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j*********m 发帖数: 33 | 2
上面已经有人给你答案了,物理版的回答也是对的。我只是想提醒一下这个问题不是很
简单的,H-需要
相当高级别的方法才有个能作对,如果你用DFT做pseudopoetntial 的code,基本没有希
望作对,所
以需要先想一想... |
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f***t 发帖数: 2247 | 3 您这里说的相当高级别的方法是指什么?我现在能想到的就是DFT了。如果这条路走不
通,基本上就废了。 |
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j*********m 发帖数: 33 | 4
如果你只想DFT,那照着物理版上说的去做就行了,很多情况是对的。H-需要QMC,
atomic的计算也可
以由非常复杂的电子互相作用 |
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f***t 发帖数: 2247 | 5 谢谢您了,我先用DFT算一下,看看结果再说,对了,物理版上提到的José Luís
Martins Pseudopotential code,您用过吗?我刚google了一下,找到了代码,但是没
有找到相应的程序使用说明,以及输入文件的例子,如果您知道,能方便告诉我一下吗
?再次谢谢您的帮助。 |
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d****n 发帖数: 397 | 6 DFT的波函数没有物理意义吧。用HF,MP2,casscf.推荐用CASPT2.然后从输出结果里面找出
gaussian primitive的系数,就可以写出波函数的具体形式了吧。个人意见。 |
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p*******8 发帖数: 158 | 8 I heard about this so much in DFT theory. Are these four guys are all in
Duke?? I only see Yang is here. Thanks for reminding me, now Duke is
talking. Whatever, they are both great for people who like computational
chemistry. It seems that Truhlar's ability for 灌水 is much bigger. :). Sometimes, school does not matter compare to which advisor you
will follow and which field you are into. Talk , then decide!
(Slow Eye Movement) 的大作中提到: 】 |
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J*******3 发帖数: 1651 | 9 Got confused about two concepts:
input file, Matrix of supercell(coordinates) is needed, while when
calculating some properties, Monkhorst Pack is also needed. What is the
difference between them? or they refer to one thing, one is in real space,
the other one in reciprocal space?
Many thanks! |
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J*******3 发帖数: 1651 | 10 Is there any correlation between them?
many thanks! |
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R**X 发帖数: 417 | 11 u mean k mesh...thats the place u sample the wavefunction and do integral |
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h**********3 发帖数: 427 | 12 请直接联系Michael J. Aubrecht -----这个人是recuitor
Senior Research Engineer (2 Open positions)
Samsung Information Systems America (SISA) is searching for a high caliber
Senior Research Engineer for its soon-to-open lab in Cambridge, MA, USA.
The candidate should possess material modeling expertise in solid state
chemistry and physics and preferred to have more than 2 year post-doctorate
experience.
The candidate will be responsible for conducting in-depth modeling research
on n... 阅读全帖 |
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L*******r 发帖数: 5448 | 13 做DFT的找博士后还不很轻松,碰到这种老板赶紧换啊 |
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J*******3 发帖数: 1651 | 14 How to test pseudopotential before carry out any calculation?
When we use our own basis, how to test the basis generated by user which
are good or not?
When we devise a model, first thing we need do is to optimize structure?
tons of thanks! |
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c*****m 发帖数: 2191 | 15 DFT肯定算不了鸡的问题,搞一个QSAR模型,来个machine learning,没准还行 |
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F****I 发帖数: 270 | 16 好像化学家主要从事一些engineer类型的工作,比如开发一个大型程序包;或者Gauss
函数,Davidson对角化这种技术性而不是框架性的工作。再比如时下流行的DFT,Becke
是原子核物理背景。Perdew也是物理背景,LYP的普遍更多的是因为当时高斯里有LYP而
没有PW91,他们直接把Becke对B3PW91的参数搬到了B3LYP。而实际上B3PW91和B3LYP的
表现似乎相差不大。B3PW91又主要是物理学家的产品了。
Kutzelnigg曾经有一个观点,理论化学的教育并没有成熟,化学家疏忽过什么吗? |
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F****I 发帖数: 270 | 17 "Becke suggested coefficients
a_0 = 0.2, a_x, = 0.72, and a_c, = 0.81
...
The Becke3LYP functional in Gaussian 92 uses the
values of a_0, a_x, and a_c, suggested by Becke but uses LYP for
the correlation functional."
P. J. Stephens, F. J. Devlin, C. F. Chabalowski, M. J. Frisch
J. Phys. Chem., 1994, 98 (45), pp 11623–11627
核对一下Gaussian网站上的参数
http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_dft.htm
****************
User-Defined Models. Gaussian 09 can use any model of the general form:
P2EXHF + P1(P4EXS... 阅读全帖 |
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F****I 发帖数: 270 | 18 我觉得任何一个前人没做过没做出没做的无法改进的课题都是前沿,只是关注程度不同。很多问题即使有了量子计算机和相应的算法也没法直接解决。比如对现象的理解,当前比较火爆的光合作用中的退相干。再比如Atom in molecules中官能团partition的transferability。再比如密度矩阵理论的N-representability和DFT的数学基础等等等等等等 |
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h********r 发帖数: 821 | 19 我狂ft,你说的好几点我都做过(事先声明我很烂,文章又少又差)。。。
同。很多问题即使有了量子计算机和相应的算法也没法直接解决。比如对现象的理解,
当前比较火爆的光合作用中的退相干。再比如Atom in molecules中官能团partition的
transferability。再比如密度矩阵理论的N-representability和DFT的数学基础等等等
等等等 |
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S*M 发帖数: 10832 | 20 别的不知道,这个decoherence好像又是物理学家搞得玩意儿,hehe
能拾人牙慧混口饭吃也算不错,哈哈
同。很多问题即使有了量子计算机和相应的算法也没法直接解决。比如对现象的理解,
当前比较火爆的光合作用中的退相干。再比如Atom in molecules中官能团partition的
transferability。再比如密度矩阵理论的N-representability和DFT的数学基础等等等
等等等 |
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F****I 发帖数: 270 | 21 Garnet Chan还算聪明吧,大概很年轻(~20岁)的时候就改进Lieb-Oxford bound了
您觉得高温超导机制算一个值得研究的方向吗?
有了量子计算机之后DFT的优势会被指数级的削弱吧 |
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h*****y 发帖数: 298 | 22 HEG的基态能是解析的,QMC做了精确的参数化,这就是为什么大家都用HEG作为半经验
ec项。带来的问题就是引入了平均场近似。但是这不是QMC的问题,而是DFT计算的问题
。QMC能得到精确ec这有什么问题? 关于铁基超导的问题你可以描述一下到底什么叫歇
菜?然后我才可以考虑。
turn |
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v**p 发帖数: 78 | 24 主要做过 ab initio MD, reactive force field development, 固体表面电子结构的
计算及hybrid DFT method development。文章主要发表在J.Chem. Phys. 及 J. Phys.
Chem. B.这两个传统物化杂志。
如您有审稿机会,请站内联系,万分感激! |
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p*****r 发帖数: 805 | 25 Immigration版正好有人可以推荐这个方向,建议直接联系发信人。
>发信人: raccoon1201 (忙呀!), 信区: Immigration
>标 题: 485提交后,人变懒了,有不少review机会
>发信站: BBS 未名空间站 (Thu Feb 16 09:36:54 2012, 美东)
>
>理论计算化学方向的(DFT)
>还有一些化工领域
>有兴趣的人可以联系我
>我推荐推荐
>谢谢了 |
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c**********r 发帖数: 199 | 26 不是的,分子光谱学和分析化学中的IR和Raman几乎无任何关系。我们用RIDER,Hole-
burn之类的光谱测定分子(尤其是conformer)结构 然后再用理论知识(如DFT/M05-2X
量子计算与群论等)归属光谱
感觉属于物理,与化学关系不大,只是研究化学物质 |
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c**s 发帖数: 732 | 27 Postdoc/RA positions on computational materials/theoretical chemistry
Two postdoctoral positions are available in the lab of Dr. Guohua Tao at
Peking University, Shenzhen Graduate School to conduct outstanding research
on the molecular structure and dynamics of materials systems. A perspective
candidate should have a strong background in at least one of the following
fields: statistical physics and chemical dynamics, computational quantum
chemistry or computational materials.
Candidates should h... 阅读全帖 |
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d****n 发帖数: 397 | 28 首先申明不是大牛,只是对这方面感兴趣,基本没有实战经验。如果说错,还请版上大
牛斧正。
你要展开分子轨道,这个太难了。确实按定义应该这么算,但是要自己分析结果写程序
,为什么不用现有的软件算这个呢。
如果你有Molpro,我不知到怎么用Molpro,也没有权限,不过大致是这样的:里面有个
non-adiabatic coupling element calculation,就能算你要的
psie(r,Rref)>.psi(r,Rref)是diabatic wavefunction,g和e是正交的,但是不是H(r,R
)的本征函数(因为R!=Rref),所以coupling不为0,只有R=Rref的时候,g和e才是正交的
,这个时候coupling 为0。
如果你没有Molpro,有Gaussian,一般都能用Gaussian.但是Gaussian只能算adiabatic
states, 你能用adiabatic和diabatic之间转换来算这个coupling.这个coupling在
avoided crossing的时候最大。
所以可以用av... 阅读全帖 |
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c******r 发帖数: 76 | 29 谢谢
我下了正在看 半吊子的就是比较挫,只知道如何generate input,run job 对于一
些深层次的理论比如HF,DFT之类的其实都是不怎么懂or似懂非懂,最近借着整理工作的
机会在恶补这方面的知识
computational |
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h********r 发帖数: 821 | 32 我的意思是说,KS本来就不是纯的DFT,所以无需纠结b3lyp是不是了。 |
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F****I 发帖数: 270 | 33 不大确定您的意思。按constraint search的精神,波函数也是单电子密度的泛函。KS
构造的动能泛函也是合法的,虽然在某种意义(只有orbital free的才是纯粹的?!)上不
是纯粹的密度泛函。
不过KS的effective potential是local的,这个和HF还是有比较大的差别。当然可以说
B3LYP之类是和KS平行的另外一种DFT方案。
还是说您另有所指? |
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h********r 发帖数: 821 | 34 形式上来说确实波函数也是密度的泛函,但是KS这么做的唯一原因只是动能密度泛函根
本做不准,精度很差,不得已才重操波函数旧业。DFT一开始就宣称不要波函数,只要
密度就行了,最后饶回去还是要算波函数,不是说不可以(没别的好办法啊),就是感
觉有点不爽。
KS |
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h********r 发帖数: 821 | 35 另外,大家都现实一点:绝大部分泛函里面都那么多经验参数了,所谓精确的数学性质
符合的有几个?DFT中不合“理”的东西太多了。
我碰到Shaeffer III,他说B3LYP就是maigic,看上去一堆问题,但就是work。 |
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a*****9 发帖数: 1884 | 36 我同意你的观点,不过像各种DFT-D,以及M06系列这些有大量经验性的方法,还是有一
定作用的 |
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b****n 发帖数: 379 | 37 Elsevier的杂志,IF 1.0左右。有兴趣的请发相关资料到站内邮箱,我会推荐。谢谢! |
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h********r 发帖数: 821 | 39 Slater orbital, Slater rule, augmented plane wave, 铁磁性,超导,X-alpha(后
来导致DFT)。。。他的书 Quantum Theory of Molecules and Solids奠定了做计算的
基础。 |
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F****I 发帖数: 270 | 40 STO迄今的影响小于GTO,更不用说在70年代
平面波有Bloch定理
铁磁性有Heisenberg模型
超导有London和BCS
X-alpha对DFT的启发不如Thomas-Fermi吧。各种半经验方法同样简化Hartree-Fock
Quantum Theory of Molecules and Solids更多的是个结果汇总吧 |
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c**z 发帖数: 1014 | 41 哈哈,你也有不懂的啊
deNOx的paper不少吧,不过大多是DFT计算
谢! |
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S*****n 发帖数: 6055 | 42 如楼上所说,我见的都是用DFT做,还真没见人用QMMM做的 |
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c**z 发帖数: 1014 | 43 原则上需要用QMMM,只是一般DFT都fixed bottom a few lays to represent bulk, 其
实可以用QMMM做,可以做很厚的materials,下面的layers用MM,surface 几层用QM |
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j********0 发帖数: 73 | 44 诚求审稿机会。发过两篇ACS Journal 的一作文章,计算化学方向 (DFT, MD, Drug
design。。。), 可提供CV。
谢谢!! |
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j********0 发帖数: 73 | 45 再顶!!!
计算化学方向的,MD, DFT drug design...
多谢! |
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b********i 发帖数: 4703 | 46 生物无机化学方向,很多领域都有涉及,从有机合成配体,到各种仪器分析手段,以及
酶反应机理,和DFT计算都做过。
年底博士毕业,之后会继续做化学方向的博后,目前经验和资历可能不足,但每天可以
花很多时间来审稿。
万分感谢,如果需要简历请站内或者联系我的邮箱[email protected]
/* */。手机
4438474324 |
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t****e 发帖数: 205 | 47 【 以下文字转载自 Immigration 讨论区 】
发信人: ttlove (ttlove), 信区: Immigration
标 题: review 机会,物理化学方向,IF 0.5-1之间
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Oct 29 14:11:09 2015, 美东)
金属-有机物相互作用,DFT
老规矩,私信简要的CV给我。 |
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s**********6 发帖数: 15 | 48 苏州大学核能环境化学研究中心现招收金属有机化学方向和理论计算化学方向的研究人
员各一名。
职位:副研究员或助理研究员 (带编制专职科研岗,类同于讲师,副教授,待遇按照苏
大统一标准)。
招收要求:在金属有机化合物设计合成/理论计算(DFT,MD)领域有较为丰富的经验成
果,在化学类顶尖期刊上发表至少一篇一作文章,具有良好的团队合作意识。
中心介绍主页:http://fyxy.suda.edu.cn/nec/。
有任何问题和意向请联系: 第五娟教授 [email protected]/* */。可电话/微信详谈。 |
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c****n 发帖数: 21367 | 49
恰恰不是运气,自然界的常见系统生长一般都是random multiplication来刻画的
random multiplication导致power law,power law导致covariance dispersion
然后导致逼近形式的entropy concentration
对于线性逼近,当信息聚集在少数几个特征方向上的时候,
必然是这几个特征向量能还原大部分信息。
这个你可以问问做图像处理的同学,任意一个图像,随便找个空间,
比如Fourier空间,拿DFT一变换,然后去掉95%的高频分量再重构,
还是能看到大致的。这是有损压缩的理论基础。当然这已经是太高层的
应用了。要看到本质,空间可以不同(维数、平直性、etc),变换
可以不同(Foureier, Laplacian, Fokk-Planck, wavelet etc),
分解和重构方式可以不同,这些都是应用。其本质在于我们生活里的
信息都是power law的,不然搞这么多分解一点意义都没有。
如果信息是各向同性的或者比较均匀,那你换个空间表示有啥用嘛?:)
对于复杂系统,power law是无处不在的,呵呵。 |
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t**********g 发帖数: 85 | 50 Thank bestbuy, I find home.
Don't know what I should say, just follow the topic above. I am doing
electronic structure calculation using DFT and tightbinding method.
BTW, what's the GCMC and GCMD? Green Card Management Center or Department? :-) |
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