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Biology版 - CAGE技术
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相关话题的讨论汇总
话题: cage话题: 技术话题: rna话题: expression话题: gene
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1 (共1页)
a**********3
发帖数: 86
1
如题,有知道这个技术的吗,cap analysis of gene expression.
j***z
发帖数: 105
2
同问,最近想做,发现只有一家日本的公司有这个kit。
求大牛介绍下经验。

【在 a**********3 的大作中提到】
: 如题,有知道这个技术的吗,cap analysis of gene expression.
Z******5
发帖数: 435
3
不知道这个技术相对于RNA-seq有啥优势。 现在测序一个G才60块钱所有。理论上把转
录本都测了,能得到的信息比CAGE要多得多。
a**********3
发帖数: 86
4

坐标日本。我完全不懂这个技术。最近科室的教授提起来,说这个技术是日本的理研开
发的,
日本的公司每天平均只收到两个分析需求,好像很新的样子。

【在 Z******5 的大作中提到】
: 不知道这个技术相对于RNA-seq有啥优势。 现在测序一个G才60块钱所有。理论上把转
: 录本都测了,能得到的信息比CAGE要多得多。

b******9
发帖数: 102
5
其实方法都差不多,没有一种是最完美的,都有优缺点。大概可以分为线性扩增(T7转
录),指数扩增(PCR)和RCA三大类,具体的可以参考这篇NAR:
SURVEY AND SUMMARY
Single-cell RNA-seq: advances and future challenges
具体到你提到的CAGE,可以去看看Illumina收集的方法:在第40页
https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/
research_reviews/rna-sequencing-methods-review-web.pdf
j***z
发帖数: 105
6
我的理解是Cage的优势在于map new unannotated TSS
比如这篇nature genetics文章:
https://www.nature.com/articles/ng.3889?WT.feed_name=subjects_genetics

【在 b******9 的大作中提到】
: 其实方法都差不多,没有一种是最完美的,都有优缺点。大概可以分为线性扩增(T7转
: 录),指数扩增(PCR)和RCA三大类,具体的可以参考这篇NAR:
: SURVEY AND SUMMARY
: Single-cell RNA-seq: advances and future challenges
: 具体到你提到的CAGE,可以去看看Illumina收集的方法:在第40页
: https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/
: research_reviews/rna-sequencing-methods-review-web.pdf

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