a**********3 发帖数: 86 | 1 如题,有知道这个技术的吗,cap analysis of gene expression. |
j***z 发帖数: 105 | 2 同问,最近想做,发现只有一家日本的公司有这个kit。
求大牛介绍下经验。
【在 a**********3 的大作中提到】 : 如题,有知道这个技术的吗,cap analysis of gene expression.
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Z******5 发帖数: 435 | 3 不知道这个技术相对于RNA-seq有啥优势。 现在测序一个G才60块钱所有。理论上把转
录本都测了,能得到的信息比CAGE要多得多。 |
a**********3 发帖数: 86 | 4
坐标日本。我完全不懂这个技术。最近科室的教授提起来,说这个技术是日本的理研开
发的,
日本的公司每天平均只收到两个分析需求,好像很新的样子。
【在 Z******5 的大作中提到】 : 不知道这个技术相对于RNA-seq有啥优势。 现在测序一个G才60块钱所有。理论上把转 : 录本都测了,能得到的信息比CAGE要多得多。
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b******9 发帖数: 102 | 5 其实方法都差不多,没有一种是最完美的,都有优缺点。大概可以分为线性扩增(T7转
录),指数扩增(PCR)和RCA三大类,具体的可以参考这篇NAR:
SURVEY AND SUMMARY
Single-cell RNA-seq: advances and future challenges
具体到你提到的CAGE,可以去看看Illumina收集的方法:在第40页
https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/
research_reviews/rna-sequencing-methods-review-web.pdf |
j***z 发帖数: 105 | 6 我的理解是Cage的优势在于map new unannotated TSS
比如这篇nature genetics文章:
https://www.nature.com/articles/ng.3889?WT.feed_name=subjects_genetics
【在 b******9 的大作中提到】 : 其实方法都差不多,没有一种是最完美的,都有优缺点。大概可以分为线性扩增(T7转 : 录),指数扩增(PCR)和RCA三大类,具体的可以参考这篇NAR: : SURVEY AND SUMMARY : Single-cell RNA-seq: advances and future challenges : 具体到你提到的CAGE,可以去看看Illumina收集的方法:在第40页 : https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/ : research_reviews/rna-sequencing-methods-review-web.pdf
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