E*********s
发帖数: 93 | 1 could you elaborate a little bit more how PCR can distinguish the two? |
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l**********1
发帖数: 5204 | 2 上图 SD its means
下图 SEM its mean
Btw,
降低 bias 就可能 增大 SEM的 error 拿测量甲地 乙地 女子的身高来作为例子
乙地的 习格格 陈小丹格格 的 身高 岂是 甲地的 芙蓉姐姐 凤姐等的身高 一样容
易测到的 哈 (NB: 钻 北方 南方地域贴的 请左拐 进菌版八区 在那里撸管)
pls refer
Sanjuan R.
From Molecular Genetics to Phylodynamics: Evolutionary Relevance of Mutation
Rates Across Viruses
PLoS Pathog. (2012) 8: e1002685.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3342999/
its pp5 left column
>To reducing bias, this method
accounts for phylogenetic relatedness (on the other hand, it
in... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 3 上图 SD its means
下图 SEM its mean
Btw,
降低 bias 就可能 增大 SEM的 error 拿测量甲地 乙地 女子的身高来作为例子
乙地的 习格格 陈小丹格格 的 身高 岂是 甲地的 芙蓉姐姐 凤姐等的身高 一样容
易测到的 哈 (NB: 钻 北方 南方地域贴的 请左拐 进菌版八区 在那里撸管)
pls refer
Sanjuan R.
From Molecular Genetics to Phylodynamics: Evolutionary Relevance of Mutation
Rates Across Viruses
PLoS Pathog. (2012) 8: e1002685.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3342999/
its pp5 left column
>To reducing bias, this method
accounts for phylogenetic relatedness (on the other hand, it
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b****s
发帖数: 148 | 4 40pmol RNAi vs. 1ug dsDNA worked fine for me.
i used lipo2000 |
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o*******a
发帖数: 242 | 5 乙肝病毒感染后，大部分会自愈，因为人体产生有效抗体。所以很多人自己感染后都不
知道。但是有10-20%的人不会产生有效抗体，会转成慢性病毒携带者（慢性乙肝）。
病毒携带者在pregnancy时会感染胎儿，因为胎儿和小婴儿的免疫系统（T细胞）没有发
育完全，不能产生有效抗体。所以，在胎儿和婴儿时感染大多数都会转成慢性肝炎，成
为病毒携带者。
病毒在肝细胞复制时会杀死肝细胞，但肝细胞能自我复制，死了的肝细胞会由其他分裂
代替。但是如果正常肝的结组织构被破坏了，复制的肝细胞不是一个一个排列在基底膜
上，而是乱长在一起，就会导致肝硬化。如果病毒太仓狂，大部分的细胞都死了，就会
产生爆发型肝炎，死亡率高达60-70%。慢性乙肝炎会产生癌变，导致肝癌。因为
heptatitis B virus 复制是dsDNA病毒—》ssRNA -> DNA, 当病毒dna 整合到肝细胞基
因里，搞乱了正常的基因功能，产生癌细胞。当这种癌细胞得不到抑制时——》肝癌。 |
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o*******a
发帖数: 242 | 6 1), 在抗体产生之前，清除病毒不都是T cell 和 innate immunity 引起的。肝细胞自
己会死(apoptosis)，也会被病毒杀死(virus-induced cell apoptosis or necrosis)。
你说“HBV是一种标准的non-cytopathic virus，本身复制对肝细胞不造成病理伤害，
更不会杀死肝细胞，实际上肝细胞损伤主要是由机体自身免疫系统造成的”
这是错误的。我知道上面有人上了文献。 我就很懒得跟你比拼上文献了。你们自己就
会很容易找到很多很多文献证明病毒可以杀死细胞。病毒在肝细胞复制时会杀死肝细胞
这个描述一点问题都没有。我没有必要一个一个的给你列出细胞死亡的机制。you are
out of your mind,才会攻击我这个观点。更合况你的观点并不正确。
2), 还有不知道你从哪儿看到说乙肝病毒不能跨过胎盘屏障，事实上它们可以。所以我
说的没错。你的错了。这也是基本知识而已。
***你强调T cell在抗体产生之前的清除病毒的作用。事实上靠这条路来清除病毒不通
。inteferon等的临床证明他们不会起关键作用。就是说不管你... 阅读全帖 |
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o*******a
发帖数: 242 | 7 乙肝病毒感染后，大部分会自愈，因为人体产生有效抗体。所以很多人自己感染后都不
知道。但是有10-20%的人不会产生有效抗体，会转成慢性病毒携带者（慢性乙肝）。
病毒携带者在pregnancy时会感染胎儿，因为胎儿和小婴儿的免疫系统（T细胞）没有发
育完全，不能产生有效抗体。所以，在胎儿和婴儿时感染大多数都会转成慢性肝炎，成
为病毒携带者。
病毒在肝细胞复制时会杀死肝细胞，但肝细胞能自我复制，死了的肝细胞会由其他分裂
代替。但是如果正常肝的结组织构被破坏了，复制的肝细胞不是一个一个排列在基底膜
上，而是乱长在一起，就会导致肝硬化。如果病毒太仓狂，大部分的细胞都死了，就会
产生爆发型肝炎，死亡率高达60-70%。慢性乙肝炎会产生癌变，导致肝癌。因为
heptatitis B virus 复制是dsDNA病毒—》ssRNA -> DNA, 当病毒dna 整合到肝细胞基
因里，搞乱了正常的基因功能，产生癌细胞。当这种癌细胞得不到抑制时——》肝癌。 |
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o*******a
发帖数: 242 | 8 1), 在抗体产生之前，清除病毒不都是T cell 和 innate immunity 引起的。肝细胞自
己会死(apoptosis)，也会被病毒杀死(virus-induced cell apoptosis or necrosis)。
你说“HBV是一种标准的non-cytopathic virus，本身复制对肝细胞不造成病理伤害，
更不会杀死肝细胞，实际上肝细胞损伤主要是由机体自身免疫系统造成的”
这是错误的。我知道上面有人上了文献。 我就很懒得跟你比拼上文献了。你们自己就
会很容易找到很多很多文献证明病毒可以杀死细胞。病毒在肝细胞复制时会杀死肝细胞
这个描述一点问题都没有。我没有必要一个一个的给你列出细胞死亡的机制。you are
out of your mind,才会攻击我这个观点。更合况你的观点并不正确。
2), 还有不知道你从哪儿看到说乙肝病毒不能跨过胎盘屏障，事实上它们可以。所以我
说的没错。你的错了。这也是基本知识而已。
***你强调T cell在抗体产生之前的清除病毒的作用。事实上靠这条路来清除病毒不通
。inteferon等的临床证明他们不会起关键作用。就是说不管你... 阅读全帖 |
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g*******r
发帖数: 129 | 9 htscorpion: Lenti is an RNA virus...
Maybe the ssRNA genomes are more flexible than dsDNA counterpart, and
there are proteins to pack these RNAs? |
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m******g
发帖数: 467 | 10 基本上就是题目+bulletin point的形式吧，不要纠结我对paper的品味，呵呵。新年快
乐！
PNAS 13.12.03
推荐：
1. Reintroducing domesticated wild mice to sociality induces adaptive
transgenerational effects on MUP expression
promiscuous / monogamous-line
higher MUP (pheromone) expression in pros-line
Male become more attractive
Difference in Mup promoter methylation level
2. High-throughput DNA sequencing errors are reduced by orders of magnitude
using circle sequencing
Previously ~0.1-1x10^-2
Unique library preparation strategy
Copie... 阅读全帖 |
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m******g
发帖数: 467 | 11 基本上就是题目+bulletin point的形式吧，不要纠结我对paper的品味，呵呵。新年快
乐！
PNAS 13.12.03
推荐：
1. Reintroducing domesticated wild mice to sociality induces adaptive
transgenerational effects on MUP expression
promiscuous / monogamous-line
higher MUP (pheromone) expression in pros-line
Male become more attractive
Difference in Mup promoter methylation level
2. High-throughput DNA sequencing errors are reduced by orders of magnitude
using circle sequencing
Previously ~0.1-1x10^-2
Unique library preparation strategy
Copie... 阅读全帖 |
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c*********r
发帖数: 1312 | 12 不做RNA-seq也可以用抗体pull down，提RNA，测一下有没有RNA；如果有的话，可以进
一步反转录合成cDNA、dsDNA做个library，然后克隆测序吧。我想。 |
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r**a
发帖数: 121 | 13 如果这个方法可行，是最好的拉。
不过不好意思，对RNA，不适特别在行，
请问，这里怎么提取RNA，然后测RNA呢？
总不至于Nanodrop测浓度吧？
还有弄成cDNA之后，用随机引物合成dsDNA？
谢谢先了；－） |
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s********n
发帖数: 248 | 14 Did you digest the DNA template? Did you run a formaldehyde gel? Did you use
RNA ladder?
RNA runs at lower MW comparing to dsDNA; if you are not using RNA gel, your
RNA will be easily degraded. |
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w*****y
发帖数: 1201 | 15 我的理解是，SYBR是针对所有dsDNA，特异性要求比较高，我一般设计primer的时候，
会设计primer cross exon-intron splicing site，这样即使RNA有轻微的DNA污染，不
会对结果有影响，你的primer是如何设计的？ |
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m*********D
发帖数: 1727 | 16 Yes,the DNA should be fine for transcription template. If you load on a
gel, you may even see ssDNA bands.
Better elude in TE. However if elude in ddH2O, you can add some NaCl
solution to 100 mM.this helps to form dsDNA. |
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H****s
发帖数: 301 | 17 如题，假设这个cDNA的序列完全不知道。cDNA是从mRNA逆转录来的，逆转录的时候用了
Oilgod(T)12-18做了逆转录引物。谢谢指点。 |
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b****r
发帖数: 17995 | 18 加random 6mer，不过只有一小部分会是全长 |
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H****s
发帖数: 301 | 19 谢谢了。我收集有各种正常以及疾病组织的cDNA，有想法把他们做成全长的cDNA文库。
目前来看，只有给ssDNA加linker这个选择了。 |
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发帖数: 1 | 20 我来说说ngAgo的局限：
1.ngAGO是否真如文章所述，不和ssRNA结合。我觉得需要通过通过高通量测序进行验证
，电泳胶的灵敏度太低，看不到不代表没有。
2.ngAgo是否和内源ssDNA或ssRNA结合，如果它的结构和TtAgo类似（包含PIWI，PDZ以
及MID domain），那么这些保守的domain也存在于与ngAgo同源的argonautes（Ago2）
中，需要利用灵敏度比较高的手段才能说明这个问题，保不齐ngAgo会对PIWI或RNAi通
路有影响，5‘p-ssDNA以及5’p-ssRNA在细胞中存在，尤其是在germ cell的分化过程
中以及很多种类的癌细胞中，如果ngAgo和它们结合的话，这将大大限制其在此类细胞
中的应用。
3. ssDNA loading 的问题，目前对于ssDNA load到Argonaute形成DNP的机制尚不清楚
，在细胞内ssDNA load到Argonaute是不是需要其他蛋白质（比如伴侣蛋白，热激蛋白
等）的辅助，甚至Argonaute折叠成functional protein是否需要ssDNA的帮助，这些都
不是很清楚。
... 阅读全帖 |
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e****0
发帖数: 678 | 21 • leukemia
ALL AML CLL
child adult elderly
BM lymphoblasts 25%myeloblasts
lab Lymphocyte 5000, mature-appearing cells
• Osgood-schlatters disease
Adolescent male athletes
Traction apophysitis—quadriceps tendon put the traction on the
apophysis of the tibial tubercle where patellar tendon inserts.
A firm mass =heterotopic bone formation
Pain can be reproduced by extending the kne... 阅读全帖 |
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l****u
发帖数: 336 | 22 If only for ssDNA's passing t\hrough
5 nano meter is enough
possibly, 5 nm is enough for dsDNA |
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V*****G
发帖数: 337 | 23 I have to ask you some more questions about history, since you didn't
mention abd pain in the 1st post, now you said there is abd pain, this
potentially changed the whole picture.
I still need more info about history if you don't mind.
For history:
Abd Pain: OCDFPPLIQRAAA all needed
Diarrhea: OCDFPPAAA ABCO, blood?
Other GI symptoms: nausea, vomit, jaundice, abd bloating, if there is
constipation, relationship between constipation and diarrhea
Edema: OCDFPPAAA, esp aggravating and alleviati... 阅读全帖 |
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l*********o
发帖数: 21 | 24 来自主题: Medicalpractice版 - 病情咨询 Dr. Garland,
Thank you very much.
ANA 抗体： 1:640
ESR: 1:90
ANTI-DSDNA: POSITIVE
RIBONUCLEOPROTEIN AB : POSITIVE
ANTI-CENTROMERE AB: POSITIVE
MRI- BRAIN: NEGATIVE
诊断： MIXED CONNECTIVE TISSUE DISEASE ？
风湿科医生 开了强的松
现在主要是头晕
请问下一步还要做什么检查？
如何治疗？
多谢！ |
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