S**********l
发帖数: 3835 | 1 某collaborator,
gene A表达涨了两倍，
gene B表达涨了三倍，假如geneA和B开始一样多。。。
跟俺说如果其中1个基因上调了3倍， 还有另外一个基因也上调的情况下，加起来应该
上调了不止三倍。
跟他说了半个小时都说不清。后来俺说，
你有一个球，明天涨了三倍，你有三个球
我有一个球，明天涨了两倍，我有两个球。
那明天我们俩加起来是今天的几倍？
他老人家说，你的例子是有2个单独的球。而我的例子是两个gene可能控制同一个反应
。所以两个gene加起来表达应该是上升了5倍。最后老人家说"你的例子的已经被我找到
错啦,看看你怎么找到我的说法的错".
俺只好说，生物真是害死人啊。。。
咋办？他老人家一定要用5倍做图。。。 |
F*****s
发帖数: 844 | 2 前几天看你帮学生debug,今天和collaborator讨论生物。。
呵呵呵，你做bioinformatics的，是吧？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 某collaborator,
: gene A表达涨了两倍，
: gene B表达涨了三倍，假如geneA和B开始一样多。。。
: 跟俺说如果其中1个基因上调了3倍， 还有另外一个基因也上调的情况下，加起来应该
: 上调了不止三倍。
: 跟他说了半个小时都说不清。后来俺说，
: 你有一个球，明天涨了三倍，你有三个球
: 我有一个球，明天涨了两倍，我有两个球。
: 那明天我们俩加起来是今天的几倍？
: 他老人家说，你的例子是有2个单独的球。而我的例子是两个gene可能控制同一个反应
|
F*****s
发帖数: 844 | 3 你俩说的都没错啊，只是假设的前提不一样。
【在 S**********l 的大作中提到】
: 某collaborator,
: gene A表达涨了两倍，
: gene B表达涨了三倍，假如geneA和B开始一样多。。。
: 跟俺说如果其中1个基因上调了3倍， 还有另外一个基因也上调的情况下，加起来应该
: 上调了不止三倍。
: 跟他说了半个小时都说不清。后来俺说，
: 你有一个球，明天涨了三倍，你有三个球
: 我有一个球，明天涨了两倍，我有两个球。
: 那明天我们俩加起来是今天的几倍？
: 他老人家说，你的例子是有2个单独的球。而我的例子是两个gene可能控制同一个反应
|
G***y
发帖数: 1082 | 4 He could be right if there is an additive effect and two genes are working
in the same pathway.
【在 S**********l 的大作中提到】
: 某collaborator,
: gene A表达涨了两倍，
: gene B表达涨了三倍，假如geneA和B开始一样多。。。
: 跟俺说如果其中1个基因上调了3倍， 还有另外一个基因也上调的情况下，加起来应该
: 上调了不止三倍。
: 跟他说了半个小时都说不清。后来俺说，
: 你有一个球，明天涨了三倍，你有三个球
: 我有一个球，明天涨了两倍，我有两个球。
: 那明天我们俩加起来是今天的几倍？
: 他老人家说，你的例子是有2个单独的球。而我的例子是两个gene可能控制同一个反应
|
w******n
发帖数: 352 | |
d***a
发帖数: 13752 | 6 你们俩都有可能对，可能是(2+3)/2=2.5，也可能是2×3=6，当然也有别的可能。 |
C********5
发帖数: 194 | |
p**m
发帖数: 11571 | 8 看不懂
【在 S**********l 的大作中提到】
: 某collaborator,
: gene A表达涨了两倍，
: gene B表达涨了三倍，假如geneA和B开始一样多。。。
: 跟俺说如果其中1个基因上调了3倍， 还有另外一个基因也上调的情况下，加起来应该
: 上调了不止三倍。
: 跟他说了半个小时都说不清。后来俺说，
: 你有一个球，明天涨了三倍，你有三个球
: 我有一个球，明天涨了两倍，我有两个球。
: 那明天我们俩加起来是今天的几倍？
: 他老人家说，你的例子是有2个单独的球。而我的例子是两个gene可能控制同一个反应
|
S**********l
发帖数: 3835 | 9 为啥啊。要是additive，不是开始也是additive么？
而且画的是expression level...
【在 G***y 的大作中提到】
: He could be right if there is an additive effect and two genes are working
: in the same pathway.
|
G***y
发帖数: 1082 | 10 Are you guys talking about the transcription level increase of Gene B or something downstream? My feeling your collaborator is talking about genes downstream of Gene B or the overall pathway instead of Gene B alone.
【在 S**********l 的大作中提到】
: 为啥啊。要是additive，不是开始也是additive么？
: 而且画的是expression level...
|
S**********l
发帖数: 3835 | 11 显然不是。我们要plot expression level的变化。两个isoenzyme。看来我兄弟是要坚
持画5倍了。。。
something downstream? My feeling your collaborator is talking about genes
downstream of Gene B or the overall pathway instead of Gene B alone.
【在 G***y 的大作中提到】
: Are you guys talking about the transcription level increase of Gene B or something downstream? My feeling your collaborator is talking about genes downstream of Gene B or the overall pathway instead of Gene B alone.
|
s****p
发帖数: 1087 | 12 It totally depends on how gene A and gene B regulate the reaction.
There are more than 2 answers (both yours and your collaborator's could be
correct, if you do not specify how the genes regulate the reaction.
【在 S**********l 的大作中提到】
: 显然不是。我们要plot expression level的变化。两个isoenzyme。看来我兄弟是要坚
: 持画5倍了。。。
:
: something downstream? My feeling your collaborator is talking about genes
: downstream of Gene B or the overall pathway instead of Gene B alone.
|
