M****e
发帖数: 70 | 1 NF1 can downregulate ras signaling. While upregulation of
P-MAPK was observed, it is speculated that ablation of NF1
leads to derepression of ras. The rationale is clear to me,
though you may talk about the figure per se. it also looks
fishy to me. i did not read the orginal paper on global Nf1
knockout, i guess they did similar experiment there.
and when i looked at fig3 j,k on the LCD screen of my laptop,
i was thinking, "what the heck are they showing me with two
black pannels?" then i turned |
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O******e
发帖数: 4845 | 2 ☆─────────────────────────────────────☆
icecreamman (qiqi) 于 (Mon Sep 25 17:27:43 2006) 提到:
我不很看好时下的Targeted Therapy，迄今的clinical trial结果都不太好(Gleevec是
例外)，针对PI3K，MAPK，EGFR, Ras到B-Raf的各种药，或是毒性太大，或是无疗效。
我自己比较中意angiogenesis和cancer cell metabolism，因此看好VEGF，mTOR，AMPK
，HIF和glycolysis。
我倾向于把癌症看作是metabolic疾病，而不是genetic疾病。我猜测未来的突破也许会
来自elucidation of the metabolic basis of cell transformation and theparies
based on metabolic perturbation。今天来研究代谢，手段方法比三四十年前多了很
多，所以很可能会有意想不到的新发现。
从大的角度上说，我更认同中医对人体对疾病的理 |
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e****s
发帖数: 1125 | 3 这个NEPER提取MAPK的原理是什么？
Western是来检测不是提取的吧？
看完有些糊涂。
Vortex多少次什么的有没有影响取决于结合强弱，既然Protocol里有这一步，你多一次
应该不是决定性的因素。但有时候Binding较弱确实容易解离。
buffer
可。
胞。另外，这次实验煮沸变性的时间长了，用了15min。
medium
验有影响。 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 4 呵呵 果蝇的behavior给整个neuro field贡献了学习记忆的cAMP pathway; 贡献了
circadian rhythm的基本整个mechanism; 贡献了几个重要signaling pathway的entry
point(e.g. MAPK-pathway)；甚至membrane potential的分子原理也可以算作behavior
贡献的 你再嘲笑
fly behavior很不公平的说 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 5 ft 我想说RTK的 不知道怎么就打成MAPK了。。
entry
behavior |
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c*********r
发帖数: 1312 | 6 wiki了一下，“Myc is activated upon various mitogenic signals such as Wnt,
Shh and EGF (via the MAPK/ERK pathway).”看来Wnt比较上游。在胚胎发育里也是。
可能太上游的信号通路不会“直接”诱导细胞。。。（也许长期来看有可能？也许还更
多能一些？？） |
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n********k
发帖数: 2818 | 7 check austin smith etc, there are already so many of them, to name a few,
GSk3b, erk, Mapk etc etc inhibitor can all do this, RA can do it too...IPS
is not a bad field, but u need a good angle/niche to catch the tide/stand
out now....
on |
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j***i
发帖数: 39 | 8 谢谢hanchenjammy的分享。
1）我用了1mM DTT在Kinase Buffer。这次我去掉DTT试试；
2）“当然加入MAP2K之后，对MAPK底物的磷酸化会强很多” EK293T中才纯化的ERK2,收
细胞前，用EGF刺激细胞，让EKR磷酸化，所以可以替代加MAP2K；
3）我发现分子量很小的一个位置（20Kd?），有信号，而对照点突变没有，可能是降解
产物。所以在想：是不是全长不容易被磷酸化？降解的反而暴露出位点？
有没有新的结果，给告详解。 |
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a********e
发帖数: 3771 | 9 正钒酸钠block MAPK通路.
Ca通道阻滞剂阻止感觉神经电活动. |
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q*****n
发帖数: 331 | 10 Insulin: insulin receptor
IGF-I: type I IGF receptor
The presence of the receptors in the tissue suggest that insulin or IGF-I
may stimulate their growth.
The binding of the ligands (insulin or IGF-I) will cause receptor
phosphorylation and activation, which in turn, activate downstream signaling
pathways, such as MAPK and Akt.
Use physiological concentration should be fine.
IGF-I: 5nM
insulin: 10-20 nM
If you want detailed information, search pubmed. There are so many reviews
outthere. |
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n***w
发帖数: 2405 | 11 STAT1 and STAT3 phosphorylation by porins are independent of JAKs but are
dependent on MAPK pathway and
plays a role in U937 cells production of interleukin-6.
PMID: 17258468
Please email to n***[email protected]
I appreciate your help. |
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h******y
发帖数: 1374 | 12 CST:
Phospho-p38 MAPK (Thr180/Tyr182) (D3F9) XP™ Rabbit mAb #4511
1:2000 dilution |
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i*****r
发帖数: 65 | 13 学生物的你伤不起zz 应个景（转）~~~
高考之前流传一句话“二十一世纪是生物的世纪”从此就跳进火坑了有没有！！！！！
考得比谁都高学得比谁都苦考了笔试考实验最后收入比谁都低！！！有没有！！！！！
一进大学就开始狂背这辈子除了考试就用不到的东西有没有！！！！
鸟适应飞行的进化十大特征！ 三碳循环！二十个氨基酸中文名！！！！！
英文名！化学式！化学结构！性质特征！
最变态的还有代谢途径 ！！！！！
氨基酸有多少种代谢途径有没有！
背什么生糖氨基酸 生酮氨基酸 生糖兼生酮氨基酸！！！！
你以为生完酮就完了？根本没完！还有分解转化！
转成糖有没有！转成脂肪有没有！
不要以为吃了蛋白质不吃脂肪就不会长胖有没有！蛋白质可以转化为脂肪的！
你以为把氨基酸代谢背完了就完啥了！没完！！！！！！
还有糖代谢！糖氧化！糖酵解！脂肪代谢！脂肪酸代谢！核酸代谢！有没有！
DNA完了RNA RNA完了rRNA, rRNA完了mRNA，然后RNAi！！！！！
你有完没完了！！！
原核遗传学完，还有真核遗传！
这还只是一门课有没有！！！！！
你说学生物的人不正常！背下来这么多没用的东西还能正常么！！！！
学GRE的... 阅读全帖 |
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S****r
发帖数: 982 | 14 别跑题啊，咱老中就这么俗啊，谈来谈去都是什么头衔啊，文章啊。
这版上做神经的同学一大把啊。来讲讲饶同学的学术贡献，比如发现了哪个不同凡响的
分子/现象，创建了什么领域，该领域有多大影响，有多少group参与其中啊，什么的。
比如，王晓东同学，细胞凋亡领域的创建者之一。韩家淮，p38 MAPK领域的创建这之一
。这些都是有很大影响的，每年有数千片研究论文发表的领域。 |
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J********n
发帖数: 534 | 15 3 first author papers. Not bad at all.
Role of the Rho pathway in regulating valvular interstitial cell phenotype
and nodule formation.
Gu X, Masters KS.
Am J Physiol Heart Circ Physiol. 2011 Feb;300(2):H448-58. Epub 2010 Dec 3.
Regulation of valvular interstitial cell calcification by adhesive peptide
sequences.
Gu X, Masters KS.
J Biomed Mater Res A. 2010 Jun 15;93(4):1620-30.
Role of the MAPK/ERK pathway in valvular interstitial cell calcification.
Gu X, Masters KS.
Am J Physiol Heart Circ Ph... 阅读全帖 |
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J********n
发帖数: 534 | 16 3 first author papers. Not bad at all.
Role of the Rho pathway in regulating valvular interstitial cell phenotype
and nodule formation.
Gu X, Masters KS.
Am J Physiol Heart Circ Physiol. 2011 Feb;300(2):H448-58. Epub 2010 Dec 3.
Regulation of valvular interstitial cell calcification by adhesive peptide
sequences.
Gu X, Masters KS.
J Biomed Mater Res A. 2010 Jun 15;93(4):1620-30.
Role of the MAPK/ERK pathway in valvular interstitial cell calcification.
Gu X, Masters KS.
Am J Physiol Heart Circ Ph... 阅读全帖 |
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m******g
发帖数: 69 | 17 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20810907
A role for AMPK in increased insulin action after serum starvation
Am J Physiol Cell Physiol November 2010 299:(5) C1171-C1179; published ahead
of print September 1, 2010, |
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m******g
发帖数: 69 | 19 这个帖子对于一个即将要读生物PHD的人是个很大的打击。 我个人感觉随便找个人，在
实验室教他一个月，怎么cell culture, 怎们做western。只要有钱买抗体，就能做
cell signal的活。我现在觉得cell signal就是一个大大的坑！一看公司送来的signal
poster，他妈的全都有联系。从A一只能联系到Z，随便找个信号分子，做做induction
,看看pathway的key enzyme的变化，就可以下结论说，哦，这个分子影响这个pathway
，然后做做细胞功能assay，得出结论这个分子有神马功能。然后发现这个分子是蛋白
大家族的一员，有开始做其他成员的pathway，或者又发现个上游或者下游的调节因子
，然后又开始做这个因子的pathway，最后做做in vivo，KO mice，会玩的还会看看这
个分子在免疫细胞的作用。
然后做做siRNA,shRNA,FISH,IHC 说是这个东西是潜在的biomarker，又说mAb,si/sh-
RNA可能成为治疗某种疾病的手段。
我感觉太胡掰了，简直是自己给自己讲故事。天天MAPK.NF-KB,AP1,GP... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 20 here you are:
A spatially distributed, signaling-transcription cascade robustly
discriminates between transient and sustained
ERK activities at the c-Fos system level:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20493519
Stimulus-dependent MAPKs, ERK1/2 and ERK5, in DRG, motor neuron:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21220101
Modeling review:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16482094
Modeling cancer review:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20836040
NGWet lab tools review:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21999828
Conclus... 阅读全帖 |
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m******5
发帖数: 1383 | 21 Since oxygen recover would also induce many MAPK pathway, I don't understand
why inhibition of p53 alone could be so effective
apoptosis.
after
similar |
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c**********r
发帖数: 2372 | 22 total的 p38和mapk
有前辈用过不？求推荐品牌～
p38最好不要是mouse的
ERK最好不要是rabbit的
多谢啦 |
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b****r
发帖数: 17995 | 23 我这个预测的最根本前提就是NGS和未来的计算能力能让我们相当有把握地找到致癌突
变。接下来的模型只是验证一下，失败的风险理论上要远低于现在的技术水平下找到的
那些致癌突变
另外2W！显然并不符合人体内的状况。现在的主流观点是double hits，了不起就是
multiple hits。正常人体一个细胞内的突变率没有那么高，很少哪个正常细胞有机会
积累什么几十个突变，应该最多积累个几个突变也就发生质变成为癌细胞了。而且我觉
得很多癌症应该是殊途同归的，就好比现在已经发现很多时候都会和P53，PTEN， AKT
，MAPK，RAS等一些主要的pathway接上，将来药物的选择也可以拿这些已有的pathway
作为线索
下。 |
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I*******o
发帖数: 49 | 24 RT，不管动物还是植物。
请教各位大拿几个问题：
1. 以前做得好的有哪些人，现在做得好的有哪些？
2. 用什么方法研究？
3. 目前进展如何，瓶颈是什么？
4. 将来的研究生长点在哪？
谢谢！ |
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w********r
发帖数: 1431 | 25 老一辈的有michael karin， Roger Davis，Melanie H. Cobb等等，
现在都没什么人专门做这个了吧？ |
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d******u
发帖数: 99 | 27 in plant field:
Shuqun Zhang |
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s******i
发帖数: 115 | 29 Jen Sheen 2001发在NATURE的有关MAPK被争论（甚至是攻击）了10多年，结果在今年被
NBIS的张跃林发在cell host mocrobe 上的论文证明是正确的。但这一次到底谁对谁错
让我们拭目以待。
学术界有争论是正常的，任何方法都有局限性，不能唯方法论，但真理只有一个。 |
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H**O
发帖数: 89 | 31 早上起来在C&EN上看到一则新闻说百济神州(Beigene)以2.33亿美元的价格向德国Merck
转让了BGB-283的除中国外的全球范围内的研发和销售。除此，协议还包括了未来在销
售上可能取得净销售收入基础上可达两位数百分比的提成(原文)。 BGB-283是一种用于
治疗癌症的第二代BRAF inhibitor，目前处于临床前开发阶段，准备明年进入临床测试
期，有效针对黑色素瘤和大肠癌。BRAF蛋白是MAPK通道的下游成分，与细胞内的信号传
导有关，能促进细胞生长，2002年发现在人类癌症细胞里有突变(DOI: 10.1038/
nature00766)。而目前市面上的BRAF inhibitor类的药物有罗氏的Vemurafenib，Brand
name是Zelboraf，FAD 2011年批准通过的。
另外一个上个星期刚被FDA批准用于黑色素瘤晚期治疗的BRAF inhibitor类药物则是葛
兰素史克Dabrafenib，Brand name是Tafinlar。
百济神州这回可算是一夜变身高富帅，这也是近两年来第二次跨国制药公司获取中国研
发的药物。第一次是由和记黄埔向阿斯康... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 32 Plus PMID 23953117 Lim WA@UCSF new Cell paper:
Coyle SM, et al., (2013).
Exploitation of latent allostery enables the evolution of new modes of MAP
kinase regulation.
Cell. 154: 875-87.
n.b. MAPK 变构反应 原来是为了进化潜规则 中 起到调控另外的pathway/s 开关作用
的...
>Abstract
ignored stuff
>The magnitude of this latent allosteric potential drifts widely among pre-
Ste5 MAP kinases, providing a
pool of hidden phenotypic diversity that, when revealed by new activators,
could lead to functional divergence and to the evo... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 33 Plus PMID 23953117 Lim WA@UCSF new Cell paper:
Coyle SM, et al., (2013).
Exploitation of latent allostery enables the evolution of new modes of MAP
kinase regulation.
Cell. 154: 875-87.
n.b. MAPK 变构反应 原来是为了进化潜规则 中 起到调控另外的pathway/s 开关作用
的...
>Abstract
ignored stuff
>The magnitude of this latent allosteric potential drifts widely among pre-
Ste5 MAP kinases, providing a
pool of hidden phenotypic diversity that, when revealed by new activators,
could lead to functional divergence and to the evo... 阅读全帖 |
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e****s
发帖数: 1125 | 34 看过他的一些文章！对我自己的研究启发很大。我很欣赏他的工作。
你是做MAPK的？ |
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e****s
发帖数: 1125 | 35 这篇文章估计不好懂慢慢读。
我对Lim是非常欣赏的。现在做的方向也是读了他几篇MAPK方面的文章后，受启发，开
始的。
他有些CNS是非常Solid的生化，信号传导方面的工作。 |
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x****z
发帖数: 327 | 36 跟风跪求审稿机会（配子体发育、植物抗逆、信号转导、蛋白质组、代谢组等）
为了绿卡申请需要积攒审稿经验，首先感谢这个信息交流平台。本人基本背景如下：
植物学领域，硕士期间研究方向为植物雄配子体发育，实验技术以分子生物学为主。博
士期间研究方向为植物保卫细胞内荷尔蒙（ABA和MeJA）信号转导和气孔介导的抗逆机
理，实验技术包括蛋白质组（iTRAQ, 2D gel, ICAT, cysTMT等）、分子生物学、激酶
（SnRK和MAPK类）相关实验技术。博士后期间为植物保卫细胞内光信号转导，以代谢组
技术为主。熟悉植物物种拟南芥、油菜、蚕豆等。
目前有十篇文章发表，IF 5-10一作四篇，open access一作两篇，其余IF 2-10。 审稿
经验IF 2左右的两篇，其余都是open access无IF的>10篇，和背景并不十分符合。
跪求审稿机会，转让或推荐。有IF最好，背景相关的有无IF皆可。感谢万分！
联系方式 m*****[email protected]或者站内。再次感谢！ |
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M*****2
发帖数: 379 | 37 最近需要test p38 pathway， 用了specific inhibitor SB 203580
但是居然发现在2种不同cell line里， SB 203580都明显的增加了phospho－p38，而且
做了个dose－dependent试验，单纯只加SB 203580，不但没有inhibit，反而activate
了p38。
已经试过了Cayman和 Sigma 2家的chemical，而且也serum free12h， pre－
treatment2小时过，能troubleshoot的都想过了，还是这种相反的结果，实在是想不通
怎么回事？
请教大家有过类似的问题么？ 有可能是什么原因呢？ 等着这个inhibition做最后的in
vitro试验，折腾好久了。。。 |
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s*******n
发帖数: 37 | 38 你不能用phospho P38去检测p38 inhibitor,inhibitor 结合kinase domain,和
activation domain 的磷酸化是两回事。你应该用p38底物(mapkapk1?)的磷酸化去确
定抑制剂的效果。
activate
in |
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b*******1
发帖数: 16 | 42 岗位一：吴虹课题组博士后工作人员 （2名）
主要职责：
1）独立开展科研工作，动手进行体内外实验；
2）协助PI负责实验室研究课题的设计和开展；
3）参与科研基金撰写；
4）协助培养研究生。
招聘条件：
1）品学兼优，身体健康，年龄在40岁以下；
2）近年来在国内外获得分子生物学、细胞生物学、肿瘤遗传学、药理学等相关专业博
士学位；
3）至少具备一项以下领域内的工作经验和文献发表：
a. 独立运用细胞和动物模型进行肿瘤药物的机理研究
b. 在分子生物学和细胞生物学领域有深厚的知识背景；
c. 在蛋白质分析、核酸分析和细胞生长分析等相关技术方面有丰富的经验；
d. 对治疗癌症的药物疗效和安全性评价方面有强烈的兴趣和研究背景 ；
4）有较强的团队合作精神，沟通协调能力强，动手能力强，工作细心，积极主动，能
持之以恒；
聘用待遇：
本职位将为你提供在生物学领域极具竞争力和创造性的工作机会。博士后工作人员薪酬
标准按照北京大学生命科学院和北大-清华生命科学中心相应规定及个人工作经验及能
力确定。
联系方式：
有意者请将本人应聘材料电子文档发至以下联络方式（请在应聘材料及邮件主题上注明
：姓名 ... 阅读全帖 |
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j*********7
发帖数: 99 | 43 因为一些个人原因，必须在年底之前申请绿卡，paper什么的一直在努力，但是review
还需要大量积累。
恳请版上的各位前辈能给一些机会，十分感谢。
研究方向：
1. Molecular mechanism of Oligodendrocyte development and myelination in
rodent
2. Post-translational modification of protein and its function, e.g.,
acetylation, phosphorylation and ubiquitination of transcription factors
3. Signaling transduction and its role in glia development, e.g. ,mTOR
and MAPK pathway.
4. Epigenetic regulation of central brain development
5. Glia response in brain injury
恳请前辈帮... 阅读全帖 |
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j*********7
发帖数: 99 | 44 恳请版上的各位前辈能给一些机会，十分感谢。（有review经验）
研究方向：
1. Molecular mechanism of Oligodendrocyte development and myelination in
rodent
2. Post-translational modification of protein and its function, e.g.,
acetylation, phosphorylation and ubiquitination of transcription factors
3. Signaling transduction and its role in glia development, e.g. ,mTOR
and MAPK pathway.
4. Epigenetic regulation of central brain development
5. Glia response in brain injury
恳请前辈帮忙，不胜感激. 谢谢!! 如果需要简历，我可以发个人简历。
email: [emai... 阅读全帖 |
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r******g
发帖数: 600 | 45 接了janeway的衣钵，最近这几年，把PRRs研究的挺好的啊
GATA3-Th2 这算是重大贡献了吧
MAPK的一大堆东西不都是flavell搞出来的么～ |
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v********a
发帖数: 646 | 46
哪篇文章啊，谢谢
Rinn JL, M. Kertesz, J. Wang, S. Brunghman, H. Goodnough, B. Wong, M. Cleary
, J.A. Helms, E. Segal, H.Y. Chang. (2007) Functional Demarcation of Active
and Silent Chromatin Domains in Human HOX Loci by Non-Coding RNAs. Cell. Jun
29;129(7):1311-23.
F. Lan, P.E. Bayliss, J.L. Rinn, J.R. Whetstine, J.K. Wang, S. Chen, S.
Iwase, T.M. Roberts, H.Y. Chang, and Y. Shi (2007). A histone H3 lysine 27
demethylase regulates animal posterior development. Nature Oct 11;449(7163):
689-94 (online 9... 阅读全帖 |
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l********n
发帖数: 260 | 47 1. Zhang P, Wei Y, Wang L, Debeb BG, Yuan Y, Zhang J, Yuan J, Wang M,
Chen D, Sun Y, Woodward W, Liu Y, Dean DC, Liang H, Hu Y, Ang KK, Hung MC,
Chen J, Ma L. ATM-mediated stabilization of ZEB1 promotes DNA damage
response and radioresistance through CHK1. Nat Cell Biol. In Press.
2. Chen D, Sun Y, Yuan Y, Han Z, Zhang P, Zhang J, You MJ, Teruya-
Feldstein J, Wang M, Gupta S, Hung MC, Liang H, Ma L. miR-100 induces
epithelial-mesenchymal transition but suppresses tumorigenesis, migration
a... 阅读全帖 |
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b**********a
发帖数: 930 | 48 范衡宇（东北人） 博士
浙江大学生命科学研究院教授、研究员、博士生导师
教育和工作背景
1993-1997： 东北农业大学生物工程系 学士
1997-2000： 东北农业大学生命科学学院 动物组织胚胎学硕士
2000-2003： 中国科学院动物研究所 生殖生物学博士
2003-2006： 美国德克萨斯大学西南医学中心（UTSW）分子生物学系博士后
2006-2009： 美国贝勒医学院（Baylor College of Medicine）分子与细胞生物学系博
士后
2010-至今： 浙江大学生命科学研究院教授、研究员、博士生导师
学术奖项与活动
2002：中国科学院动物研究所 优秀研究生奖
2003：中国科学院 院长优秀奖
2009：美国国立卫生研究院 杰出研究奖学金 (Ruth L. Kirschstein National
Research Service Award, National Institute of Health, USA).
2009：北美生殖生物学会 优秀研究奖 (Lalor Foundation Merit Award)
2010：国际卵巢生物学会 杰出青... 阅读全帖 |
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e**r
发帖数: 1144 | 49 Structural insights into the enzymatic mechanism of the pathogenic MAPK
phosphothreonine lyase. Mol. Cell, 28, 899-913.
这个？ |
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T*****e
发帖数: 247 | 50 说不了下一个热点，莫若说说现在的方向有哪些。
1. 开发工具
A. 监测神经活性
GCaMP到6是不是已经差不多了？但是Ca2+究竟能代表多少neuronal activity？
cAMP的sensor能代表多少？
传统的IEG能代表多少？缺点是什么？记得有人用MAPK磷酸化水平来估计neuronal
activity
几种非电生理的voltage sensor 好用吗？
B. 改变神经活性
大名鼎鼎的optogenetics
恒温动物不能用的温控通道TrpA1
最近热炒的磁感应，还有超声控制的
C. 更高解析度观察突触
几种突触活性区的marker
证明物理联系的比如split GFP
能不能不通过电镜观察synaptic cleft？
D. 各种活体成像 高端显微镜 通过影像（包括电镜）重建神经网络
高解析度
实时成像
快速扫描
高穿透性
2. 具体的问题（水平有限，说说自己熟一点的）
具体的行为模型：学习记忆，生物节律，睡眠，aggressive，mating，social
interaction，decision making, pain, fear, navigation,... 阅读全帖 |
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