z****n
发帖数: 79 | 1 说， “7 Dey St 14th Fl,\nNew York,\nNY 10007 " , 如何把里面的"NY" 给extract
出来？
可不可以用regexp 来写？要如何写？ 还有什么简单干净的方法？
多谢。 |
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r*******n
发帖数: 3020 | 2 in vim.
open filename in vim.
then
step 1: %s/.*\D\{5}$//g 删掉所有不是以5个数字的邮编结尾的行
step 2: %s/\d\{5}$//g 删掉邮编
step 3: %s/^\n//g 删掉所有空行
extract |
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F*******i
发帖数: 190 | 4 i mean extract files in memory from .zip archive.
thanks! |
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F*******i
发帖数: 190 | 5 zlib can compress or uncompress a stream/file. but not for extract file from
an archive. |
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t*******3
发帖数: 734 | 6 Extracting basic personal info: such as name, education, working experience,
programming language etc. |
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a********e
发帖数: 78 | 7 假如想实现 entity recognition， relation extraction这些功能的话，除了GATE，
还有 哪些其它的open source library。 |
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f******e
发帖数: 144 | 8 有人知道怎么把扫描质量很差的pdf里面表格extract出来么，输出txt,excel等等都行
，最后能做成方便编辑的数据表就好了
曾经用过一个软件，想不起来了
adobe pro的ocr似乎不成，language里面找不到中文，不知道是不是这个原因 |
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f******e
发帖数: 582 | 9 How to extract the audio part of a DVD/VCD? Thanks |
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g****r
发帖数: 14 | 10 Dear All,
I have a text file with multiple event entries, in which the email address are
organized differently. (i mean each event is some different, such as
1st event, first name, last name;
second event, email, first name, address, last name, email ....)
I am wondering how to extract the email address out of it?
I have got to the point of
sed -n -e 's./*\( .*@.* \).*/\1/p' sourcefile > newfile
yet I think the problem with the above is about the tab in my sourcefile, so far
still a lot of gubba |
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x***i
发帖数: 12 | 11 I have a data file with 20000 lines. Let me named it as A.dat
But I don't need so many lines of data to draw graph.
I just hope I can extract data from A.dat every 200 lines
and generate a new data file named B.dat and use file B.dat
to do my post-processing job.
Is there any shell command which can implement this job easily?
Thanks for help! |
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y*****i
发帖数: 6 | 12 【 以下文字转载自 Linux 讨论区,原文如下 】
发信人: yangqyi (小稚--不离不弃), 信区: Linux
标 题: tar extract 文件的时候
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Thu May 27 23:03:05 2004) WWW-POST
总是说：can't chang ownership, operation not permitted,
请问是怎么回事啊 ？？ |
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w******s
发帖数: 16209 | 13 I have an output as:
and I want to do one line script to just extract the hihi out..
what is the fastest way to do it? I guess replacing it using regular
expression?
Thanks |
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b*******t
发帖数: 459 | 14 how?
I burned a Ghost2003 CD before using a floppy .img file, now I am
having a hard time to retrieve the .img file (1440kb) - can I extract
it from the cd by some trick? thanks... |
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h**********r
发帖数: 671 | 15 最近想用QIAquick Gel Extraction Kit回收一个72bp的片段，有没有人有过类似的经
验？
回收效率怎么样？回收之后做亚克隆的。
多谢！ |
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a***a
发帖数: 40617 | 16 本人多次验证，gel extraction的紫柱子吸附量起码是miniprep那个蓝柱子的2倍 |
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S*****s
发帖数: 287 | 17 gel extraction 有两种 kit，一种是用 column 纯化，另一种是用 beads 纯化，和做
co-ip 的 beads 差不多。100bp 的小片段最好还是买那种 beads 纯化的 kit 比较好
，产量也高。 |
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f******g
发帖数: 1003 | 18 They are Hematopoietic stem cell.
I do not want to do GeneChip, only RT-PCR.
Can I use normal RNA kit to extract RNA from PFA-fixed cells? |
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T**********t
发帖数: 1604 | 19 270nm是phenol的峰，应该是你的phenol没有除干净。phenol extraction之后用氯仿再
提一次，然后再做ethanol precipitation。做ethanol precipitation的时候，用95%
的乙醇比用100%的乙醇要好。 |
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T**********t
发帖数: 1604 | 20 你们招人么？我刚被我第一次面试的PI糗了一通，说我达不到他的要求还敢要H1B，让
我再表一下忠心他才考虑要不要招我，郁闷透了。说 If you are still seriously
interested in the postdoc position in my laboratory, please tell me why I
should revise my concerns listed above. 简直了。。。
做phenol extraction，氯仿这一步是不能省的，否则除不干净phenol。
乙醇蒸馏是和水共蒸馏的，最纯只能达到95%。工业上制备100%纯酒精是要在95%的基础
上再除水的，我忘了是怎么除了，反正依稀记得说是最后出来的纯酒精里，会有痕量的
苯。一般如果用做溶剂没什么问题，可是如果用来做DNA沉淀的话，如果酒精的质量不
过关，反而会影响后续的实验。 |
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w******e
发帖数: 1187 | 21 常用的kit对small size RNA/DNA太差，不知道做aptamer/siRNA/micro RNA的铜锈们
都用什么kit做RNA extraction？还是基本都trizol＋phenol＋ethanol，不用
column？ |
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k****o
发帖数: 728 | 22 我生物外行，问个概念，提取蛋白的时候，如果说蛋白是tissue extract，那这个是不
是也是一种whole cell lysate？还是说这是两类样品？ |
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F*****e
发帖数: 182 | 23 我觉得tissue extract和cell lysate的区别就是tissue多了匀浆分散成单细胞这一步
。其他的应该都一样。 |
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W****C
发帖数: 1937 | 24 tissue的应该比cell的多， 杂吧？ 细胞分泌物， 基质， 杂细胞污染 （尤其是血细
胞的污染）。。。比如说liver extract， 应该很难去掉血细胞， 我估计肯定能测到
血红蛋白， 如果是liver cell的话应该不表达血红蛋白吧。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 25 当然是稀释比较好，除非是某些需要很长时间才能交换出来的离子或者小分子。
透析的时候时间放得太长，蛋白会变性，一方面是因为你用的buffer 怎么着
也不是细胞内部的native buffer, 另外一方面，即使你用了还原剂，
也挡不住一些氧化反应，第三，extract中会有被释放出来的蛋白酶。 |
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s*********t
发帖数: 600 | 26 是啊，看到那么多沉淀我好担心。
我打算把nuclear extract分成两份，一份透析了再用，另一部分直接稀释用。 |
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s******y
发帖数: 220 | 27 我用的旧的也是invitrogen的，很好用，换了就不行了：（
我这个pcr 优化好久了，不想花太大力气，搞成纯种了没准就能用简单dna extraction
protocol了。
用麻烦方法提出的dna跑带很清晰，用简单方法提的dna跑就是smear：（
谢谢老鼠女王～ |
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q*****n
发帖数: 331 | 28 Why not make it yourself?
There are so many protocols online about how to make nuclear extract from
cell lines.
Co-IP may need a lot of lysates (mg scale). Purchased lysates are normally
in small quantity ( a few hundred ug). |
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x******m
发帖数: 736 | 29 最近rna extraction很不顺，260/230ratio很低，bioanalyzer中的RIN很低。
用乙醇洗过以后，有白色的沉淀。用buffer和水溶解以后，还是可以看见白色沉淀，有
点透明。有人说可能是盐，但是用isoproponal 和乙醇洗了几遍，还是有。 |
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x******m
发帖数: 736 | 30 最近rna extraction很不顺，260/230ratio很低，bioanalyzer中的RIN很低。
用乙醇洗过以后，有白色的沉淀。用buffer和水溶解以后，还是可以看见白色沉淀，有
点透明。有人说可能是盐，但是用isoproponal 和乙醇洗了几遍，还是有。 |
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i******w
发帖数: 407 | 31 用的是Qproteome Bacterial Protein Prep Kit，里面有Benzonase Nuclease，结果跑
SDS-PAGE然后coomassie染色后，总在最下面几kb左右出现一条超蓝的带。
直接用cell culture加laemmli buffer跑就没有那条带。所以我猜应该是Nuclease。
请问一下谁知道怎么能把protein extract里的Nuclease去掉啊？谢谢 |
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g*********5
发帖数: 2533 | 32 thanks. no experience with mtDNA extraction. |
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h******y
发帖数: 351 | 33 You can use the same protocol for genomic DNA to extract mtDNA. |
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w*****t
发帖数: 179 | 34 My co-worker asked me this question, what is minimal E.coli extract, I have
no idea what this is. Is anybody here can help me? Is there any paper to
recommend me to read about this? Thanks a lot. |
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w********a
发帖数: 324 | 35 一直以来的一个问题：
PCR产物如果用Qiagen kit切胶提纯后，再作为Template,用Neb的Q5或者Phusion继续做
PCR （尤其条带比较长的时候），经常做不出来。打电话问了一下Neb的technician。
他们说他们也发现了这个问题
。他们觉得可能是Qiagen kit提纯后，最后的elute里面有某种inhibitor影响了后续
PCR的反应。但是他们也没有想出有效的办法来解决这个问题。
不知道版上的牛牛们有没有遇到类似的问题？是怎么解决的？另外，有别的公司的Gel
extraction kit会避免这个问题吗？
多谢！ |
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s******s
发帖数: 13035 | 36 我说了有20遍了，qiagen gel extraction以后，通通过一遍minElute浓缩换buffer
Gel |
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h*********g
发帖数: 18 | 37 After gel extraction, I checked the DNA using Nanodrop, the 260/280 is 1.5,
260/230 is 0.5. Can I still use the DNA? I will use the DNA as template to
make RNA. Thanks. |
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G********e
发帖数: 528 | 38 I'd like to ask if it is possible to do so.
For example, PFA fixation, FACS sorting for specific cell population, then
lyse protein for western.
The reason not doing live cell FACS is lack of the cell surface marker for
the specific cells I'm interested in. I have to do fixation/permeablization
and intracellular marker for cell purification. But after that, it seems
very hard to get protein extract from fixed cells. Can I use mild fixation?
Please let me know your experience, if any. |
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w********u
发帖数: 90 | 45 小弟用 calibre做layout extraction, 用得到的calibre 做postsimulation ,发现
mixer 的input resistance 竟然只有1-j40，而用schematic 仿真时候mixer的输入电
阻可以达到1000欧左右，相差块20倍了，哪位帮忙看看为啥？ |
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I***a
发帖数: 704 | 46 用Calibre extract RC后仿真生成 calibre view
如何在用Ultrasim仿真的时候指定用这个calibre view而不是schematic view呢？
用config吗 ？ |
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t****1
发帖数: 827 | 47 对你感兴趣的结点，在schematic给出一个确定的名字，比如 Va, Vb, Vo, Vin,
whatever, 在layout上相应节点同样标出名字，extraction tool 对那几个节点会使用你自己标出的,和schematic上一样的名字。 |
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b******2
发帖数: 654 | 48 Server里有很多病人的数据，包括化验结果和clinical parameter，其中有很多check
box之类的选项
1）如何把所需要的data从Server里取出来在SAS里做statistical analysis？ 特别是
把很多checkbox类型的variable变成sas可以处理的变量（ordinal/nominal）,主要有
那些方法？
2)在healthcare/hospital领域里， 有哪些常用的方法来extract data from server
到SAS里?
万分谢谢！！ |
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t********1
发帖数: 799 | 49 Can SAS do this?
or is there any other way to extract data information from website? Thx! |
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l******0
发帖数: 244 | 50 有些 metadata可能是结构化的，而 description 是非结构化的。是不是自然语言处理
可以有所帮助？
我以前做过点从 news 中提取发生事件的时间关系，非因果关系。但这种关系提取方法
有些类似，效果都不太好，属于很 advanced 的领域。
NLP 里有一个信息提取的 track, 专门比较 relation extraction 的算法和系统，年
度会议。现在忘了链接。 |
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