G**i
发帖数: 1 | 1 去年的时候，我一个在芝加哥比我小几级的南京大学校友去世了。乳腺癌，发现得晚了
，才34岁，留下了一个4岁的孩子。非常可惜。想想能不能做点什么事情可以帮助大众
来提高乳腺癌的早期检测成功率。因为如果在 stage 1 发现乳腺癌的话，5年存活率是
99%。
想想能否写一个完全免费的网站和 ios app 来让用户可以迅速得到 X-ray Mammogram
的诊断结果。至少可以是 2nd Opinion. 因为用户做完 Mammography 之后有的时候需
要等好几周才能有 Radiologist 来读片子。而且现在 Radiologist 有20% 的概率会漏
掉早期的肿瘤。我决定用 Deep Learning (深度学习) 来做这件事情。
对于一个足够好的 Deep Learning Model, 一是要有足够多的数据 (即使是做
Transfer Learning 的情况下), 二是要有足够强大的计算力。为了做成这件事情，我
在本地搭建了一个 50 个 Nvidia Geforce GTX 1080 Ti 的 GPU cluster, 这是搭成之
后的硬件:
有了硬件之后就是设计 Model
最终的结果我在欧洲的 InBreast 数据上做了测试，达到了 90% 的准确度 (AUC).
我觉得这个 Model 已经可以给大众实用了，在这里公开出来:
http://neuralrad.com:5000/upload
你可以直接上传 .jpg 形式的 Mammo 图片，这个 AI 会给出判断结果. 这是
Screenshot:
这个网站是完全免费使用的。我现在还在继续更新和改进 Model, 也在联系国内的几家
医院来合作来获取更多的数据来 Training.
你如果在医院做过 Breast Mammography, 可以直接从医生那里获取你的 mammogram 来
使用这个网站。 |
D****g
发帖数: 275 | |
h*****x
发帖数: 147 | |
f*****n
发帖数: 499 | 4 膜拜一下
Mammogram
【在 G**i 的大作中提到】
: 去年的时候，我一个在芝加哥比我小几级的南京大学校友去世了。乳腺癌，发现得晚了
: ，才34岁，留下了一个4岁的孩子。非常可惜。想想能不能做点什么事情可以帮助大众
: 来提高乳腺癌的早期检测成功率。因为如果在 stage 1 发现乳腺癌的话，5年存活率是
: 99%。
: 想想能否写一个完全免费的网站和 ios app 来让用户可以迅速得到 X-ray Mammogram
: 的诊断结果。至少可以是 2nd Opinion. 因为用户做完 Mammography 之后有的时候需
: 要等好几周才能有 Radiologist 来读片子。而且现在 Radiologist 有20% 的概率会漏
: 掉早期的肿瘤。我决定用 Deep Learning (深度学习) 来做这件事情。
: 对于一个足够好的 Deep Learning Model, 一是要有足够多的数据 (即使是做
: Transfer Learning 的情况下), 二是要有足够强大的计算力。为了做成这件事情，我
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g*********5
发帖数: 2533 | |
D***s
发帖数: 5613 | 6 搞好免责声明，说不会收集用户上传数据。否则会有大麻烦。
Mammogram
【在 G**i 的大作中提到】
: 去年的时候，我一个在芝加哥比我小几级的南京大学校友去世了。乳腺癌，发现得晚了
: ，才34岁，留下了一个4岁的孩子。非常可惜。想想能不能做点什么事情可以帮助大众
: 来提高乳腺癌的早期检测成功率。因为如果在 stage 1 发现乳腺癌的话，5年存活率是
: 99%。
: 想想能否写一个完全免费的网站和 ios app 来让用户可以迅速得到 X-ray Mammogram
: 的诊断结果。至少可以是 2nd Opinion. 因为用户做完 Mammography 之后有的时候需
: 要等好几周才能有 Radiologist 来读片子。而且现在 Radiologist 有20% 的概率会漏
: 掉早期的肿瘤。我决定用 Deep Learning (深度学习) 来做这件事情。
: 对于一个足够好的 Deep Learning Model, 一是要有足够多的数据 (即使是做
: Transfer Learning 的情况下), 二是要有足够强大的计算力。为了做成这件事情，我
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s*********r
发帖数: 84 | |
d********m
发帖数: 3662 | |
l*h
发帖数: 4124 | 9 "需要等好几周才能有 Radiologist 来读片子" ---- 这是真的？
Mammogram
【在 G**i 的大作中提到】
: 去年的时候，我一个在芝加哥比我小几级的南京大学校友去世了。乳腺癌，发现得晚了
: ，才34岁，留下了一个4岁的孩子。非常可惜。想想能不能做点什么事情可以帮助大众
: 来提高乳腺癌的早期检测成功率。因为如果在 stage 1 发现乳腺癌的话，5年存活率是
: 99%。
: 想想能否写一个完全免费的网站和 ios app 来让用户可以迅速得到 X-ray Mammogram
: 的诊断结果。至少可以是 2nd Opinion. 因为用户做完 Mammography 之后有的时候需
: 要等好几周才能有 Radiologist 来读片子。而且现在 Radiologist 有20% 的概率会漏
: 掉早期的肿瘤。我决定用 Deep Learning (深度学习) 来做这件事情。
: 对于一个足够好的 Deep Learning Model, 一是要有足够多的数据 (即使是做
: Transfer Learning 的情况下), 二是要有足够强大的计算力。为了做成这件事情，我
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m*****a
发帖数: 2160 | 10 首先非常敬佩楼主的开创和科研精神
不同地方做的检查等待时间估计会不一样，但是从乳腺癌筛查的角度，考虑到乳腺癌本
来也就是1-2年查一次，几周的延误对最终的治疗结果不太可能会有实质影响。
另一方面，“影像科医生会漏掉20%的乳腺癌”不知道楼主数据来源是哪里，以及你的
训练数据集的标准是什么。因为一般只有影像科医生通过钼靶检查看出问题了才会有进
一步的检查从而判断似乎否是癌症，如果影像科医生一开始就漏掉了，这张片子是否会
被直接定性为阴性?由这样一个数据集训练出来的AI，出现不明显表现的时候且不是一
样会漏诊?
最后，如果患者依据楼主的软件出现假阳性或假阴性结果并因此做出最终导致严重不良
后果的决策，从法律角度楼主是否liable，还是建议好好咨询律师。
【在 l*h 的大作中提到】
: "需要等好几周才能有 Radiologist 来读片子" ---- 这是真的？
:
: Mammogram
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P****R
发帖数: 22479 | 11 楼主的工作可以作为第二种咨询吧？
【在 m*****a 的大作中提到】
: 首先非常敬佩楼主的开创和科研精神
: 不同地方做的检查等待时间估计会不一样，但是从乳腺癌筛查的角度，考虑到乳腺癌本
: 来也就是1-2年查一次，几周的延误对最终的治疗结果不太可能会有实质影响。
: 另一方面，“影像科医生会漏掉20%的乳腺癌”不知道楼主数据来源是哪里，以及你的
: 训练数据集的标准是什么。因为一般只有影像科医生通过钼靶检查看出问题了才会有进
: 一步的检查从而判断似乎否是癌症，如果影像科医生一开始就漏掉了，这张片子是否会
: 被直接定性为阴性?由这样一个数据集训练出来的AI，出现不明显表现的时候且不是一
: 样会漏诊?
: 最后，如果患者依据楼主的软件出现假阳性或假阴性结果并因此做出最终导致严重不良
: 后果的决策，从法律角度楼主是否liable，还是建议好好咨询律师。
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z*******x
发帖数: 103 | 12 虽然楼主的出发点是为人民服务，提供这种服务，是不是有点像无许可算命？
也同意这个意见。
发信人: mszzeta (星尘的残光), 信区: Biology
标 题: Re: 关于乳腺癌，说说我最近自己做的这个 Project 吧
发信站: BBS 未名空间站 (Fri May 18 22:58:58 2018, 美东)
首先非常敬佩楼主的开创和科研精神
不同地方做的检查等待时间估计会不一样，但是从乳腺癌筛查的角度，考虑到乳腺癌本
来也就是1-2年查一次，几周的延误对最终的治疗结果不太可能会有实质影响。
另一方面，“影像科医生会漏掉20%的乳腺癌”不知道楼主数据来源是哪里，以及你的
训练数据集的标准是什么。因为一般只有影像科医生通过钼靶检查看出问题了才会有进
一步的检查从而判断似乎否是癌症，如果影像科医生一开始就漏掉了，这张片子是否会
被直接定性为阴性?由这样一个数据集训练出来的AI，出现不明显表现的时候且不是一
样会漏诊? |
l******n
发帖数: 9344 | 13 AUC在imbalanced dataset不是好的accuracy measurement,所以你的结果很难说是好还
是不好
这是我做的一个解释的例子，你可以看看
https://myoptions.shinyapps.io/ShinyApps/
你这种做法可以作为辅助诊断，但是不能替代radiologist
建议你看看kaggle data science bowl 2017
Mammogram
【在 G**i 的大作中提到】
: 去年的时候，我一个在芝加哥比我小几级的南京大学校友去世了。乳腺癌，发现得晚了
: ，才34岁，留下了一个4岁的孩子。非常可惜。想想能不能做点什么事情可以帮助大众
: 来提高乳腺癌的早期检测成功率。因为如果在 stage 1 发现乳腺癌的话，5年存活率是
: 99%。
: 想想能否写一个完全免费的网站和 ios app 来让用户可以迅速得到 X-ray Mammogram
: 的诊断结果。至少可以是 2nd Opinion. 因为用户做完 Mammography 之后有的时候需
: 要等好几周才能有 Radiologist 来读片子。而且现在 Radiologist 有20% 的概率会漏
: 掉早期的肿瘤。我决定用 Deep Learning (深度学习) 来做这件事情。
: 对于一个足够好的 Deep Learning Model, 一是要有足够多的数据 (即使是做
: Transfer Learning 的情况下), 二是要有足够强大的计算力。为了做成这件事情，我
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f*******h
发帖数: 1269 | 14 病人上传的数据你是否保存？
如果保存，是不是follow HIPAA rules? 这个得千万小心了。
Mammogram
【在 G**i 的大作中提到】
: 去年的时候，我一个在芝加哥比我小几级的南京大学校友去世了。乳腺癌，发现得晚了
: ，才34岁，留下了一个4岁的孩子。非常可惜。想想能不能做点什么事情可以帮助大众
: 来提高乳腺癌的早期检测成功率。因为如果在 stage 1 发现乳腺癌的话，5年存活率是
: 99%。
: 想想能否写一个完全免费的网站和 ios app 来让用户可以迅速得到 X-ray Mammogram
: 的诊断结果。至少可以是 2nd Opinion. 因为用户做完 Mammography 之后有的时候需
: 要等好几周才能有 Radiologist 来读片子。而且现在 Radiologist 有20% 的概率会漏
: 掉早期的肿瘤。我决定用 Deep Learning (深度学习) 来做这件事情。
: 对于一个足够好的 Deep Learning Model, 一是要有足够多的数据 (即使是做
: Transfer Learning 的情况下), 二是要有足够强大的计算力。为了做成这件事情，我
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c******s
发帖数: 1 | |
P****R
发帖数: 22479 | 16 做这种东西的朋友太多了。
但是都不在节奏上。
癌症的机制没有搞清楚前，所有的努力都是无用功。
【在 c******s 的大作中提到】
: 这种愿意做敢做的精神很不错。
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e*********6
发帖数: 3453 | 17 有了数据就能得到好结果，人人都知道。谁有数据谁是老大，算法不值钱。 |
