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Chemistry版 - 问个晶体结构的问题
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K********e
发帖数: 336
1
做了x-ray scattering之后 得道的FW没有显示H 是不是X-ray不能detect 到氢?这个H
需要自己
加上去
用了mercury 画了结构图后发现 应该带的是一分子水 但是一种一个氢和氧不成键
不是搞这个的 没玩过x-ray 有人能解答一下吗?
t**t
发帖数: 27760
2
一般的X-ray,H是解不出来的。
水分子的氢可以手动加。

个H

【在 K********e 的大作中提到】
: 做了x-ray scattering之后 得道的FW没有显示H 是不是X-ray不能detect 到氢?这个H
: 需要自己
: 加上去
: 用了mercury 画了结构图后发现 应该带的是一分子水 但是一种一个氢和氧不成键
: 不是搞这个的 没玩过x-ray 有人能解答一下吗?

K********e
发帖数: 336
3

这样的话 H的具体位置不就解不出来了吗? 这样判断氢键信息不久不可靠了吗?

【在 t**t 的大作中提到】
: 一般的X-ray,H是解不出来的。
: 水分子的氢可以手动加。
:
: 个H

t**t
发帖数: 27760
4
氢键信息不能说不可靠,因为手动加氢,也是有理论根据的,不是随便加。
现在已经有技术解决氢的绝对位置了。

【在 K********e 的大作中提到】
:
: 这样的话 H的具体位置不就解不出来了吗? 这样判断氢键信息不久不可靠了吗?

s*******2
发帖数: 47
5
氢键的长度是测量两个杂原子之间的距离,氢在中间。如果真需要,可以去做中子衍射
,氢的绝对位置就定了。
m***c
发帖数: 1403
6
lol. H is a disaster for neutron diffraction.

【在 s*******2 的大作中提到】
: 氢键的长度是测量两个杂原子之间的距离,氢在中间。如果真需要,可以去做中子衍射
: ,氢的绝对位置就定了。

t**t
发帖数: 27760
7
H原子的绝对位置可以通过同步辐射XRD来解。

【在 m***c 的大作中提到】
: lol. H is a disaster for neutron diffraction.
m***c
发帖数: 1403
8
not posible. X_ray is X_ray.

【在 t**t 的大作中提到】
: H原子的绝对位置可以通过同步辐射XRD来解。
l**j
发帖数: 651
9
deuterated...

【在 m***c 的大作中提到】
: not posible. X_ray is X_ray.
m***c
发帖数: 1403
10
very hard. requires high purity

【在 l**j 的大作中提到】
: deuterated...
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t**t
发帖数: 27760
11
一般的X-ray,因为强度不够,不能得到hkl大于10的衍射点,但用短波长的同步辐射,
由于强度高(一般Mo靶的1百万倍),可以得到hkl大于50的衍射点。这样可以得到的独立
衍射点数据是一般X-ray的100倍的数据量。这样解结构的时候,独立变量就可以再增加
100倍。
一般的x-ray解的是原子。而同步辐射xray的数据能解出电子密度分布来,通过电子密度
分布,就能定出H原子的绝对位置。

【在 m***c 的大作中提到】
: very hard. requires high purity
t**t
发帖数: 27760
12
氘原子,在X-ray数据好的情况,一般CCD-X-Ray就能解。

【在 l**j 的大作中提到】
: deuterated...
m***c
发帖数: 1403
13
all the X-ray gives only lattice of electron, photon-nuclei interaction is
negligible,while neutron diffraction gives the lattice of nuclei.
high hkl (high Q) only means smaller d-spacings from the heavy elements can
be detected.

密度

【在 t**t 的大作中提到】
: 一般的X-ray,因为强度不够,不能得到hkl大于10的衍射点,但用短波长的同步辐射,
: 由于强度高(一般Mo靶的1百万倍),可以得到hkl大于50的衍射点。这样可以得到的独立
: 衍射点数据是一般X-ray的100倍的数据量。这样解结构的时候,独立变量就可以再增加
: 100倍。
: 一般的x-ray解的是原子。而同步辐射xray的数据能解出电子密度分布来,通过电子密度
: 分布,就能定出H原子的绝对位置。

S*****n
发帖数: 6055
14
我见到过有人用EXAFS找氢键,但是我觉得不太靠谱。。。

is
can

【在 m***c 的大作中提到】
: all the X-ray gives only lattice of electron, photon-nuclei interaction is
: negligible,while neutron diffraction gives the lattice of nuclei.
: high hkl (high Q) only means smaller d-spacings from the heavy elements can
: be detected.
:
: 密度

m***c
发帖数: 1403
15
I do not know much about EXAFS, but still it is X-ray-electron cloud
interaction, it does not sound making sense for direct detection of H atom.
but it may be possible to detect some subtle difference on O atom.

【在 S*****n 的大作中提到】
: 我见到过有人用EXAFS找氢键,但是我觉得不太靠谱。。。
:
: is
: can

f****t
发帖数: 313
16
氢的位置不都是有个什么百分之多少的可能性么?
l**j
发帖数: 651
17
数据到手了 不都想咋解释咋解释 只要能把别人忽悠晕菜就中

【在 S*****n 的大作中提到】
: 我见到过有人用EXAFS找氢键,但是我觉得不太靠谱。。。
:
: is
: can

c****o
发帖数: 1280
18
水上的H可以不标,但是分子式要保证是对的,一般来说包含水的氢键数据不是非常可
靠,只有原子之间的距离是可靠的,键角是不太可靠。
t**t
发帖数: 27760
19
呵呵
我就干这个的,你要说我干的这个是假的,我也没办法。
文章照发就行。

is
can

【在 m***c 的大作中提到】
: I do not know much about EXAFS, but still it is X-ray-electron cloud
: interaction, it does not sound making sense for direct detection of H atom.
: but it may be possible to detect some subtle difference on O atom.

m***c
发帖数: 1403
20
有没有经典文献介绍一篇?

【在 t**t 的大作中提到】
: 呵呵
: 我就干这个的,你要说我干的这个是假的,我也没办法。
: 文章照发就行。
:
: is
: can

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