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f**u
发帖数: 346 | 2 每次看到关于基础研究和应用研究的讨论，
我觉得双方关于基础研究和应用研究的定义都不见的是一样的，
所以经常感觉是在你说你得我说我的。
这样吧，我下面列了几项假想的研究，我基本上从基础到应用的列，
各位可以先说说基础和应用的线到底在哪里，如果界定一样再讨论。
如果觉得有两项研究之间差得太多，也可以往中间加上一个居中的。
1。研究一种嗜热古菌的噬菌体是如何感染宿主的
2。研究果蝇被病毒感染以后的免疫反应
3。研究老鼠被病毒感染以后的免疫反应
4。研究HIV如何进入宿主细胞的
5。解析HIV和它受体结合在一起的complex的结构，以期寻找到小分子抑制物
6。从天然产物中大规模筛选能抑制HIV和它的受体相结合的微生物此生代谢物
7。改进微生物菌种以及发酵条件以提高次生代谢物的发酵产量
8。通过有机合成改进6中筛选到的先导化合物，提高活性降低副作用
9。将8中改进过的有机分子加上辅料制成可以给病人使用的制剂
各位说说你们心中基础和应用的界限在几和几之间？ |
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H****s
发帖数: 301 | 3 一个比较简单的法子，把这段蛋白的基因随机片段化（最好是50-100bp大小）。然后把
片段文库克隆到噬菌体展示载体（phage display vector）上去，用你的抗体来筛。把
筛到的克隆测序，除去假阳性，然后做序列比较，（一般来说）你就可以找到抗原表位
了。 |
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E*C
发帖数: 1629 | 4 是啊,噬菌体展示可能是最好的办法了.
谁能解释一下第二个问题吗 |
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z*******o
发帖数: 1794 | 5 11公现在是什么国籍？真的放弃美国国籍了？
“我常问自己缺什么？思来想去，我明白，自己缺少的是归属感、认同感，是对自己求
学时期信念的坚持，是缺少那种直接参与国家建设的成就感！”
文/《瞭望》新闻周刊记者孙英兰顾淑霞
2010年9月3日美国《科学》期刊上发表的一篇讨论中国科研基金分配体制及科研文
化问题的社论引发了国内科技界一场不小的震动，至今“余震不断”。有评论认为，这
一社论“具有里程碑意义”。《瞭望》新闻周刊记者日前专程采访了这篇社论的撰写人
之一，被誉为当今结构生物学领军人物的清华大学生命科学学院院长施一公教授。
在美国生活了18年的施一公，2008年初全职回到清华大学工作。他的归来被认为是
中国科技界吸引力增强的标志之一。2010年1月6日，《纽约时报》以《逆势而上，中国
吸引海外科学家归国》为题，以施一公等中国“海归”科学家为例，分析了中国发展科
学的努力：“施一公博士，这位在美国居住了18年的已加入美国籍的公民，宣布自己为
了追寻科学事业要返回中国。他拒绝了1000万美元资助，从普林斯顿大学辞职，回国担
任了清华大学生命科学学院院长。”
“他是我们的明星，我觉得他完全疯了... 阅读全帖 |
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t*******n
发帖数: 446 | 6 多谢回复！我的培养产物先是变得很澄清像你的第一张图，摇过夜后又长回来，像你的
第二张图。倒是没什么泡沫，闻上去像酵母，不过酵母应该不会杀细菌吧？有一次我把
同一瓶LB种子培养基扩增的菌体离心后分到两瓶M9中，结果一瓶正常，一瓶出状况。所
以我不确定是不是是培养箱的问题。我今天看了一篇文章讲可以放缓细菌生长的速度来
抑制噬菌体引起的细菌裂解，文章是建议用20度来扩增细菌，不知道有没有人这样试过
，大概从0.1括增到1.0需要多久？ |
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h******u
发帖数: 131 | 7 分子生物学技术“圣经”的作者 精选
已有 7001 次阅读 2011-6-8 07:55 |个人分类:科学|系统分类:观点评述|关键词:生物
技术 圣经 基因组 中国 美国
科学和《圣经》有着根本的冲突。
但有时，某些科学书籍很有权威、或非常流行，人们戏称为“圣经”，是引号
，不是书名号。
最近几十年，生物理论书籍中最权威的，可能是旧金山加州大学教授、美国科
学院前院长、现任《科学》杂志主编Bruce Alberts主编的《细胞的分子生物学》（
Molecular Biology of the Cell），五大洲学生用了二十多年。
2011年6月8日，也就是本周三的下午4点，应谢晓亮教授邀请来北大给学术报
告的Tom Maniatis教授，曾是我这一辈人做学生期间一本“圣经”的作者。
这本书为《Molecular Cloning》，是1980到1990年代分子生物学技术最常用
的手册，很多人靠此书入门学会克隆DNA。
Maniatis是1970年代几项主要分子克隆技术的发明者：第一个构建基因... 阅读全帖 |
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r*****t
发帖数: 4793 | 8 有可能是噬菌体感染么？怎么证明？如果是，该怎么办？ |
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s*******e
发帖数: 1010 | 9 前面挂着细菌/噬菌体启动子的DNA很好理解，但是很多时候CMV或者昆虫启动子所驱动
的DNA片段也有这个现象，我也很费解。 |
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m*********e
发帖数: 378 | 10 fresh master 也来搭车找个工作，今年夏天毕业，刚从thesis里面抽出点身来找工作，想作tech
skills大概就是这些吧，用过的模式生物主要是细胞，大小鼠，本科很intense的作过两年拟南芥。对酵母，果蝇，噬菌体也
都有了解
版上的前辈们哪里有要人呀，要是作cancer的就更好了
• Protein analysis by immunoblot, immunoprecipitation, ELISA,
antibody purification, and coomassie blue staining
• Expression of recombinant protein (or miRNA, siRNA) in
mammalian cells, bacteria, and plants
• RNA analysis by Real-time PCR and PCR array
• Plasmid construction of recombinant DNA and small RNA
R... 阅读全帖 |
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A******r
发帖数: 121 | 11 首先谢谢大家的时间。因为自己是工程专业，没有生物背景，所以特来问问诸位经验丰
富的大侠们对此的看法。
实验大致上是用喷雾剂喷出一些virus stock suspension，接着用gelatin filter收集
这些带有病毒的小颗粒，然后把gelatin filter溶解在beef extract溶液中，最后用
infectivity assay测病毒的感染性，以及用qPCR测总共病毒的量。
照理qPCR测的是病毒DNA/RNA，而在雾化和空气传播过程中病毒又会失掉一些
infectivity，所以qPCR结果应该要比infectivity assay得到的值（TCID50或PFU）要
高，但是尝试了几种动物病毒和噬菌体之后，qPCR给出的结果都要比infectivity
assay要低（有的甚至低大于一个数量级）。
qPCR的standard curve就是用已知浓度的virus stock系列稀释之后做的。考虑过
gelatin filter和beef extract对viral nucleic acid extraction的影响，也做了几
个小实验验证了一下，发现是有一些影... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 12 phage group 的
卢瑞亚-德尔布吕克实验
早就指出了 bac resistant to phage 进化是自然环境选择的随机概率 事件 而不是
适应性变异事件
不是 适应phage attack bac 者继续后代 概率大
而是randomly gained higher fittness bac 继续后代 概率大
please refer PPT file:
//www.nicholls.edu/biol-ds/biol370/Lectures/Genetic%20Variation%202.pdf
卢瑞亚-德尔布吕克实验指生物学家萨尔瓦多·卢瑞亚与马克斯·德尔布吕克在1943年
所做的一些生物学实验，这些实验证实细菌对噬菌体的抵抗能力主要来自于自然选择而
非适应性变异
paper link:
/www.genetics.org/content/136/3/1209.full.pdf
or
//en.wikipedia.org/wiki/Luria–Delbrück_experiment |
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n********y
发帖数: 187 | 13 维生素C与两步发酵法 (2009-03-07 09:28:54)转载▼
标签： 保健 饮食 维生素c 维c 古龙 中国 健康
1986年，来自媒体的一则消息引起了国内外的广泛关注：由中科院微生物所和北京制药
厂联合研究发明的用于维生素C生产的二步发酵法新技术，以550万美元的价格转让给瑞
士的罗氏公司。这一技术的出口交易额不仅创造了当年中国最大技术出口交易额的纪录
，即使到今天在中科院系统也无出其右者。
“二步发酵法”是中国第一个拥有自主知识产权的工艺技术。如今从国家正式颁布发明
的1980年算起已25年过去了，国内有关制药厂仍然都使用二步发酵法这种新工艺进行维
生素C生产，一直在创造着巨大的经济效益和社会效益。
研发历史
上世纪60年代末，北京制药厂有关技术人员向中科院微生物所求援，就维生素C在生产
过程中产生的噬菌体问题，提出希望微生物所能够帮助改革维生素C生产老工艺的迫切
要求。
传统生产维生素C的方法是1933年德国人发明的的“莱氏化学法”，它需要经过五道工
序（一步发酵、酮化、氧化、转化和精制），连续操作有困难，生产中不仅伴有大量有
毒气体和“三废”的产出，而且对生产环... 阅读全帖 |
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b***q
发帖数: 18 | 14 抗体药物项目经理
职位职责： 1、负责生物试剂市场的产品销售和市场开发，开拓、维护和发展海外
客户关系； 2、为客户提供产品、技术、咨询等服务；
3. 负责项目跟踪和技术支持。
应聘要求：
生物学专业，免疫学专业及其它相关专业硕士以上学历；
具有基因工程、 发酵工程、细胞实验、抗体制备、免疫学方面等研究实验；
熟练掌握基因工程抗体制备等实验技能，如噬菌体抗体库构建及筛选，抗体亲和力成熟
，抗体人源化等；
具备扎实的理论基础；思路清晰，有一定的开拓创新能力；能够独立设计与开展相关研
究项目；
工作认真负责，有敬业精神和团队协作精神，具有一定的抗压能力；
熟悉行业海外市场状况，有海外市场开拓或海外市场销售经验优先
英语六级水平以上，能够熟练进行英语交流和报告写作，能以英语作为工作语言与国外
客户进行无障碍交流
具备较强的客户开发能力，具有出色的谈判能力、说服力，亲和力强，善于与不同国家
与地域的客户沟通，有工作责任心和服务意识。
北京安必奇生物科技有限公司是由一批资深留学归国人员创办的生物制药服务公司。公
司依托深厚的国际资源背景、经验丰富的留美科研人员致力于生物制药服务并为客户提
供... 阅读全帖 |
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b***q
发帖数: 18 | 15 职位职责： 1、负责生物试剂市场的产品销售和市场开发，开拓、维护和发展海外
客户关系； 2、为客户提供产品、技术、咨询等服务；
3. 负责项目跟踪和技术支持。
应聘要求：
生物学专业，免疫学专业及其它相关专业硕士以上学历；
具有基因工程、 发酵工程、细胞实验、抗体制备、免疫学方面等研究实验；
熟练掌握基因工程抗体制备等实验技能，如噬菌体抗体库构建及筛选，抗体亲和力成熟
，抗体人源化等；
具备扎实的理论基础；思路清晰，有一定的开拓创新能力；能够独立设计与开展相关研
究项目；
工作认真负责，有敬业精神和团队协作精神，具有一定的抗压能力；
熟悉行业海外市场状况，有海外市场开拓或海外市场销售经验优先
英语六级水平以上，能够熟练进行英语交流和报告写作，能以英语作为工作语言与国外
客户进行无障碍交流
具备较强的客户开发能力，具有出色的谈判能力、说服力，亲和力强，善于与不同国家
与地域的客户沟通，有工作责任心和服务意识。
北京安必奇生物科技有限公司是由一批资深留学归国人员创办的生物制药服务公司。公
司依托深厚的国际资源背景、经验丰富的留美科研人员致力于生物制药服务并为客户提
供项目解决方案。公司... 阅读全帖 |
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A******r
发帖数: 121 | 16 感谢各位大侠的时间。
小弟生物外行，读文献的时候看见前人总结说病毒灭活原因要么是病毒的RNA/DNA受损
，要么是病毒外壳上的蛋白质受损，要么两者兼有。
为了解释病毒灭活的机理，小弟尝试过从样本和培养好的virus stock中分别提取RNA（
病毒是MS2噬菌体），然后做gel electrophoresis，希望virus stock给出清晰的一条
band，而病毒样本可以给出数条尺寸较小的band，以此来证明RNA受损断裂是灭活机理
。Virus stock倒是给出一条band，但是样本中病毒浓度太低，所以看不见任何条带。
所以想问问各位大侠在这种情况下有什么其他方法能够帮助阐明病毒灭活的机理？
再次感谢诸位的时间。 |
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b********e
发帖数: 50 | 18 是噬菌体库，还是把人所有抗体基因cDNA做成库？ |
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b******k
发帖数: 2321 | 19 Francis Crick花了几年弄出了DNA双螺旋？之前他是干啥的？这算不算抢了Pauling的
饭碗？
Seymour Benzer花了几年弄出了r4 rII gene structure？之前他是干啥的？是不是抢
了Max Delbruck和phage club的饭碗？他又怎么突然从噬菌体遗传学跑去做behavior了
？是不是抢了Jerry Hirsh的饭碗？
Anjana Rao是怎么突然弄出了tet1的？之前他是做啥的？这算不算抢了epigenetics无
数人的饭碗？ |
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w***a
发帖数: 4361 | 20 噬菌体就不算病毒了？
CMV来自herpesviruses，这个病毒只能感染真核细胞。 |
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z********4
发帖数: 701 | 21 体内结果怎样？体外能抑菌的蛋白质很多，甚至硫酸氢氧化钠都能杀菌，关键是能否在
体内专一的起效。在体外用不如用噬菌体，还能自我繁殖，FDA批准过在食物上使用 |
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x********e
发帖数: 35261 | 22 1.碱基配对：DNA中(A+T):(C+G)永远是1：1
2.噬菌体碱基同位素标记 |
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f**u
发帖数: 346 | 23 我个人觉得这个说的还真不对。
1953年的时候什么是遗传物质应该还是有争论的，有蛋白派跟核酸派。由于遗传物质必
须要能被精确复制，这个结构出来以后，提示了一个很简单的复制机理（那篇文章里提
到了），所以应该对于核酸派战胜蛋白派有很大的作用。在DNA结构之前，其实就有肺
炎链球菌转化试验很清楚的从功能上证明了DNA是遗传物质，但是大家还是觉得DNA化学
成分太简单，不可能是遗传物质。那个噬菌体同位素实验我记得应该是在DNA结构出来
之后。其实从实验角度来说，这个实验比细菌转化试验要脏不少，但有了DNA结构以后
，大家就都认了。
从这个角度，DNA结构是结构里的另类。现在大部分都是某个东西已经被证明很重要了
，再去解结构，把某些其他手段搞不定的机理搞一搞。DNA属于结构出来的时候这东西
有什么重要作用大家还有争论，结构出来以后争论就基本平了的。
DNA结构要说揭示了什么机理，那就一个，就是解释了查伽夫定律。但是这个东西如果
离开了DNA是遗传物质，其实就没什么意义了。所以DNA结构的意义我觉得还是在确立
DNA是遗传物质上。生物最重要的还是功能，是机理。关于DNA的很多功能实验是以后别
人... 阅读全帖 |
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x********e
发帖数: 35261 | 24 你能就着一个个实验结果下结论么？DNA双螺旋的确是分子生物学的基石。不过就一个
双螺旋能回答“遗传信息如何传递下去”这么深奥的问题？
确定核酸而非蛋白是遗传载体的实验是在双螺旋发现之前做的。发现双螺旋结构以后也
是研究DNA转录翻译密码子的人揭示的四碱基如何记载复杂的遗传信息。至于传递，那
是搞噬菌体同位素标记才知道的半保留复制。其他更细的我都不说了。
解一个遗传信息载体的结构就可以把其他人前后几百年苦心研究的credit都偷走了？ |
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H****s
发帖数: 301 | 25 这个问题不是太好回答。
（1）。你这个基因是不是膜蛋白？如果全长蛋白和truncated isoform都是膜蛋白的话
，你的选择是做cDNA免疫大鼠或者是小鼠，然后用细胞表面表达全长蛋白和truncated
isoform的细胞来做筛选。这个过程大概需要3-6个月，看做事的人的效率和运气。
（2）。如果不是膜蛋白，并且你可以表达和纯化这两个蛋白。你的选择有以下两种：
第一种：用truncated isoform免疫大鼠或者是小鼠，然后通过杂交瘤的方法来筛选符
合你要求的抗体。这个抗体很可能识别由于truncation所造成的构象变化。这个过程大
概也需要6个月，看做事的人的效率和运气。
第二种：如果你有资源和人脉，可以使用体外抗体展示的技术（比如，噬菌体展示或者
是酵母展示）。这个应该比较简单一些。这个过程大概需要3个月，看做事的人的效率。
如果你实验室不缺钱的话，就找两个做抗体的CRO，在谈条件的时候说好，拿不到你需
要的抗体不付钱就行了（这招有点损，版上开公司的同学可能会不高兴）。如果我是你
，我会选择这个。因为你可以花时间去做真正的科学研究，而不是把你的时间都浪费在
创造实验条... 阅读全帖 |
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J****T
发帖数: 20 | 26 重要的实验交给其他lab或者公司做，然后再自己lab慢慢想办法 |
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e********r
发帖数: 147 | 27 呵呵，这个恐怕有问题，都是日常表达蛋白的实验，全交给公司，人民币的不够用啊:) |
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J****T
发帖数: 20 | 29 重要的实验交给其他lab或者公司做，然后再自己lab慢慢想办法 |
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e********r
发帖数: 147 | 30 呵呵，这个恐怕有问题，都是日常表达蛋白的实验，全交给公司，人民币的不够用啊:) |
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b*****x
发帖数: 17 | 32 1%SDS擦洗所有工作台，洗所有非一次性的容器。 bleach什么的对phage不管用。 |
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b******y
发帖数: 627 | 33 When we had similar problem 10+ years ago, we determined that the phage is
t1 using pcr. We knew from literature that t1 phage gets into cells via tona
, a copper or ion transporter, or something alike. There are tona knockout
strain commercially availabe bl21de3 and dh5alpha, which are called
something like bl21de3 T1r and dh5alpha T1r. T1r means T1 phage resistant.
That really solved the problem once and for all.
Good luck! |
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c******d
发帖数: 564 | 35 先不说怎样分离确定有效成分的技术问题，这个虽然有困难，但是只要确定效果好副作
用小，抽丝剥茧总能确定成分。
从哪里找？我觉得可以从细菌真菌里找。 比如大肠杆菌对噬菌体，这两伙道高一尺魔
高一丈的共同进化了这末久，估计能找到的攻击点防御点都试过了。又没有免疫系统帮
忙，可能会有化合物抑制病毒。 |
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f***e
发帖数: 332 | 36 http://www.jianshu.com/p/baa30697fc6a
什么是2015年最受科学界关注的新技术？
图片来自：nature.com
导语：
每年的岁末年初，《自然》杂志旗下子刊《自然·方法》（Nature Methods）都会盘点
当年的年度科学技术。2015年最受关注的技术为冷冻电镜技术（cryo-EM），此前呼声
很高的CRISPR/Cas9基因编辑技术未能折桂。
在冷冻电镜的这场技术革命中，华人科学家功不可没，在某些方面甚至独领风骚，做出
了诸多重大成果。
文 |张凯（剑桥大学MRC分子生物学实验室博士）
●●●
细胞里面的生命活动井然有序，每一个部分都有其特定的结构，承担不同的功能。生物
大分子则是一切生命活动的最终执行者，它们主要是核酸和蛋白。核酸携带了生命体的
遗传信息，而蛋白是生命活动的主要执行者。自现代分子生物学诞生以来的半个世纪里
，解析和分析生物大分子的结构、进而阐释其功能机制一直都是现代生命科学的核心问
题之一。
事实上，一切自然科学都涉及物质结构及结构间的相互作用为核心的研究方向，天文学
研究宇宙、星体等的结构及其相互作用，粒子物理研究物质世界... 阅读全帖 |
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t*****a
发帖数: 308 | 37 M13 is more commonly used for displaying proteins, scFv. |
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m*s
发帖数: 6855 | 38 M13噬菌粒 很少有靠谱的公司卖嘛，有什么推荐的? |
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l*****D
发帖数: 41 | 42 导师简介：
蒋先兴(Xianxing Jiang)，男，博士，教授，博士生导师。中组部第十一批“千人计划
”青年人才入选者，中山大学“百人计划二期”杰出青年引进人才。迄今为止，在SCI
刊物上已发表论文40余篇，其中作为第一作者及通信作者在Chem. Rev.，J. Am. Chem.
Soc.，Angew. Chem. Int. Ed.等国际知名刊物上发表论文24篇，到目前被SCI 引用
1200余次，最高单篇被引用162次。已申请国家发明专利5项，美国专利1项，已授权2项
。曾施维雅青年药物化学奖（2012 CPA-Servier Young Investigator Awards in
Medicinal Chemistry）；2014年获教育部自然科学一等奖（排名第二）；中科院奖学
金等。
科研方向：
1. 多肽及抗体药物化学生物学研究；
2. 抗体药物偶联体和生物大分子药物的化学修饰和活性研究
3. 蛋白质的特异性修饰和荧光标记及其在细胞显影中的应用
招聘内容: 常年欢迎有下列专业方向或研究背景的博士后，特聘正、副研究员和助理研
究员: 分子生物学，细胞生物学，生物化学，免疫... 阅读全帖 |
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R*******o
发帖数: 19 | 44 国内生物科技公司
猎头岗位：
一、senior scientist A
关键点：
1、噬菌体展示技术
2、文库构建
3、抗体人源化
二、senior scientist B
关键点：
1、单抗、多抗设计制备
2、杂交瘤细胞融合筛选
3、免疫动物模型构建
如果您有意向回国发展，如果您是博士学历，欢迎联系咨询。
咨询邮箱：r********[email protected] |
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l*******r
发帖数: 39279 | 45 这不是科幻小说
这顶多是个观点
一个现象你可以这么解释，也可以那样解释
细菌会被噬菌体消灭，万事万物相生相克啦
况且威胁人类的不光有细菌，还有病毒，病毒也可以和人类共生的。 |
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R*******e
发帖数: 25533 | 46
我突然意识到这可能很合鹿鹿你的口味，至少歌词。。。
夏宇愈混 刺青
http://www.xiami.com/song/192268
10. 刺青
曲、演唱：Rj、噬菌体、Faye 词：夏宇
他的身体 拥有复杂的回忆
每个回忆 都化做一个刺青
每个图案 都无与伦比
每个名字 都无可代替
你不曾见过 这样的一个肉体
有这么多 爱与不爱的证据
新的符号 刚被刺上去
他的心 又有了新的主意
爱的时候深深刺进去 不爱时候又磨平洗乾净
愈重要的爱位置愈隐密 也不是後悔只是真的无所谓
爱的时候深深刺进去 不爱时候要彻底磨乾净
爱的时候长一层新皮 皮愈来愈厚爱人也愈来愈多
从此以後 金刚不坏
从此以後 你才是真爱
从此以後 金刚不坏
从此以後 你才是真爱 |
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