Channels and Arrhythmias
Muscle Biology and Heart Failure
Prediction and Prevention of Cardiovascular Disease
Research Summary
... 阅读全帖

发帖数: 1
18
Postdoctoral Positions Available
Two postdoctoral positions are immediately available for studies in
neurophysiology focusing on the role of voltage-gated potassium channels in
regulating hippocampal circuit development and function. The candidate will
be working with a team of highly interactive electrophysiologists and
molecular biologists at the Eunice Kennedy Shriver National Institutes of
Child Health and Human Development (NICHD), National Institues of Health (
NIH).
Skills and Qualifica... 阅读全帖

发帖数: 1
19
来自主题: Biology版 - 关于biological vs technical replicate
技术重复是看你操作有没有失误;生物重复是看你实验本身(这里是细胞)有没有有统
计意义的差异。
[在 flareon () 的大作中提到:]
:最近做luciferase assay,就是把含有疾病相关的snp的promoter跟luciferase连接在
:一起,看snp对promoter的影响。假设snp的ref allele是A, 疾病相关的allele是B
:我首先在hek293里做,用lipofectamine3000转染。铺板子(12-well)铺了10个孔,5
:个用于allele-a, 5个用于allele-b。先把lipo和dna混合好,然后把mix分给每一个
孔。
:以上是第一次实验,过两天我会一模一样的重复上述实验。
:我想请问这里的5个孔中的每一个孔算是biological replicate还是technical
:replicate呢?
:而这两次实验算是biological replicate还是technical replicate呢?
:之所以问这个问题是因为后来面对转染neuron的实验。neuron比较难转染所以用的是
:nucleofection... 阅读全帖
l******3
发帖数: 536
20
一个控制多个neuron。在很多 neuron中间。所以才叫interneuron
c*******0
发帖数: 190
21
最近跟办公室信基督的大叔聊到唯物唯心这个话题,无意间想到这个问题: 按照我们所
接受的马克思唯物主义教育,物质是世间万物的基础,包括我们的思维和思想。不过有
一个问题楼主百思不得其解,上网翻了一些资料也没有找到系统、靠谱的研究,就是“
thinking”这个action到底是如何被启动的?当然神经生物学、影像学、心理学都证明
了人思考的时候大脑神经元是有规律放电行为的,基于此甚至还能预判某些人类行为。
但是问题是,这一切的源头在哪?我们可以在有意识的状态下无限制地“想”任何事,
而且我们每个人都经历过在完全平静的情况下,无外界刺激,不带任何前提的某个想法
突然“jump into our mind”,那么,如果这一切的基础都是神经元,最初的那个神经
元放电活动是如何被选择和启动的呢?在“thinking”或者"thought"产生之前,大脑
发生了什么?是不是“mind”作为一种未发现的力或者场存在?其能否被检测到甚至量
化?这种“力”或者“场”是否只能控制本体的neuron?更进一步,其是不是有潜能控
制身体的其他细胞或者就近个体的neuron?一些唯心主义者认为,存在某种free ... 阅读全帖

发帖数: 1
22
我的理解:
任何ageing相关的疾病,更多是外界环境引起的,比如什么DNA damage;所以某种程度
来说,研究ageing就是希望能 返老还童,长生不老。或者说,希望扭转死亡。
而哲学上,我们都是在走向死亡的。
相反,neurodevelopmental disease应该更多是基因导致的,因为没有外界环境的诱因
(什么怀孕期间母亲抽烟不算);所以我觉得crispr啥的改变neurodev更加有希望。当
然了,就算什么autism,genetics诱因也是非常复杂的。
现在degeneration最先进的都是做ips-derived neuron,因为high-quality的neuron或
者神经组织很难获得。但是这个ips-derived是in vitro,鬼知道能多大程度上模拟人
体衰老
总之,都是坑。
g***j
发帖数: 40861
23
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: gshjj (1+1=2), 信区: Military
标 题: 维基说这是气功大师严新的学术论文
发信站: BBS 未名空间站 (Thu May 4 16:01:52 2017, 美东)
他发表在国际期刊的科研论文有“Protective effect of XY99-5038 on hydrogen
peroxide induced cell death in cultured retinal neurons”(Life Sciences
2001 69:289–299), "XY99-5038 PROMOTES LONG-TERM SURVIVAL OF CULTURED
RETINAL NEURONS"(International Journal of Neuroscience, 112:1209–1227,
2002)等。
L***y
发帖数: 125
24
【 以下文字转载自 WaterWorld 讨论区 】
发信人: honde (宏德之坚韧不拔), 信区: WaterWorld
标 题: 诺贝尔奖获得者Sudhof老婆是踹了原配找美国老头的中国裔女留学(转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 10 12:24:52 2013, 美东)
发信人: honde (宏德之坚韧不拔), 信区: Biology
标 题: 诺贝尔奖获得者Sudhof老婆是踹了原配找美国老头的中国裔女留学生ZZ
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 10 12:24:37 2013, 美东)
诺贝尔奖获得者Sudhof老婆是踹了原配找美国老头的中国裔女留学生
楼主:bxdfhbh 时间:2013-10-09 22:57:00 点击:3363 回复:32

新浪微博有人爆料,诺贝尔奖获得者Sudhof老婆是踹了中国原配找美国老头的中国
裔女留学生:
@walnut姐姐:他Lp和她的前lg是国内大学同学双飞,后来俩人经过奋斗成为某校ap
,那时她的前lg给她挂了很多文章。后来她搭上了sudhof,离婚又结婚又生女,然后就迅
速得了... 阅读全帖
w********h
发帖数: 12367
25
来自主题: Macromolecules版 - Re: 2012年诺贝尔生物医学奖 (转载)
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: lingzhuzi (), 信区: Biology
标 题: Re: 2012年诺贝尔生物医学奖
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Oct 8 15:55:54 2012, 美东)
iPS本身最大的创新可能是1)技术的简易化,使得其迅速普及;2)其本身机制的研究
促进了epigenetics等领域的发展。
reprogramming这个概念早就存在。就体细胞向ESC逆编程而言,SCNT应该比iPS更好,
可惜的是,到目前为止还无法在人的细胞上完全实现。
iPS细胞刚出来时,几乎所有人都对其临床应用充满了期待,随着研究的深入,该领域
内怀疑其clinical therapy价值的人渐渐增多,其主要弱点有:
1)iPS与ESC的identity:Yamanaka现在似乎仍然坚持iPS与ESC是非常相似的,但是他
本人也承认现在iPS还根本无法取代ESC;相反的一派认为iPS与ESC根本就是两种不同的
细胞,无论是在transcriptome水平,还是epigenetic水平——蛋白组水平的研究,我
只看到两篇文章,不知为啥... 阅读全帖
a*****g
发帖数: 19398
26
Deep Learning Isn’t a Dangerous Magic Genie. It’s Just Math
Deep learning is rapidly ‘eating’ artificial intelligence. But let’s not
mistake this ascendant form of artificial intelligence for anything more
than it really is. The famous author Arthur C. Clarke wrote, “Any
sufficiently advanced technology is indistinguishable from magic.” And deep
learning is certainly an advanced technology—it can identify objects and
faces in photos, recognize spoken words, translate from one language to
another... 阅读全帖
w*****e
发帖数: 17
27
来自主题: MedicalCareer版 - a question from K Qbank
Blood vessel smooth muscles have M3 receptors, however, are not innervated
by neurons. The local vasodilation effect described in this scenario is a
humoral effect, not a neuronal effect. NO activates M3 receptor leading to
activation of cGMP and subsequent vasodilation. Choice B is correct.
P*****s
发帖数: 375
28
来自主题: Science版 - Science Breakthrough '99 (6) Memories
Making memories.
From an old nursery rhyme to the name of someone you just met, memories of all
kinds are etched into your brain by a molecular cast of epic proportions. The
actors in this drama are molecules rushing into and out of the synapse, the
gap between neurons. Their movements strengthen the connections between certain
neurons, making those synapses more likely to fire in the future. Exactly how
the enhanced firing calls up and stores memories remains a mystery, but this
year researcher
f*******d
发帖数: 339
29

forget her name, but she is a professor in the PKU math department. I think
this theory is not her invention, but she has done some work in it.
If I remembered correctly, the neurons form a network, the linking function
of two neighbouring element is changed each time a stimulus is applied. Since
information is supposed to be stored in the neuron network, it must be something
that can not be easily destroyed, so should be some invariants. If we consider
this network as a huge dynamical system,
c**********m
发帖数: 2088
A*******s
发帖数: 9638
31
来自主题: Medicalpractice版 - 肖传国的反射弧理论和手术
这个反射弧现在又成了热点了,我老来发表一下看法吧:
1. 想法很创新, 技术上(nerve graft)行得通。
2. 用于临床太不成熟。
在手术适应症中, 脊柱裂、脊髓脊膜膨出与脊髓栓系综合症、脊髓损伤、截瘫导致的
神经原性膀胱是不同的, 前者是lower motor neuron损伤引起的大膀胱, 后者是
upper neuron损伤引起的小膀胱。 前者因为神经的缺陷,膀胱的肌纤维因为失去神经
支配萎缩, 所以接上了体神经也不可能有效。 后者的神经肌肉链接相对正常, 所以
接好了有可能工作, 但是, 没有中枢的参与, 自主排尿是不可能的。
那么有没有特例呢, 我想有, 比方说脊柱裂的病人, 有可能有部分神经是正常的,
换成新神经, 膀胱就可能接受到足够强的刺激, 形成排尿。 截瘫也可能不是完全的
, 所以中枢可能还有控制。
测定膀胱还有没有能力对nerve graft有反应可以通过神经传导检查测定, 病人必须经
过严格筛选。 我个人觉得这个手术对某些患者可能有效,不应该一棒子打死, 毕竟对
这部分病人实在没什么好的治疗可以帮助他们的。
下面这个视频就有点落井下石的味道, 拍了一些病... 阅读全帖
A*******s
发帖数: 9638
32
来自主题: Medicalpractice版 - 肖传国的反射弧理论和手术
这个反射弧现在又成了热点了,我老来发表一下看法吧:
1. 想法很创新, 技术上(nerve graft)行得通。
2. 用于临床太不成熟。
在手术适应症中, 脊柱裂、脊髓脊膜膨出与脊髓栓系综合症、脊髓损伤、截瘫导致的
神经原性膀胱是不同的, 前者是lower motor neuron损伤引起的大膀胱, 后者是
upper neuron损伤引起的小膀胱。 前者因为神经的缺陷,膀胱的肌纤维因为失去神经
支配萎缩, 所以接上了体神经也不可能有效。 后者的神经肌肉链接相对正常, 所以
接好了有可能工作, 但是, 没有中枢的参与, 自主排尿是不可能的。
那么有没有特例呢, 我想有, 比方说脊柱裂的病人, 有可能有部分神经是正常的,
换成新神经, 膀胱就可能接受到足够强的刺激, 形成排尿。 截瘫也可能不是完全的
, 所以中枢可能还有控制。
测定膀胱还有没有能力对nerve graft有反应可以通过神经传导检查测定, 病人必须经
过严格筛选。 我个人觉得这个手术对某些患者可能有效,不应该一棒子打死, 毕竟对
这部分病人实在没什么好的治疗可以帮助他们的。
下面这个视频就有点落井下石的味道, 拍了一些病... 阅读全帖
M***D
发帖数: 249
33
来自主题: Medicalpractice版 - Antipsychotics: A New Hope Against Glioblastoma
Yes, you are right that I am serious about Dr. Chen's study.
I guess you did not have experiences with cell culture studies:
(1) In vitro and in vivo conditions are different and you cannot COPY in
vivo therapeutic Haldol level to in vitro Haldol level.
(2) In vivo Haldol has first pass metabolism, while in vitro cultured cells
do not have it. So the in vivo serum Haldol level will be lower than that in
cultured cells.
(3) In a real patient, there are limited number of dopamine receptors on
neur... 阅读全帖
S*****s
发帖数: 287
34
这个贴光是 Re 的回帖太多了,找半天才看到你的问题。我们实验室涉及的方向比较杂
,做什么的人都有,所以我什么都沾一点。我们做的是癫痫病的 channelopathy,就是
离子通道异常引起的癫痫。Seizure 一般都是突然发作,完毕之后在很短的时间内恢复
常态,这个和离子通道 fast activation fast deactivation 的特点满符合。而且目
前在 Calcium channel, sodium channel, GABAA receptor (Chloride channel) 里都
发现了和癫痫有关的突变,而且做成 knockin 老鼠之后在老鼠上也发现了癫痫。这些
都说明 channelopathy 满靠谱。这个应该就是你说的 intrinsic 的离子机制吧。
hippocampus 应该是和 temporal lobe epilepsy 有关系,是 hippocampus 和 皮层之
间的 oscillation 发生了异常。 TLE 是一个 partial epilepsy,只涉及到大脑皮层
的某一个区域功能增强。我们的癫痫研究和 thalamu... 阅读全帖
S*****s
发帖数: 287
35
这个贴光是 Re 的回帖太多了,找半天才看到你的问题。我们实验室涉及的方向比较杂
,做什么的人都有,所以我什么都沾一点。我们做的是癫痫病的 channelopathy,就是
离子通道异常引起的癫痫。Seizure 一般都是突然发作,完毕之后在很短的时间内恢复
常态,这个和离子通道 fast activation fast deactivation 的特点满符合。而且目
前在 Calcium channel, sodium channel, GABAA receptor (Chloride channel) 里都
发现了和癫痫有关的突变,而且做成 knockin 老鼠之后在老鼠上也发现了癫痫。这些
都说明 channelopathy 满靠谱。这个应该就是你说的 intrinsic 的离子机制吧。
hippocampus 应该是和 temporal lobe epilepsy 有关系,是 hippocampus 和 皮层之
间的 oscillation 发生了异常。 TLE 是一个 partial epilepsy,只涉及到大脑皮层
的某一个区域功能增强。我们的癫痫研究和 thalamu... 阅读全帖
p**q
发帖数: 6
36
来自主题: Neuroscience版 - Discussion
Based on two-photon imaging (Stettler DD and Axel R. Neuron 2009) and recent
tracing experiments (Sosulski DL, Nature. 2011), Axel concluded that no “
grandmother" neuron exsited for olfactory sensation/perception. Do you think
this is a valid conclusion/reseaonable hypothesis, or just an
overexplanation of data?
A********e
发帖数: 117
37
http://www.lifeomics.com/?p=19815
动力学双稳态的(Kinetically bi-stable)channelrhodopsin-2光敏通道变异体能够
对神经元细胞进行高敏感度的、逐步作用式的、可逆的光控调节。
光控刺激技术因其能对神经元进行非侵入式的精准定位刺激操作而彻底改变了神经科学
领域的研究状况。光敏离子通道(light-responsive ion channel)也被称作视蛋白(
opsin),它是引领这场技术革命的大功臣。因为表达有视蛋白的神经元细胞能被特异
性地激活,所以科学家可以借此来研究神经元细胞之间如何进行沟通、交换信息,并可
以在此基础上进一步描绘出神经网络(neuronal network)。斯坦福大学(Stanford
University)的Karl Deisseroth等人与来自德国柏林洪堡大学(Humboldt University
of Berlin)的Peter Hegemann小组合作,得到了一种新的channelrhodopsin-2(ChR2
)光敏通道变异体,该光敏阳离子通道来自一种绿藻,它具有稳定的激活态和... 阅读全帖
A********e
发帖数: 117
38
http://www.lifeomics.com/?p=19815
动力学双稳态的(Kinetically bi-stable)channelrhodopsin-2光敏通道变异体能够
对神经元细胞进行高敏感度的、逐步作用式的、可逆的光控调节。
光控刺激技术因其能对神经元进行非侵入式的精准定位刺激操作而彻底改变了神经科学
领域的研究状况。光敏离子通道(light-responsive ion channel)也被称作视蛋白(
opsin),它是引领这场技术革命的大功臣。因为表达有视蛋白的神经元细胞能被特异
性地激活,所以科学家可以借此来研究神经元细胞之间如何进行沟通、交换信息,并可
以在此基础上进一步描绘出神经网络(neuronal network)。斯坦福大学(Stanford
University)的Karl Deisseroth等人与来自德国柏林洪堡大学(Humboldt University
of Berlin)的Peter Hegemann小组合作,得到了一种新的channelrhodopsin-2(ChR2
)光敏通道变异体,该光敏阳离子通道来自一种绿藻,它具有稳定的激活态和... 阅读全帖
f**d
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39
来自主题: Neuroscience版 - 自闭症大脑变大发生在两岁前
ScienceDaily (May 2, 2011) — In 2005, researchers from the University
of North Carolina at Chapel Hill found that 2-year-old children with
autism have brains up to 10 percent larger than children of the same age
without autism.
Now a follow-up study by UNC researchers has found that the children who
had enlarged brains at age 2 continued to have enlarged brains at
ages 4 and 5, but the amount of the enlargement was to the same degree
found at age 2. This increased brain growth did not continue b... 阅读全帖
f**d
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40
ScienceDaily (May 2, 2011) — Higher levels of cell chatter boost
amyloid beta in the brain regions that Alzheimer's hits first,
researchers at Washington University School of Medicine in St. Louis
report. Amyloid beta is the main ingredient of the plaque lesions that
are a hallmark of Alzheimer's.
These brain regions belong to a network that is more active when the
brain is at rest. The discovery that cells in these regions
communicate with each other more often than cells in other parts of
the ... 阅读全帖
m********a
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41
来自主题: Neuroscience版 - 用思想控制单个神经元的活动
Since every single thought is created by neuronal activity, this work
basically shows neuronal activity in certain parts of the brain affects
activity in another part. The subject may feel that they have a control of
their brain activity, it is essential "their brains" control their brains.
m******1
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42
来自主题: Neuroscience版 - 谈谈对IBM Blue Brain Project看法吧
很高兴你能指出Hopfield network,和我说的spiking network有相似有不同。
相似的是,每一个神经元都是一个0/1发生器,根据synaptic传来的输入决定是否从0变成1
不同的也很明显,如果你从Hopfield网络里面拽一个神经元出来做neuron recording,会发现大部分神经元的虽然是在0/1之间变来变去,但这个0/1串不符合poisson分布(这是我的推论,我没有仿真实测过也没有看到过类似文章)。而神经脉冲符合poisson分布这是在大量neuron recording的实验数据上总结出来的,虽有例外,但也算得上是个“金科玉律”了。我说的spiking network一定要保证神经元符合poisson分布,这应该是和Hopfield network的显著不同之一,也是难点之一。
希望也对楼上的demoner也make sense
m******1
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43
来自主题: Neuroscience版 - 谈谈对IBM Blue Brain Project看法吧
Huh, great talk with you. 我很好奇你是做什么的,会上要是见到细聊。
就我们这里来说,LIF的生理依据不足,Hodgkin-Huxley参数太多又都是微分方程,根
本跑不快。我们需要both biologically realistic + computationally cheap
最后选的是折衷的Izhikevich, "the point of the Izhikevich neuron is not to
gain an understanding of how a neuron works, but to be able to replicate a
wide range of experimentally observed neural spiking behavior cheaply for
use in large-scale simulations. "

property
huxley?
f**d
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44
来自主题: Neuroscience版 - 今年POO MU-MING在SFN有专题报告
据说有一些ION的课题组组长也随之而来给些TALK
值得去听阿
2011, DC, Society for neuroscience conference
Nov.12-16
Featured Lectures
Neurotrophins: From Axon Growth to Synaptic Plasticity CME
Speaker: Mu-ming Poo, PhD
University of California - Berkeley, Institute of Neuroscience,
Chinese Academy of Sciences
Neurotrophins were first identified as target-derived factors that
promote neuronal differentiation and survival. Over the past decades,
they also were found to regulate neuronal differentiation, axonal and
dendritic ... 阅读全帖
f**d
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45
来自主题: Neuroscience版 - 今年POO MU-MING在SFN有专题报告
2011, DC, Society for neuroscience conference
Nov.12-16
Featured Lectures
Neurotrophins: From Axon Growth to Synaptic Plasticity CME
Speaker: Mu-ming Poo, PhD
University of California - Berkeley, Institute of Neuroscience,
Chinese Academy of Sciences
Neurotrophins were first identified as target-derived factors that
promote neuronal differentiation and survival. Over the past decades,
they also were found to regulate neuronal differentiation, axonal and
dendritic growth, synapse formation and pl... 阅读全帖
D*a
发帖数: 6830
46
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: Dua (Dua), 信区: Biology
标 题: 有没有一个大脑的功能的atlas啊?
发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 17 07:16:15 2011, 美东)
现在很多根据结构的atlas,什么这个nucleus那个结构的,有没有功能结构图啊?
稍微详细点儿的,比如 xxx positive neuron是在什么什么地方,这类的,而不是大的结构。
具体问题是我想看看hypothalamus的在哪里的什么neurons是干嘛的,查文献查烦了。
。。
N****7
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47
来自主题: Neuroscience版 - 大家来给神经科学的杂志的排排名吧
同意 Neuron is better than Nature Neuroscience.
很多时候都是被 editor bias, nature neuroscience 的editor 据说是一帮 kids
Nature 在这方面,也好不到哪去,特别是关于neuroscience 的。Editor 的水平实在
有限,很难follow 最新的发展。很多时候直接拒掉很好的文章,而送一些 crap 去
review
我看到一些送来review 的,真的是 unbelievably crapy.
Neuron 多数文章的质量都比 nature neurosci 扎实。
N****7
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来自主题: Neuroscience版 - 大家来给神经科学的杂志的排排名吧
同意 Neuron is better than Nature Neuroscience.
很多时候都是被 editor bias, nature neuroscience 的editor 据说是一帮 kids
Nature 在这方面,也好不到哪去,特别是关于neuroscience 的。Editor 的水平实在
有限,很难follow 最新的发展。很多时候直接拒掉很好的文章,而送一些 crap 去
review
我看到一些送来review 的,真的是 unbelievably crapy.
Neuron 多数文章的质量都比 nature neurosci 扎实。
f**d
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49
来自主题: Neuroscience版 - job positions available
1. Two year postdoctoral position in computational neuroscience
at Boston University. (Mark Kramer)
2. computational neuroscience post-doctoral opportunity in
Boston (Stephanie Jones)
3. CIRM Semester on Theoretical, Mathematical and Computational
Neuroscience (Stephen Coombes)
4. PhD studentship, University of Genoa, Italy; brain networks
from deep brain electrophysiological data (Andrea Schenone)
5. Re: Connectionists: Neuroscience software survey: What i... 阅读全帖
l*w
发帖数: 567
50
来自主题: Neuroscience版 - 求文献 + 讨论
没错,glial cell 主要是supporting neurons. 只是neuron是神经系统的主角,所以
以前大家把研究重点放在了神经元上了。但是研究的继续深入必然就要涉及所有参与者
,而且要治疗SCI之类的疾病,没胶质细胞也不行。当然,也不能低估在发育或损伤修
复中glial cell 和神经元的相互作用。这些事件中的机理,都有理论和应用的价值。
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