r****g 发帖数: 511 | 1 //tears~`` 到底是制药研究的。。。共鸣得很学术很专业哪~~` //hands...
感觉应该有办法人工合成的。。。//blushing~`` 然后就算不能合成出完整的全部结构
,把主要的几个靶点官能团搞定可能也会有些效果?
如果是欧美已经在研究,估计人家可能申请什么专利了。。。不知道有没有涵盖国内,
如果没有的话就可以到国内找一些院校来攻攻看。。。:"> |
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M**a 发帖数: 4816 | 2 虽然我们是一路的,不过,在你面前,俺绝对是应该倚老卖老,不知不觉在生物这行大
约20年了,汗一个。
针对你几个疑惑,谈谈俺的看法。
1) -钱的方面,测序确实很烧钱,不过不久的将来等1000美元一个基因组的技术出来后
,这个不是问题。实际应用方面,“现有的那些测出来的结果”,已经找到几个非常特
异的疾病的突变,是非常理想的药物靶点,动物实验很成功的,应该还是很有前景的。
预测的结果能够提前预防,这到个人而言,是非常有利的:赢得预防和治疗的时间,从
而节省大把的钱。
2) -个性化医疗,有些不是牺牲短期的感官享受就能避免的,尤其是有些遗传病。同时
,这个也是对症下药的意思,这是西医做得比较靠近“中医”的地方。
3) -预防我觉得应该还包括易感基因的测定和重大疾病的早期检测。说难听一些,治疗
很多时候已经是烧钱了,举个例子,癌症中后期。
4) -MM比较理想主义,可是,科研界并非圣土。科研界应该是以社会需求为主导。科学
家也不过是个365行中的一个普通行而已。
5) “就算是出了科研成果,在现在极度商业化的社会,第一个受益的是谁呢?真的是
芸芸众生甚至老弱病残群体嘛?“ -这个俺就不多说了... 阅读全帖 |
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m********5 发帖数: 17667 | 3 这个数据挖掘可以忽悠,因为会出来很多数据,一开始就去忽悠数据标准,我觉得有戏。
http://news.ifeng.com/a/20140611/40694077_0.shtml
原标题:我国全面启动人类蛋白质组计划
新华网北京6月10日电(沈基飞、胥金章)中国人类蛋白质组计划(CNHPP)10日全面启
动实施,主要目标是以我国重大疾病的防治需求为牵引,发展蛋白质组研究相关设备及
关键技术,绘制人类蛋白质组生理和病理精细图谱、构建人类蛋白质组“百科全书”,
全景式揭示生命奥秘,为提高重大疾病防诊治水平提供有效手段,为我国生物医药产业
发展提供原动力。
人类蛋白质组计划(HPP)是继基因组计划之后人类全面探索自我奥秘征程中又一伟大
科技工程,是新世纪第一个国际大型科技合作计划。中国科学家率先倡导并领衔了人类
第一个器官(肝脏)国际蛋白质组计划(HLPP),开中国引领国际大型科技合作计划之
先河,所形成的理论框架、整体策略和技术标准被国际同行认可和应用,为人类蛋白质
组计划的全面展开发挥了示范和指导作用。近4年,中国在这一领域国际核心刊物发文
章1000多篇,跃居世界第二。在乙酰化新的代谢... 阅读全帖 |
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c***r 发帖数: 3965 | 4 【 以下文字转载自 ChinaNews 讨论区 】
【 原文由 dychdych 所发表 】
非碘病毒的基因组与tigr上现有微生物文库的比对,确实有很多特异区域,的确是一种新型
病毒.不过它是一个DNA病毒,而不是RNA病毒(HIV是RNA病毒)它的长度大概是HIV的十倍
左右
现在世界上应该很多实验室都在研究它的基因诊断和疫苗设计,从理论上讲道路是明确的
这个病毒和其他所有同样冠状DNA病毒家族都低同源,在进化上,它几乎是完全独立的一
只。这意味着已有的治疗方法都不起作用。
在蛋白水平上,它有非常多的特异性区域。这意味着要找到致病的靶点比较困难。也就是
说,在短期,不太可能得到有效的药物和疫苗。
4,目前的所谓"支持性治疗",就是指医生也没有办法,只能患者的免疫系统,能挺的过
就挺,没有办法的办法。
所以,依照WHO( www.who.int/en), CDC (www.cdc.gov ) 的建议,除了手册中说的那些
注
意事项以外,请:
1,尽量不要在公众场合出现
2,尽可能的带口罩,18层那种,3-4小时一换
3,尽可能的不乘坐公车,
4,尽可能的不乘坐电梯,:),锻炼的好机会 |
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t****p 发帖数: 1504 | 5 如果要成为工具箱的一员,一般来说需要这个小分子具有特异性,特异地作用在某个蛋
白或者pathway上。
作用在已知蛋白的小分子还是可以促进基因功能的研究。比如最初研究的时候是发现这
个基因在癌症发生的作用,那么它对脑神经的作用,对血细胞分化的作用并不一定知道
。现在做实验也常常会用某些蛋白酶抑制剂来确证结果,就证明这些小分子的价值。
如果这个筛选成本不太高的话,我觉得就可以系统地筛一类蛋白的抑制剂或者激活剂。
比如筛所有kinase的抑制剂,不管知不知道功能,然后拿这个特异的抑制剂小分子来研
究这些蛋白酶的在不同组织的,不同发育阶段的功能。
小分子筛选还有一个应用现在正在开展,我不知道归到哪一类。就是取代defined
factors,诱导ips,或者诱导细胞转化,或者细胞之间的转化 trans-differentiation
。我还忘了说一点,小分子作用以后一般可以可逆地去掉。这个比起一直过表达转录因
子有着本质的优势。
实现
靶点的小分子,和你这个library的概念就不是一个东西了;3,就药物开发而言,算是
有些小帮助,但有起到颠覆性的作用吗?还有很多缺点,不过这些都不重要,关 |
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u**s 发帖数: 384 | 6 google search EGFR, 这个是最普遍的,其实是一大类中的一种。70%的药物都是用这
个做靶点。 |
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f********n 发帖数: 6465 | 7 国内作昆虫的多不多啊.例如昆虫的农药靶点GPCR等. |
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c*v 发帖数: 151 | 8 做昆虫的GPCR的可能不是很多,美国这边也不太多啊。国内有几个人做nAChR的做得不
错,其他农药靶点好像都不多。 |
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w***j 发帖数: 88 | 9 Resveratrol最近被证明是直接结合AMPK的调节subunit,然后激活了AMPK。AMPK才是
Resveratrol对代谢综合症的靶点。
参见Cell Metabolism 11, 554–565, June 9, 2010 |
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w**r 发帖数: 134 | 10 我不知道AD如此多其他的进展,我是受合成化学训练,AD也不是我的研究,我也只是跟
着主流的思路在走,对于你说的其他方面的考虑,我觉得主要是药物研发缺乏对应的研
究靶点,否则制药公司早就蜂拥而上了。药物研发特点是不一定背后的机制都很清楚,
黑箱情况下也能出药,等一切清楚了,早就没有蛋糕给你分了,这也就说明药物研究偏
应用研发,对基础的东西其实并不关心。
当然基础研究很重要,我想药物研发切入的时机也就很重要。
对AD再说两句,在ab amyloid假说出来前,Ache不足的假说下,发现ache inbibitor的
AD的药都上市的三个,疗效可想而知,对药厂来说,在已有的只是情况下能推出FDA满
意的药赚钱足够了。
希望大家对药物研发能有点新的认识
First
side
INSDIE |
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h****g 发帖数: 439 | 11 avastin和好多RTK抑制剂存在很多问题,好多效果不咋地,价钱倒很贵。
哪位制药的同学说说为啥这种靶点治疗制剂怎么这么贵。因为专利,还是特殊的制备过
程? |
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s******y 发帖数: 28562 | 12 不,我只是对单靶点的机制死心了。
总是按下葫芦浮起瓢,没完没了。
我觉得免疫介入治疗是现代医学的将来。然后在接触多了免疫概念之后,
突然发现其实和中医的很多概念有相通之处,所以就激发了我那个认为
中医的理论其实是古人在不理解现代科学概念的情况下只好用阴阳五行来
标记人体内部反映系统的一个经验系统这个念头。 |
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i***R 发帖数: 663 | 13 中药不是万灵药,中医也不是完美的理论,哪里都会有错误。西方最先进的筛选技术也
不能确定能够
找到有用的化合物,也会遗漏可能的药物,几十亿元研发的药物也可能在人体没有用。
面对这么复杂
的系统,我们对古老的中医药如此求全责备,不是有失公道么。
对中医理论,中药当然要持怀疑态度,但这并不能否认它其中很多合理观察。中医药是
多年研究的富
矿,我们完全抛弃这些遗产,无疑是很不理智的。比如中医讲心肾相交,西医也发现心
脏功能和肾功
能直接有非常多的联系,惊恐会释放肾上腺素,使心跳加快,血压上升,释放心钠素,
调节肾功能,
这种应激状态久而久之会损伤肾功能的。在根本不知道肾上腺素,心钠素这些体内因子
的存在的情况
下,就能通过观察提出心肾相交,恐伤肾,我觉得这是很了不起的。这样的例子,懂中
医的人可能会
说出更多。
事实上中医发现了几千种治病的药物,我们为什么不能用开放一点的心态,用现代的筛
选手段去验证
呢,说不定热性的中药就可能含有某种成分作用在身体某个靶点上而产生疗效。单单凭
一两个药物的
失误就全盘否定,也不是科学的态度吧。 |
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n***w 发帖数: 2405 | 14 这个也算gamma secretase modulators吧? |
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C*********m 发帖数: 213 | 15 AD基础研究领域现在是不是认为 APP/Tau之类只是secondary players? 针对secretase
会有效果么?
比例是不是显著低,好像比较难通过BBB,可能还需要改进下分子,有趣 |
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h*******o 发帖数: 4884 | 16 Tau hyperphosphorylation is generally considered as downstream to Amyloid.
secretase |
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f********n 发帖数: 6465 | 17 氨水哥,搞你门蛋白质结晶,具体的需要什么技术呢?
因为我自己克隆的一个GPCR新基因是个很好的药物靶点,不知道是不是要把蛋白质结构
搞出来比较好?
是不是,只要是个人,都可以到你们那里去打酱油呢?
还是说,需要预先掌握什么技术呢?
谢谢前辈. |
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j*******n 发帖数: 62 | 18 virus有好多种,看现在多用lenti和adeno,为啥没有其它的呢?另外使用重组表达单
抗的病毒作为药物载体的概念很早就有了,怎么现在看不到什么进展了?遇到什么问题
了吗?对这个东西很好奇,哪位业内的大牛能给答疑解惑下? |
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l***m 发帖数: 26 | 19 这问题,我也问过。大牛来总结总结吧。
我只知道virus vector做疫苗,发展不错,phase II了。其他的不知道!
期盼总结! |
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h********0 发帖数: 944 | 20 我公司在做痘病毒治疗肿瘤,现在有几个公司在FOLLOW UP, 包括用腺病毒,预计未来
第三代肿瘤治疗药物就是用这些溶瘤病毒了,不过目前问题还很多,需要一个个去解决 |
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k******n 发帖数: 39 | 21 what is your company?
any position now?
lol |
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c******m 发帖数: 884 | 22 一般是先把鱼搞得不正常(phenotype),再拿去筛药,看哪个药能把鱼搞回正常。
靶点现在只能靠猜,就算猜出了pathway,可能的靶蛋白也至少有几百种,所以验证起来
问题很多,成本很高。 |
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p*****m 发帖数: 7030 | 23 首先,有n多的病不知道靶点,要是真知道了就好了
第二,可以用外因在WT animal induce病,不一定就是在WT fish上直接搞 |
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X******n 发帖数: 914 | 24 我的意思是说如果你用fish筛到了一个化合物,你想知道作用靶点,可是目前在fish里
面又很难找到其作用位点,是不是可以尝试用一些简单的模型帮助找到一些candidates
,再用fish去验证。当然最终你还是要在一些更高级的模型上验证了。 |
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f**u 发帖数: 346 | 25 这些我都可以理解,但是既然已经有了疾病模型还关心靶点干什么。 |
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f**u 发帖数: 346 | 26 这个最好理解了。但这种情况肯定是靶点已经了解得比较清楚了 |
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p*****m 发帖数: 7030 | 27 我是两个意思,就是首先搞出靶点不容易,如果你想知道的话;
其次就是 如果直接用WT fish model然后筛药,这个成功概率是很低的,因为你不知道
target的话你就不太容易在更高级的动物模型上验证这个药的作用,毕竟不是什么动物
你都能搞出一个类似的model的。当然了,其实我自己是很喜欢这种phenotypic screen
的策略的,但是我也不是很确信这个成功率
了。 |
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l*********1 发帖数: 351 | 28 本人做蛋白质工程的,对癌症治疗方面了解很少。设计稳定p53和抑制p53降解的小分子
药物有搞头吗?谢不吝赐教。 |
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l*********1 发帖数: 351 | 31 看着一老牛仍然孜孜不倦地做这方面的研究,灌水到灌得挺勤的,就不知道是不是一个
粪坑。 |
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Z******5 发帖数: 435 | 32 听说效果不好,信息仅仅是这几个字而已,再具体的就一点都不知道了。 |
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h******y 发帖数: 1374 | 33 没了
现在都是对病人分组,然后直接对癌基因进行targeted therapy吧 |
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h********n 发帖数: 4079 | 34 see these 2 papers about recovery of p53 in lung cancer mouse models:
Selective activation of p53-mediated tumour suppression in high-grade
tumours
Nature 2010, page 567
Stage-specific sensitivity to p53 restoration during lung cancer progression
Nature, 2010, page 572 |
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l***m 发帖数: 26 | 35 我倾向于找到p53 mimic peptide |
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f********n 发帖数: 6465 | 36 只要生物没有产业化一天,生物这行就没有什么搞头.
具体到P53,原来都已经讨论过了,肿瘤抑制之类的多数都是
老板之间合伙呼悠科研经费. |
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c****d 发帖数: 681 | 37 Nutlin-3的clinical trial好像不是很顺利啊 |
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A*******e 发帖数: 284 | 39 趁着这个帖子,请教结构的牛人。
做结构到底有什么作用? 找潜在的药物靶点,大家都这么说,牛人们能给点具体例子
吗? 曾经有个到结构牛人实验室的机会被我放弃了,但现在一点都不后悔。 感觉做结
构很难做出story。整天表达纯化结晶,会把我郁闷死。 还有看施做很多膜蛋白,一位
做结构的哥们跟我说他用除垢剂处理就能溶解结晶。我又有一个问题,这些发表的结构
真的能反应蛋白在体内的结构状态吗? 特别是那些膜蛋白。 国内化大力气把施请回去
,除了指望CNS外,还指望其他的吗? 比如解决什么具体问题,如找到某个疾病的治疗
方法。
想当年钱学森回去解决多少国内难题,这才是真的有用之才, 而生物学, 我觉得这样
的有用之才是非常少的,就实际情况来说很多目前都是没用的。 有人将施和钱放在同
一等级,我实在是难以理解。 |
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g*********d 发帖数: 233 | 40 《Cell》文献翻译:基因表达的小RNA调节因子
Cell 134, 899 – 902, September 19, 2008
Joel R. Neilson and Philip A. Sharp
今年Lasker基金会承认了Victor Ambros、Gary Ruvkun和David Baulcombe在推断
小RNA分子在真核基因表达的转录后调节中所进行的开创性工作。
分子生物学是一门年轻的学科,如同充满了未开发土地的新大陆。有关小RNA在基
因调节中的作用的重要发现是这门年轻学科中还有许多未开发的重要领域的一个例证。
9月26日,几位先驱(麻州大学医学院的Victor Ambros、麻州总医院和哈佛大学医学院
的Gary Ruvkun和剑桥大学的David Bulcombe有关小RNA的发现将被授予2008年Albert
Lasker基础医学研究奖。
历史上先驱者以及他们的发现的意义通常被忽略,只是在很多年之后才被承认。
Ambros和Ruvkun所发表的描述第一个微RNA及其标靶的优秀论文(发表在高深的Cell杂
志上)被忽略了近10年。与此同时,... 阅读全帖 |
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b****r 发帖数: 17995 | 41 做抗癌药如果在大学里很多从分子机理或者分子结构入手,多归到有机化学去了。有机
药物合成其实很容易找公司工作的,。生物口传统药理药代已经极少了。而且即使作出
有潜在意义的新靶点,fda淘汰率和其他不明朗因素太多了。
it的基础我看线点电路结构优化,算法,仿生之类还是很多的,但是因为没有fda门槛
,市场化还是容易很多 |
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m*****n 发帖数: 421 | 43 我觉得这是近来的新观点,癌细胞的基因组不停的断裂重组,以往那些研究单独的癌基
因、突变和靶点的理论就不正确。长期以来的癌症研究就是盲人摸象、管中窥豹、一叶
障目不见森林。 |
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j****x 发帖数: 1704 | 44 没人说“everything related to BIO is BAD!”,有什么可悲愤的啊。。。
现在尝试进入NGS数据分析领域还能被算做first generation?你也许太乐观了点
如果personal genome sequencing costs only $1000, 数据分析需要10000$? 你觉得
可能吗?“It is said”? By whom?好吧,就算真需要10000$,也不意味着就创造出
了大量的“work at home”的分析师啊,这块是可以高度流程化做成pipeline来实现的
,甚至某种程度上比传统的芯片数据分析还要可集成化一些。
关于肿瘤的各种突变,你说的没错,问题是进入到诊断应用阶段,只有那些具有真正确
定诊断意义的才可能作为识别的靶点,而这里的瓶颈不在NSG技术。另外,在后续的诊
断过程中,人工介入越少越好,这是基本的宗旨。一方面避免人为的bias,另一方面更
为关键的是保护个人隐私,这其实才是personal genomics真正能市场化的关键考验之
一。
作为重要的技术手段,NGS当然有着广泛的前景,自然有相应的职场需求,但是指望它
... 阅读全帖 |
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j*****d 发帖数: 787 | 45 多发言,特别是作用靶点和机制上,是不是确有神异之处?
线!
★ 发自iPhone App: ChineseWeb - 中文网站浏览器 |
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j****x 发帖数: 1704 | 46 其实应该说这个并不奇怪,之前有计算表明,每一个human miRNA都可能参与调控多个
靶点,而且数目还不小(有人认为可能平均下来可能会有上百个,不过争议比较大),
原因可能在于miRNA/mRNA interaction对序列匹配度的要求至少目前看来不是特别的高
,考虑到transcriptome这么大,那么无论内源外源的miRNA能蒙上几个target应该说并
不意外,碰巧又有相关的生物/生理学功能,那自然就会吸引眼球了。 |
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j****x 发帖数: 1704 | 47 近缘物种比对一下看看结合靶点是保守还是human specific?问题是,这里共进化的意
义何在,没啥story啊 |
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j****x 发帖数: 1704 | 48 其实应该说这个并不奇怪,之前有计算表明,每一个human miRNA都可能参与调控多个
靶点,而且数目还不小(有人认为可能平均下来可能会有上百个,不过争议比较大),
原因可能在于miRNA/mRNA interaction对序列匹配度的要求至少目前看来不是特别的高
,考虑到transcriptome这么大,那么无论内源外源的miRNA能蒙上几个target应该说并
不意外,碰巧又有相关的生物/生理学功能,那自然就会吸引眼球了。 |
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j****x 发帖数: 1704 | 49 近缘物种比对一下看看结合靶点是保守还是human specific?问题是,这里共进化的意
义何在,没啥story啊 |
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o*****l 发帖数: 203 | 50 细胞自噬是机体一种重要的防御和保护机制。但是这种自噬“信号”如何传递给细胞从
而使其“执行”自噬过程,则一直是科学界的难题。近期,我校生命科学学院林圣彩教
授课题组成功找到高等动物细胞在生长因子缺失条件下,启动自噬的部分“密码”,从
而在细胞自噬机制研究方面取得重大突破。
4月27日,最新一期的美国《科学》杂志以研究文章的形式刊发了这项研究成果,
并配发专门评述。这也是近三年来,我校生命科学学院第二篇发表在这一世界顶级学术
刊物上的论文。2009年6月,该院韩家淮教授的一篇有关细胞选择死亡方式机制的研究
文章曾“登上”该杂志。
所谓自噬,是指细胞消化自身蛋白质或细胞内的结构(细胞器)的一种自食现象。
通过这种现象,细胞可以降解、消除和消化受损、变性、衰老和失去功能的细胞器和变
性蛋白质等生物大分子,为细胞的生存和修复提供必须的能量。
科学家们认为,自噬与细胞凋亡、细胞衰老一样,是一种十分重要的生物学现象。
有关实验表明,包括肥胖症、糖尿病、神经退行性疾病、免疫失调及癌症在内的人类许
多重大疾病的发生都与该过程的异常有关。为此,自噬也是当前生命科学中最热门的研
究领域之一。
据林圣彩介绍... 阅读全帖 |
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