u*********1 发帖数: 2518 | 1 广义上说,copy number是SV的一种。
exome纵然优化(估计你说的优化是同时拿几百个exome样本做control,然后remove
noise),对于CNV的power还是比较差的,毕竟还是局限在coding region
而我一直都觉得,真正的坐落在coding region的gene的比如大于1kb的CNV,应该很少
见吧?大部分的大于1kb的big deletion还是在noncoding region
略了 |
|
u*********1 发帖数: 2518 | 2 sequencing: 更多的sequence 新方法,还有intron, promoter sequencing, levi
的TERT promoter是不是要引起一阵promoter and intron region sequencing的热潮
关于melanoma promotor mutation的文章,不知道大家有何评价?
70%的sporadic melanoma都有promotor区域的SNP,这也太surprising了
一般我们就是找coding region的SNP,或者noncoding区域的CNV/SV;没想到小小的
promotor的SNP竟然会成为背后杀手。
同样的,对于其他的神经疾病的genetics,会不会也是noncoding region的很多问题呢
?真是越来越难做了。从SNP到SV/CNV到complex region,从coding到noncoding
levi |
|
l****n 发帖数: 844 | 3 我很好奇现在有没有公认的说法,认为在cancer research和在临床上, SV/CNV和
somatic mutation 相比哪个用处更大或者更准确/更有临床价值
从技术应用来讲, array 用于SV/CNV也不见得比NGS差,但是rare mutation来说NGS明显
有前途,甚至比RT-PCR更有前途
,
might |
|
a**m 发帖数: 184 | 4 Package for calling CNV using whole exome sequencing data.
Key words: CNV, whole exome sequencing
The ones used by others already: ExomeCNV, ExomeNorm, ExomeDepth, CoNVEX (
Copy Number Variation Exome Sequencing), XHMM (Exome Hidden Markov Model),
CoNIFER (Copy Number Inference From Exome Reads)
The one I have in mind: eCNV, which is okay but not ideal.
5 baozi for the one I choose as favorite.
Thanks XD |
|
i*e 发帖数: 352 | 5 nocnv记得是tumor cnv去除germline cnv
难道我记错了? |
|
i*e 发帖数: 352 | 6 SNP array可以做CNV,但是技术更新换代快呀,现在测序中心有的买SNP array只是用
作NGS的QC,也就是说上NGS的话,可以有两套数据可以call CNV,想怎么玩就怎么玩,
也是哈皮的 |
|
b****r 发帖数: 17995 | 7 看你可以允许漏掉多少百分比的CNV了
如果想抓到比如90%以上,20x差得远,估计起吗平均的一百以上,而且跟算法很有关系
,这些cnv一般都是重复性比较高的地方,很多algorithm直接就把这些reads给扔了,
算出来的会很不准 |
|
发帖数: 1 | 8 是不是很多这种染色体大片段的变化,比如SV、CNV,现在被发现是通过影响TADs (
topological associated domains)来发挥作用,通过影响3D genome、enhancer-
promoter的相互作用来发挥功能?
过去鉴定的CNV、SV,跟疾病的关联,现在可以通过这方面来解读。
coding
的。 |
|
b*****h 发帖数: 3386 | 9 ☆─────────────────────────────────────☆
badfish (badfish) 于 (Mon Jul 20 13:55:04 2009, 美东) 提到:
内线朋友告诉我,是因为很多科研机构的刺激计划的拨款还未落实,预定的设备被暂时
halt了。 导致上个季度miss。 在第4季度应该恢复。
现在这个股比前一个月下降了25%, 我正式建议大家用自己的投资账号或退休账号
buy on dip。 这是未来几年的明星企业, 在新一代测序技术问世并商业化前,
Illumina将统治这个行业至少3-5年。 我今天入1/2仓。
☆─────────────────────────────────────☆
pippo (pippo) 于 (Mon Jul 20 14:03:44 2009, 美东) 提到:
用投资帐号or退休帐号means real-long-term play?
☆─────────────────────────────────────☆
badfish (badfish) 于 (Mon Jul 20 14:13:... 阅读全帖 |
|
b*******8 发帖数: 37364 | 10 奶子不小,虽非完璧,然而可操性强过无数CNV。
建议菌斑WSN日后再说! |
|
b*******8 发帖数: 37364 | 11 原书写的晦涩朦胧,估摸着金庸也是WSN,从没干过CNv |
|
d****o 发帖数: 32610 | 12 DNA突变率并不是一定的
基因组有不稳定区域
此外还有CNV啥的就不说了
你这半瓶水还不如我高中竞赛知识基础牢固 |
|
x********e 发帖数: 35261 | 13 废话。你自己去学一学大部分突变是什么突变。CNV是啥?不用看其他的,就看看癌症
基因p53都是些什么突变。
半瓶水就是半瓶水。我还没开始说bt蛋白突变成对人体有毒性蛋白的概率几乎为零呢 |
|
v**e 发帖数: 8422 | 14 何止军版, 世上一个义人也没有
罗马书 3:9-31 Chinese New Version (Simplified) (CNVS)
世上一个义人也没有
9 那又怎么样呢?我们比他们强吗?绝不是的。因为我们已经控诉过,无论是犹太人或
是希腊人,都在罪恶之下, 10 正如经上所说:
“没有义人,连一个也没有,
11 没有明白的,没有寻求 神的;
12 人人都偏离了正道,一同变成污秽;
没有行善的,连一个也没有。
13 他们的喉咙是敞开的坟墓,
他们用舌头弄诡诈,
他们嘴里有虺蛇的毒,
14 满口是咒骂和恶毒;
15 为了杀人流血,他们的脚步飞快,
16 在经过的路上留下毁灭和悲惨。
17 和睦之道,他们不晓得,
18 他们的眼中也不怕 神。”
19 然而我们晓得,凡律法所说的,都是对在律法之下的人说的,好让每一个人都没有
话可讲,使全世界的人都伏在 神的审判之下。 20 没有一个人可以靠行律法,在 神
面前得称为义,因为借着律法,人对于罪才有充分的认识。 |
|
M********a 发帖数: 10 | 15 默沙东(美国默克), 世界500强,全球第二大制药公司。
Merck & Co., Inc., known as MSD outside North America, is committed to
scientific research in China. MSD China R&D is proud to announce the launch
of the China Postdoctoral program offering Chinese postdoctoral researchers
a new path to the forefront of their research (in the areas of Biostatistics
, Bioinformatics and health/medical informatics). The MSD China R&D post-doc
will be stationed in the MSD Beijing site and will conduct research with
scientists in MSD Chi... 阅读全帖 |
|
e*i 发帖数: 10288 | 16 Forward this post to your email--if you are using telnet
_=_
_=_ Part 001 of 001 of file 5_off_30_cpn.zip
_=_
begin 666 5_off_30_cpn.zip
M4$L#!!0````(`&!D_$)O_NPBKE```.-W```0````-5]O9F9?,S!?8W!N+G!D
M9NV]=5Q5V]8P#"B*I)2((FR1E-@==)=T2(@@M:6[0T5"!`D+#%04D!`%:02D
MI;M#NKN[O@7F$>X]]]SG?=_OGV?NW]YK[KGF&CW''&.N8E82E^2"
MZYI("%$@",C:P(R$GQ\L9VJ%U;
M!:!=#6A'PI!@:9`V"`I'HD`P.%1'4)`$:V6T!P9TL)`0NMAAK^]A0L))""'?
M"Q1`O%=`5C_:H$@,^D`;"H4XT(9!0/]L@\'0R`-M*!Z>/]O@4`C\... 阅读全帖 |
|
M********a 发帖数: 10 | 17 默沙东(美国默克), 世界500强,全球第二大制药公司。
Merck & Co., Inc., known as MSD outside North America, is committed to
scientific research in China. MSD China R&D is proud to announce the launch
of the China Postdoctoral program offering Chinese postdoctoral researchers
a new path to the forefront of their research (in the areas of Biostatistics
, Bioinformatics and health/medical informatics). The MSD China R&D post-doc
will be stationed in the MSD Beijing site and will conduct research with
scientists in MSD Chi... 阅读全帖 |
|
s****a 发帖数: 9912 | 18 【 以下文字转载自 WaterWorld 讨论区 】
发信人: Tianzi (Sun Scracher), 信区: WaterWorld
标 题: 不管WSN喜欢不喜欢,WF会愈演愈烈
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jul 17 21:16:33 2013, 美东)
现在所谓的外F盛行,有很多因素。其中最重要的原因就是中国正在向后现代消费社会
转型,自然伴随妇女性解放。而在国外的国女可以更先行一步,可以做自己想做的事情
了。这些事情就是有的猥琐男的梦想,“吃遍天下美味,睡遍天下美女”。所以为什么
女人不能“睡遍天下美男”?国女的性意识在觉醒,想找刺激,玩儿SM,群P,暴露等
等重口味的,也就可以理解了。而WSN能提供什么?日子还没过安稳呢,还在蝇营狗苟
,努力工作还房贷,很多WSN,长期不锻炼,无论形象还是能力都不咋样,哪能满足国
女日益增长的精神性追求?
当年欧美性解放阶段,女人一样什么人都睡,所以欧巴马的老爹才有那么多机会。现在
欧洲性解放式微,美国的已经算结束了,所以大家对待性趋于理性了。中国的性解放才
开始,还有至少二三十年呢。外F大潮浩浩荡荡。大家会看到越来越多... 阅读全帖 |
|
|
|
w********2 发帖数: 16371 | 21 机会天天有,大赌伤神小赌怡情
er 明天盘后看看你认得几个 一个都不认识的请排队申请退市退版:
AF,AFOP,AMP,ATGN,AWH,AXP,BDN,BGS,BHLB,BRKL,CAKE,CCI,CLB,CNV,CPAC,CRUS,CVA,
CVBF,CVTI,CYS,DEL,DFS,DLB,DMRC,DWCH,EFX,EGBN,EGHT,ESND,FBHS,FBNK,FFIV,FISI,
FTK,FTNT,GGG,GLF,IBKC,IEX,INFN,LHO,LOGI,LVS,MKSI,MLNX,MORN,MOSY,MSA,NVEC,OII
,PCBK,PLCM,PLXS,QCOM,QDEL,RCKY,RELL,RJF,SCSS,SFS,SLG,SLM,SNDK,TBI,TCBI,TSC,
TSCO,TXN,TYL,UCTT,URI,VMI,WFT,XLNX,ZHNE, |
|
v*****z 发帖数: 3067 | 22 2011 BMW M3 8G 2DCV A PS AC CV 4X2 36,986 GREY
$35,000
2013 BMW M5 8G 4DSN A PS PB AC MR 4X2 61,495 BLACK
SA $52,000
2006 BMW X3 3.0L 6G 4CUV A AWD 51,002
SILVER $10,500
2008 BMW X3 3.0SI 6G 4CUV A AWD 70,484 BLACK
$12,100
2008 BMW X3 3.0SI 6G 4CUV A AWD 93,624 SLVR
$10,000
2013 BMW X3 35I 6GT SUV A PS PB AC ... 阅读全帖 |
|
l*x 发帖数: 14021 | 23 一条疯狗从上世纪五道口到现在太空针,咬人无数。你跟一群被狗咬过的人说,给你24
小时问候狗狗的家人,把怨气发泄,然后狗咬人的问题就会自然解决了?疯狗不被剁
嘴或关笼子里前,我是不敢回来的。你们没有得罪疯狗的,请随意。但不要怪我这点jb
小事过不去,不愿意回来灌水。前面疯狗咬人,后面狗主人捅刀子。背后还有靠山,我
发怨气有屁用。
几千年前,人所罗门王就写了
我又看见日光之下所发生一切欺压的事:受欺压的流泪,却无人安慰他们;欺压他们的
,手里握着权柄,因此无人安慰受欺压的。
传道书 4:1 CNVS |
|
|
d******u 发帖数: 1114 | 25 请看我刚发的那个cnv双眼皮帖的帖子里面推荐的产品。 |
|
V*7 发帖数: 818 | 26 为什么女人可以接受非CN,可以接受离婚男
男人却不能接受非CNv,不能接受离婚女
是女人心胸比男人广阔?不是的,是因为社会是男性强权,女人在很多时候还是很依赖
男人,所以对男人不那么挑剔,男人很多毛病都可以忍耐。等到女人真正强大起来,女
人真正一辈子不嫁人也可以过而且没人说三道四,那个时候女人就可以像现在男人挑剔
女的一样去挑剔男人了 |
|
U*****g 发帖数: 366 | 27 什么是“没有漏洞的证明”?
谁现在还相信周找到活老虎?没有漏洞的铁证呢?就凭那一张年画也能成为铁证?为什
么我们不去相信一个老实农民屈打成招?那年画在陕西卖了吗?有证据表明周买了?周
买了就一定用了?周老虎给出了他拍的那么清楚的照片,还信誓旦旦的“造了假拿我头
当皮球”,为什么你们就是不相信?
谁相信阿娇是cnv?没有漏洞的铁证呢?就凭陈gx流出的一些非常模糊的照片,和阿娇
一句“当年很傻很天真”?照片不能是ps的?就算照片是真,哪张照片是正在xx的?”
很天真”不是表明自己没有xx?难道天真不是常用量形容小孩子的吗? |
|
T****i 发帖数: 15191 | 28 现在所谓的外F盛行,有很多因素。其中最重要的原因就是中国正在向后现代消费社会
转型,自然伴随妇女性解放。而在国外的国女可以更先行一步,可以做自己想做的事情
了。这些事情就是有的猥琐男的梦想,“吃遍天下美味,睡遍天下美女”。所以为什么
女人不能“睡遍天下美男”?国女的性意识在觉醒,想找刺激,玩儿SM,群P,暴露等
等重口味的,也就可以理解了。而WSN能提供什么?日子还没过安稳呢,还在蝇营狗苟
,努力工作还房贷,很多WSN,长期不锻炼,无论形象还是能力都不咋样,哪能满足国
女日益增长的精神性追求?
当年欧美性解放阶段,女人一样什么人都睡,所以欧巴马的老爹才有那么多机会。现在
欧洲性解放式微,美国的已经算结束了,所以大家对待性趋于理性了。中国的性解放才
开始,还有至少二三十年呢。外F大潮浩浩荡荡。大家会看到越来越多的外F。中国强盛
与否,只会是次要因素。所以要是气愤外F,估计本版有些人要气死了。
顺便说一句,性解放之后的女人很难伺候。由简入奢易,由奢入简难啊。举个例子,我
一对美国人朋友。女的家庭主妇,每天大把时间健身,非常活跃;而男的养家糊口,平
常挺累的,经济也不太宽裕,但还是要满足老婆... 阅读全帖 |
|
t******n 发帖数: 2939 | 29 ☆─────────────────────────────────────☆
Tianzi (Sun Scracher) 于 (Wed Jul 17 21:16:33 2013, 美东) 提到:
现在所谓的外F盛行,有很多因素。其中最重要的原因就是中国正在向后现代消费社会
转型,自然伴随妇女性解放。而在国外的国女可以更先行一步,可以做自己想做的事情
了。这些事情就是有的猥琐男的梦想,“吃遍天下美味,睡遍天下美女”。所以为什么
女人不能“睡遍天下美男”?国女的性意识在觉醒,想找刺激,玩儿SM,群P,暴露等
等重口味的,也就可以理解了。而WSN能提供什么?日子还没过安稳呢,还在蝇营狗苟
,努力工作还房贷,很多WSN,长期不锻炼,无论形象还是能力都不咋样,哪能满足国
女日益增长的精神性追求?
当年欧美性解放阶段,女人一样什么人都睡,所以欧巴马的老爹才有那么多机会。现在
欧洲性解放式微,美国的已经算结束了,所以大家对待性趋于理性了。中国的性解放才
开始,还有至少二三十年呢。外F大潮浩浩荡荡。大家会看到越来越多的外F。中国强盛
与否,只会是次要因素。所以要是气愤外F,估计本版有些人要... 阅读全帖 |
|
h***0 发帖数: 248 | 30 你们要找SNPs还有SVs,CNVs吗?
RNA-seq做吗?
我家没有,就我一个,我倒是认识一对双胞胎都是,不过在国内 |
|
b******n 发帖数: 2212 | 31 lz小姑娘
你甚麽都可以接受
但是不可以接受一个男人的威胁
这次威胁你就道歉
下次不理你了你上床
再下次跪地磕头
再再下次呢?你还有甚麽可以做的?
对於初恋不能放手可以理解
但是希望你看清楚,他对你的“爱”非常有限
你不用纠结甚麽
如果说你有甚麽问题
就是不要给男友扣帽子
CN CNV也可以谈论性
如果只是调情,没有问题
如果他动不动就玩失踪,来“不按照我说的做就不要找我”
那就让他彻底失踪好了 |
|
t*******7 发帖数: 544 | 32 是跟年检一样的内容(除了切片)吗?
btw,“真正解放”的美国女生会确定好自己哪一天要跟男友ML破自己的cnv身,然后专门提前去医院检
查一趟?为啥除了年检还有这个必要?
不好意思,第一次听说,问题有点多,勿怪~ |
|
f*********e 发帖数: 3037 | 33 18岁以上推荐做了,不管是不是cnv。
再说两个人感情稳定,抱也抱了亲也亲了,两个人谈到以后have sex不是很自然么。
提早检查,确定避孕方式,到时候就后顾无忧了。
说实话,偶当年觉得反正不have sex就一直拖到24岁然后去检查才发现出了大毛病了。
郁闷。早点发现说不定还好多了。
专门提前去医院检 |
|
|
V*7 发帖数: 818 | 35 你的意思就是要找个CNv嘛!
那只能十几岁的,搬得过来? |
|
l*****a 发帖数: 38403 | 36 发信人: ESV (ESV), 信区: TrustInJesus
标 题: Re: 我犯罪了,很严重,求指导
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Sep 30 14:30:39 2011, 美东)
不是,是ESV,NIV,NLT,KJV,NASB,CUV,NCV,CNV,CEV,TEV,NRSV系列之一 |
|
l*****a 发帖数: 38403 | 37 ESV,NIV,NLT,KJV,NASB是老霍的马甲,
从CUV开始都不存在,除了有两个已被注册的cuv(螂王),cnv(例如) |
|
h*o 发帖数: 1035 | 38 雅 1:27 在 神我们的父面前,那清洁没有玷污的虔诚,就是看顾在患难中的孤儿寡
妇,并且保
守自己不沾染世俗。(CUV)
Jas 1:27 Pure religion and undefiled before God and the Father is this, To
visit the
fatherless and widows in their affliction, and to keep himself unspotted
from the
world.(KJV)
在父 神看来,纯洁无玷污的虔诚,就是照顾患难中的孤儿寡妇,并且保守自己不被世
俗所污
染。(CNV)
Religion that is pure and undefiled before God, the Father, is this: to
visit orphans
and widows in their affliction, and to keep oneself unstained from the world
. (ESV)
我说怎么没见过你的经文呢,Religion是虔诚的意思,不是A Relig... 阅读全帖 |
|
h*o 发帖数: 1035 | 39 罗 9:5 列祖就是他们的祖宗,按肉体说,基督也是从他们出来的,他是在万有之上,
永远可称颂的
神。阿们。(CUV)
蒙拣选的列祖也是他们的祖宗;按肉身来说,基督也是出自他们这一族。其实,他是在
万有之上,永
远受称颂的 神。阿们。(CNV)
To them belong the patriarchs, and from their race, according to the
flesh, is the Christ who is God over all, blessed forever. Amen. (ESV)
约 1:1 太初有道,道与 神同在,道就是 神。 约 1:2 这道太初与 神同在。 约 1
藉着他造的;凡被造的,没有一样不是藉着他造的。(CUV)
1:1 In the beginning was the Word, and the Word was with God, and the
Word was God. He was in the beginning with God. (ESV)
耶稣是上帝(圣父)的儿子,耶稣是上帝。
犹太教、伊斯兰教、以及一些基督教的异端... 阅读全帖 |
|
G*******s 发帖数: 4956 | 40 赛 12 ⑶
结 47 ①
Ref. Esv cnv |
|
G*******s 发帖数: 4956 | 41 来自主题: TrustInJesus版 - 童女怀孕 圣经译本有好有坏,我推荐:ESV, NASB, NIV, NLT, KJV, CUV, CNV
之前听人说NET有问题,现在才发现真的有问题。
发信人: GetThere (广告招募中), 信区: TrustInJesus
标 题: Re: Michael 看过来 - Isaiah 7:14
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jun 29 13:16:43 2011, 美东)
Revised Standard Version:Therefore the Lord himself will give you a sign.
Behold, a young woman shall conceive and bear a son, and shall call his nam
Imman'u-el.
Jewish Bible: Therefore, the Lord, of His own, shall give you a sign; behol
, the young woman is with child, and she shall bear a son, and she s... 阅读全帖 |
|
G*******s 发帖数: 4956 | 42 你可以看英文啊,英文ESV版本的,比较好。 NIV也不错。
中文要白话的可以看 新译本 NCV or CNV
网上都有电子版。可以去 youversion.com等网站,那里比较全。 |
|
E*V 发帖数: 200 | 43 不是,是ESV,NIV,NLT,KJV,NASB,CUV,NCV,CNV,CEV,TEV,NRSV系列之一 |
|
G*******s 发帖数: 4956 | 44 哥林多前书 (林前) 11 林前 11:1 你们该效法我,象我效法基督一样。 林前 11:2 我
称赞你们,因你们凡事记念我,又坚守我所传给你们的。 林前 11:3 我愿意你们知道,
基督是各人的头;男人是女人的头; 神是基督的头。 林前 11:4 凡男人祷告或是讲道
(“讲道”或作“说预言”。下同),若蒙着头,就羞辱自己的头; 林前 11:5 凡女人祷
告或是讲道,若不蒙着头,就羞辱自己的头,因为这就如同剃了头发一样。 林前 11:6
女人若不蒙着头,就该剪了头发;女人若以剪发、剃发为羞愧,就该蒙着头。 林前 1
1:7 男人本不该蒙着头,因为他是 神的形象和荣耀,但女人是男人的荣耀。 林前 11
:8 起初,男人不是由女人而出;女人乃是由男人而出。 林前 11:9 并且男人不是为女
人造的;女人乃是为男人造的。 林前 11:10 因此,女人为天使的缘故,应当在头上有
服权柄的记号。 林前 11:11 然而照主的安排,女也不是无男;男也不是无女。 林前
11:12 因为女人原是由男人而出;男人也是由女人而出;但万有都是出乎 神。 林前
11:13 你们自己审察,女人祷告 神不蒙着头,... 阅读全帖 |
|
G*******s 发帖数: 4956 | 45 哥林多前书 (林前) 11 林前 11:1 你们该效法我,象我效法基督一样。 林前 11:2 我
称赞你们,因你们凡事记念我,又坚守我所传给你们的。 林前 11:3 我愿意你们知道,
基督是各人的头;男人是女人的头; 神是基督的头。 林前 11:4 凡男人祷告或是讲道
(“讲道”或作“说预言”。下同),若蒙着头,就羞辱自己的头; 林前 11:5 凡女人祷
告或是讲道,若不蒙着头,就羞辱自己的头,因为这就如同剃了头发一样。 林前 11:6
女人若不蒙着头,就该剪了头发;女人若以剪发、剃发为羞愧,就该蒙着头。 林前 1
1:7 男人本不该蒙着头,因为他是 神的形象和荣耀,但女人是男人的荣耀。 林前 11
:8 起初,男人不是由女人而出;女人乃是由男人而出。 林前 11:9 并且男人不是为女
人造的;女人乃是为男人造的。 林前 11:10 因此,女人为天使的缘故,应当在头上有
服权柄的记号。 林前 11:11 然而照主的安排,女也不是无男;男也不是无女。 林前
11:12 因为女人原是由男人而出;男人也是由女人而出;但万有都是出乎 神。 林前
11:13 你们自己审察,女人祷告 神不蒙着头,... 阅读全帖 |
|
J*******g 发帖数: 8775 | 46 "圣经不是讲科学的书,但从神而来的特殊启示(圣经)和普遍启示(包括科学)不矛盾。
在这个探讨中,我们的信仰更加坚定。"
圣经跟科学是否矛盾,很大程度上取决于我们如何解读圣经。创世纪前几章有人认为是
很早的文章,那时候可能还没有文字记录,所以很可能是口头相传。这种情况下,诗歌
的形式是最容易让人记忆的。而且考虑到那时候人的认知水平有限,说太难的他们一是
不懂,二是记不住。我认为对这几章,我们要以理解其神学上的意义为主。比如神存在
于世界之前,神创世,是一切物质的创造者。人是区别去其他动物的受造物,人有神的
形象,神爱人关心人,人的堕落等等。至于它里面有多少科学或是历史意义,我认为并
非这几章的重点。
至于那些科学亚当夏娃这些东西也都是一些猜测。从严谨的观点看,我们是无法准确预
测过去的。我们只是根据现在的观测对过去插值而已。新的科学发展会不断推倒旧的观
点,生物尤其如此。而且现在人们发现人体内各个细胞的DNA并非完全一样,细胞分裂
时会有SNV甚至CNV。DNA的破坏与修复也会导致DNA的变化。比如年纪大的女人之所以不
容易生小孩,很多时候就是因为卵子的DNA有缺陷。
科学的一些观点,如... 阅读全帖 |
|
l*****c 发帖数: 17 | 47 是啊,我们研究遗传学,分子生物学包括搞统计的人,不断的创造新的名词来解释以前
不能解释的现象。每个都合理,最后表示都不合理。现在的GWAS研究,根本不能对超出
QTL范畴的生物学有人和解释。
这又回到了50年前的解释了,把所有(大部分)疾病/表型看成是数量性状,用微效多
基因来解释,既然是微效多基因,那当然是有无穷的组合了,比如有40个基因,每个基
因可能有50个突变,然后加上这些突变的组合,大家计算以下这有多少?从应用的角度
,接近无穷吧。最近的一篇NG文章用新方法来处理以前的数据,发现12万个SNP(我望
了具体的数值,反正很大)能解释56%的疾病表型,那是不是需要1百万的SNPs能解释80
%呢?显然还达不到,因为有环境因素在。那在计算这多大上百万SNPs的组合表型呢?
这还是只从SNP出发来解释。大家在建立简单的BLUP模型的时候,能考虑多少互作?
还有大量的CNV, chromosome rearrangement,methylation......,然后还有这些遗传因
素的组合呢?我们在研究这些生物现象的时候,用了太多的determinism的方法,考虑
太少的stocha |
|
s******s 发帖数: 13035 | 48 不说作者说的有没有道理,他找了一个所谓当时同成本的NGS比较。
要知道,虽然Chip也在提高密度,但和NGS的发展速度完全不能比。
microarry做transcription研究从质量上全面落后,价格上也好不
到哪里去;当然,做genome里面比如SNP/CNV还是有很大价格优势,
不过NGS这个发展速度完全打破摩尔law, 超过array也就是几年的问题 |
|
n******7 发帖数: 12463 | 49 CNV我最近在做,刚处理了一下1000genome的数据。别的不说,NGS分辨率是1bp,
microarray根本
不能比 |
|