M********a 发帖数: 10 | 1 默沙东(美国默克), 世界500强,全球第二大制药公司。
Merck & Co., Inc., known as MSD outside North America, is committed to
scientific research in China. MSD China R&D is proud to announce the launch
of the China Postdoctoral program offering Chinese postdoctoral researchers
a new path to the forefront of their research (in the areas of Biostatistics
, Bioinformatics and health/medical informatics). The MSD China R&D post-doc
will be stationed in the MSD Beijing site and will conduct research with
scientists in MSD Chi... 阅读全帖 |
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m*****7 发帖数: 366 | 2 我是做Pancreatic Cancer genetics方向的,包括像germline genetic variant/
mutation (GWAS和whole exome sequencing),somatic genetic variants都有涉及,
欢迎也是做胰腺癌genetics一块的同行(包括population/clinic level或basic
science level)一起合作讨论。
多谢! |
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M*P 发帖数: 6456 | 3 建议增加样品量,然后做个gwas啥的投nature
falun |
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l*****t 发帖数: 2019 | 4 可以问一下搞基因和疾病(GWAS么),怎么对付big data。是big.data 问题么?
sorry,我走题了。 |
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g*****g 发帖数: 3 | 5 Two postdoctoral fellow positions (2-3 year, extension possible) in
Statistical genetics and Bioinformatics are available in the Department of
Biostatistics at Virginia Commonwealth University (VCU, a top 100 research
university in US).
One position will focus on haplotyping, quantitative trait loci (QTL)
mapping, identifying gene-gene and gene-environment interactions for complex
traits with large pedigrees.
The other position will focus on genome-wide association studies (GWAS)
using genome-wi |
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g*****g 发帖数: 3 | 6 Two postdoctoral fellow positions (2-3 year, extension possible) in
Statistical genetics and Bioinformatics are available in the Department of
Biostatistics at Virginia Commonwealth University (VCU, a top 100 research
university in US).
One position will focus on genome-wide association studies (GWAS) using
genome-wide SNPs and gene expression data, modeling gene expression network,
admixture mapping, sequencing data analysis and multiple hypothesis testing
.
The other position will focus on hap |
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M********a 发帖数: 10 | 7 默沙东(美国默克), 世界500强,全球第二大制药公司。
Merck & Co., Inc., known as MSD outside North America, is committed to
scientific research in China. MSD China R&D is proud to announce the launch
of the China Postdoctoral program offering Chinese postdoctoral researchers
a new path to the forefront of their research (in the areas of Biostatistics
, Bioinformatics and health/medical informatics). The MSD China R&D post-doc
will be stationed in the MSD Beijing site and will conduct research with
scientists in MSD Chi... 阅读全帖 |
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q******o 发帖数: 17 | 8 赛福解码(北京)基因科技有限公司(简称“赛福基因”)坐落于中关村核心区域,是
微软创投加速器孵化的唯一一家针对医疗健康基因大数据深度挖掘与精准分析的初创团
队,并已于近期完成天使轮融资。赛福基因由顶级美国生物信息学和转化医学的海归博
士组成,公司高级顾问团包括美国唯一生物医学信息科学院院士、美国精准医疗联盟技
术负责人以及美国遗传咨询师等。
赛福基因专注于中国人基因大数据在健康管理与疾病诊疗领域的产业化应用,致力于推
进中国的精准医疗事业,让每个中国人都拥有一本基因使用说明书。
我们为医院、科研单位和三方检测机构提供数据分析解读服务及各类疾病基因检测产
品的研发服务,同时我们也正在开发自动化基因数据分析平台,并着手建立专属于中国
人的疾病数据库。
在赛福基因,等待你的除了有增长空间的报酬,更有一帮有才、有趣、敢想、敢拼的同
事,会用心向你传授经验,期待与你共同成长!
如果你热爱生命,期望去影响甚至改变数亿中国人的健康事业,请联系我们,期待你的
加入!
具体招聘职位及招聘要求如下:
1. 生物信息分析师
工作地点: 北京
数量:2名
岗位职责:
· 肿瘤及遗传疾病相关的NGS数... 阅读全帖 |
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s***l 发帖数: 2236 | 10 ☆─────────────────────────────────────☆
iamtheretoo (iamhereiamthere) 于 (Mon Aug 29 15:34:54 2011, 美东) 提到:
听说美国也有gifted school,我们正在准备买房,有朋友劝我们不用考虑学区,因为
以后女儿可以上gifted school。对女儿的智力很有信心,有疑惑:
这种学校是怎么选拔的?也有考试?
是不是不用自己交钱,比私立学校好吗?
听说会有专门的校车接送孩子,是不是就不用考虑离家远近了?
谢谢!!
☆─────────────────────────────────────☆
mitbbser1 (mitbbser) 于 (Mon Aug 29 15:39:26 2011, 美东) 提到:
不要钱, 是公立系统的一部分. 因材施教, 就和智力落后的孩子需要特殊教育一样.
gifted program具体执行因学区而异, 你得自己在当地打听.
☆─────────────────────────────────────☆
winterlake (冬... 阅读全帖 |
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g*****g 发帖数: 3 | 11 Two postdoctoral fellow positions (2-3 year, extension possible) in
Statistical genetics and Bioinformatics are available in the Department of
Biostatistics at Virginia Commonwealth University (VCU, a top 100 research
university in US).
One position will focus on haplotyping, quantitative trait loci (QTL)
mapping, identifying gene-gene and gene-environment interactions for complex
traits with large pedigrees.
The other position will focus on genome-wide association studies (GWAS)
using genome-wi |
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b*******m 发帖数: 3 | 12 Hiring unit:
Garmire Group (PI starting 09/01/2012, the postdoc position available 09/01
or later) )
University of Hawaii Cancer Research Center
Job description:
Located on the beautiful sea shore of Honolulu, Hawaii, overlooking the
Pacific Ocean, the University of Hawaii Cancer Center (UHCC) is one of only
66 research organizations in the country designated by the National Cancer
Institute. Its mission is to focus on key cancers that impact the multi-
ethic population of Hawaii, as well as wor... 阅读全帖 |
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s********r 发帖数: 109 | 13 准备申请绿卡,希望增加审稿机会。
本人在Nat Genet, Plos Genet, NAR, Bioinformaticc 等杂志不同研究方向发表10+文
章。为Plos Genet, BMC Bioinformatics, Plos Computational Biology 等杂志审稿6
次。
站内联系。
谢谢! |
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T******y 发帖数: 14506 | 15 Nature Genetics 上一堆这样的文章,有助于科学家们深入解析肝癌的发病机制是他瞎
吹。没谱的事。
GWAS用钱堆出的,没技术含量。 |
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m****6 发帖数: 30 | 16 目前在英国某研究型大学当讲师(英国人人tenure),非牛剑,文章一般,只有领域内
的几篇
文章,无CNS,综合影响因子大约30。因家庭原因考虑回国。请不要人肉。
上次回国时,在沿海某中医药类大学进行沟通,初稿如下,急需大牛指点。
1. 科研启动经费20万元
我目前主要从事GWAS数据的运算也了解二代测序的运算。学校目前没有CLUSTER, 想买
个小服务器,自己算东西,也想买个小型的测序仪,估计学校也没有。加起来大约100
万吧。
2. 40万元人才补贴 分期付款 先付18万。看表现3年后付12万,5年后付10万。
我看过他们的文件标准,对于海外助理教授级别的,都是60-70万。不过我被认定为学
术骨干 而不是学科带头人,所以是40万标准。怎么谈?
3.12个月房补,3000
4.专业技术五级岗位
这个是副教授级别里最高的
5.5 年内,主持国家级课题1项,省部级课题1项及以上;以第一作者或通讯作者发表
JCR一、二区论文3篇或总影响因子15以上。
国家课题似乎很难,我觉得改成省级课题2项比较好。 文章的要求 我觉得还合理。
6. 乙方到甲方工作,须与甲方签订聘用合同,实行合同管理,... 阅读全帖 |
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l*******i 发帖数: 890 | 17 Have review experience.
Will provide prompt and high quality review.
Thank you for your consideration! |
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v*****e 发帖数: 309 | 18 主要是生物方面,偏计算的。二代测序相关,进化选择,疾病的association study (
GWAs)研究等都可胜任。
不胜感激,谢谢。 |
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h*******e 发帖数: 142 | 19 Congratulations!
Request Sent to you, Please check you mail. Thank you so much |
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A*F 发帖数: 2272 | 20 转一篇审稿,IF=4,关键字epithelial cell, cytokine (gone)
另外需要审稿人,IF=2.5,必须有GWAS analysis,population genetics背景,长期有效
请把简历或者最近发表文章列表发到[email protected]
(function(){try{var s,a,i,j,r,c,l,b=document.getElementsByTagName("script");l=b[b.length-1].previousSibling;a=l.getAttribute('data-cfemail');if(a){s='';r=parseInt(a.substr(0,2),16);for(j=2;a.length-j;j+=2){c=parseInt(a.substr(j,2),16)^r;s+=String.fromCharCode(c);}s=document.createTextNode(s);l.parentNode.replaceChild(s,l);}}catch(e){}})();
/* ]]> */ |
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S**********e 发帖数: 1789 | 21 流行病学, GWAS的稿子, 4分多。需要的同学私信给我,附上简历。 需要两个,先来
先得。 |
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h*********9 发帖数: 233 | 22 生物信息学,NGS在基因检测,疾病研究方面的应用,NGS数据分析,DNA甲基化
与疾病的关系,DNA相关的方法学等等。
包子答谢! |
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A*F 发帖数: 2272 | 23 第一篇:GWAS, polymorphism analysis. 需要有相关经验,只做wet lab的不行
第二篇:apoptosis, p38 MAPK, JNK signaling (gone)
请把cv发到[email protected]
/* */
请注明你想要review哪一篇,谢谢 |
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A*F 发帖数: 2272 | 24 第一篇 GWAS study, SNP analysis
第二篇 bioinformatics analysis on differetially expressed genes
需要相关领域背景,如果您只做wet lab,应该没法review这两篇文章
请发简历至[email protected]/* */ 谢谢 |
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S****6 发帖数: 214 | 25 EB1B 够了:
文章40 + 其中今年4篇去年4篇 含一篇一坐5分杂志 5篇2作,
引用 4000+ 其中2500来自并列3作,600来自2作。400来自4篇一坐。
准备了 5篇推荐信,其中2篇 独立推荐人。律师起草自己修改后最终版发出去了正在等
待推荐人回复。
今年有一些审稿,不知道够不够 claim 一项, 变成 申请 EB1A?
6分杂志 一次 ,稿子毙了。
2-3 分杂志 5篇8次,含2审3审,毙了两篇。
1分杂志一次,也毙了稿子。
合计总共7篇10次
Eb1a 毕竟会比 EB1B 早得自由身。
拖拖拉拉。可是看着川普上台,政策未卜, 着急了,想抓紧元旦前交上。所以来不及
增加多少审稿了。而且自己也工作相当忙。
有没有网友可以帮忙再提供几票稿子? 衷心感谢。现在工作方向: Bioinformatics ,
medical genomics,全套 NGS, gwas, personalized medicine. |
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发帖数: 1 | 26 gwas文章 sample size很大 多个国家多机构合作 所有贡献sample的pi名字都要放
上去~ |
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s********n 发帖数: 80 | 27 journal: Bioinformatics
keywords: Bayesian, Tree-Based, QTL, GWAS
很好的杂志,如果想要的请站内信联系,请注明 姓名,邮箱,个人简介。 |
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S******a 发帖数: 2369 | 28 U gotta be kidding...
I just can't match "Lau Shr" and "Qe Di Ba Gwa" in this "老实点期待更多的八
卦吧"
LOL |
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S******a 发帖数: 2369 | 29 U didn't get it? LOL
"Lau Shr" shouldn't "Qe Di Ba Gwa".
^_^
Too much generation gap. Sorry for u. |
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T******T 发帖数: 3066 | 31 刘SHR的量化宽松狄吧挝
???? what the heck ?
8&text=Lau+Shr+Qe+Di+Ba+Gwa&sl=en&tl=zh-CN#zh-
CN|en|Lau%20Shr%20Qe%20Di%20Ba%20Gwa |
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i****a 发帖数: 36252 | 32 www.bing.com/translator
劉 Shr Qe 迪巴藝術
8&text=Lau+Shr+Qe+Di+Ba+Gwa&sl=en&tl=zh-CN#zh-
CN|en|Lau%20Shr%20Qe%20Di%20Ba%20Gwa |
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m*******t 发帖数: 168 | 33 My boss is looking for a full-time statistician. The main job is to analysis
genetics data, including GWAS, meta analysis, exom chip, microarray.... The
qualified candidate should familiar with R, and LINUX.This position haven't
been posted, so I don't have any other information.
有意请发简历到m*******[email protected],谢谢。 |
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n***o 发帖数: 95 | 34 英文字典要在"American Heritage Dictionary"附录-Indo-European Roots里去找。
查gwa, 去掉w变成梵文动词根gam, 德文kommen, 英文come。去掉g变拉丁文的venire
。gw两个和起来变希腊文的bainein。。。 |
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wh 发帖数: 141625 | 35 不错啊。1988不知道是什么书。生命之轻你看的是中文版?
我找到那个id了:
发信人: nonso (nonso), 信区: LeisureTime
标 题: Re: a book list
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Jun 26 01:21:37 2010, 美东)
《理想国》原文本来就很文言哦。
gam or 这个or可是金子的意思喔。至于这个gam,更是大有来头。。。
发信人: nonso (nonso), 信区: LeisureTime
标 题: Re: a book list
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Jun 26 12:16:19 2010, 美东)
英文字典要在"American Heritage Dictionary"附录-Indo-European Roots里去找。
查gwa, 去掉w变成梵文动词根gam, 德文kommen, 英文come。去掉g变拉丁文的venire
。gw两个和起来变希腊文的bainein。。。
发信人: nonso (nonso), 信区: LeisureTime
标 题: Re: a book list
... 阅读全帖 |
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r****e 发帖数: 3373 | 36 LeisureTime版 - sasa,请教你一个无耻的问题
iamwhatieat
2011-01-27 15:29:13
来自: 24.159.
1
霍乱时期的爱情我90年读的。分明记得那版紫色书皮,最后阿里萨终于得手时,费尔米
纳已经老朽,"耻骨上的毛"都没多少了。前几天网上闲翻,版本显然更新,但译笔粗
糙,更可恶的是,根本就没有关于耻骨的描写。。不禁有一点怀疑,难道自己记错了?
你是马尔克斯专家,所以不揣无耻,把这个关于耻骨的问题写出来,请你解惑。
izel
2011-01-27 15:31:35
来自: 129.59.
2
无耻!下流!
wh
2011-01-27 15:34:22
来自: 67.86.
3
乐子!你让我们版损失2000伪币!星版搞十大星星活动,每个得奖id有200,版面又有
2000伪币。臭乐子!
izel
2011-01-27 15:35:07
来自: 129.59.
4
庸俗!
wh
2011-01-27 15:38:53
来自: 67.86.
5
包子是王道!这是你说的!
lhr
2011-01-27 15:43:04
来自: 137.71.
6
发包... 阅读全帖 |
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b****r 发帖数: 17995 | 37 基因组测序也分很多种的,什么技术测,精确度,覆盖面都可以有很大差别。
比如我们这只测3%基因组的外显子区,发单基因病的临床诊断报告,7000刀,但实际上
另外97%的突变也可能导致很多问题,现有的技术只能忽略之
市面上1000多刀给你测个外显子区的公司有不少了,但那个不可能是临床诊断级的可信
度,甚至人家就是给你多少个G的测序数据,剩下的都得你自己分析处理,而分析处理
需要的技术能力,特别是临床那一块的理解力很高,即使我们学校,内部都有争议,这
个东西到底能不能上临床
至于用预测疾病风险到国内忽悠,这个恐怕几年前刚开始做GWAS不久的时候很多人就有
这想法了。我也想过往国内搞,但是我觉得没戏。刚开始可能忽悠得到几个人,但是这
玩意太不准了,很快就会被识破的,比脑白金可能还不如。而且你还得能像脑白金那样
往广告上和市场拓展上砸银子
真正要比较准确预测将来这些常见多基因病风险,我估计20年肯定不够。常见多基因病
的环境因素太重要了,因而造成工作过程中准确估算哪个突变带来多少风险的能力会很
差,然后真要validate结果也很难,你总不能随便就等40年再看是不是准确吧。当然我
不否认,这个市... 阅读全帖 |
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c******y 发帖数: 547 | 39 来自主题: ChineseClassics版 - 篆隶楷行草 基因检测疾病的时代到来了么?
作者: 高翔
最后更新:2010-07-22 11:32:17 来源:南方周末
http://www.infzm.com/content/47911
"科学可以超速发展,却无法实现大跃进。虽然现在已经可以用漱口水检测易感基因,
但是利用这些基因进行疾病诊断和预测为时尚早。现阶段,它们对于病因学的意义更大
。"
2000年6月26日,美国总统克林顿和英国首相布莱尔联合宣布,科学家们已绘制完成有
史以来人类第一张基因组草图。其后10年间,人类遗传学研究取得了长足进展,其中最
令人瞩目的当属全基因组关联分析(Genome Wide Association Study, GWAS)。这类
研究,通常将病人和健康人群的数十万个基因位点进行扫描,然后比较两类人群的异同
,从而找出与该疾病可能的相关突变基因。通过这个办法,在过去的两三年中,上百种
常见疾病或人体特征(如头发颜色)的易感基因被发现,极大地促进了我们对疾病病因
和病理的理解。
常见基因突变对人类的危险度并不高。目前所有了解的易感基因加在一起,才能解释常
见疾病遗传度中的10%左右。 (CFP/图)
与此同时... 阅读全帖 |
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c******y 发帖数: 547 | 40 来自主题: ChineseClassics版 - 篆隶楷行草 基因检测疾病的时代到来了么?
作者: 高翔
最后更新:2010-07-22 11:32:17 来源:南方周末
http://www.infzm.com/content/47911
"科学可以超速发展,却无法实现大跃进。虽然现在已经可以用漱口水检测易感基因,
但是利用这些基因进行疾病诊断和预测为时尚早。现阶段,它们对于病因学的意义更大
。"
2000年6月26日,美国总统克林顿和英国首相布莱尔联合宣布,科学家们已绘制完成有
史以来人类第一张基因组草图。其后10年间,人类遗传学研究取得了长足进展,其中最
令人瞩目的当属全基因组关联分析(Genome Wide Association Study, GWAS)。这类
研究,通常将病人和健康人群的数十万个基因位点进行扫描,然后比较两类人群的异同
,从而找出与该疾病可能的相关突变基因。通过这个办法,在过去的两三年中,上百种
常见疾病或人体特征(如头发颜色)的易感基因被发现,极大地促进了我们对疾病病因
和病理的理解。
常见基因突变对人类的危险度并不高。目前所有了解的易感基因加在一起,才能解释常
见疾病遗传度中的10%左右。 (CFP/图)
与此同时... 阅读全帖 |
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t*d 发帖数: 1290 | 41 看看这个吧:
http://glass.ed.asu.edu/gene/papers/meta25.html
再区亚马逊或图书馆弄两本书看看。
没有什么太深的东西。就看你怎么把不同的数据集综合起来,确定显著性和作用效果。
好多现成方法都非常直观。
现在不少人用综合不同的 GWAS 数据集,做meta-analysis。好多人都凭直觉来做,也
说得过去。比如最简单的就是,gene在A集中显著,B集中也显著,那就更确信这个gene
的association。如果A集中显著,B集中不显著,那就再费点脑子,massage一下数据(
也就是 meta-analysis 一下)。当然这种massage的方法最好别人发表过的。各种
massage的方法多如牛毛,你再组合组合,很大的可能你可以找到一种方法,弄个显著
出来。不过这样能不能通过review,就看你运气了。 |
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t*d 发帖数: 1290 | 42 抱歉,误解了你的意思。还扬扬傻傻写了一大堆,呵呵。
这种 unknown 基因我一般是不去碰的。为什么呢?因为microarray结果的假阳性太高
了。就算你 rank 后,排在第一那个的都有可能是个假阳性。所以在做任何后续实验,
甚至简单的validation(用qPCR等方法)前,都最好综合各方面的知识,给candidate
genes排个序。然后决定试哪个。而这些未知的基因,后面要做的实验太多了。最难的
是找到它表达的蛋白,找到它的蛋白的抗体。够你折腾老长一段时间了。
当然,你有其它的证据。比如你发现在某个 GWAS 中,这个基因的 SNP 和某个疾病极
强相关,然后在你的与这个疾病相关的处理中表达变化了,然后qPCR验证了这个基因的
表达变化。这时也许值得一试。
very
Affy
to
I |
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t*d 发帖数: 1290 | 44 也不是这么肯定的。否则这么多Nature genetics GWAS papers 都是骗人的了。
特别是有遗传病史的家庭,检查一下,还是有帮助的。
genomic |
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c****1 发帖数: 1095 | 45 能否介绍Psychiatry领域的大牛?想总体看看这个领域的现状。
我现在知道的是 Schizophrenia和Autism比较热, 弄出了很多相关的基
因,其中的个别基因,很火,做的人很多。做的深入的,很少做这些相关基因
的联系的。做大规模的GWAS的,弄出很多基因,但是,都是简单的相关性。感
觉有很多可以做的,似乎有瓶颈。。。。。。。
欢迎讨论!!! |
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s*r 发帖数: 2757 | 47 people were discussing this a few months ago |
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y****2 发帖数: 65 | 48 我的理解
我们知道定位QTL是不准确的。证明一个QTL存在或是不存在是困难的。
在一个不是非常巨大的群体里估计出来的QTl效应是有偏差的。
为啥不放弃QTL的模型,而是仅仅将所有的markers放在一个模型中,来给每个genotype
一个值的估计?--把所有的marker(SNP在这里)同时放在一个模型中,预测每个
marker allele的对于疾病的效应。所有marker alleles的值总和就是这个genotype的
效应。
总之,我们可能不知道QTL是啥,但是我们可以更加准确地预测每个genotype的值。黑
箱操作。需要对于每个群体都单独分析,因为LD不consistent across populations.LD
啊LD,population structure,genetic architecture这些都是association analysis
极端重要的问题。
两个前提,good phenotyping; 第二 if marker –target gene LD is consistent
across populations. |
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O******e 发帖数: 4845 | 49 重复?人类疾病的数据,你怎么重复?怎么个湿实验法?一个一个突变引进到小鼠然后
重复症状?
再说了,重复不出别人的结果,原因很多的。 |
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H*********1 发帖数: 56 | 50 这些SNP怎么就不能重复呢?
你如果用1000份样本得出的结论,别人在另外的1000份样本得不到同样的SNP,那只能说
明你的结果有
很大的局限性,可能只在少数样本有效.那1000份样本的数据,跟5个样品的数据有啥区别
?别人都不能重
复.而且5个样本花钱还少.
关于湿试验证明这些SNP或者deletion,我记得已经有些这样的文章发表了。 |
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