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Biology版 - 求助,投稿时RNA-seq数据什么时候deposit?
相关主题
求助 哪里能找到 RNA-seq的数据库?怎么找RNA splicing variants? 有相关的数据库吗?
请教microarray的数据分析哪儿下载RNA-seq 文件
如何批量转换AFF ID到正常的基因名?学生物的同胞应该多想想创业
请教做生物信息学或者做果蝇的大侠完成的cancer genome sequencing 数据现在有吗?
有人发帖说小保方晴子的文章可能有问题。。RNA-seq结果分析求助
同一结果能用在两篇文章里吗?求教:RNA-seq数据分析的疑惑
问一个比较白痴的问题,关于stop codon的引入【求助】如何从Scaffold批量导出 gi number
一个基因为什么需要多个transcript variant ?白痴问题 怎么blast人的基因
相关话题的讨论汇总
话题: 投稿话题: rna话题: geo话题: seq话题: accession
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n*******l
发帖数: 190
1
最近一篇文章修回,打算把RNA-seq的数据放上去,我看人家都是在文章里面写geo
accession number. 请问是投稿的时候就deposit, 还是等文章接受了以后再上传数据
? 如果是接受以后上传的话,投稿的时候要不要写"XXXXX"来代替accession number?
版上牛人多, 麻烦有这投稿发文方面经验的大侠帮忙解答一下!!!多谢!!!
v*******e
发帖数: 11604
2

发表时至少要有个number。一般先注册个number,杂志就高兴了。发表前upload数据就
行了。这个可以和杂志沟通。

【在 n*******l 的大作中提到】
: 最近一篇文章修回,打算把RNA-seq的数据放上去,我看人家都是在文章里面写geo
: accession number. 请问是投稿的时候就deposit, 还是等文章接受了以后再上传数据
: ? 如果是接受以后上传的话,投稿的时候要不要写"XXXXX"来代替accession number?
: 版上牛人多, 麻烦有这投稿发文方面经验的大侠帮忙解答一下!!!多谢!!!

v*******e
发帖数: 11604
3
一般的institute这事都有专人负责。你不要自己搞出了岔子。重要的有:de-identify
ID's;还有consent之类。
n*******l
发帖数: 190
4
多谢牛人。那我再问问前老板吧。
才知道可以先注册再放data

identify

【在 v*******e 的大作中提到】
: 一般的institute这事都有专人负责。你不要自己搞出了岔子。重要的有:de-identify
: ID's;还有consent之类。

J********7
发帖数: 43
5
Submit yor raw data and processed data to NCBI GEO,
then you will get a GEO accession number GSE#####.
You need this number in your manuscript.
You can set the release date of your raw data (usually after the paper
online).
You also can generate a link to your data for the reviewers.

【在 n*******l 的大作中提到】
: 最近一篇文章修回,打算把RNA-seq的数据放上去,我看人家都是在文章里面写geo
: accession number. 请问是投稿的时候就deposit, 还是等文章接受了以后再上传数据
: ? 如果是接受以后上传的话,投稿的时候要不要写"XXXXX"来代替accession number?
: 版上牛人多, 麻烦有这投稿发文方面经验的大侠帮忙解答一下!!!多谢!!!

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相关主题
白痴问题 怎么blast人的基因有人发帖说小保方晴子的文章可能有问题。。
没想到投稿就要提供sequencing同一结果能用在两篇文章里吗?
菜鸟请教:affymetrix array data问一个比较白痴的问题,关于stop codon的引入
Manuscript submission: GEO accession number一个基因为什么需要多个transcript variant ?
求助 哪里能找到 RNA-seq的数据库?怎么找RNA splicing variants? 有相关的数据库吗?
请教microarray的数据分析哪儿下载RNA-seq 文件
如何批量转换AFF ID到正常的基因名?学生物的同胞应该多想想创业
请教做生物信息学或者做果蝇的大侠完成的cancer genome sequencing 数据现在有吗?
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