z*******9 发帖数: 112 | 1 不好意思,出去休假去了,也就把这事给忘了,我刚刚给机子装上linux,以前在win下
,我一直用DNAstar做genetic分析。
在linux下,我一直找不到可以替代DNAstar的。你提到跨平台的综合序列分析软件有很
多,能否推荐几个??谢谢!! |
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j****x 发帖数: 1704 | 2 跨平台的综合序列分析软件有很多,不过你要求和DNASTAR相似,这个就不好说了,怎
个个相似法呢? |
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C*I 发帖数: 4736 | 3 一直在误导,现在还在误导。 说说明corona virus 不可以从蝙蝠直接传染给人,必须
经过一个中间宿体性的其它动物才能传染给人。所以,病毒发生后,就故意误导全国人
民去海鲜市场找证据,找其它野生动物的麻烦。 而且还是病毒所去找的,找完了还装
模做样化验呀,分离呀什么的。最后把责任全部推给了海鲜市场的动物。可是那种动物
,一直不敢说,说了其它相关已经在人就会去早那种动物监测。 所以压根不说,打马
虎眼。
事实上,早在2013 年,就是这个武汉病毒研究所,已经从来自云南的蝙蝠身上所携带
的corona virus中分离出第一株蝙蝠SARS类似样的冠状病毒的活病毒,其中就包含了类
似于S类型的基因。从而证实这株病毒能够使其接受和SARS病毒相同的受体,并能够感
染人的细胞。对此新发现,武汉病毒所还把它以武汉病毒研究所的英文简称命名“WIV1
”,以彰显这一发现的重要价值和属于自己第一个发现的巨大研究成果。这个成果刊载
于2013年11月的《自然》杂志。
就是说,从云南弄回来的这种蝙蝠所携带的类似于sars的 corona virus, 可以不经过
其它受体/宿体,而直接传染给人。 他们... 阅读全帖 |
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C*I 发帖数: 4736 | 4 一直在误导,现在还在误导。 说说明corona virus 不可以从蝙蝠直接传染给人,必须
经过一个中间宿体性的其它动物才能传染给人。所以,病毒发生后,就故意误导全国人
民去海鲜市场找证据,找其它野生动物的麻烦。 而且还是病毒所去找的,找完了还装
模做样化验呀,分离呀什么的。最后把责任全部推给了海鲜市场的动物。可是那种动物
,一直不敢说,说了其它相关已经在人就会去早那种动物监测。 所以压根不说,打马
虎眼。
事实上,早在2013 年,就是这个武汉病毒研究所,已经从来自云南的蝙蝠身上所携带
的corona virus中分离出第一株蝙蝠SARS类似样的冠状病毒的活病毒,其中就包含了类
似于S类型的基因。从而证实这株病毒能够使其接受和SARS病毒相同的受体,并能够感
染人的细胞。对此新发现,武汉病毒所还把它以武汉病毒研究所的英文简称命名“WIV1
”,以彰显这一发现的重要价值和属于自己第一个发现的巨大研究成果。这个成果刊载
于2013年11月的《自然》杂志。
就是说,从云南弄回来的这种蝙蝠所携带的类似于sars的 corona virus, 可以不经过
其它受体/宿体,而直接传染给人。 他们... 阅读全帖 |
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C*I 发帖数: 4736 | 5 Published: 30 October 2013
Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the
ACE2 receptor
Xing-Yi Ge, Jia-Lu Li, Xing-Lou Yang, Aleksei A. Chmura, Guangjian Zhu,
Jonathan H. Epstein, Jonna K. Mazet, Ben Hu, Wei Zhang, Cheng Peng, Yu-Ji
Zhang, Chu-Ming Luo, Bing Tan, Ning Wang, Yan Zhu, Gary Crameri, Shu-Yi
Zhang, Lin-Fa Wang, Peter Daszak & Zheng-Li Shi
Nature volume 503, pages535–538(2013)Cite this article
Abstract
The 2002–3 pandemic caused by severe acute respirator... 阅读全帖 |
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k*****8 发帖数: 86 | 6 photoshop
illustrator
DNAstar
Thank you very much. |
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k*****8 发帖数: 86 | 8 photoshop
illustrator
DNAstar
Thank you. |
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x******8 发帖数: 350 | 9 安装了Fedora 20,想找找类似DNASTAR、Bioedit类的软件,结果还不太好找。各位,
麻烦给我推荐几款类似Windows下用的生物学软件啊。
目前找到了Cluster X, MUSCLE。就是类似上面的2款还没有找到,愁
求指点 |
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k*****8 发帖数: 86 | 10 photoshop
illustrator
DNAstar
Thank you. |
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a**********s 发帖数: 238 | 11 最近打算把电脑升级到Windows 7,但是不知道哪些软件在win7下还可以用,有没有用过
的人能通报一声,谢谢了!
本人目前是XP系统,在用的软件有:
DNASTAR(5.0);DNAMAN(5.0);Vector NTII(9.0);Origin(6.0);EndNote X;
希望已经用win7的弟兄们冒个泡列一下可以用的生物软件,谢谢! |
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a******a 发帖数: 68 | 12 合作实验室给的operon annotation是用这个软件编写的,试用版14天就过期了,哪位能贡献一个
正式版的序列号(windows版的)?万分感激! |
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a******a 发帖数: 68 | 13 没有人知道么。。。自己顶一下先
位能贡献一
个 |
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k****i 发帖数: 53 | 16 NCBI primer design
primer3
Primer premier
DNAStar
invitrogen 在线设计 |
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s*********s 发帖数: 110 | 17 我给你推荐一个吧
DNAstar软件里有个Seqman,很好用,虽然没有你说的那么自动化
google一下,网上有破解版
good luck |
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j****x 发帖数: 1704 | 18 这个实在太多了,商业软件例如DNASTAR,NextGENe,CLC,Genomatix等等都有比较成
熟的模块,界面也相对友好,价格自然不菲。
免费软件更是层出不穷,PeakSeq,F-Seq,USeq,CisGenome,ChromaSig,ChiPDiff,
MACS,SISSRs,ChIP-Seq Simulator,QuEST,FindPeaks,GLITR,WTD/MSP/MTC,
ERANGE3,都出生名门,还有一堆基于R的代码就不提了,自己去看paper吧。
新手的话,个人推荐CisGenome,功能强大,也不用自己编译调试,或者webserver比如
ChIP-Seq Tool Set(http://havoc.genomecenter.ucdavis.edu/cgi-bin/chipseq.cgi);
ChIP-Seq Analysis Server(http://ccg.vital-it.ch/chipseq/),在线分析,省心省力。 |
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j****x 发帖数: 1704 | 20 跨平台的商业软件,简单一点的如DNAMAN(老牌),复杂一些的如CLC Bio Workbench
(强力),都是不错的选择,免费的有Serial Cloner(DNA序列分析和subcloning利器
),DAMBE (北美中国教授出品,推荐)。
Linux下开源的软件包就更多了(emboss等),看你的具体需要了 |
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s********n 发帖数: 248 | 21 想下载一个比对测序结果用,找了好几个下载地址都下不了。请问大家知道哪里还能下载到吗?
多谢多谢! |
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l**********1 发帖数: 5204 | 23 sunnyday 的实验室不能想太平洋对岸的中科院某些Lab 那样 用盗版的DNASTAR的 至少
生物谷里边的
密码和序列号 绝对不能用。
不然一个被FBI 或母公司的人 查到 Lab啥就都没有啦
Cost Analysis
Table 4. Quotes for the alignment softwares.
Initial License Cost
Service Plan Renewal
SeqScape
$8820 (CND)
-
Lasergene
$4496 (USD)
$780 (USD)
Sequencher
$3450 (USD)
$325 (USD)
//dataserver.robarts.ca/pi/Supplemental_Material/Sequence%20Alignment%
20Algorithms.pdf |
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s******y 发帖数: 28562 | 24 太好了!如果Vector NTI 里面包含的contig express 也能这么用的话那就是
最合适我的软件了。
DNAstar 他们的质粒管理软件没有vector NTI 那么好用,而且和contig assmeble
软件分开放在不同的软件包里买,而且还塞给你一大堆乱七八糟的我根本不会去用的软
件。
不过他们的价格倒是和vector NTI 差不多。 |
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l**********1 发帖数: 5204 | 25 ChromasPro is fully functional for a period of 60 days while unregistered.
The registration fee is US$240 for a single user, and includes all future
upgrades free of charge. ChromasPro can be registered by purchase order or
online through share-it.
For suggestions and technical problems, e-mail:
com.au>
//www.technelysium.com.au/ChromasPro.html
Ps: one decade ago our paper used this one.
from it is so far away from now and i also quit this field works so
yesterday fo... 阅读全帖 |
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s******r 发帖数: 2876 | 26 谢了,另外,学习了一会儿DNAstar,Geneious, CLC workbench,
还是这个界面比较方便,就是怕以后被套牢。
fbi |
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b******n 发帖数: 4225 | 27 DNAStar的webseminar,蛮不错的
最好有他们的Seqman NGen |
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s******r 发帖数: 2876 | 28 谢谢,
这个软件不太便宜。
DNAStar的webseminar,蛮不错的
最好有他们的Seqman NGen |
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b******n 发帖数: 4225 | 29 上次看DNAstar的webseminar
那里面的讲解员也说pacbio的data错误率高
所以他们的软件暂时不支持pacbio的data |
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x******8 发帖数: 350 | 30 安装了Fedora 20,想找找类似DNASTAR、Bioedit类的软件,结果还不太好找。各位,
麻烦给我推荐几款类似Windows下用的生物学软件啊。
目前找到了Cluster X, MUSCLE。就是类似上面的2款还没有找到,愁
求指点 |
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